More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_4605 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4605  response regulator receiver protein  100 
 
 		 120 aa  245  1e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.509614 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0856  response regulator receiver domain-containing protein  55.93 
 
 		 120 aa  147  5e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0758877  normal  0.0586548 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1062  response regulator receiver protein  50.42 
 
 		 120 aa  140  5e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58489  hitchhiker  0.0000344775 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2795  response regulator receiver protein  52.54 
 
 		 121 aa  138  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0059  response regulator receiver domain-containing protein  50.43 
 
 		 125 aa  128  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.157498  normal  0.212271 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1423  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 119 aa  114  6e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.24081  normal  0.185499 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1221  response regulator receiver domain-containing protein  49.52 
 
 		 125 aa  111  3e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1234  response regulator receiver protein  40.83 
 
 		 122 aa  107  5e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1264  response regulator receiver protein  40.83 
 
 		 122 aa  107  5e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0578681  hitchhiker  0.00155192 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3000  response regulator receiver protein  37.82 
 
 		 124 aa  105  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2789  response regulator receiver protein  41.18 
 
 		 121 aa  105  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3970  response regulator receiver protein  35.59 
 
 		 121 aa  104  3e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0244969 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3776  response regulator receiver domain-containing protein  39.83 
 
 		 120 aa  104  5e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.143561 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1422  response regulator receiver protein  39.5 
 
 		 119 aa  103  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.153955  normal  0.123704 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2158  response regulator receiver protein  38.33 
 
 		 120 aa  103  8e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3189  twitching motility protein  35.96 
 
 		 121 aa  103  8e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.612166  normal  0.249154 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1997  two component transcriptional regulator  41.38 
 
 		 234 aa  103  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000742772  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0508  response regulator receiver domain-containing protein  38.66 
 
 		 121 aa  102  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.481314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3353  response regulator receiver protein  35.59 
 
 		 121 aa  102  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.392561  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3968  response regulator receiver protein  37.82 
 
 		 125 aa  101  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0130  response regulator receiver  39.13 
 
 		 121 aa  101  3e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1137  response regulator receiver domain-containing protein  37.29 
 
 		 121 aa  101  3e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.635456 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3248  response regulator receiver protein  38.66 
 
 		 121 aa  101  4e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.500247 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4952  response regulator receiver protein  38.66 
 
 		 121 aa  101  4e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.699568  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4991  response regulator receiver protein  35.83 
 
 		 121 aa  100  5e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.353726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4865  response regulator receiver protein  35.83 
 
 		 121 aa  100  5e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.321258  normal  0.0275279 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4285  response regulator receiver protein  40.17 
 
 		 122 aa  100  6e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4345  response regulator receiver protein  40.17 
 
 		 122 aa  100  6e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2900  response regulator receiver protein  37.29 
 
 		 121 aa  100  8e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.197839  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3577  response regulator receiver protein  37.29 
 
 		 121 aa  100  8e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.400966  normal  0.141746 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2780  response regulator receiver protein  38.66 
 
 		 121 aa  100  8e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.76051 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3337  response regulator receiver protein  38.66 
 
 		 121 aa  100  8e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3633  response regulator receiver domain-containing protein  37.29 
 
 		 120 aa  100  9e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.480345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3020  response regulator receiver protein  37.29 
 
 		 121 aa  100  9e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.447611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0902  response regulator receiver protein  37.29 
 
 		 121 aa  99.4  2e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844306 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1573  response regulator receiver protein  37.84 
 
 		 121 aa  99  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.146471 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3747  response regulator receiver protein  36.97 
 
 		 121 aa  98.2  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1243  response regulator receiver domain-containing protein  38.14 
 
 		 121 aa  97.8  4e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.253807 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2903  response regulator receiver protein  34.17 
 
 		 120 aa  97.8  4e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.629195  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5041  response regulator receiver protein  35 
 
 		 121 aa  98.2  4e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0473  response regulator receiver protein  35 
 
 		 121 aa  97.8  5e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.950452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0751  response regulator receiver protein  37.82 
 
 		 121 aa  97.4  6e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0722  response regulator receiver protein  37.82 
 
 		 121 aa  97.4  6e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1372  response regulator receiver domain-containing protein  36.52 
 
 		 121 aa  97.4  6e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0313107  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2399  response regulator receiver protein  35.65 
 
 		 121 aa  97.1  7e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.732485 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0609  DNA-binding response regulator  38.14 
 
 		 231 aa  96.7  1e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000282114  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3990  response regulator receiver protein  40.54 
 
 		 146 aa  96.7  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.27172  normal  0.4632 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3767  response regulator receiver protein  36.97 
 
 		 124 aa  96.3  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0858272 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0399  two component transcriptional regulator  37.61 
 
 		 272 aa  95.5  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.802217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2551  response regulator receiver domain-containing protein  36.44 
 
 		 121 aa  95.9  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0653  two-component response regulator PhoB  40.68 
 
 		 230 aa  95.5  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.131558  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0515  response regulator receiver protein  34.17 
 
 		 120 aa  95.5  2e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.163432  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02637  regulatory protein PilH family  34.17 
 
 		 128 aa  95.1  3e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0489  response regulator receiver  34.17 
 
 		 121 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.646514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  37.82 
 
 		 229 aa  94.7  3e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4743  response regulator receiver protein  38.94 
 
 		 125 aa  95.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00329385 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4625  response regulator receiver protein  33.05 
 
 		 121 aa  95.1  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.635313  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1955  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.07 
 
 		 236 aa  94.7  4e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.295041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3018  response regulator receiver protein  34.17 
 
 		 123 aa  94.4  5e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.454082 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3898  response regulator receiver  36.44 
 
 		 121 aa  94.4  5e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4323  two component LuxR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 215 aa  94.4  5e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.115662  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0415  two component transcriptional regulator  38.14 
 
 		 231 aa  94.4  5e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.777838 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0356  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 121 aa  94  6e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0780111  normal  0.957515 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0717  response regulator receiver protein  38.6 
 
 		 115 aa  94  7e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0522  response regulator receiver domain-containing protein  39.29 
 
 		 120 aa  93.6  9e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4125  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.13 
 
 		 230 aa  93.2  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.125271  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1724  response regulator receiver protein  32.5 
 
 		 128 aa  92.8  1e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.999633  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0882  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.14 
 
 		 230 aa  93.2  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.148935 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5033  type IV pilus response regulator PilH  33.33 
 
 		 121 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4151  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.13 
 
 		 230 aa  93.2  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1789  response regulator receiver protein  32.5 
 
 		 128 aa  92.8  1e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4009  two component transcriptional regulator  36.13 
 
 		 230 aa  93.2  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00751412  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3768  response regulator receiver protein  34.17 
 
 		 120 aa  92.8  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48045  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0623  DNA-binding response regulator  37.29 
 
 		 231 aa  92.8  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000212568  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1116  DNA-binding response regulator  39.32 
 
 		 235 aa  92.8  1e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.310768  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1911  two component transcriptional regulator  36.44 
 
 		 229 aa  92.8  1e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.258551 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1077  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.32 
 
 		 235 aa  92.8  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21640  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.5 
 
 		 226 aa  92.4  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000176926  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0444  DNA-binding response regulator  40.17 
 
 		 233 aa  92.4  2e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2709  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.44 
 
 		 236 aa  92  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0011921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3689  response regulator receiver protein  33.9 
 
 		 121 aa  92  3e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.443278  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2100  response regulator receiver domain-containing protein  35 
 
 		 120 aa  91.7  3e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0707  two component transcriptional regulator  35.9 
 
 		 227 aa  91.7  3e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.598521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4699  DNA-binding response regulator PhoP  40.17 
 
 		 239 aa  91.3  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0539  DNA-binding response regulator PhoP  40.17 
 
 		 239 aa  91.3  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000130788 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4720  DNA-binding response regulator PhoP  40.17 
 
 		 239 aa  91.3  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4714  DNA-binding response regulator PhoP  40.17 
 
 		 239 aa  91.3  4e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4484  DNA-binding response regulator PhoP  40.17 
 
 		 239 aa  91.3  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4319  alkaline phosphatase synthesis response regulator  40.17 
 
 		 239 aa  91.3  4e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4330  alkaline phosphatase synthesis response regulator  40.17 
 
 		 239 aa  91.3  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2308  response regulator receiver protein  36.13 
 
 		 123 aa  91.3  4e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4833  DNA-binding response regulator PhoP  40.17 
 
 		 239 aa  91.3  4e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0982965  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1155  two component transcriptional regulator  36.44 
 
 		 231 aa  91.3  4e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000430064  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4704  DNA-binding response regulator PhoP  40.17 
 
 		 239 aa  91.3  4e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000673192 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4419  two component transcriptional regulator  39.32 
 
 		 239 aa  90.9  5e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5307  response regulator receiver domain-containing protein  32.5 
 
 		 121 aa  90.9  5e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0137607  normal  0.215998 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1784  alkaline phosphatase synthesis transcriptional regulatory protein  38.14 
 
 		 234 aa  90.9  5e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.561076  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1750  two component transcriptional regulator  38.14 
 
 		 234 aa  90.9  5e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0404  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 121 aa  90.9  6e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2472  response regulator receiver protein  36.44 
 
 		 216 aa  90.5  7e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>