More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3018 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_3018  response regulator receiver protein  100 
 
 		 123 aa  250  4.0000000000000004e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.454082 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02637  regulatory protein PilH family  87.39 
 
 		 128 aa  216  8.999999999999998e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1724  response regulator receiver protein  79.17 
 
 		 128 aa  205  1e-52  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.999633  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1789  response regulator receiver protein  79.17 
 
 		 128 aa  205  1e-52  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0404  response regulator receiver protein  61.98 
 
 		 121 aa  158  2e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3633  response regulator receiver domain-containing protein  61.86 
 
 		 120 aa  158  2e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.480345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5307  response regulator receiver domain-containing protein  59.5 
 
 		 121 aa  155  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0137607  normal  0.215998 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3768  response regulator receiver protein  61.67 
 
 		 120 aa  154  4e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48045  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0489  response regulator receiver  58.68 
 
 		 121 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.646514  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5033  type IV pilus response regulator PilH  57.85 
 
 		 121 aa  150  7e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0509  twitching motility protein PilH  57.85 
 
 		 121 aa  149  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05330  twitching motility protein PilH  57.85 
 
 		 121 aa  149  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2399  response regulator receiver protein  57.14 
 
 		 121 aa  149  2e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.732485 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2100  response regulator receiver domain-containing protein  51.26 
 
 		 120 aa  144  4.0000000000000006e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2903  response regulator receiver protein  59.17 
 
 		 120 aa  141  3e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.629195  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0356  response regulator receiver protein  55.37 
 
 		 121 aa  141  3e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0780111  normal  0.957515 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5041  response regulator receiver protein  54.55 
 
 		 121 aa  140  4e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2158  response regulator receiver protein  50 
 
 		 120 aa  140  7e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0473  response regulator receiver protein  53.72 
 
 		 121 aa  139  9e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.950452  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4991  response regulator receiver protein  53.72 
 
 		 121 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.353726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1817  putative two-component response regulator  49.58 
 
 		 120 aa  139  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4865  response regulator receiver protein  53.72 
 
 		 121 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.321258  normal  0.0275279 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2551  response regulator receiver domain-containing protein  53.04 
 
 		 121 aa  134  3.0000000000000003e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0515  response regulator receiver protein  51.26 
 
 		 120 aa  134  3.0000000000000003e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.163432  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3689  response regulator receiver protein  52.29 
 
 		 121 aa  134  5e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.443278  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3898  response regulator receiver  51.67 
 
 		 121 aa  130  6e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01603  PilH  52.25 
 
 		 120 aa  128  2.0000000000000002e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.376187  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0130  response regulator receiver  53.15 
 
 		 121 aa  127  5.0000000000000004e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1243  response regulator receiver domain-containing protein  53.15 
 
 		 121 aa  127  7.000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.253807 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0522  response regulator receiver domain-containing protein  44.83 
 
 		 120 aa  121  3e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3088  response regulator receiver protein  49.55 
 
 		 120 aa  121  3e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.224006 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1573  response regulator receiver protein  48.62 
 
 		 121 aa  117  4.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.146471 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3970  response regulator receiver protein  48.18 
 
 		 121 aa  117  4.9999999999999996e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0244969 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3189  twitching motility protein  48.65 
 
 		 121 aa  117  6e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.612166  normal  0.249154 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0613  response regulator receiver protein  46.61 
 
 		 122 aa  116  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.242329  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0561  response regulator receiver protein  46.61 
 
 		 122 aa  116  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.718467 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0902  response regulator receiver protein  47.71 
 
 		 121 aa  115  1.9999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844306 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3577  response regulator receiver protein  47.71 
 
 		 121 aa  115  3e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.400966  normal  0.141746 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2900  response regulator receiver protein  47.71 
 
 		 121 aa  115  3e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.197839  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0669  putative twitching motility two-component response regulator transcription regulator protein  46.61 
 
 		 122 aa  114  3.9999999999999997e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3020  response regulator receiver protein  47.27 
 
 		 121 aa  114  3.9999999999999997e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.447611  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4625  response regulator receiver protein  48.62 
 
 		 121 aa  114  6e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.635313  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1264  response regulator receiver protein  45.53 
 
 		 122 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0578681  hitchhiker  0.00155192 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1234  response regulator receiver protein  45.53 
 
 		 122 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2622  response regulator receiver  49.54 
 
 		 123 aa  111  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3353  response regulator receiver protein  46.79 
 
 		 121 aa  110  5e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.392561  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1062  response regulator receiver protein  38.74 
 
 		 120 aa  110  6e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58489  hitchhiker  0.0000344775 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3661  response regulator receiver protein  47.75 
 
 		 120 aa  110  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.442071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1137  response regulator receiver domain-containing protein  45.95 
 
 		 121 aa  110  8.000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.635456 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2795  response regulator receiver protein  39.83 
 
 		 121 aa  110  9e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0059  response regulator receiver domain-containing protein  38.14 
 
 		 125 aa  109  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.157498  normal  0.212271 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0670  response regulator receiver domain-containing protein  45.95 
 
 		 122 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00691443  normal  0.823575 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0508  response regulator receiver domain-containing protein  41.32 
 
 		 121 aa  108  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.481314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1372  response regulator receiver domain-containing protein  46.79 
 
 		 121 aa  106  8.000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0313107  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3747  response regulator receiver protein  38.02 
 
 		 121 aa  106  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3248  response regulator receiver protein  39.64 
 
 		 121 aa  105  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.500247 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3968  response regulator receiver protein  39.66 
 
 		 125 aa  103  8e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1221  response regulator receiver domain-containing protein  44.86 
 
 		 125 aa  103  8e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0650  response regulator receiver protein  48.62 
 
 		 123 aa  103  8e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.438565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3000  response regulator receiver protein  40.54 
 
 		 124 aa  103  9e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4952  response regulator receiver protein  38.84 
 
 		 121 aa  103  1e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.699568  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1955  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.44 
 
 		 236 aa  102  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.295041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1805  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  40.37 
 
 		 310 aa  100  8e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0638722  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0912  response regulator receiver protein  40.83 
 
 		 118 aa  99.8  1e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.616011 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1842  response regulator receiver protein  37.19 
 
 		 122 aa  100  1e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.808404  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0722  response regulator receiver protein  35.29 
 
 		 121 aa  99.4  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0751  response regulator receiver protein  35.29 
 
 		 121 aa  99.4  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0631  response regulator receiver protein  47.71 
 
 		 123 aa  99.8  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4136  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  42.74 
 
 		 440 aa  99.4  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000660181  hitchhiker  0.00876613 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0856  response regulator receiver domain-containing protein  34.75 
 
 		 120 aa  99  2e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0758877  normal  0.0586548 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0640  response regulator receiver protein  46.79 
 
 		 123 aa  99  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3337  response regulator receiver protein  37.82 
 
 		 121 aa  97.8  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2780  response regulator receiver protein  37.82 
 
 		 121 aa  97.8  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.76051 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2507  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  39.83 
 
 		 488 aa  97.8  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.182398 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0251  response regulator receiver protein  31.71 
 
 		 126 aa  97.8  4e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.102048 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2789  response regulator receiver protein  41.44 
 
 		 121 aa  97.8  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0606  response regulator receiver domain-containing protein  46.79 
 
 		 123 aa  97.4  6e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5066  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  39.83 
 
 		 338 aa  97.4  6e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3990  response regulator receiver protein  36.52 
 
 		 146 aa  96.7  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.27172  normal  0.4632 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5515  response regulator receiver protein  41.32 
 
 		 134 aa  96.3  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1901  response regulator receiver protein  37.29 
 
 		 125 aa  96.3  1e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1941  response regulator receiver domain-containing protein  40 
 
 		 156 aa  95.9  2e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1277  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  42.06 
 
 		 454 aa  95.5  2e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.410696  normal  0.0388481 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1748  response regulator receiver  43.1 
 
 		 123 aa  94.7  3e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.122601  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1911  two component transcriptional regulator  39.52 
 
 		 229 aa  95.1  3e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.258551 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4677  response regulator receiver domain-containing protein  40.68 
 
 		 121 aa  94.4  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4605  response regulator receiver protein  34.17 
 
 		 120 aa  94.4  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.509614 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4229  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  39.32 
 
 		 383 aa  94.4  5e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.599633  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0695  response regulator receiver  35.04 
 
 		 170 aa  94  6e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.412637  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3061  two component transcriptional regulator  40.5 
 
 		 227 aa  94  6e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.799336  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1077  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.94 
 
 		 235 aa  93.6  8e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4225  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.59 
 
 		 1322 aa  93.6  8e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1102  DNA-binding response regulator  40.54 
 
 		 225 aa  92.8  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2960  response regulator receiver  35.34 
 
 		 190 aa  92.8  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0852903  normal  0.915615 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2219  response regulator  36.67 
 
 		 123 aa  92.4  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0599  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  37.96 
 
 		 313 aa  92.4  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.464892  normal  0.548622 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2051  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.67 
 
 		 247 aa  92.4  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.520505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6528  two component AraC family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 271 aa  92.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.485144  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0393  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.4 
 
 		 227 aa  92  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.202895 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6350  two component AraC family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 271 aa  92.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.787195  normal  0.900493 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>