More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_2158 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_2158  response regulator receiver protein  100 
 
 		 120 aa  249  1e-65  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1817  putative two-component response regulator  72.27 
 
 		 120 aa  191  3e-48  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2100  response regulator receiver domain-containing protein  68.91 
 
 		 120 aa  184  3e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0404  response regulator receiver protein  51.67 
 
 		 121 aa  147  7e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5033  type IV pilus response regulator PilH  52.5 
 
 		 121 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3633  response regulator receiver domain-containing protein  54.24 
 
 		 120 aa  145  2.0000000000000003e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.480345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1724  response regulator receiver protein  51.67 
 
 		 128 aa  145  2.0000000000000003e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.999633  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1789  response regulator receiver protein  51.67 
 
 		 128 aa  145  2.0000000000000003e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5307  response regulator receiver domain-containing protein  51.67 
 
 		 121 aa  143  6e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0137607  normal  0.215998 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0489  response regulator receiver  51.67 
 
 		 121 aa  143  9e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.646514  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4991  response regulator receiver protein  53.33 
 
 		 121 aa  142  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.353726  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5041  response regulator receiver protein  53.33 
 
 		 121 aa  143  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4865  response regulator receiver protein  53.33 
 
 		 121 aa  142  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.321258  normal  0.0275279 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3768  response regulator receiver protein  52.5 
 
 		 120 aa  142  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48045  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0509  twitching motility protein PilH  50.83 
 
 		 121 aa  141  4e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05330  twitching motility protein PilH  50.83 
 
 		 121 aa  141  4e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3018  response regulator receiver protein  50 
 
 		 123 aa  140  7e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.454082 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2551  response regulator receiver domain-containing protein  54.24 
 
 		 121 aa  139  9.999999999999999e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0356  response regulator receiver protein  51.67 
 
 		 121 aa  137  4.999999999999999e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0780111  normal  0.957515 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0473  response regulator receiver protein  50 
 
 		 121 aa  136  8.999999999999999e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.950452  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02637  regulatory protein PilH family  50.42 
 
 		 128 aa  135  2e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2399  response regulator receiver protein  49.57 
 
 		 121 aa  132  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.732485 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0130  response regulator receiver  52.94 
 
 		 121 aa  132  9.999999999999999e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2903  response regulator receiver protein  47.5 
 
 		 120 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.629195  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3689  response regulator receiver protein  50.43 
 
 		 121 aa  126  9.000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.443278  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0515  response regulator receiver protein  44.54 
 
 		 120 aa  125  2.0000000000000002e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.163432  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1243  response regulator receiver domain-containing protein  48.7 
 
 		 121 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.253807 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3353  response regulator receiver protein  46.61 
 
 		 121 aa  120  6e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.392561  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4625  response regulator receiver protein  44.92 
 
 		 121 aa  120  7e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.635313  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3577  response regulator receiver protein  46.61 
 
 		 121 aa  119  9.999999999999999e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.400966  normal  0.141746 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1137  response regulator receiver domain-containing protein  45.76 
 
 		 121 aa  119  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.635456 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3020  response regulator receiver protein  46.61 
 
 		 121 aa  119  9.999999999999999e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.447611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2900  response regulator receiver protein  46.61 
 
 		 121 aa  119  9.999999999999999e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.197839  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3898  response regulator receiver  47.46 
 
 		 121 aa  118  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3189  twitching motility protein  47.79 
 
 		 121 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.612166  normal  0.249154 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3970  response regulator receiver protein  45.22 
 
 		 121 aa  118  1.9999999999999998e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0244969 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1062  response regulator receiver protein  42.02 
 
 		 120 aa  118  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58489  hitchhiker  0.0000344775 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01603  PilH  42.02 
 
 		 120 aa  117  3.9999999999999996e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.376187  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0902  response regulator receiver protein  45.76 
 
 		 121 aa  117  3.9999999999999996e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844306 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1573  response regulator receiver protein  45.76 
 
 		 121 aa  117  7.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.146471 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3088  response regulator receiver protein  41.67 
 
 		 120 aa  116  9.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.224006 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0059  response regulator receiver domain-containing protein  43.59 
 
 		 125 aa  114  3.9999999999999997e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.157498  normal  0.212271 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1372  response regulator receiver domain-containing protein  45.76 
 
 		 121 aa  113  6.9999999999999995e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0313107  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0613  response regulator receiver protein  48.7 
 
 		 122 aa  113  7.999999999999999e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.242329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3000  response regulator receiver protein  43.7 
 
 		 124 aa  113  7.999999999999999e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0561  response regulator receiver protein  48.7 
 
 		 122 aa  113  7.999999999999999e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.718467 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1264  response regulator receiver protein  41.67 
 
 		 122 aa  112  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0578681  hitchhiker  0.00155192 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1234  response regulator receiver protein  41.67 
 
 		 122 aa  112  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3747  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 121 aa  111  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0631  response regulator receiver protein  44.07 
 
 		 123 aa  111  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0640  response regulator receiver protein  43.22 
 
 		 123 aa  110  5e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0606  response regulator receiver domain-containing protein  44.07 
 
 		 123 aa  110  6e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0522  response regulator receiver domain-containing protein  41.23 
 
 		 120 aa  110  9e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2622  response regulator receiver  45.22 
 
 		 123 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3248  response regulator receiver protein  43.7 
 
 		 121 aa  108  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.500247 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0669  putative twitching motility two-component response regulator transcription regulator protein  45.22 
 
 		 122 aa  107  4.0000000000000004e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0670  response regulator receiver domain-containing protein  45.22 
 
 		 122 aa  108  4.0000000000000004e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00691443  normal  0.823575 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3968  response regulator receiver protein  44.35 
 
 		 125 aa  107  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3661  response regulator receiver protein  40.34 
 
 		 120 aa  107  6e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.442071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0508  response regulator receiver domain-containing protein  40.34 
 
 		 121 aa  106  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.481314  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4952  response regulator receiver protein  41.18 
 
 		 121 aa  106  1e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.699568  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0856  response regulator receiver domain-containing protein  40.68 
 
 		 120 aa  105  2e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0758877  normal  0.0586548 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0650  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 123 aa  104  3e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.438565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2795  response regulator receiver protein  43.22 
 
 		 121 aa  105  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4605  response regulator receiver protein  38.33 
 
 		 120 aa  103  8e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.509614 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2780  response regulator receiver protein  37.82 
 
 		 121 aa  101  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.76051 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3337  response regulator receiver protein  37.82 
 
 		 121 aa  101  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1805  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  36.28 
 
 		 310 aa  101  4e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0638722  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0751  response regulator receiver protein  39.5 
 
 		 121 aa  99.4  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1911  two component transcriptional regulator  38.46 
 
 		 229 aa  99.4  1e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.258551 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3990  response regulator receiver protein  39.64 
 
 		 146 aa  100  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.27172  normal  0.4632 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0722  response regulator receiver protein  39.5 
 
 		 121 aa  99.4  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1221  response regulator receiver domain-containing protein  41.28 
 
 		 125 aa  99  2e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3776  response regulator receiver domain-containing protein  39.5 
 
 		 120 aa  97.1  8e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.143561 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2308  response regulator receiver protein  37.61 
 
 		 123 aa  96.3  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0221  response regulator PleD  38.79 
 
 		 460 aa  95.9  2e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2619  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  41.03 
 
 		 1956 aa  95.5  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0912  response regulator receiver protein  40 
 
 		 118 aa  95.1  3e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.616011 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3767  response regulator receiver protein  31.93 
 
 		 124 aa  93.6  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0858272 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0567  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.97 
 
 		 225 aa  93.2  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.463355  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2492  response regulator receiver  37.39 
 
 		 352 aa  92.8  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.570528  normal  0.0101485 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2789  response regulator receiver protein  36.97 
 
 		 121 aa  92.8  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0304  response regulator PleD  35.9 
 
 		 458 aa  92.8  2e-18  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0864091  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4743  response regulator receiver protein  40.52 
 
 		 125 aa  92.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00329385 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0512  response regulator PleD  37.07 
 
 		 456 aa  92.4  2e-18  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2543  response regulator receiver protein  37.19 
 
 		 121 aa  92.4  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0605  adenylate/guanylate cyclase  38.26 
 
 		 355 aa  91.7  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.657653  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0926  response regulator PleD  35.04 
 
 		 455 aa  91.7  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.773886 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6237  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  40.68 
 
 		 721 aa  91.7  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.703753 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5316  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36.52 
 
 		 354 aa  91.3  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.100222 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0220  two component transcriptional regulator, AraC family  37.07 
 
 		 934 aa  91.3  4e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.497584  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1955  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.97 
 
 		 236 aa  91.3  4e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.295041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2507  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  36.84 
 
 		 488 aa  90.9  5e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.182398 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2815  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  35.04 
 
 		 457 aa  90.9  6e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.631579  normal  0.0857187 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0251  response regulator receiver protein  38.26 
 
 		 126 aa  90.5  6e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.102048 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0773  response regulator PleD  35.04 
 
 		 458 aa  90.5  7e-18  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1866  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  35.9 
 
 		 326 aa  90.5  7e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1423  response regulator receiver protein  35.29 
 
 		 119 aa  90.5  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.24081  normal  0.185499 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1873  response regulator receiver  35.9 
 
 		 326 aa  90.1  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.402703 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0695  response regulator receiver  35.59 
 
 		 170 aa  89.7  1e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.412637  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>