More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_0613 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_0561  response regulator receiver protein  100 
 
 		 122 aa  249  7e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.718467 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0613  response regulator receiver protein  100 
 
 		 122 aa  249  7e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.242329  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0669  putative twitching motility two-component response regulator transcription regulator protein  88.52 
 
 		 122 aa  224  3e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0670  response regulator receiver domain-containing protein  76.23 
 
 		 122 aa  206  9e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00691443  normal  0.823575 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2622  response regulator receiver  75 
 
 		 123 aa  200  6e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4625  response regulator receiver protein  63.64 
 
 		 121 aa  165  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.635313  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3689  response regulator receiver protein  58.68 
 
 		 121 aa  159  2e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.443278  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3189  twitching motility protein  63.25 
 
 		 121 aa  154  3e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.612166  normal  0.249154 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2551  response regulator receiver domain-containing protein  61.98 
 
 		 121 aa  155  3e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3353  response regulator receiver protein  61.16 
 
 		 121 aa  154  4e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.392561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1137  response regulator receiver domain-containing protein  60.33 
 
 		 121 aa  154  5.0000000000000005e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.635456 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1372  response regulator receiver domain-containing protein  59.5 
 
 		 121 aa  151  2.9999999999999998e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0313107  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1573  response regulator receiver protein  61.67 
 
 		 121 aa  150  4e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.146471 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3898  response regulator receiver  56.67 
 
 		 121 aa  150  5e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3970  response regulator receiver protein  56.41 
 
 		 121 aa  146  7e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0244969 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2900  response regulator receiver protein  58.33 
 
 		 121 aa  144  3e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.197839  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3020  response regulator receiver protein  57.85 
 
 		 121 aa  144  3e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.447611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3577  response regulator receiver protein  58.33 
 
 		 121 aa  144  3e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.400966  normal  0.141746 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0902  response regulator receiver protein  57.5 
 
 		 121 aa  144  5e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844306 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1243  response regulator receiver domain-containing protein  53.72 
 
 		 121 aa  137  6e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.253807 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3633  response regulator receiver domain-containing protein  52.99 
 
 		 120 aa  128  3e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.480345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2903  response regulator receiver protein  53.45 
 
 		 120 aa  125  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.629195  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0130  response regulator receiver  53.91 
 
 		 121 aa  122  1e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01603  PilH  43.33 
 
 		 120 aa  123  1e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.376187  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2399  response regulator receiver protein  49.57 
 
 		 121 aa  122  2e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.732485 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1234  response regulator receiver protein  47.83 
 
 		 122 aa  121  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1264  response regulator receiver protein  47.83 
 
 		 122 aa  121  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0578681  hitchhiker  0.00155192 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3768  response regulator receiver protein  50.86 
 
 		 120 aa  121  4e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48045  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0515  response regulator receiver protein  49.54 
 
 		 120 aa  120  7e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.163432  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0356  response regulator receiver protein  48.67 
 
 		 121 aa  119  9.999999999999999e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0780111  normal  0.957515 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4991  response regulator receiver protein  48.67 
 
 		 121 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.353726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4865  response regulator receiver protein  48.67 
 
 		 121 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.321258  normal  0.0275279 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0509  twitching motility protein PilH  50.44 
 
 		 121 aa  117  7e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5041  response regulator receiver protein  47.79 
 
 		 121 aa  117  7e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05330  twitching motility protein PilH  50.44 
 
 		 121 aa  117  7e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3018  response regulator receiver protein  46.61 
 
 		 123 aa  116  9.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.454082 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2100  response regulator receiver domain-containing protein  47.86 
 
 		 120 aa  115  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5033  type IV pilus response regulator PilH  49.56 
 
 		 121 aa  115  3e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0722  response regulator receiver protein  41.67 
 
 		 121 aa  114  5e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02637  regulatory protein PilH family  46.55 
 
 		 128 aa  114  5e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0751  response regulator receiver protein  41.67 
 
 		 121 aa  114  5e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0473  response regulator receiver protein  46.96 
 
 		 121 aa  113  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.950452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0489  response regulator receiver  48.67 
 
 		 121 aa  113  7.999999999999999e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.646514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2158  response regulator receiver protein  48.7 
 
 		 120 aa  113  7.999999999999999e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0404  response regulator receiver protein  47.79 
 
 		 121 aa  113  8.999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1817  putative two-component response regulator  47.01 
 
 		 120 aa  112  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3088  response regulator receiver protein  42.24 
 
 		 120 aa  112  1.0000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.224006 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5307  response regulator receiver domain-containing protein  47.79 
 
 		 121 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0137607  normal  0.215998 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3248  response regulator receiver protein  44.07 
 
 		 121 aa  112  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.500247 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3000  response regulator receiver protein  41.53 
 
 		 124 aa  111  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1724  response regulator receiver protein  43.97 
 
 		 128 aa  110  4.0000000000000004e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.999633  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1789  response regulator receiver protein  43.97 
 
 		 128 aa  110  4.0000000000000004e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2789  response regulator receiver protein  46.49 
 
 		 121 aa  111  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3661  response regulator receiver protein  46.09 
 
 		 120 aa  108  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.442071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0508  response regulator receiver domain-containing protein  41.74 
 
 		 121 aa  106  8.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.481314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0717  response regulator receiver protein  43.36 
 
 		 115 aa  106  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4952  response regulator receiver protein  39.83 
 
 		 121 aa  105  2e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.699568  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3337  response regulator receiver protein  41.23 
 
 		 121 aa  103  9e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2780  response regulator receiver protein  41.23 
 
 		 121 aa  103  9e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.76051 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2795  response regulator receiver protein  43.59 
 
 		 121 aa  103  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0059  response regulator receiver domain-containing protein  40.87 
 
 		 125 aa  102  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.157498  normal  0.212271 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0522  response regulator receiver domain-containing protein  42.74 
 
 		 120 aa  102  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3747  response regulator receiver protein  39.83 
 
 		 121 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3990  response regulator receiver protein  42.11 
 
 		 146 aa  102  3e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.27172  normal  0.4632 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4345  response regulator receiver protein  34.71 
 
 		 122 aa  99.4  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4743  response regulator receiver protein  40.68 
 
 		 125 aa  99.8  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00329385 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0856  response regulator receiver domain-containing protein  38.39 
 
 		 120 aa  99.8  1e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0758877  normal  0.0586548 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3968  response regulator receiver protein  42.74 
 
 		 125 aa  99.8  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4285  response regulator receiver protein  34.71 
 
 		 122 aa  99.4  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0516  response regulator receiver  44.35 
 
 		 247 aa  97.8  4e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.62167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1423  response regulator receiver protein  39.13 
 
 		 119 aa  97.4  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.24081  normal  0.185499 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1062  response regulator receiver protein  36.52 
 
 		 120 aa  97.1  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58489  hitchhiker  0.0000344775 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0631  response regulator receiver protein  43.59 
 
 		 123 aa  95.5  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1701  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.89 
 
 		 236 aa  95.9  2e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0640  response regulator receiver protein  43.59 
 
 		 123 aa  95.9  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2642  GAF sensor hybrid histidine kinase  43.75 
 
 		 1216 aa  94.7  3e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.974276  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1422  response regulator receiver protein  38.14 
 
 		 119 aa  95.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.153955  normal  0.123704 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3907  two component transcriptional regulator  41.74 
 
 		 245 aa  94.7  4e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0196213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1901  response regulator receiver protein  37.61 
 
 		 125 aa  94  6e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0237  response regulator receiver protein  35.4 
 
 		 124 aa  93.6  8e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000555979 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3210  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  42.86 
 
 		 337 aa  93.6  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.32327  normal  0.712325 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1174  two component transcriptional regulator  39.32 
 
 		 239 aa  93.2  1e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1943  GAF sensor hybrid histidine kinase  43.48 
 
 		 1468 aa  93.2  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5704  two component transcriptional regulator  39.13 
 
 		 246 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.140603  normal  0.300283 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0606  response regulator receiver domain-containing protein  42.74 
 
 		 123 aa  93.2  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1438  putative PAS/PAC sensor protein  41.74 
 
 		 393 aa  92.8  1e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.92182 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1136  two component transcriptional regulator  39.32 
 
 		 239 aa  93.2  1e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000652217  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2748  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.87 
 
 		 233 aa  92  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3776  response regulator receiver domain-containing protein  35.83 
 
 		 120 aa  92.8  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.143561 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2086  two component transcriptional regulator  39.13 
 
 		 246 aa  92  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03750  PhoP-like protein  38.26 
 
 		 226 aa  92.4  2e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.181369  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3011  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.87 
 
 		 233 aa  92  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0650  response regulator receiver protein  44.44 
 
 		 123 aa  91.7  3e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.438565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3778  response regulator receiver domain-containing protein  36.75 
 
 		 124 aa  91.7  3e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3303  two component transcriptional regulator  39.13 
 
 		 245 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52250  two-component response regulator  37.17 
 
 		 239 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.220903 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5113  response regulator receiver protein  36.21 
 
 		 121 aa  90.9  5e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2149  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  41.07 
 
 		 407 aa  90.9  5e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.142048 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2051  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.87 
 
 		 246 aa  90.9  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0474711  normal  0.959624 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0578  two component transcriptional regulator  41.96 
 
 		 240 aa  90.9  5e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>