More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0130 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_0130  response regulator receiver  100 
 
 		 121 aa  249  9.000000000000001e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3768  response regulator receiver protein  60.5 
 
 		 120 aa  151  2e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48045  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3633  response regulator receiver domain-containing protein  57.76 
 
 		 120 aa  148  3e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.480345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2399  response regulator receiver protein  54.17 
 
 		 121 aa  146  8e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.732485 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3898  response regulator receiver  60.34 
 
 		 121 aa  143  8.000000000000001e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0356  response regulator receiver protein  53.33 
 
 		 121 aa  143  1e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0780111  normal  0.957515 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2903  response regulator receiver protein  53.78 
 
 		 120 aa  142  1e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.629195  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0509  twitching motility protein PilH  55.46 
 
 		 121 aa  142  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05330  twitching motility protein PilH  55.46 
 
 		 121 aa  142  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0515  response regulator receiver protein  51.67 
 
 		 120 aa  140  5e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.163432  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0404  response regulator receiver protein  53.78 
 
 		 121 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0489  response regulator receiver  53.78 
 
 		 121 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.646514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5307  response regulator receiver domain-containing protein  56.03 
 
 		 121 aa  138  3e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0137607  normal  0.215998 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2100  response regulator receiver domain-containing protein  59.13 
 
 		 120 aa  138  3e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5033  type IV pilus response regulator PilH  53.78 
 
 		 121 aa  137  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0473  response regulator receiver protein  51.26 
 
 		 121 aa  137  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.950452  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4991  response regulator receiver protein  50.42 
 
 		 121 aa  137  7e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.353726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4865  response regulator receiver protein  50.42 
 
 		 121 aa  137  7e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.321258  normal  0.0275279 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1817  putative two-component response regulator  58.26 
 
 		 120 aa  137  7e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5041  response regulator receiver protein  50.42 
 
 		 121 aa  137  7e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3970  response regulator receiver protein  55.75 
 
 		 121 aa  135  2e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0244969 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2900  response regulator receiver protein  55.65 
 
 		 121 aa  134  4e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.197839  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3577  response regulator receiver protein  55.65 
 
 		 121 aa  134  4e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.400966  normal  0.141746 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3020  response regulator receiver protein  54.24 
 
 		 121 aa  134  5e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.447611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1243  response regulator receiver domain-containing protein  56.25 
 
 		 121 aa  134  5e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.253807 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0902  response regulator receiver protein  55.65 
 
 		 121 aa  134  5e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844306 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4625  response regulator receiver protein  54.78 
 
 		 121 aa  133  6.0000000000000005e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.635313  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2158  response regulator receiver protein  52.94 
 
 		 120 aa  132  9.999999999999999e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02637  regulatory protein PilH family  49.17 
 
 		 128 aa  130  7.999999999999999e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2551  response regulator receiver domain-containing protein  52.54 
 
 		 121 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1573  response regulator receiver protein  55.65 
 
 		 121 aa  129  1.0000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.146471 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3189  twitching motility protein  53.04 
 
 		 121 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.612166  normal  0.249154 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3018  response regulator receiver protein  53.15 
 
 		 123 aa  127  5.0000000000000004e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.454082 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1137  response regulator receiver domain-containing protein  53.91 
 
 		 121 aa  127  5.0000000000000004e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.635456 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1724  response regulator receiver protein  49.56 
 
 		 128 aa  127  7.000000000000001e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.999633  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1789  response regulator receiver protein  49.56 
 
 		 128 aa  127  7.000000000000001e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3689  response regulator receiver protein  50.43 
 
 		 121 aa  127  7.000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.443278  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0670  response regulator receiver domain-containing protein  52.5 
 
 		 122 aa  126  9.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00691443  normal  0.823575 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3353  response regulator receiver protein  53.04 
 
 		 121 aa  125  2.0000000000000002e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.392561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01603  PilH  48.33 
 
 		 120 aa  123  9e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.376187  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0613  response regulator receiver protein  53.91 
 
 		 122 aa  122  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.242329  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0561  response regulator receiver protein  53.91 
 
 		 122 aa  122  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.718467 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1372  response regulator receiver domain-containing protein  51.3 
 
 		 121 aa  121  4e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0313107  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3248  response regulator receiver protein  42.02 
 
 		 121 aa  120  6e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.500247 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2622  response regulator receiver  51.3 
 
 		 123 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0522  response regulator receiver domain-containing protein  47.83 
 
 		 120 aa  118  3e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0669  putative twitching motility two-component response regulator transcription regulator protein  51.69 
 
 		 122 aa  118  3.9999999999999996e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2795  response regulator receiver protein  43.33 
 
 		 121 aa  117  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0508  response regulator receiver domain-containing protein  40 
 
 		 121 aa  115  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.481314  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1062  response regulator receiver protein  42.02 
 
 		 120 aa  115  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58489  hitchhiker  0.0000344775 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4952  response regulator receiver protein  38.66 
 
 		 121 aa  114  6e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.699568  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1264  response regulator receiver protein  47.06 
 
 		 122 aa  114  6e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0578681  hitchhiker  0.00155192 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1234  response regulator receiver protein  47.06 
 
 		 122 aa  114  6e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0856  response regulator receiver domain-containing protein  42.61 
 
 		 120 aa  112  1.0000000000000001e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0758877  normal  0.0586548 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3000  response regulator receiver protein  39.5 
 
 		 124 aa  113  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3747  response regulator receiver protein  36.97 
 
 		 121 aa  112  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3088  response regulator receiver protein  45.38 
 
 		 120 aa  112  2.0000000000000002e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.224006 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3990  response regulator receiver protein  44.04 
 
 		 146 aa  112  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.27172  normal  0.4632 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1221  response regulator receiver domain-containing protein  50.48 
 
 		 125 aa  110  1.0000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2922  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.86 
 
 		 230 aa  108  2.0000000000000002e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.221617  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2780  response regulator receiver protein  43.7 
 
 		 121 aa  107  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.76051 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3337  response regulator receiver protein  43.7 
 
 		 121 aa  107  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2789  response regulator receiver protein  46.22 
 
 		 121 aa  106  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0722  response regulator receiver protein  38.33 
 
 		 121 aa  105  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0059  response regulator receiver domain-containing protein  41.38 
 
 		 125 aa  105  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.157498  normal  0.212271 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0751  response regulator receiver protein  38.33 
 
 		 121 aa  105  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3968  response regulator receiver protein  38.66 
 
 		 125 aa  105  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0367  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.86 
 
 		 503 aa  105  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0540164 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0631  response regulator receiver protein  45.13 
 
 		 123 aa  104  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0640  response regulator receiver protein  45.13 
 
 		 123 aa  104  4e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0483  two component transcriptional regulator  38.66 
 
 		 229 aa  103  6e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.342081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0606  response regulator receiver domain-containing protein  45.13 
 
 		 123 aa  103  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1498  two component transcriptional regulator  40 
 
 		 247 aa  102  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.220919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4743  response regulator receiver protein  41.32 
 
 		 125 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00329385 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4605  response regulator receiver protein  39.13 
 
 		 120 aa  101  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.509614 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1423  response regulator receiver protein  41.18 
 
 		 119 aa  101  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.24081  normal  0.185499 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1955  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.24 
 
 		 236 aa  100  5e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.295041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1010  chemotaxis protein CheY  39.5 
 
 		 124 aa  100  9e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1936  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.33 
 
 		 246 aa  100  9e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1963  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.33 
 
 		 246 aa  100  9e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.470012 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3637  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.66 
 
 		 246 aa  99.4  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2649  response regulator receiver protein  35.04 
 
 		 122 aa  99.4  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.857048  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2149  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  42.11 
 
 		 407 aa  99  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.142048 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3763  response regulator receiver protein  41.67 
 
 		 121 aa  99  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0603  two component transcriptional regulator  35.29 
 
 		 233 aa  99  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0519325  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  40 
 
 		 229 aa  99  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4937  two component transcriptional regulator  39.5 
 
 		 257 aa  98.6  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.565868 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1887  adenylate/guanylate cyclase  41.38 
 
 		 403 aa  98.6  3e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.522729 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5207  winged helix family two component transcriptional regulator  39.17 
 
 		 247 aa  98.2  3e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3776  response regulator receiver domain-containing protein  39.64 
 
 		 120 aa  98.2  4e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.143561 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1100  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.33 
 
 		 236 aa  97.4  6e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000182155 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1097  response regulator receiver protein  42.11 
 
 		 131 aa  97.1  7e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00801176  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1277  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  39.66 
 
 		 454 aa  97.1  7e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.410696  normal  0.0388481 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3742  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.46 
 
 		 263 aa  97.1  8e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0609  DNA-binding response regulator  37.07 
 
 		 231 aa  97.1  8e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000282114  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1474  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  37.39 
 
 		 345 aa  96.3  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2709  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.17 
 
 		 236 aa  96.7  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0011921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0095  two component transcriptional regulator  39.32 
 
 		 249 aa  96.3  1e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1236  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  41.23 
 
 		 386 aa  96.3  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.493129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1997  two component transcriptional regulator  40 
 
 		 234 aa  95.9  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000742772  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>