More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_1789 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_1789  response regulator receiver protein  100 
 
 
128 aa  263  7e-70  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1724  response regulator receiver protein  100 
 
 
128 aa  263  7e-70  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.999633  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02637  regulatory protein PilH family  83.59 
 
 
128 aa  221  2e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3018  response regulator receiver protein  79.17 
 
 
123 aa  205  1e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.454082 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3633  response regulator receiver domain-containing protein  56.78 
 
 
120 aa  154  5.0000000000000005e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.480345  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2399  response regulator receiver protein  58.33 
 
 
121 aa  149  1e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.732485 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3768  response regulator receiver protein  56.67 
 
 
120 aa  148  3e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48045  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2158  response regulator receiver protein  51.67 
 
 
120 aa  145  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0489  response regulator receiver  51.67 
 
 
121 aa  142  1e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.646514  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5307  response regulator receiver domain-containing protein  50.83 
 
 
121 aa  141  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0137607  normal  0.215998 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0404  response regulator receiver protein  50.83 
 
 
121 aa  140  7e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2100  response regulator receiver domain-containing protein  46.22 
 
 
120 aa  140  8e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5033  type IV pilus response regulator PilH  50 
 
 
121 aa  138  3e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0509  twitching motility protein PilH  50.83 
 
 
121 aa  138  3e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05330  twitching motility protein PilH  50.83 
 
 
121 aa  138  3e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1817  putative two-component response regulator  45.38 
 
 
120 aa  135  2e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2903  response regulator receiver protein  53.98 
 
 
120 aa  134  3.0000000000000003e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.629195  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0356  response regulator receiver protein  53.98 
 
 
121 aa  134  4e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0780111  normal  0.957515 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5041  response regulator receiver protein  48.33 
 
 
121 aa  133  9e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4991  response regulator receiver protein  48.33 
 
 
121 aa  132  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.353726  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4865  response regulator receiver protein  48.33 
 
 
121 aa  132  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.321258  normal  0.0275279 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0515  response regulator receiver protein  45 
 
 
120 aa  131  1.9999999999999998e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.163432  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0473  response regulator receiver protein  48.33 
 
 
121 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.950452  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1243  response regulator receiver domain-containing protein  50 
 
 
121 aa  128  2.0000000000000002e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.253807 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0130  response regulator receiver  49.56 
 
 
121 aa  127  7.000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2551  response regulator receiver domain-containing protein  48.21 
 
 
121 aa  124  3e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01603  PilH  49.11 
 
 
120 aa  121  3e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.376187  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1062  response regulator receiver protein  42.02 
 
 
120 aa  121  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58489  hitchhiker  0.0000344775 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3689  response regulator receiver protein  44.55 
 
 
121 aa  120  5e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.443278  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3898  response regulator receiver  46.67 
 
 
121 aa  120  7e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1264  response regulator receiver protein  45.45 
 
 
122 aa  119  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0578681  hitchhiker  0.00155192 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1234  response regulator receiver protein  45.45 
 
 
122 aa  119  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0059  response regulator receiver domain-containing protein  41.53 
 
 
125 aa  116  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.157498  normal  0.212271 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0508  response regulator receiver domain-containing protein  45.38 
 
 
121 aa  115  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.481314  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3088  response regulator receiver protein  45.54 
 
 
120 aa  115  1.9999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.224006 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0522  response regulator receiver domain-containing protein  41.23 
 
 
120 aa  115  3e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1573  response regulator receiver protein  44.95 
 
 
121 aa  113  6.9999999999999995e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.146471 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3970  response regulator receiver protein  44.55 
 
 
121 aa  113  7.999999999999999e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0244969 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0902  response regulator receiver protein  44.95 
 
 
121 aa  113  1.0000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.844306 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2795  response regulator receiver protein  41.53 
 
 
121 aa  112  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3577  response regulator receiver protein  44.95 
 
 
121 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.400966  normal  0.141746 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4625  response regulator receiver protein  44.55 
 
 
121 aa  112  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.635313  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2900  response regulator receiver protein  44.95 
 
 
121 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.197839  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0613  response regulator receiver protein  43.97 
 
 
122 aa  110  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.242329  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0561  response regulator receiver protein  43.97 
 
 
122 aa  110  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.718467 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3248  response regulator receiver protein  39.5 
 
 
121 aa  111  4.0000000000000004e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.500247 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3020  response regulator receiver protein  44.95 
 
 
121 aa  110  5e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.447611  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3661  response regulator receiver protein  44.64 
 
 
120 aa  110  5e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.442071  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4952  response regulator receiver protein  42.86 
 
 
121 aa  110  5e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.699568  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3747  response regulator receiver protein  41.18 
 
 
121 aa  110  6e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3990  response regulator receiver protein  40.87 
 
 
146 aa  110  6e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.27172  normal  0.4632 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0669  putative twitching motility two-component response regulator transcription regulator protein  43.97 
 
 
122 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1372  response regulator receiver domain-containing protein  44.55 
 
 
121 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0313107  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3968  response regulator receiver protein  41.38 
 
 
125 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3000  response regulator receiver protein  40.34 
 
 
124 aa  108  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0722  response regulator receiver protein  39.67 
 
 
121 aa  108  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0751  response regulator receiver protein  39.67 
 
 
121 aa  108  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1911  two component transcriptional regulator  44.55 
 
 
229 aa  107  5e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.258551 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3189  twitching motility protein  43.75 
 
 
121 aa  107  5e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.612166  normal  0.249154 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3353  response regulator receiver protein  42.73 
 
 
121 aa  107  5e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.392561  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2622  response regulator receiver  45.45 
 
 
123 aa  107  6e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1137  response regulator receiver domain-containing protein  43.64 
 
 
121 aa  107  8.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.635456 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0670  response regulator receiver domain-containing protein  42.86 
 
 
122 aa  105  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00691443  normal  0.823575 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0856  response regulator receiver domain-containing protein  36.44 
 
 
120 aa  104  5e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0758877  normal  0.0586548 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1955  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.39 
 
 
236 aa  103  8e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.295041  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1901  response regulator receiver protein  40.17 
 
 
125 aa  102  2e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4743  response regulator receiver protein  37.4 
 
 
125 aa  102  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00329385 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1221  response regulator receiver domain-containing protein  42.06 
 
 
125 aa  101  4e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2892  two component transcriptional regulator  38.58 
 
 
227 aa  101  4e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0239565 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0695  response regulator receiver  38.53 
 
 
170 aa  100  5e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.412637  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2308  response regulator receiver protein  40.34 
 
 
123 aa  99.8  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2507  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  39.83 
 
 
488 aa  99  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.182398 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0631  response regulator receiver protein  41.18 
 
 
123 aa  99  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0640  response regulator receiver protein  40.34 
 
 
123 aa  98.6  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0650  response regulator receiver protein  40.34 
 
 
123 aa  99  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.438565  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2780  response regulator receiver protein  37.82 
 
 
121 aa  99  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.76051 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3337  response regulator receiver protein  37.82 
 
 
121 aa  99  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4136  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  41.44 
 
 
440 aa  97.8  4e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000660181  hitchhiker  0.00876613 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2044  response regulator receiver protein  36.36 
 
 
123 aa  97.8  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0300859  normal  0.405857 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1501  response regulator receiver protein  42.02 
 
 
132 aa  97.8  5e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.153095  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3061  two component transcriptional regulator  41.44 
 
 
227 aa  97.4  6e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.799336  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2219  response regulator  36.97 
 
 
123 aa  96.7  9e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0606  response regulator receiver domain-containing protein  40.34 
 
 
123 aa  96.7  9e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2960  response regulator receiver  31.93 
 
 
190 aa  96.7  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0852903  normal  0.915615 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1748  response regulator receiver  40.87 
 
 
123 aa  96.3  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.122601  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2029  response regulator receiver protein  37.29 
 
 
124 aa  96.7  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.371136 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2789  response regulator receiver protein  37.82 
 
 
121 aa  96.7  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1805  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  37.27 
 
 
310 aa  96.7  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0638722  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1706  response regulator receiver protein  37.01 
 
 
131 aa  96.3  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5066  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  36.36 
 
 
338 aa  95.9  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2562  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  40.37 
 
 
437 aa  95.9  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0669  response regulator receiver protein  41.44 
 
 
123 aa  95.9  2e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0251  response regulator receiver protein  31.4 
 
 
126 aa  94.7  3e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.102048 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2356  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.72 
 
 
602 aa  94.7  4e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0221  GAF sensor hybrid histidine kinase  41.82 
 
 
1651 aa  94.4  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3778  response regulator receiver domain-containing protein  38.84 
 
 
124 aa  94.4  5e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1423  response regulator receiver protein  35.59 
 
 
119 aa  94  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.24081  normal  0.185499 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2387  two component transcriptional regulator  40 
 
 
229 aa  94  6e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00115026  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0804  two component transcriptional regulator  35.61 
 
 
236 aa  94  6e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.324741  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2492  response regulator receiver  38.66 
 
 
352 aa  94  6e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.570528  normal  0.0101485 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>