More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3353 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_3353  response regulator receiver protein  100 
 
 		 121 aa  249  7e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.392561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1137  response regulator receiver domain-containing protein  92.56 
 
 		 121 aa  235  1e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.635456 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4625  response regulator receiver protein  82.64 
 
 		 121 aa  213  5e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.635313  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2900  response regulator receiver protein  83.47 
 
 		 121 aa  211  1.9999999999999998e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.197839  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3577  response regulator receiver protein  83.47 
 
 		 121 aa  211  1.9999999999999998e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.400966  normal  0.141746 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1573  response regulator receiver protein  81.82 
 
 		 121 aa  212  1.9999999999999998e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.146471 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3020  response regulator receiver protein  83.47 
 
 		 121 aa  211  2.9999999999999995e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.447611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0902  response regulator receiver protein  82.64 
 
 		 121 aa  210  4.9999999999999996e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844306 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1372  response regulator receiver domain-containing protein  78.51 
 
 		 121 aa  202  1e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0313107  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3189  twitching motility protein  73.33 
 
 		 121 aa  195  2.0000000000000003e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.612166  normal  0.249154 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3970  response regulator receiver protein  71.9 
 
 		 121 aa  194  3e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0244969 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2622  response regulator receiver  62.5 
 
 		 123 aa  162  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0670  response regulator receiver domain-containing protein  60.33 
 
 		 122 aa  159  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00691443  normal  0.823575 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0561  response regulator receiver protein  61.16 
 
 		 122 aa  154  4e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.718467 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0613  response regulator receiver protein  61.16 
 
 		 122 aa  154  4e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.242329  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0669  putative twitching motility two-component response regulator transcription regulator protein  60 
 
 		 122 aa  154  5.0000000000000005e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3689  response regulator receiver protein  58.68 
 
 		 121 aa  154  6e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.443278  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2551  response regulator receiver domain-containing protein  54.55 
 
 		 121 aa  146  7e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1243  response regulator receiver domain-containing protein  54.7 
 
 		 121 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.253807 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3898  response regulator receiver  55 
 
 		 121 aa  143  6e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2903  response regulator receiver protein  52.59 
 
 		 120 aa  134  3.0000000000000003e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.629195  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0489  response regulator receiver  51.72 
 
 		 121 aa  131  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.646514  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5033  type IV pilus response regulator PilH  51.72 
 
 		 121 aa  130  5e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3633  response regulator receiver domain-containing protein  53.1 
 
 		 120 aa  130  6e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.480345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5041  response regulator receiver protein  50.88 
 
 		 121 aa  130  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4991  response regulator receiver protein  50.88 
 
 		 121 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.353726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4865  response regulator receiver protein  50.88 
 
 		 121 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.321258  normal  0.0275279 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0509  twitching motility protein PilH  50.86 
 
 		 121 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0473  response regulator receiver protein  51.33 
 
 		 121 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.950452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05330  twitching motility protein PilH  50.86 
 
 		 121 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3768  response regulator receiver protein  50 
 
 		 120 aa  126  9.000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48045  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0404  response regulator receiver protein  48.28 
 
 		 121 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5307  response regulator receiver domain-containing protein  51.82 
 
 		 121 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0137607  normal  0.215998 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0130  response regulator receiver  53.04 
 
 		 121 aa  125  2.0000000000000002e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0515  response regulator receiver protein  46.85 
 
 		 120 aa  125  2.0000000000000002e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.163432  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1817  putative two-component response regulator  51.79 
 
 		 120 aa  122  1e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2399  response regulator receiver protein  48.67 
 
 		 121 aa  123  1e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.732485 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2100  response regulator receiver domain-containing protein  50.43 
 
 		 120 aa  121  3e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2158  response regulator receiver protein  46.61 
 
 		 120 aa  120  6e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4743  response regulator receiver protein  49.14 
 
 		 125 aa  117  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00329385 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0059  response regulator receiver domain-containing protein  44.07 
 
 		 125 aa  117  6e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.157498  normal  0.212271 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0356  response regulator receiver protein  46.55 
 
 		 121 aa  117  6e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0780111  normal  0.957515 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01603  PilH  43.97 
 
 		 120 aa  116  9e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.376187  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3088  response regulator receiver protein  44.83 
 
 		 120 aa  116  9.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.224006 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1264  response regulator receiver protein  44.35 
 
 		 122 aa  111  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0578681  hitchhiker  0.00155192 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1234  response regulator receiver protein  44.35 
 
 		 122 aa  111  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3248  response regulator receiver protein  42.37 
 
 		 121 aa  111  4.0000000000000004e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.500247 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3018  response regulator receiver protein  46.79 
 
 		 123 aa  110  5e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.454082 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02637  regulatory protein PilH family  45.45 
 
 		 128 aa  110  9e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0508  response regulator receiver domain-containing protein  41.74 
 
 		 121 aa  109  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.481314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0856  response regulator receiver domain-containing protein  38.26 
 
 		 120 aa  109  1.0000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0758877  normal  0.0586548 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1062  response regulator receiver protein  40 
 
 		 120 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58489  hitchhiker  0.0000344775 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3000  response regulator receiver protein  39.83 
 
 		 124 aa  107  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1724  response regulator receiver protein  42.73 
 
 		 128 aa  107  5e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.999633  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1789  response regulator receiver protein  42.73 
 
 		 128 aa  107  5e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2795  response regulator receiver protein  40.52 
 
 		 121 aa  107  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2789  response regulator receiver protein  42.11 
 
 		 121 aa  107  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0522  response regulator receiver domain-containing protein  43.59 
 
 		 120 aa  106  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4952  response regulator receiver protein  40.87 
 
 		 121 aa  106  1e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.699568  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3661  response regulator receiver protein  44.44 
 
 		 120 aa  105  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.442071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2709  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.88 
 
 		 236 aa  104  4e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0011921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2575  chitin degradation sensor protein  42.11 
 
 		 1127 aa  104  5e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1423  response regulator receiver protein  39.13 
 
 		 119 aa  103  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.24081  normal  0.185499 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4285  response regulator receiver protein  39.32 
 
 		 122 aa  103  7e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4345  response regulator receiver protein  39.32 
 
 		 122 aa  103  7e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3968  response regulator receiver protein  40.87 
 
 		 125 aa  103  9e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0722  response regulator receiver protein  37.29 
 
 		 121 aa  102  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0045  adenylate/guanylate cyclase  41.74 
 
 		 382 aa  103  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0751  response regulator receiver protein  37.29 
 
 		 121 aa  102  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3106  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  42.74 
 
 		 229 aa  102  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3747  response regulator receiver protein  37.29 
 
 		 121 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4605  response regulator receiver protein  35.59 
 
 		 120 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.509614 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2915  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  42.74 
 
 		 229 aa  101  4e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3776  response regulator receiver domain-containing protein  37.93 
 
 		 120 aa  101  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.143561 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1236  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  42.48 
 
 		 386 aa  101  4e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.493129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0717  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 115 aa  100  6e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1221  response regulator receiver domain-containing protein  41.18 
 
 		 125 aa  100  7e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3302  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  41.88 
 
 		 229 aa  99.8  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1008  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  41.88 
 
 		 229 aa  99.8  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2266  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  39.17 
 
 		 230 aa  99.8  1e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3286  phosphate regulon transcriptional regulatory protein  40.83 
 
 		 230 aa  99  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0413143 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4530  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  41.59 
 
 		 386 aa  98.6  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3990  response regulator receiver protein  38.39 
 
 		 146 aa  99  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.27172  normal  0.4632 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3276  two component transcriptional regulator  41.03 
 
 		 229 aa  98.6  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3136  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  41.03 
 
 		 229 aa  98.6  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1041  two component transcriptional regulator  40.17 
 
 		 229 aa  97.8  4e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.194422 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2002  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.35 
 
 		 306 aa  97.4  5e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3105  DNA-binding response regulator PhoB  39.17 
 
 		 232 aa  97.8  5e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5615  DNA-binding response regulator YycF  39.66 
 
 		 235 aa  97.8  5e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5572  DNA-binding response regulator YycF  39.66 
 
 		 235 aa  97.8  5e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.81316e-29 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5319  DNA-binding response regulator YycF  39.66 
 
 		 235 aa  97.8  5e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.169223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5147  response regulator  39.66 
 
 		 235 aa  97.8  5e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00168683  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5163  response regulator  39.66 
 
 		 235 aa  97.8  5e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00196509  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5715  DNA-binding response regulator YycF  39.66 
 
 		 235 aa  97.8  5e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.656882  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0435  transcriptional regulator PhoB  41.03 
 
 		 229 aa  97.8  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5650  DNA-binding response regulator YycF  39.66 
 
 		 235 aa  97.8  5e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00563499  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0606  response regulator receiver domain-containing protein  40.34 
 
 		 123 aa  97.4  6e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5259  two component transcriptional regulator  39.66 
 
 		 235 aa  97.4  6e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000559572  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1805  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  39.13 
 
 		 310 aa  97.4  6e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0638722  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0867  transcriptional regulator PhoB  41.03 
 
 		 229 aa  97.4  6e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.437737  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>