More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_4743 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_4743  response regulator receiver protein  100 
 
 		 125 aa  259  6e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00329385 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4345  response regulator receiver protein  54.92 
 
 		 122 aa  152  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4285  response regulator receiver protein  54.92 
 
 		 122 aa  152  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3248  response regulator receiver protein  50 
 
 		 121 aa  134  3.0000000000000003e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.500247 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4952  response regulator receiver protein  47.11 
 
 		 121 aa  130  5e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.699568  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0722  response regulator receiver protein  45.08 
 
 		 121 aa  129  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0751  response regulator receiver protein  45.08 
 
 		 121 aa  129  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2900  response regulator receiver protein  52.07 
 
 		 121 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.197839  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0508  response regulator receiver domain-containing protein  46.28 
 
 		 121 aa  129  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.481314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3577  response regulator receiver protein  52.07 
 
 		 121 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.400966  normal  0.141746 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3020  response regulator receiver protein  53.57 
 
 		 121 aa  128  2.0000000000000002e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.447611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0902  response regulator receiver protein  51.24 
 
 		 121 aa  128  3e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844306 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3747  response regulator receiver protein  45.45 
 
 		 121 aa  122  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3000  response regulator receiver protein  42.62 
 
 		 124 aa  122  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1573  response regulator receiver protein  51.79 
 
 		 121 aa  121  4e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.146471 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0856  response regulator receiver domain-containing protein  44.83 
 
 		 120 aa  119  9.999999999999999e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0758877  normal  0.0586548 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1137  response regulator receiver domain-containing protein  48.28 
 
 		 121 aa  119  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.635456 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1372  response regulator receiver domain-containing protein  50.91 
 
 		 121 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0313107  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3970  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 121 aa  119  1.9999999999999998e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0244969 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1062  response regulator receiver protein  47.41 
 
 		 120 aa  117  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58489  hitchhiker  0.0000344775 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3353  response regulator receiver protein  49.14 
 
 		 121 aa  117  3.9999999999999996e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.392561  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3968  response regulator receiver protein  42.24 
 
 		 125 aa  116  7.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1234  response regulator receiver protein  43.44 
 
 		 122 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2399  response regulator receiver protein  43.8 
 
 		 121 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.732485 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1264  response regulator receiver protein  43.44 
 
 		 122 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0578681  hitchhiker  0.00155192 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4625  response regulator receiver protein  47.01 
 
 		 121 aa  115  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.635313  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3189  twitching motility protein  44.83 
 
 		 121 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.612166  normal  0.249154 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3661  response regulator receiver protein  48.33 
 
 		 120 aa  112  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.442071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2780  response regulator receiver protein  43.1 
 
 		 121 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.76051 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3337  response regulator receiver protein  43.1 
 
 		 121 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2795  response regulator receiver protein  43.44 
 
 		 121 aa  111  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3898  response regulator receiver  46.15 
 
 		 121 aa  110  4.0000000000000004e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0059  response regulator receiver domain-containing protein  44.25 
 
 		 125 aa  110  6e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.157498  normal  0.212271 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3633  response regulator receiver domain-containing protein  42.37 
 
 		 120 aa  110  9e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.480345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2789  response regulator receiver protein  43.1 
 
 		 121 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1423  response regulator receiver protein  38.79 
 
 		 119 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.24081  normal  0.185499 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0356  response regulator receiver protein  47.93 
 
 		 121 aa  109  1.0000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0780111  normal  0.957515 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0669  putative twitching motility two-component response regulator transcription regulator protein  40.68 
 
 		 122 aa  105  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0473  response regulator receiver protein  42.98 
 
 		 121 aa  105  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.950452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0670  response regulator receiver domain-containing protein  41.53 
 
 		 122 aa  104  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00691443  normal  0.823575 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02637  regulatory protein PilH family  38.4 
 
 		 128 aa  103  5e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5041  response regulator receiver protein  42.98 
 
 		 121 aa  104  5e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3990  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 146 aa  103  6e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.27172  normal  0.4632 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2551  response regulator receiver domain-containing protein  42.48 
 
 		 121 aa  103  8e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4991  response regulator receiver protein  42.98 
 
 		 121 aa  102  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.353726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4865  response regulator receiver protein  42.98 
 
 		 121 aa  102  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.321258  normal  0.0275279 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1221  response regulator receiver domain-containing protein  44.95 
 
 		 125 aa  103  1e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0515  response regulator receiver protein  37.19 
 
 		 120 aa  102  2e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.163432  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0509  twitching motility protein PilH  40 
 
 		 121 aa  102  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1724  response regulator receiver protein  37.4 
 
 		 128 aa  102  2e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.999633  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0404  response regulator receiver protein  40 
 
 		 121 aa  102  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3776  response regulator receiver domain-containing protein  37.93 
 
 		 120 aa  102  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.143561 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0130  response regulator receiver  41.32 
 
 		 121 aa  102  2e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05330  twitching motility protein PilH  40 
 
 		 121 aa  102  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1789  response regulator receiver protein  37.4 
 
 		 128 aa  102  2e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5307  response regulator receiver domain-containing protein  40 
 
 		 121 aa  101  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0137607  normal  0.215998 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0489  response regulator receiver  39.17 
 
 		 121 aa  100  5e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.646514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2622  response regulator receiver  42.11 
 
 		 123 aa  100  5e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2903  response regulator receiver protein  39.66 
 
 		 120 aa  100  7e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.629195  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3689  response regulator receiver protein  40.52 
 
 		 121 aa  100  8e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.443278  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3210  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  42.02 
 
 		 337 aa  99.8  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.32327  normal  0.712325 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0613  response regulator receiver protein  40.68 
 
 		 122 aa  99.8  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.242329  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0561  response regulator receiver protein  40.68 
 
 		 122 aa  99.8  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.718467 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1422  response regulator receiver protein  36.67 
 
 		 119 aa  99.8  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.153955  normal  0.123704 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5033  type IV pilus response regulator PilH  39.17 
 
 		 121 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3768  response regulator receiver protein  38.52 
 
 		 120 aa  98.6  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48045  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1243  response regulator receiver domain-containing protein  38.98 
 
 		 121 aa  98.2  4e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.253807 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0717  response regulator receiver protein  41.44 
 
 		 115 aa  97.4  6e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3302  two component transcriptional regulator  42.98 
 
 		 230 aa  96.7  9e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.288231  normal  0.346827 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0522  response regulator receiver domain-containing protein  39.13 
 
 		 120 aa  96.7  9e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0707  two component transcriptional regulator  40.16 
 
 		 232 aa  95.9  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21640  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.34 
 
 		 226 aa  95.5  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000176926  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1419  two component transcriptional regulator  40.16 
 
 		 231 aa  95.5  2e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0720218  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4605  response regulator receiver protein  38.94 
 
 		 120 aa  95.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.509614 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1817  putative two-component response regulator  40.5 
 
 		 120 aa  95.1  3e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0227  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  40.5 
 
 		 236 aa  94.4  5e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0969  two component transcriptional regulator  38.21 
 
 		 226 aa  93.6  9e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.165699  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1694  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.28 
 
 		 236 aa  93.2  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000906935 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2844  two component transcriptional regulator  38.4 
 
 		 248 aa  92.8  1e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0951  response regulator receiver protein  39.82 
 
 		 239 aa  92.8  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000111905  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0467  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.54 
 
 		 230 aa  92  2e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2158  response regulator receiver protein  40.52 
 
 		 120 aa  92.4  2e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4009  two component transcriptional regulator  34.68 
 
 		 230 aa  91.7  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00751412  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3018  response regulator receiver protein  40.18 
 
 		 123 aa  91.7  3e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.454082 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0772  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.28 
 
 		 233 aa  91.7  3e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.07 
 
 		 234 aa  91.3  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.178035  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1197  response regulator receiver  37.1 
 
 		 230 aa  91.3  4e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01603  PilH  37.19 
 
 		 120 aa  91.3  4e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.376187  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0398  two component transcriptional regulator  36.97 
 
 		 246 aa  90.9  5e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.761758 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1077  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.6 
 
 		 235 aa  90.9  5e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1955  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.89 
 
 		 236 aa  90.9  6e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.295041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1941  response regulator receiver domain-containing protein  38.05 
 
 		 156 aa  90.9  6e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2188  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  40.35 
 
 		 384 aa  90.9  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00677544 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1242  response regulator receiver protein  39.02 
 
 		 138 aa  90.5  7e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.390656 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1600  two component transcriptional regulator  37.29 
 
 		 224 aa  90.5  7e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000237714  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4151  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.28 
 
 		 230 aa  90.5  7e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0809  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 367 aa  90.5  7e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4125  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.28 
 
 		 230 aa  90.5  8e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.125271  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2892  two component transcriptional regulator  33.88 
 
 		 227 aa  90.1  8e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0239565 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0867  transcriptional regulator PhoB  37.07 
 
 		 229 aa  89.4  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.437737  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>