More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_2780 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_3337  response regulator receiver protein  100 
 
 
121 aa  244  3e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2780  response regulator receiver protein  100 
 
 
121 aa  244  3e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.76051 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2789  response regulator receiver protein  72.73 
 
 
121 aa  184  5e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3747  response regulator receiver protein  50.83 
 
 
121 aa  148  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3776  response regulator receiver domain-containing protein  60.17 
 
 
120 aa  148  2e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.143561 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3248  response regulator receiver protein  50 
 
 
121 aa  140  6e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.500247 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0508  response regulator receiver domain-containing protein  50.41 
 
 
121 aa  140  8e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.481314  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1423  response regulator receiver protein  54.62 
 
 
119 aa  138  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.24081  normal  0.185499 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4952  response regulator receiver protein  49.59 
 
 
121 aa  138  3e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.699568  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3000  response regulator receiver protein  49.17 
 
 
124 aa  133  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1234  response regulator receiver protein  51.26 
 
 
122 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1264  response regulator receiver protein  51.26 
 
 
122 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0578681  hitchhiker  0.00155192 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0059  response regulator receiver domain-containing protein  49.58 
 
 
125 aa  130  7.999999999999999e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.157498  normal  0.212271 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1422  response regulator receiver protein  50.42 
 
 
119 aa  127  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.153955  normal  0.123704 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0856  response regulator receiver domain-containing protein  48.31 
 
 
120 aa  127  5.0000000000000004e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0758877  normal  0.0586548 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1062  response regulator receiver protein  47.9 
 
 
120 aa  127  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58489  hitchhiker  0.0000344775 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0722  response regulator receiver protein  46.28 
 
 
121 aa  125  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0751  response regulator receiver protein  46.28 
 
 
121 aa  125  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2795  response regulator receiver protein  47.41 
 
 
121 aa  122  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2551  response regulator receiver domain-containing protein  48.25 
 
 
121 aa  120  7e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3968  response regulator receiver protein  42.15 
 
 
125 aa  119  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3661  response regulator receiver protein  43.7 
 
 
120 aa  116  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.442071  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0717  response regulator receiver protein  48.25 
 
 
115 aa  115  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4743  response regulator receiver protein  43.1 
 
 
125 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00329385 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3990  response regulator receiver protein  41.28 
 
 
146 aa  109  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.27172  normal  0.4632 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3189  twitching motility protein  41.23 
 
 
121 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.612166  normal  0.249154 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2399  response regulator receiver protein  39.67 
 
 
121 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.732485 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3970  response regulator receiver protein  41.23 
 
 
121 aa  108  2.0000000000000002e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0244969 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3898  response regulator receiver  43.86 
 
 
121 aa  108  3e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3633  response regulator receiver domain-containing protein  41.53 
 
 
120 aa  108  3e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.480345  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0130  response regulator receiver  43.7 
 
 
121 aa  107  4.0000000000000004e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01603  PilH  40.83 
 
 
120 aa  107  4.0000000000000004e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.376187  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4285  response regulator receiver protein  36.07 
 
 
122 aa  105  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4345  response regulator receiver protein  36.07 
 
 
122 aa  105  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114649  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0669  putative twitching motility two-component response regulator transcription regulator protein  42.11 
 
 
122 aa  105  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0489  response regulator receiver  42.02 
 
 
121 aa  105  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.646514  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2622  response regulator receiver  42.11 
 
 
123 aa  105  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1573  response regulator receiver protein  45.63 
 
 
121 aa  105  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.146471 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0509  twitching motility protein PilH  42.86 
 
 
121 aa  105  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1372  response regulator receiver domain-containing protein  42.98 
 
 
121 aa  105  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0313107  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1243  response regulator receiver domain-containing protein  41.23 
 
 
121 aa  105  2e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.253807 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0670  response regulator receiver domain-containing protein  41.23 
 
 
122 aa  105  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00691443  normal  0.823575 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05330  twitching motility protein PilH  42.86 
 
 
121 aa  105  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5033  type IV pilus response regulator PilH  42.02 
 
 
121 aa  104  3e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3689  response regulator receiver protein  39.47 
 
 
121 aa  105  3e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.443278  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0404  response regulator receiver protein  42.02 
 
 
121 aa  105  3e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1221  response regulator receiver domain-containing protein  42.99 
 
 
125 aa  103  6e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2900  response regulator receiver protein  41.75 
 
 
121 aa  103  6e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.197839  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3577  response regulator receiver protein  41.75 
 
 
121 aa  103  6e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.400966  normal  0.141746 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0561  response regulator receiver protein  41.23 
 
 
122 aa  103  9e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.718467 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0613  response regulator receiver protein  41.23 
 
 
122 aa  103  9e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.242329  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3020  response regulator receiver protein  41.75 
 
 
121 aa  103  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.447611  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02637  regulatory protein PilH family  41.18 
 
 
128 aa  102  1e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5307  response regulator receiver domain-containing protein  40.34 
 
 
121 aa  102  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0137607  normal  0.215998 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3210  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  43.7 
 
 
337 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.32327  normal  0.712325 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4625  response regulator receiver protein  39.47 
 
 
121 aa  102  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.635313  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0902  response regulator receiver protein  40.78 
 
 
121 aa  102  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.844306 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3768  response regulator receiver protein  40.34 
 
 
120 aa  102  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48045  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2158  response regulator receiver protein  37.82 
 
 
120 aa  101  3e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1817  putative two-component response regulator  40 
 
 
120 aa  100  5e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2100  response regulator receiver domain-containing protein  38.33 
 
 
120 aa  100  5e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2903  response regulator receiver protein  41.18 
 
 
120 aa  100  6e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.629195  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4605  response regulator receiver protein  38.66 
 
 
120 aa  100  8e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.509614 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1137  response regulator receiver domain-containing protein  38.6 
 
 
121 aa  100  8e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.635456 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1789  response regulator receiver protein  37.82 
 
 
128 aa  99  2e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3088  response regulator receiver protein  40.34 
 
 
120 aa  99  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.224006 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1724  response regulator receiver protein  37.82 
 
 
128 aa  99  2e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.999633  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0515  response regulator receiver protein  39.29 
 
 
120 aa  98.6  3e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.163432  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3018  response regulator receiver protein  37.82 
 
 
123 aa  97.8  4e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.454082 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3353  response regulator receiver protein  37.72 
 
 
121 aa  97.1  7e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.392561  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1246  CheA signal transduction histidine kinases  39.66 
 
 
1643 aa  96.7  8e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0708097  normal  0.755815 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0725  CheA signal transduction histidine kinase  43.1 
 
 
762 aa  96.7  9e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0356  response regulator receiver protein  36.97 
 
 
121 aa  96.7  9e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0780111  normal  0.957515 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0567  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.52 
 
 
225 aa  95.1  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.463355  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4991  response regulator receiver protein  35.29 
 
 
121 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.353726  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4865  response regulator receiver protein  35.29 
 
 
121 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.321258  normal  0.0275279 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0473  response regulator receiver protein  34.45 
 
 
121 aa  94.4  4e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.950452  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2472  response regulator receiver protein  39.83 
 
 
216 aa  94.4  5e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0522  response regulator receiver domain-containing protein  38.05 
 
 
120 aa  94.4  5e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5041  response regulator receiver protein  34.45 
 
 
121 aa  94  7e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2513  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.33 
 
 
225 aa  94  7e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0793  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.33 
 
 
225 aa  93.2  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2106  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.07 
 
 
238 aa  92.8  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1257  two component transcriptional regulator  40.68 
 
 
229 aa  92.8  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.536699  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1756  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.5 
 
 
230 aa  92.4  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.769657  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2910  response regulator receiver  37.5 
 
 
230 aa  92.4  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4322  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.5 
 
 
231 aa  92.4  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0986  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  40.18 
 
 
433 aa  92.4  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0645349  normal  0.624976 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1865  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.5 
 
 
226 aa  92  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4171  CheA signal transduction histidine kinase  42.86 
 
 
686 aa  91.7  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1419  two component transcriptional regulator  39.17 
 
 
231 aa  91.3  4e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0720218  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2798  response regulator receiver modulated serine phosphatase  40.98 
 
 
538 aa  91.3  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1518  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  40.71 
 
 
767 aa  91.3  4e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0706082  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0912  response regulator receiver protein  38.33 
 
 
118 aa  90.9  5e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.616011 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0216  two component transcriptional regulator  38.79 
 
 
230 aa  90.9  5e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.305183 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2294  two component transcriptional regulator  40.52 
 
 
228 aa  90.9  5e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.305192  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0961  response regulator receiver protein  35.83 
 
 
229 aa  90.5  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2231  two component transcriptional regulator  37.82 
 
 
234 aa  90.9  6e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1997  two component transcriptional regulator  37.29 
 
 
234 aa  90.5  7e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000742772  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2149  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  42.99 
 
 
407 aa  90.5  7e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.142048 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>