More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_1234 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011726  PCC8801_1234  response regulator receiver protein  100 
 
 		 122 aa  249  1e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1264  response regulator receiver protein  100 
 
 		 122 aa  249  1e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0578681  hitchhiker  0.00155192 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4952  response regulator receiver protein  55.46 
 
 		 121 aa  154  4e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.699568  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0508  response regulator receiver domain-containing protein  55.46 
 
 		 121 aa  154  4e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.481314  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3000  response regulator receiver protein  54.62 
 
 		 124 aa  150  5e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3747  response regulator receiver protein  51.26 
 
 		 121 aa  147  7e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3248  response regulator receiver protein  50.42 
 
 		 121 aa  143  7.0000000000000006e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.500247 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0722  response regulator receiver protein  48.74 
 
 		 121 aa  140  7e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0751  response regulator receiver protein  48.74 
 
 		 121 aa  140  7e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1062  response regulator receiver protein  45.38 
 
 		 120 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58489  hitchhiker  0.0000344775 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3337  response regulator receiver protein  51.26 
 
 		 121 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2780  response regulator receiver protein  51.26 
 
 		 121 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.76051 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3661  response regulator receiver protein  47.9 
 
 		 120 aa  130  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.442071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0856  response regulator receiver domain-containing protein  44.92 
 
 		 120 aa  127  5.0000000000000004e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0758877  normal  0.0586548 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3968  response regulator receiver protein  43.7 
 
 		 125 aa  122  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2795  response regulator receiver protein  44.92 
 
 		 121 aa  121  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0613  response regulator receiver protein  47.83 
 
 		 122 aa  121  3e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.242329  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0561  response regulator receiver protein  47.83 
 
 		 122 aa  121  3e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.718467 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02637  regulatory protein PilH family  47.93 
 
 		 128 aa  121  3e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2789  response regulator receiver protein  50.42 
 
 		 121 aa  121  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0356  response regulator receiver protein  47.5 
 
 		 121 aa  120  4e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0780111  normal  0.957515 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3990  response regulator receiver protein  49.54 
 
 		 146 aa  120  9e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.27172  normal  0.4632 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1789  response regulator receiver protein  45.45 
 
 		 128 aa  119  9.999999999999999e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1724  response regulator receiver protein  45.45 
 
 		 128 aa  119  9.999999999999999e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.999633  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2551  response regulator receiver domain-containing protein  43.22 
 
 		 121 aa  118  3e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3970  response regulator receiver protein  45.13 
 
 		 121 aa  118  3e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0244969 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0669  putative twitching motility two-component response regulator transcription regulator protein  46.09 
 
 		 122 aa  117  3.9999999999999996e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1422  response regulator receiver protein  46.22 
 
 		 119 aa  117  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.153955  normal  0.123704 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1243  response regulator receiver domain-containing protein  46.96 
 
 		 121 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.253807 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1423  response regulator receiver protein  41.18 
 
 		 119 aa  116  7.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.24081  normal  0.185499 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3776  response regulator receiver domain-containing protein  46.61 
 
 		 120 aa  115  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.143561 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4743  response regulator receiver protein  43.44 
 
 		 125 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00329385 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4625  response regulator receiver protein  46.96 
 
 		 121 aa  115  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.635313  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1221  response regulator receiver domain-containing protein  50 
 
 		 125 aa  114  3.9999999999999997e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0130  response regulator receiver  47.06 
 
 		 121 aa  114  6e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2903  response regulator receiver protein  43.33 
 
 		 120 aa  112  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.629195  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2158  response regulator receiver protein  41.67 
 
 		 120 aa  112  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0059  response regulator receiver domain-containing protein  40.52 
 
 		 125 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.157498  normal  0.212271 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3018  response regulator receiver protein  45.53 
 
 		 123 aa  112  2.0000000000000002e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.454082 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2100  response regulator receiver domain-containing protein  42.02 
 
 		 120 aa  112  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3353  response regulator receiver protein  44.35 
 
 		 121 aa  111  3e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.392561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2622  response regulator receiver  43.8 
 
 		 123 aa  111  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1137  response regulator receiver domain-containing protein  44.35 
 
 		 121 aa  110  4.0000000000000004e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.635456 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0670  response regulator receiver domain-containing protein  40.68 
 
 		 122 aa  110  6e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00691443  normal  0.823575 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3898  response regulator receiver  43.48 
 
 		 121 aa  110  7.000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3189  twitching motility protein  43.36 
 
 		 121 aa  110  8.000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.612166  normal  0.249154 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3689  response regulator receiver protein  40.87 
 
 		 121 aa  110  8.000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.443278  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0654  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 120 aa  110  9e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.54464 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4605  response regulator receiver protein  40.83 
 
 		 120 aa  107  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.509614 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1756  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.83 
 
 		 230 aa  107  8.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.769657  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1817  putative two-component response regulator  39.5 
 
 		 120 aa  106  1e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4345  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 122 aa  105  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4285  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 122 aa  105  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2900  response regulator receiver protein  42.61 
 
 		 121 aa  104  3e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.197839  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1372  response regulator receiver domain-containing protein  41.74 
 
 		 121 aa  104  3e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0313107  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3020  response regulator receiver protein  42.61 
 
 		 121 aa  104  3e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.447611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3577  response regulator receiver protein  42.61 
 
 		 121 aa  104  3e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.400966  normal  0.141746 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1573  response regulator receiver protein  42.61 
 
 		 121 aa  104  4e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.146471 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3633  response regulator receiver domain-containing protein  38.14 
 
 		 120 aa  104  5e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.480345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2399  response regulator receiver protein  38.66 
 
 		 121 aa  104  5e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.732485 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1028  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.82 
 
 		 237 aa  103  6e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2401  phosphate regulon transcriptional regulatory protein phoB  38.52 
 
 		 229 aa  103  7e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0902  response regulator receiver protein  41.74 
 
 		 121 aa  103  7e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844306 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1874  response regulator receiver protein  38.52 
 
 		 320 aa  103  8e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.420153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1257  two component transcriptional regulator  43.59 
 
 		 229 aa  103  8e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.536699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2177  response regulator receiver protein  38.66 
 
 		 120 aa  102  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3942  response regulator receiver protein  43.33 
 
 		 163 aa  102  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0489  response regulator receiver  38.66 
 
 		 121 aa  102  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.646514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3768  response regulator receiver protein  39.17 
 
 		 120 aa  102  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48045  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5041  response regulator receiver protein  36.67 
 
 		 121 aa  101  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1924  two component transcriptional regulator  39.5 
 
 		 230 aa  101  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.781724  normal  0.399122 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1955  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.86 
 
 		 236 aa  102  3e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.295041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4125  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.6 
 
 		 230 aa  101  4e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.125271  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4151  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.6 
 
 		 230 aa  101  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2599  phosphate regulon transcriptional regulator, PhoR  38.66 
 
 		 230 aa  100  5e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1257  two component transcriptional regulator  38.66 
 
 		 230 aa  100  5e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.621627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0473  response regulator receiver protein  36.67 
 
 		 121 aa  100  7e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.950452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4379  response regulator receiver protein  36.97 
 
 		 120 aa  100  7e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2892  two component transcriptional regulator  38.66 
 
 		 227 aa  100  7e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0239565 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4991  response regulator receiver protein  36.67 
 
 		 121 aa  100  8e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.353726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4865  response regulator receiver protein  36.67 
 
 		 121 aa  100  8e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.321258  normal  0.0275279 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4009  two component transcriptional regulator  36.8 
 
 		 230 aa  100  8e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00751412  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1419  two component transcriptional regulator  40.34 
 
 		 231 aa  99.8  1e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0720218  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2981  two component transcriptional regulator  39.66 
 
 		 229 aa  99.8  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000201285  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2150  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  42.24 
 
 		 443 aa  99.8  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.394463 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  41.18 
 
 		 229 aa  99.8  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01603  PilH  38.66 
 
 		 120 aa  100  1e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.376187  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1911  two component transcriptional regulator  37.93 
 
 		 229 aa  98.6  2e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.258551 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1538  phosphate regulon transcriptional regulatory protein  39.32 
 
 		 228 aa  99  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.280381 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1011  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.38 
 
 		 231 aa  99.4  2e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3065  response regulator receiver protein  36.13 
 
 		 120 aa  99  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3791  response regulator receiver protein  36.13 
 
 		 120 aa  99  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0845  response regulator receiver protein  41.53 
 
 		 125 aa  98.6  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.455865  normal  0.167506 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01871  two-component response regulator  38.79 
 
 		 242 aa  98.6  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0268  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.66 
 
 		 227 aa  99.4  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.509377 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0522  response regulator receiver domain-containing protein  36.21 
 
 		 120 aa  99  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2096  CheA signal transduction histidine kinases  38.33 
 
 		 2301 aa  99  2e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1115  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.52 
 
 		 243 aa  98.2  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0950226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1813  putative hybrid two-component sensor and regulatory protein  40 
 
 		 2284 aa  98.2  3e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.409027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2294  two component transcriptional regulator  40.52 
 
 		 228 aa  98.6  3e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.305192  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>