More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3942 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_3942  response regulator receiver protein  100 
 
 
163 aa  319  9.000000000000001e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0845  response regulator receiver protein  77.12 
 
 
125 aa  181  4.0000000000000006e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.455865  normal  0.167506 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1560  response regulator receiver protein  73.73 
 
 
129 aa  172  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1003  response regulator receiver protein  65.52 
 
 
128 aa  159  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3728  response regulator receiver protein  64.66 
 
 
128 aa  157  8e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.445342 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0315  response regulator receiver protein  60 
 
 
138 aa  150  8e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.198988 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0627  response regulator receiver protein  46.15 
 
 
163 aa  118  3.9999999999999996e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.143116  hitchhiker  0.00307044 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0355  response regulator receiver protein  37.34 
 
 
161 aa  103  7e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.384709  normal  0.97064 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1632  response regulator receiver  40.68 
 
 
123 aa  103  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4150  response regulator receiver protein  40.68 
 
 
125 aa  103  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.583085 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0609  DNA-binding response regulator  42.74 
 
 
231 aa  103  1e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000282114  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1234  response regulator receiver protein  43.33 
 
 
122 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1264  response regulator receiver protein  43.33 
 
 
122 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0578681  hitchhiker  0.00155192 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3767  response regulator receiver protein  38.46 
 
 
130 aa  101  3e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.401563  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3085  CheA signal transduction histidine kinase  41.09 
 
 
2212 aa  101  4e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.284349 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0623  DNA-binding response regulator  42.74 
 
 
231 aa  101  4e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000212568  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1518  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  44.17 
 
 
767 aa  101  5e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0706082  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5515  response regulator receiver protein  47.71 
 
 
134 aa  101  5e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2904  response regulator receiver protein  40.35 
 
 
137 aa  100  7e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01871  two-component response regulator  44.17 
 
 
242 aa  100  9e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2400  response regulator receiver protein  39.53 
 
 
135 aa  100  1e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.726464 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3143  response regulator receiver protein  36.97 
 
 
124 aa  100  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2041  DNA-binding response regulator  40.34 
 
 
225 aa  99  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0972255  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1011  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.25 
 
 
231 aa  99.4  2e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2107  two component LuxR family transcriptional regulator  40.74 
 
 
245 aa  99.8  2e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4011  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.67 
 
 
236 aa  99.4  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0268606  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2101  response regulator receiver domain-containing protein  40 
 
 
125 aa  99.4  2e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1818  two component reponse regulator  40 
 
 
125 aa  98.6  3e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1537  two component LuxR family transcriptional regulator  42.74 
 
 
242 aa  98.6  3e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2951  two component transcriptional regulator  43.97 
 
 
236 aa  99  3e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2427  two component LuxR family transcriptional regulator  41.48 
 
 
245 aa  98.6  3e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.27075  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1242  response regulator receiver protein  41.74 
 
 
138 aa  98.6  3e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.390656 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02441  two-component response regulator  42.74 
 
 
242 aa  98.6  3e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.72299  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3747  response regulator receiver protein  36.13 
 
 
121 aa  98.6  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2062  DNA-binding response regulator  40.34 
 
 
225 aa  98.2  4e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000169038  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2552  response regulator receiver domain-containing protein  40.83 
 
 
130 aa  98.2  5e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1555  response regulator receiver protein  40 
 
 
121 aa  97.8  5e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3089  response regulator receiver protein  36.84 
 
 
133 aa  97.8  5e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.22915 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0843  response regulator receiver protein  38.66 
 
 
122 aa  97.8  5e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.774989  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0707  two component transcriptional regulator  41.38 
 
 
232 aa  97.8  5e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0761  two component transcriptional regulator  45.3 
 
 
229 aa  97.8  6e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3688  response regulator receiver protein  43.36 
 
 
133 aa  97.8  6e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478813  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1991  DNA-binding response regulator  40.52 
 
 
254 aa  97.4  7e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.9362699999999994e-45 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1382  response regulator receiver protein  37.82 
 
 
122 aa  97.4  7e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.997925  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0653  two-component response regulator PhoB  42.74 
 
 
230 aa  97.4  7e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.131558  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0332  response regulator receiver protein  44.14 
 
 
806 aa  97.4  7e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.112355  normal  0.937153 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3000  response regulator receiver protein  35.9 
 
 
124 aa  97.4  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1772  response regulator  40.52 
 
 
254 aa  97.4  8e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0719  DNA-binding response regulator  41.38 
 
 
236 aa  97.1  1e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0951718  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1816  DNA-binding response regulator  39.66 
 
 
254 aa  97.1  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1790  response regulator  39.66 
 
 
254 aa  96.3  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0306127  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0508  twitching motility protein PilG  36.75 
 
 
135 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1955  DNA-binding response regulator  39.66 
 
 
228 aa  96.7  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0403  response regulator receiver protein  37.61 
 
 
135 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1136  response regulator receiver domain-containing protein  40.34 
 
 
132 aa  97.1  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.638067 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2219  response regulator  37.82 
 
 
123 aa  96.3  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1911  two component transcriptional regulator  41.23 
 
 
229 aa  95.9  2e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.258551 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1756  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.98 
 
 
230 aa  95.5  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.769657  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3899  response regulator receiver  41.59 
 
 
136 aa  96.3  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3354  response regulator receiver protein  39.66 
 
 
147 aa  95.9  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.878811  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0092  response regulator receiver protein  39.83 
 
 
120 aa  96.3  2e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4206  CheA signal transduction histidine kinase  37.67 
 
 
741 aa  96.3  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.351121  normal  0.245941 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4937  two component transcriptional regulator  40.34 
 
 
257 aa  95.9  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.565868 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0951  response regulator receiver protein  37.39 
 
 
239 aa  95.5  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000111905  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05320  twitching motility protein PilG  36.75 
 
 
135 aa  96.3  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4992  response regulator receiver protein  40.17 
 
 
133 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.162705  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0893  response regulator receiver protein  35.56 
 
 
138 aa  95.5  3e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.605635  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1962  DNA-binding response regulator  40.17 
 
 
225 aa  95.5  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.597164  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1017  response regulator receiver protein  35.56 
 
 
138 aa  95.5  3e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.88924  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4445  two component transcriptional regulator  43.59 
 
 
229 aa  95.1  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.14031 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5055  two component transcriptional regulator  40.88 
 
 
223 aa  95.5  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0775  response regulator receiver protein  36.97 
 
 
122 aa  95.1  3e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0246849 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4866  response regulator receiver protein  40.17 
 
 
133 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.638507  normal  0.0288736 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5433  DNA-binding response regulator  40.58 
 
 
223 aa  95.1  4e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5379  DNA-binding response regulator  40.58 
 
 
223 aa  95.1  4e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0472  response regulator receiver protein  40.17 
 
 
133 aa  95.1  4e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.418097  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5034  type IV pilus response regulator PilG  36.75 
 
 
136 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0488  response regulator receiver  36.75 
 
 
136 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1498  two component transcriptional regulator  39.5 
 
 
247 aa  94.7  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.220919  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1696  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.66 
 
 
224 aa  95.1  4e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3629  putative CheA signal transduction histidine kinases  36.67 
 
 
2336 aa  94.7  4e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2185  response regulator receiver  41.9 
 
 
356 aa  95.1  4e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0444  DNA-binding response regulator  39.66 
 
 
233 aa  95.1  4e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4944  DNA-binding response regulator  44.83 
 
 
223 aa  94.7  5e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0109954  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4959  DNA-binding response regulator  44.83 
 
 
223 aa  94.7  5e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000160223  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3366  DNA-binding response regulator  40.17 
 
 
225 aa  94.4  5e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.166078  hitchhiker  0.00000000000000126215 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0301  two component LuxR family transcriptional regulator  38.14 
 
 
231 aa  94.7  5e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.54347  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0508  response regulator receiver domain-containing protein  34.45 
 
 
121 aa  94.7  5e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.481314  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5353  DNA-binding response regulator  44.83 
 
 
223 aa  94.7  5e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5308  response regulator receiver domain-containing protein  36.89 
 
 
134 aa  94.7  5e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0630269  normal  0.22086 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01891  two-component response regulator  41.18 
 
 
242 aa  94.4  5e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.991625  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2405  CheA signal transduction histidine kinase  38.36 
 
 
740 aa  94.7  5e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.588075  normal  0.188448 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1071  two component transcriptional regulator, winged helix family  46 
 
 
238 aa  94.7  5e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5113  DNA-binding response regulator  44.83 
 
 
223 aa  94.4  6e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00211772  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5504  DNA-binding response regulator  44.83 
 
 
223 aa  94.4  6e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2159  response regulator receiver protein  39.13 
 
 
129 aa  94.4  6e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0171  two component LuxR family transcriptional regulator  40.34 
 
 
242 aa  94  7e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3248  response regulator receiver protein  34.45 
 
 
121 aa  94.4  7e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.500247 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3742  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.46 
 
 
263 aa  94  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0095  two component transcriptional regulator  39.67 
 
 
249 aa  94  8e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>