More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0845 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_0845  response regulator receiver protein  100 
 
 		 125 aa  248  1e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.455865  normal  0.167506 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1560  response regulator receiver protein  82.4 
 
 		 129 aa  204  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3942  response regulator receiver protein  77.12 
 
 		 163 aa  181  3e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1003  response regulator receiver protein  67.52 
 
 		 128 aa  161  3e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3728  response regulator receiver protein  64.96 
 
 		 128 aa  158  2e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.445342 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0315  response regulator receiver protein  61.86 
 
 		 138 aa  149  8.999999999999999e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.198988 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0627  response regulator receiver protein  47.11 
 
 		 163 aa  120  6e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.143116  hitchhiker  0.00307044 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2219  response regulator  43.97 
 
 		 123 aa  114  5e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3248  response regulator receiver protein  42.37 
 
 		 121 aa  113  8.999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.500247 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3000  response regulator receiver protein  41.53 
 
 		 124 aa  112  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2401  phosphate regulon transcriptional regulatory protein phoB  45.13 
 
 		 229 aa  113  1.0000000000000001e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3747  response regulator receiver protein  41.53 
 
 		 121 aa  111  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1632  response regulator receiver  43.1 
 
 		 123 aa  110  5e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1011  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.35 
 
 		 231 aa  110  5e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5515  response regulator receiver protein  50 
 
 		 134 aa  109  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2308  response regulator receiver protein  41.38 
 
 		 123 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2951  two component transcriptional regulator  44.26 
 
 		 236 aa  107  6e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0142  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.72 
 
 		 221 aa  105  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.709604 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1277  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  46.15 
 
 		 454 aa  105  2e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.410696  normal  0.0388481 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3661  response regulator receiver protein  39.83 
 
 		 120 aa  105  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.442071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1196  response regulator receiver protein  48.74 
 
 		 119 aa  104  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4952  response regulator receiver protein  39.83 
 
 		 121 aa  103  5e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.699568  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1555  response regulator receiver protein  41.53 
 
 		 121 aa  103  6e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1866  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  46.79 
 
 		 326 aa  103  7e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0719  DNA-binding response regulator  44.83 
 
 		 236 aa  103  8e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0951718  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0508  response regulator receiver domain-containing protein  38.98 
 
 		 121 aa  103  8e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.481314  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3105  DNA-binding response regulator PhoB  47.79 
 
 		 232 aa  103  9e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0399  two component transcriptional regulator  46.02 
 
 		 272 aa  103  9e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.802217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5055  two component transcriptional regulator  47.01 
 
 		 223 aa  103  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1873  response regulator receiver  46.79 
 
 		 326 aa  103  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.402703 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3535  response regulator receiver protein  43.86 
 
 		 134 aa  103  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.283754  normal  0.0368978 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4657  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.83 
 
 		 240 aa  102  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2749  two component transcriptional regulator  42.61 
 
 		 241 aa  102  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000593879  unclonable  0.00000330773 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5433  DNA-binding response regulator  47.01 
 
 		 223 aa  102  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0707  two component transcriptional regulator  44.64 
 
 		 232 aa  101  3e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3794  two component transcriptional regulator  47.01 
 
 		 223 aa  101  4e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0280755  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2427  two component LuxR family transcriptional regulator  43.22 
 
 		 245 aa  101  4e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.27075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0843  response regulator receiver protein  39.34 
 
 		 122 aa  101  4e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.774989  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0098  two component transcriptional regulator  44.74 
 
 		 229 aa  101  4e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.761303  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1955  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.96 
 
 		 236 aa  100  5e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.295041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1498  two component transcriptional regulator  43.22 
 
 		 247 aa  100  5e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.220919  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5379  DNA-binding response regulator  46.15 
 
 		 223 aa  100  6e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2155  CheA signal transduction histidine kinase  36.21 
 
 		 1609 aa  100  6e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26531  two-component response regulator  44.44 
 
 		 248 aa  100  6e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0609  DNA-binding response regulator  42.24 
 
 		 231 aa  100  6e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000282114  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4944  DNA-binding response regulator  46.15 
 
 		 223 aa  100  7e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0109954  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4959  DNA-binding response regulator  46.15 
 
 		 223 aa  100  7e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000160223  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5353  DNA-binding response regulator  46.15 
 
 		 223 aa  100  7e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1116  DNA-binding response regulator  43.1 
 
 		 235 aa  100  7e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.310768  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5113  DNA-binding response regulator  46.15 
 
 		 223 aa  100  8e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00211772  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5504  DNA-binding response regulator  46.15 
 
 		 223 aa  100  8e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04130  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  45.22 
 
 		 236 aa  100  8e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.118973  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1950  DNA-binding response regulator  44.83 
 
 		 235 aa  100  8e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.100456  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1485  response regulator receiver  41.38 
 
 		 235 aa  100  8e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.236897  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1911  two component transcriptional regulator  43.86 
 
 		 229 aa  100  9e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.258551 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21640  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.38 
 
 		 226 aa  99.8  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000176926  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0467  response regulator receiver protein  37.93 
 
 		 122 aa  100  1e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5385  DNA-binding response regulator  46.15 
 
 		 223 aa  99.8  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5569  DNA-binding response regulator  46.15 
 
 		 223 aa  99.8  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2892  two component transcriptional regulator  43.59 
 
 		 227 aa  99.8  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0239565 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1518  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  45.37 
 
 		 767 aa  99.4  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0706082  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1234  response regulator receiver protein  41.53 
 
 		 122 aa  98.6  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2937  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.94 
 
 		 243 aa  99  2e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0751  response regulator receiver protein  39.83 
 
 		 121 aa  99  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2302  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.04 
 
 		 243 aa  99  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0452  response regulator receiver protein  36.21 
 
 		 122 aa  98.6  2e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.17051  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0332  response regulator receiver protein  45.37 
 
 		 806 aa  99  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.112355  normal  0.937153 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2107  two component LuxR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 245 aa  99.4  2e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2353  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.04 
 
 		 243 aa  99  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0794558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1696  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.98 
 
 		 224 aa  99  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0722  response regulator receiver protein  39.83 
 
 		 121 aa  99  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0623  DNA-binding response regulator  42.24 
 
 		 231 aa  99  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000212568  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4011  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.38 
 
 		 236 aa  99  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0268606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1264  response regulator receiver protein  41.53 
 
 		 122 aa  98.6  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0578681  hitchhiker  0.00155192 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0951  response regulator receiver protein  40.87 
 
 		 239 aa  99  2e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000111905  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0444  DNA-binding response regulator  41.38 
 
 		 233 aa  99  2e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5261  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.24 
 
 		 237 aa  98.6  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.909356  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1208  phosphate regulon response regulator PhoB  40.35 
 
 		 233 aa  98.2  3e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0825  response regulator receiver  42.24 
 
 		 204 aa  98.6  3e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.751719  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4937  two component transcriptional regulator  43.22 
 
 		 257 aa  98.6  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.565868 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1554  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.12 
 
 		 229 aa  98.6  3e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709514 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2051  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.13 
 
 		 247 aa  97.8  4e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.520505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01621  two-component response regulator  44.44 
 
 		 248 aa  98.2  4e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.367767  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1220  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.67 
 
 		 233 aa  97.8  4e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00991602 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3742  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.38 
 
 		 263 aa  98.2  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0558  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.09 
 
 		 237 aa  97.4  5e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2185  response regulator receiver  39.45 
 
 		 356 aa  97.4  5e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5207  winged helix family two component transcriptional regulator  42.37 
 
 		 247 aa  97.8  5e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3504  response regulator receiver protein  42.62 
 
 		 127 aa  97.4  5e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2472  response regulator receiver protein  43.36 
 
 		 216 aa  97.4  5e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0092  response regulator receiver protein  39.32 
 
 		 120 aa  97.8  5e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2599  phosphate regulon transcriptional regulator, PhoR  43.36 
 
 		 230 aa  97.1  6e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0653  two-component response regulator PhoB  41.46 
 
 		 230 aa  97.4  6e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.131558  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3303  two component transcriptional regulator  40.87 
 
 		 229 aa  97.1  6e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000702519  hitchhiker  0.00000106408 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2096  CheA signal transduction histidine kinases  39.13 
 
 		 2301 aa  97.4  6e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0821  two component transcriptional regulator  44.04 
 
 		 232 aa  97.1  6e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.60557  hitchhiker  0.00503775 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1257  two component transcriptional regulator  43.36 
 
 		 230 aa  97.1  6e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.621627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1681  response regulator receiver protein  43.52 
 
 		 227 aa  97.1  6e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0956507  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1991  two component transcriptional regulator  41.03 
 
 		 235 aa  97.1  7e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01871  two-component response regulator  43.33 
 
 		 242 aa  97.1  7e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>