More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_3768 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_3768  response regulator receiver protein  100 
 
 
120 aa  242  9.999999999999999e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48045  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5307  response regulator receiver domain-containing protein  74.17 
 
 
121 aa  189  1e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0137607  normal  0.215998 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0404  response regulator receiver protein  72.5 
 
 
121 aa  187  4e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0509  twitching motility protein PilH  71.67 
 
 
121 aa  186  1e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05330  twitching motility protein PilH  71.67 
 
 
121 aa  186  1e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0489  response regulator receiver  70 
 
 
121 aa  183  6e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.646514  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5033  type IV pilus response regulator PilH  70 
 
 
121 aa  183  8e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3633  response regulator receiver domain-containing protein  71.19 
 
 
120 aa  182  2.0000000000000003e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.480345  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0473  response regulator receiver protein  65 
 
 
121 aa  173  9e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.950452  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5041  response regulator receiver protein  64.17 
 
 
121 aa  171  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2399  response regulator receiver protein  64.71 
 
 
121 aa  168  2e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.732485 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4991  response regulator receiver protein  62.5 
 
 
121 aa  167  3e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.353726  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4865  response regulator receiver protein  62.5 
 
 
121 aa  167  3e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.321258  normal  0.0275279 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2903  response regulator receiver protein  61.67 
 
 
120 aa  157  3e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.629195  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3018  response regulator receiver protein  61.67 
 
 
123 aa  154  4e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.454082 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0515  response regulator receiver protein  57.14 
 
 
120 aa  152  1e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.163432  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0130  response regulator receiver  60.5 
 
 
121 aa  151  2e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02637  regulatory protein PilH family  58.82 
 
 
128 aa  149  1e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0356  response regulator receiver protein  53.33 
 
 
121 aa  149  1e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0780111  normal  0.957515 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1789  response regulator receiver protein  56.67 
 
 
128 aa  148  3e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1724  response regulator receiver protein  56.67 
 
 
128 aa  148  3e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.999633  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2158  response regulator receiver protein  52.5 
 
 
120 aa  142  2e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1817  putative two-component response regulator  55.65 
 
 
120 aa  142  2e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2100  response regulator receiver domain-containing protein  52.1 
 
 
120 aa  140  4e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3898  response regulator receiver  57.39 
 
 
121 aa  140  6e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3689  response regulator receiver protein  51.72 
 
 
121 aa  139  9.999999999999999e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.443278  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2551  response regulator receiver domain-containing protein  54.24 
 
 
121 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3970  response regulator receiver protein  53.91 
 
 
121 aa  138  3e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0244969 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01603  PilH  54.62 
 
 
120 aa  136  8.999999999999999e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.376187  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4625  response regulator receiver protein  52.59 
 
 
121 aa  136  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.635313  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3088  response regulator receiver protein  53.33 
 
 
120 aa  135  2e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.224006 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3189  twitching motility protein  51.69 
 
 
121 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.612166  normal  0.249154 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1243  response regulator receiver domain-containing protein  54.87 
 
 
121 aa  131  3e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.253807 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2900  response regulator receiver protein  50 
 
 
121 aa  130  5e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.197839  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3577  response regulator receiver protein  50 
 
 
121 aa  130  5e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.400966  normal  0.141746 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3020  response regulator receiver protein  50 
 
 
121 aa  129  1.0000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.447611  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0902  response regulator receiver protein  49.14 
 
 
121 aa  129  1.0000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.844306 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1573  response regulator receiver protein  50.86 
 
 
121 aa  127  4.0000000000000003e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.146471 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3353  response regulator receiver protein  50 
 
 
121 aa  126  9.000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.392561  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1137  response regulator receiver domain-containing protein  50 
 
 
121 aa  126  1.0000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.635456 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0522  response regulator receiver domain-containing protein  46.96 
 
 
120 aa  124  5e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1372  response regulator receiver domain-containing protein  48.28 
 
 
121 aa  123  8.000000000000001e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0313107  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1062  response regulator receiver protein  42.02 
 
 
120 aa  121  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58489  hitchhiker  0.0000344775 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0613  response regulator receiver protein  50.86 
 
 
122 aa  121  4e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.242329  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0561  response regulator receiver protein  50.86 
 
 
122 aa  121  4e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.718467 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0670  response regulator receiver domain-containing protein  49.15 
 
 
122 aa  120  8e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00691443  normal  0.823575 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0669  putative twitching motility two-component response regulator transcription regulator protein  52.59 
 
 
122 aa  119  9.999999999999999e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2622  response regulator receiver  50 
 
 
123 aa  118  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0059  response regulator receiver domain-containing protein  40.34 
 
 
125 aa  116  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.157498  normal  0.212271 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0856  response regulator receiver domain-containing protein  38.14 
 
 
120 aa  111  4.0000000000000004e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0758877  normal  0.0586548 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0751  response regulator receiver protein  38.66 
 
 
121 aa  107  6e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0722  response regulator receiver protein  38.66 
 
 
121 aa  107  6e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2795  response regulator receiver protein  37.29 
 
 
121 aa  105  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0631  response regulator receiver protein  44.92 
 
 
123 aa  105  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0640  response regulator receiver protein  44.07 
 
 
123 aa  105  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3000  response regulator receiver protein  38.66 
 
 
124 aa  105  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1277  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  43.22 
 
 
454 aa  105  3e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.410696  normal  0.0388481 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1750  response regulator PleD  45.76 
 
 
457 aa  104  4e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.263569  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2815  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  42.37 
 
 
457 aa  104  5e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.631579  normal  0.0857187 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3248  response regulator receiver protein  36.13 
 
 
121 aa  103  6e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.500247 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0606  response regulator receiver domain-containing protein  44.07 
 
 
123 aa  103  7e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0424  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  47.46 
 
 
469 aa  103  9e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.97349 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1234  response regulator receiver protein  39.17 
 
 
122 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3337  response regulator receiver protein  40.34 
 
 
121 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1221  response regulator receiver domain-containing protein  41.9 
 
 
125 aa  102  2e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1382  response regulator PleD  44.07 
 
 
457 aa  102  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.390598 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1264  response regulator receiver protein  39.17 
 
 
122 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0578681  hitchhiker  0.00155192 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2780  response regulator receiver protein  40.34 
 
 
121 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.76051 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1213  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  45.3 
 
 
457 aa  101  4e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0650  response regulator receiver protein  42.37 
 
 
123 aa  101  4e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.438565  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2789  response regulator receiver protein  41.18 
 
 
121 aa  101  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1423  response regulator receiver protein  40.34 
 
 
119 aa  100  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.24081  normal  0.185499 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3747  response regulator receiver protein  36.13 
 
 
121 aa  100  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0926  response regulator PleD  43.22 
 
 
455 aa  100  9e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.773886 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0912  response regulator receiver protein  42.02 
 
 
118 aa  99.4  1e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.616011 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0508  response regulator receiver domain-containing protein  36.97 
 
 
121 aa  99.8  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.481314  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1290  response regulator PleD  43.22 
 
 
457 aa  99  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0138689  hitchhiker  0.00259394 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3968  response regulator receiver protein  37.82 
 
 
125 aa  99  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4743  response regulator receiver protein  38.52 
 
 
125 aa  98.6  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00329385 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0773  response regulator PleD  41.53 
 
 
458 aa  99  2e-20  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6679  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  41.53 
 
 
457 aa  98.2  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2022  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  40.17 
 
 
589 aa  97.8  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3990  response regulator receiver protein  39.09 
 
 
146 aa  97.4  5e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.27172  normal  0.4632 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3661  response regulator receiver protein  38.66 
 
 
120 aa  97.4  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.442071  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2666  two component transcriptional regulator, AraC family  38.33 
 
 
251 aa  97.4  6e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.21287  normal  0.224489 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4952  response regulator receiver protein  36.13 
 
 
121 aa  97.4  6e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.699568  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1864  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  44.07 
 
 
457 aa  97.1  8e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.831894  normal  0.121309 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1887  adenylate/guanylate cyclase  40.17 
 
 
403 aa  97.1  8e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.522729 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0304  response regulator PleD  40.68 
 
 
458 aa  96.3  1e-19  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0864091  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7417  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  40.68 
 
 
457 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.196799  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0967  diguanylate cyclase  42.37 
 
 
457 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.555277  normal  0.0207283 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0931  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  42.37 
 
 
457 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.436852  normal  0.104843 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3308  response regulator PleD  43.59 
 
 
457 aa  95.9  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.268667  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1842  response regulator receiver protein  38.33 
 
 
122 aa  95.5  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.808404  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3038  response regulator PleD  45.76 
 
 
457 aa  95.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.372566  normal  0.319547 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0907  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  42.37 
 
 
457 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.401363  normal  0.40647 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1228  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  41.9 
 
 
349 aa  94.4  4e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2442  response regulator PleD  41.88 
 
 
457 aa  94.4  4e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.696702  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1348  response regulator PleD  41.03 
 
 
457 aa  94.7  4e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3776  response regulator receiver domain-containing protein  33.9 
 
 
120 aa  94.4  5e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.143561 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>