More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3898 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_3898  response regulator receiver  100 
 
 		 121 aa  246  1e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3689  response regulator receiver protein  68.33 
 
 		 121 aa  182  2.0000000000000003e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.443278  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2551  response regulator receiver domain-containing protein  66.67 
 
 		 121 aa  176  9e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3970  response regulator receiver protein  60 
 
 		 121 aa  164  2.9999999999999998e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0244969 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0670  response regulator receiver domain-containing protein  60 
 
 		 122 aa  156  8e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00691443  normal  0.823575 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0669  putative twitching motility two-component response regulator transcription regulator protein  57.02 
 
 		 122 aa  154  4e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4625  response regulator receiver protein  57.5 
 
 		 121 aa  153  6e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.635313  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2622  response regulator receiver  58.47 
 
 		 123 aa  151  2.9999999999999998e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0561  response regulator receiver protein  56.67 
 
 		 122 aa  150  5e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.718467 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0613  response regulator receiver protein  56.67 
 
 		 122 aa  150  5e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.242329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1243  response regulator receiver domain-containing protein  55.83 
 
 		 121 aa  149  1e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.253807 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3189  twitching motility protein  57.5 
 
 		 121 aa  149  1e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.612166  normal  0.249154 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1573  response regulator receiver protein  58.33 
 
 		 121 aa  149  2e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.146471 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2900  response regulator receiver protein  57.5 
 
 		 121 aa  148  2e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.197839  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3577  response regulator receiver protein  57.5 
 
 		 121 aa  148  2e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.400966  normal  0.141746 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2903  response regulator receiver protein  60.34 
 
 		 120 aa  147  3e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.629195  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3020  response regulator receiver protein  57.5 
 
 		 121 aa  147  3e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.447611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0902  response regulator receiver protein  55.83 
 
 		 121 aa  146  1.0000000000000001e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844306 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1137  response regulator receiver domain-containing protein  55.83 
 
 		 121 aa  145  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.635456 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0509  twitching motility protein PilH  59.13 
 
 		 121 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05330  twitching motility protein PilH  59.13 
 
 		 121 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3353  response regulator receiver protein  55 
 
 		 121 aa  143  6e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.392561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0130  response regulator receiver  60.34 
 
 		 121 aa  143  8.000000000000001e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2399  response regulator receiver protein  57.14 
 
 		 121 aa  142  1e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.732485 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0404  response regulator receiver protein  57.39 
 
 		 121 aa  142  1e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3768  response regulator receiver protein  57.39 
 
 		 120 aa  140  6e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48045  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5033  type IV pilus response regulator PilH  55.65 
 
 		 121 aa  139  9e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5307  response regulator receiver domain-containing protein  56.25 
 
 		 121 aa  138  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0137607  normal  0.215998 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0356  response regulator receiver protein  51.69 
 
 		 121 aa  137  3.9999999999999997e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0780111  normal  0.957515 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0489  response regulator receiver  54.78 
 
 		 121 aa  137  6e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.646514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1372  response regulator receiver domain-containing protein  53.33 
 
 		 121 aa  137  7e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0313107  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0515  response regulator receiver protein  55.45 
 
 		 120 aa  137  7e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.163432  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3633  response regulator receiver domain-containing protein  54.87 
 
 		 120 aa  135  2e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.480345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5041  response regulator receiver protein  53.1 
 
 		 121 aa  134  5e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4991  response regulator receiver protein  53.1 
 
 		 121 aa  134  5e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.353726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4865  response regulator receiver protein  53.1 
 
 		 121 aa  134  5e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.321258  normal  0.0275279 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3018  response regulator receiver protein  51.67 
 
 		 123 aa  130  6e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.454082 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2100  response regulator receiver domain-containing protein  54.46 
 
 		 120 aa  127  6e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1817  putative two-component response regulator  52.17 
 
 		 120 aa  125  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0473  response regulator receiver protein  48.21 
 
 		 121 aa  124  3e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.950452  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01603  PilH  48.28 
 
 		 120 aa  124  5e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.376187  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3088  response regulator receiver protein  47.41 
 
 		 120 aa  123  9e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.224006 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02637  regulatory protein PilH family  50 
 
 		 128 aa  120  7e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1724  response regulator receiver protein  46.67 
 
 		 128 aa  120  7e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.999633  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1789  response regulator receiver protein  46.67 
 
 		 128 aa  120  7e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2158  response regulator receiver protein  47.46 
 
 		 120 aa  118  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0522  response regulator receiver domain-containing protein  46.15 
 
 		 120 aa  115  1.9999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3248  response regulator receiver protein  43.48 
 
 		 121 aa  115  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.500247 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2789  response regulator receiver protein  47.37 
 
 		 121 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4743  response regulator receiver protein  46.15 
 
 		 125 aa  110  5e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00329385 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1264  response regulator receiver protein  43.48 
 
 		 122 aa  110  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0578681  hitchhiker  0.00155192 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1234  response regulator receiver protein  43.48 
 
 		 122 aa  110  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1720  two component LuxR family transcriptional regulator  42.24 
 
 		 301 aa  110  9e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.162572  normal  0.616267 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1062  response regulator receiver protein  39.13 
 
 		 120 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58489  hitchhiker  0.0000344775 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1221  response regulator receiver domain-containing protein  47.17 
 
 		 125 aa  109  1.0000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0640  response regulator receiver protein  47.01 
 
 		 123 aa  109  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0631  response regulator receiver protein  46.15 
 
 		 123 aa  108  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0751  response regulator receiver protein  38.98 
 
 		 121 aa  108  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4952  response regulator receiver protein  38.98 
 
 		 121 aa  108  3e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.699568  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2780  response regulator receiver protein  43.86 
 
 		 121 aa  108  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.76051 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3337  response regulator receiver protein  43.86 
 
 		 121 aa  108  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0722  response regulator receiver protein  38.98 
 
 		 121 aa  108  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0059  response regulator receiver domain-containing protein  42.37 
 
 		 125 aa  107  4.0000000000000004e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.157498  normal  0.212271 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2795  response regulator receiver protein  41.74 
 
 		 121 aa  107  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0606  response regulator receiver domain-containing protein  46.15 
 
 		 123 aa  107  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0508  response regulator receiver domain-containing protein  38.98 
 
 		 121 aa  107  5e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.481314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2149  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  43.59 
 
 		 407 aa  107  5e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.142048 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3000  response regulator receiver protein  38.98 
 
 		 124 aa  107  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1805  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  44.44 
 
 		 310 aa  105  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0638722  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1955  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.38 
 
 		 236 aa  105  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.295041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3661  response regulator receiver protein  38.98 
 
 		 120 aa  105  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.442071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0856  response regulator receiver domain-containing protein  38.26 
 
 		 120 aa  105  3e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0758877  normal  0.0586548 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2061  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  44.44 
 
 		 318 aa  103  6e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365539  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4530  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  45.54 
 
 		 386 aa  103  7e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1236  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  45.54 
 
 		 386 aa  103  9e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.493129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7377  two component AraC family transcriptional regulator  44.25 
 
 		 278 aa  102  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0377301  normal  0.284562 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0790  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.86 
 
 		 566 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.391268  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6477  two component AraC family transcriptional regulator  43.36 
 
 		 277 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0923467 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5621  two component AraC family transcriptional regulator  43.36 
 
 		 277 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.289619  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1423  response regulator receiver protein  40.68 
 
 		 119 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.24081  normal  0.185499 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3747  response regulator receiver protein  35.59 
 
 		 121 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0650  response regulator receiver protein  44.44 
 
 		 123 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.438565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5986  two component AraC family transcriptional regulator  43.36 
 
 		 277 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0117191 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2188  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  43.36 
 
 		 384 aa  101  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00677544 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4408  two component transcriptional regulator  46.15 
 
 		 229 aa  100  6e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0897949 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2397  two component transcriptional regulator, AraC family  42.48 
 
 		 269 aa  100  6e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.92999  normal  0.351016 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0599  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  39.17 
 
 		 313 aa  100  6e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.464892  normal  0.548622 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1887  adenylate/guanylate cyclase  45.22 
 
 		 403 aa  100  8e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.522729 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0707  two component transcriptional regulator  40 
 
 		 227 aa  100  8e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.598521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2472  response regulator receiver protein  40 
 
 		 216 aa  100  9e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3210  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  41.96 
 
 		 337 aa  99.8  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.32327  normal  0.712325 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2239  adenylate/guanylate cyclase  42.74 
 
 		 1156 aa  99.4  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.159061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2709  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.03 
 
 		 236 aa  99.8  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0011921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1118  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  42.48 
 
 		 452 aa  99.4  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000972917  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6198  two component AraC family transcriptional regulator  43.36 
 
 		 277 aa  99.8  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5320  winged helix family two component transcriptional regulator  45.3 
 
 		 242 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.023746 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3776  response regulator receiver domain-containing protein  39.5 
 
 		 120 aa  99.4  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.143561 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4136  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  41.07 
 
 		 440 aa  99  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000660181  hitchhiker  0.00876613 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0154  two component transcriptional regulator  45.3 
 
 		 229 aa  99  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.596099 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0882  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.5 
 
 		 230 aa  99  2e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.148935 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>