More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3000 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3000  response regulator receiver protein  100 
 
 		 124 aa  257  3e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4952  response regulator receiver protein  80 
 
 		 121 aa  204  3e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.699568  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0508  response regulator receiver domain-containing protein  78.33 
 
 		 121 aa  202  1e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.481314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3248  response regulator receiver protein  73.55 
 
 		 121 aa  196  1.0000000000000001e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.500247 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0751  response regulator receiver protein  75.21 
 
 		 121 aa  194  3e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0722  response regulator receiver protein  75.21 
 
 		 121 aa  194  3e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3747  response regulator receiver protein  74.17 
 
 		 121 aa  187  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1234  response regulator receiver protein  54.62 
 
 		 122 aa  150  5e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1264  response regulator receiver protein  54.62 
 
 		 122 aa  150  5e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0578681  hitchhiker  0.00155192 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3661  response regulator receiver protein  55.46 
 
 		 120 aa  147  6e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.442071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3968  response regulator receiver protein  55.37 
 
 		 125 aa  145  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3990  response regulator receiver protein  56.76 
 
 		 146 aa  140  4e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.27172  normal  0.4632 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1062  response regulator receiver protein  50.42 
 
 		 120 aa  135  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58489  hitchhiker  0.0000344775 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2789  response regulator receiver protein  50 
 
 		 121 aa  134  5e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0856  response regulator receiver domain-containing protein  50.85 
 
 		 120 aa  134  6.0000000000000005e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0758877  normal  0.0586548 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2780  response regulator receiver protein  49.17 
 
 		 121 aa  133  9e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.76051 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3337  response regulator receiver protein  49.17 
 
 		 121 aa  133  9e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2795  response regulator receiver protein  47.9 
 
 		 121 aa  130  5e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1221  response regulator receiver domain-containing protein  49.07 
 
 		 125 aa  125  1.0000000000000001e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0059  response regulator receiver domain-containing protein  47.5 
 
 		 125 aa  123  7e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.157498  normal  0.212271 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2551  response regulator receiver domain-containing protein  45.76 
 
 		 121 aa  123  9e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1423  response regulator receiver protein  44.54 
 
 		 119 aa  122  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.24081  normal  0.185499 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4743  response regulator receiver protein  42.62 
 
 		 125 aa  122  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00329385 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1422  response regulator receiver protein  45.38 
 
 		 119 aa  120  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.153955  normal  0.123704 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4345  response regulator receiver protein  40.16 
 
 		 122 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4285  response regulator receiver protein  40.16 
 
 		 122 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0609  DNA-binding response regulator  40.83 
 
 		 231 aa  117  3.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000282114  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0623  DNA-binding response regulator  40.83 
 
 		 231 aa  117  4.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000212568  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1257  two component transcriptional regulator  46.61 
 
 		 230 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.621627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2599  phosphate regulon transcriptional regulator, PhoR  46.61 
 
 		 230 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1924  two component transcriptional regulator  46.61 
 
 		 230 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.781724  normal  0.399122 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0707  two component transcriptional regulator  44.72 
 
 		 232 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2308  response regulator receiver protein  46.61 
 
 		 123 aa  114  3e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3970  response regulator receiver protein  41.53 
 
 		 121 aa  113  6.9999999999999995e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0244969 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2158  response regulator receiver protein  43.7 
 
 		 120 aa  113  6.9999999999999995e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.62 
 
 		 234 aa  113  7.999999999999999e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.178035  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4546  two component transcriptional regulator  44.07 
 
 		 230 aa  113  7.999999999999999e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.281853 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0130  response regulator receiver  39.5 
 
 		 121 aa  113  1.0000000000000001e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4151  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.16 
 
 		 230 aa  112  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4009  two component transcriptional regulator  45.16 
 
 		 230 aa  113  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00751412  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0845  response regulator receiver protein  41.53 
 
 		 125 aa  112  1.0000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.455865  normal  0.167506 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4125  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.16 
 
 		 230 aa  112  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.125271  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0951  response regulator receiver protein  43.22 
 
 		 239 aa  112  1.0000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000111905  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1955  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.98 
 
 		 236 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.295041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3776  response regulator receiver domain-containing protein  42.5 
 
 		 120 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.143561 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1456  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.86 
 
 		 223 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000183373  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3633  response regulator receiver domain-containing protein  41.53 
 
 		 120 aa  112  2.0000000000000002e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.480345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0301  two component LuxR family transcriptional regulator  40.16 
 
 		 231 aa  111  3e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.54347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4663  two component transcriptional regulator  45.45 
 
 		 232 aa  111  3e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4625  response regulator receiver protein  39.83 
 
 		 121 aa  111  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.635313  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0483  two component transcriptional regulator  41.8 
 
 		 229 aa  111  3e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.342081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3689  response regulator receiver protein  40.68 
 
 		 121 aa  111  3e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.443278  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0561  response regulator receiver protein  41.53 
 
 		 122 aa  111  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.718467 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02637  regulatory protein PilH family  39.34 
 
 		 128 aa  111  4.0000000000000004e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0613  response regulator receiver protein  41.53 
 
 		 122 aa  111  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.242329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2892  two component transcriptional regulator  42.86 
 
 		 227 aa  110  4.0000000000000004e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0239565 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2900  response regulator receiver protein  41.53 
 
 		 121 aa  110  5e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.197839  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0902  response regulator receiver protein  41.53 
 
 		 121 aa  110  5e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844306 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3577  response regulator receiver protein  41.53 
 
 		 121 aa  110  5e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.400966  normal  0.141746 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.63 
 
 		 232 aa  110  5e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3020  response regulator receiver protein  41.53 
 
 		 121 aa  110  6e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.447611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2384  two component transcriptional regulator  45.76 
 
 		 259 aa  110  6e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4627  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.52 
 
 		 226 aa  110  6e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0208  two component transcriptional regulator  40.65 
 
 		 240 aa  110  6e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2286  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.32 
 
 		 231 aa  110  6e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000188753  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2219  response regulator  40.68 
 
 		 123 aa  110  7.000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0216  two component transcriptional regulator  40.98 
 
 		 230 aa  110  7.000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.305183 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2401  phosphate regulon transcriptional regulatory protein phoB  41.8 
 
 		 229 aa  110  7.000000000000001e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4207  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.7 
 
 		 247 aa  110  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1257  two component transcriptional regulator  43.22 
 
 		 229 aa  110  7.000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.536699  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1865  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.8 
 
 		 226 aa  110  7.000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0510  two component transcriptional regulator  41.13 
 
 		 234 aa  110  8.000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0567  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.94 
 
 		 225 aa  110  8.000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.463355  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1756  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.83 
 
 		 230 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.769657  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0669  putative twitching motility two-component response regulator transcription regulator protein  41.53 
 
 		 122 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0399  two component transcriptional regulator  40.16 
 
 		 272 aa  109  1.0000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.802217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1897  two component transcriptional regulator  43.22 
 
 		 227 aa  109  1.0000000000000001e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.151466  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1077  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.32 
 
 		 235 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2472  response regulator receiver protein  43.33 
 
 		 216 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1538  phosphate regulon transcriptional regulatory protein  43.22 
 
 		 228 aa  109  1.0000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.280381 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4325  two component transcriptional regulator  44.55 
 
 		 229 aa  109  1.0000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.974523  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2564  DNA-binding response regulator  38.71 
 
 		 231 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0589521  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2385  DNA-binding response regulator  38.71 
 
 		 231 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.534853  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2341  DNA-binding response regulator  38.71 
 
 		 231 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000166477  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2302  DNA-binding response regulator  38.71 
 
 		 231 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0142  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.28 
 
 		 221 aa  108  2.0000000000000002e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.709604 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1485  response regulator receiver  43.7 
 
 		 235 aa  108  2.0000000000000002e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.236897  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0308  two component transcriptional regulator  44.92 
 
 		 248 aa  108  2.0000000000000002e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.030574  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2561  DNA-binding response regulator  38.71 
 
 		 231 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.630654  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0603  two component transcriptional regulator  41.8 
 
 		 233 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0519325  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1243  response regulator receiver domain-containing protein  41.53 
 
 		 121 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.253807 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3189  twitching motility protein  41.38 
 
 		 121 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.612166  normal  0.249154 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0821  two component transcriptional regulator  42.37 
 
 		 232 aa  108  2.0000000000000002e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.60557  hitchhiker  0.00503775 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2574  DNA-binding response regulator  38.71 
 
 		 231 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000040017 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1573  response regulator receiver protein  42.37 
 
 		 121 aa  108  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.146471 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1441  two component transcriptional regulator  44.17 
 
 		 247 aa  109  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.167327  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2617  DNA-binding response regulator  38.71 
 
 		 231 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.993672  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1866  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  41.53 
 
 		 326 aa  108  3e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2526  DNA-binding response regulator  39.52 
 
 		 231 aa  108  3e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0743  response regulator receiver protein  42.15 
 
 		 132 aa  108  3e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>