More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2219 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2219  response regulator  100 
 
 		 123 aa  245  1e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2308  response regulator receiver protein  72.95 
 
 		 123 aa  178  2e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3143  response regulator receiver protein  63.11 
 
 		 124 aa  168  2e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0743  response regulator receiver protein  66.94 
 
 		 132 aa  165  2e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0758  response regulator receiver protein  66.39 
 
 		 132 aa  165  2e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0540632 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1409  two component signal transduction response regulator  63.03 
 
 		 123 aa  156  8e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000120114  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0845  response regulator receiver protein  43.97 
 
 		 125 aa  114  5e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.455865  normal  0.167506 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0653  two-component response regulator PhoB  48.76 
 
 		 230 aa  114  5e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.131558  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2695  response regulator receiver domain-containing protein  45.76 
 
 		 186 aa  114  6e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00269866  normal  0.78823 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2892  two component transcriptional regulator  47.11 
 
 		 227 aa  114  6e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0239565 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0789  response regulator receiver protein  54.81 
 
 		 278 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2076  histidine kinase  45.45 
 
 		 1373 aa  112  2.0000000000000002e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0090  two component transcriptional regulator, winged helix family  50 
 
 		 228 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1901  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 125 aa  111  3e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4150  response regulator receiver protein  48.31 
 
 		 125 aa  111  4.0000000000000004e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.583085 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1501  response regulator receiver protein  47.01 
 
 		 132 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.153095  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3000  response regulator receiver protein  40.68 
 
 		 124 aa  110  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3248  response regulator receiver protein  43.59 
 
 		 121 aa  110  7.000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.500247 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2951  two component transcriptional regulator  47.06 
 
 		 236 aa  109  1.0000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1911  two component transcriptional regulator  43.8 
 
 		 229 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.258551 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0669  response regulator receiver protein  45 
 
 		 123 aa  108  2.0000000000000002e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2712  two component transcriptional regulator  45.38 
 
 		 224 aa  108  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00552555  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2443  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.54 
 
 		 224 aa  108  3e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00121019 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1805  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  38.02 
 
 		 310 aa  108  3e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0638722  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0640  two component transcriptional regulator  43.59 
 
 		 233 aa  108  3e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.772339  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1497  response regulator PleD  47.41 
 
 		 454 aa  108  3e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.122959 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0399  two component transcriptional regulator  43.7 
 
 		 272 aa  107  4.0000000000000004e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.802217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1394  two component transcriptional regulator  47.22 
 
 		 236 aa  107  4.0000000000000004e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000024965  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4009  two component transcriptional regulator  45.69 
 
 		 230 aa  107  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00751412  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4125  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.69 
 
 		 230 aa  107  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.125271  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4151  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.69 
 
 		 230 aa  107  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1277  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  44.44 
 
 		 454 aa  107  7.000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.410696  normal  0.0388481 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1102  DNA-binding response regulator  44.92 
 
 		 225 aa  105  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14770  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  44.63 
 
 		 226 aa  105  1e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.383411  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0221  response regulator PleD  43.97 
 
 		 460 aa  105  1e-22  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1011  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.6 
 
 		 231 aa  105  1e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1632  response regulator receiver  43.22 
 
 		 123 aa  106  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0508  response regulator receiver domain-containing protein  42.24 
 
 		 121 aa  106  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.481314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1955  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.66 
 
 		 236 aa  106  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.295041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2106  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.98 
 
 		 238 aa  106  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4952  response regulator receiver protein  41.38 
 
 		 121 aa  105  2e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.699568  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2387  two component transcriptional regulator  43.8 
 
 		 229 aa  105  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00115026  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0603  two component transcriptional regulator  42.02 
 
 		 233 aa  105  2e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0519325  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0951  response regulator receiver protein  43.09 
 
 		 239 aa  105  2e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000111905  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0467  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.54 
 
 		 230 aa  105  3e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0987  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.77 
 
 		 233 aa  105  3e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.195539  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1893  two component transcriptional regulator  40.34 
 
 		 235 aa  105  3e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203788 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0882  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.98 
 
 		 230 aa  104  4e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.148935 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1604  two component transcriptional regulator, AraC family  44.44 
 
 		 904 aa  104  4e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20650  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  43.86 
 
 		 231 aa  103  5e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0260682  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1848  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.22 
 
 		 236 aa  104  5e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0065624  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5261  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.74 
 
 		 237 aa  103  6e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.909356  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0849  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  40.68 
 
 		 593 aa  103  6e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.386146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0820  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  40.68 
 
 		 593 aa  103  6e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3747  response regulator receiver protein  41.88 
 
 		 121 aa  103  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2562  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  44.04 
 
 		 437 aa  103  8e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2226  response regulator receiver protein  40 
 
 		 129 aa  103  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.561592  normal  0.814785 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2815  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  44.44 
 
 		 457 aa  102  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.631579  normal  0.0857187 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0573  response regulator receiver protein  40 
 
 		 129 aa  103  1e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.087024  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2749  two component transcriptional regulator  41.03 
 
 		 241 aa  103  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000593879  unclonable  0.00000330773 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2649  response regulator receiver protein  41.53 
 
 		 122 aa  102  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.857048  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1133  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.38 
 
 		 217 aa  102  1e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2062  response regulator receiver protein  46.72 
 
 		 217 aa  102  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0415  two component transcriptional regulator  47.71 
 
 		 231 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.777838 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0984  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.92 
 
 		 246 aa  102  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0723779 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2401  phosphate regulon transcriptional regulatory protein phoB  40.52 
 
 		 229 aa  102  2e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4918  two component transcriptional regulator  41.88 
 
 		 234 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.134814 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1991  two component transcriptional regulator  41.03 
 
 		 235 aa  102  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0323  two component transcriptional regulator  46.15 
 
 		 227 aa  102  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4285  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.02 
 
 		 238 aa  101  3e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.83647  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1347  two component transcriptional regulator  47.66 
 
 		 228 aa  101  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1381  two component transcriptional regulator  47.66 
 
 		 228 aa  101  3e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.497022 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1365  two component transcriptional regulator  47.66 
 
 		 228 aa  101  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0135  DNA-binding response regulator  42.15 
 
 		 230 aa  101  4e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4451  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  40.98 
 
 		 314 aa  100  4e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.586345 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2969  two component transcriptional regulator  39.32 
 
 		 229 aa  101  4e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000855765  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4701  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.83 
 
 		 1274 aa  101  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0613664  normal  0.609464 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3359  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  39.17 
 
 		 395 aa  101  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.361398  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2316  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  42.15 
 
 		 230 aa  101  4e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2743  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  39.17 
 
 		 395 aa  101  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1713  two component LuxR family transcriptional regulator  45.3 
 
 		 361 aa  101  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.310925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1419  two component transcriptional regulator  41.03 
 
 		 231 aa  101  4e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0720218  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2852  histidine kinase  38.52 
 
 		 1342 aa  100  5e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0012841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1997  two component transcriptional regulator  42.24 
 
 		 234 aa  100  5e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000742772  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2442  response regulator PleD  43.97 
 
 		 457 aa  100  5e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.696702  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3569  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.17 
 
 		 235 aa  100  5e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0013  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  40.16 
 
 		 314 aa  100  5e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.992585 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4712  two component transcriptional regulator  46.73 
 
 		 228 aa  100  5e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.541483  normal  0.0134498 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0790  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.59 
 
 		 566 aa  100  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.391268  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0424  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  44.83 
 
 		 469 aa  100  5e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.97349 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3446  response regulator receiver  45.13 
 
 		 234 aa  100  5e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.664648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1752  two component transcriptional regulator  46.73 
 
 		 228 aa  100  5e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.581522 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1777  metal dependent phosphohydrolase, HD region with response regulator receiver modulation  39.17 
 
 		 414 aa  100  6e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0329  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.93 
 
 		 231 aa  100  6e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13275  two component system sensor transduction transcriptional regulatory protein mtrA  45.79 
 
 		 228 aa  100  6e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.656178 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0095  two component transcriptional regulator  42.86 
 
 		 249 aa  100  6e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3814  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  40.35 
 
 		 1131 aa  100  6e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.257486 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1197  response regulator receiver  42.34 
 
 		 230 aa  100  6e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2768  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  40.17 
 
 		 229 aa  100  6e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0176064  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0804  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  40.98 
 
 		 314 aa  100  6e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.504991 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>