More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_2695 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_2695  response regulator receiver domain-containing protein  100 
 
 		 186 aa  366  1e-100  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00269866  normal  0.78823 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1406  response regulator receiver protein  63.48 
 
 		 121 aa  155  3e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0894387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0171  response regulator receiver protein  55.56 
 
 		 122 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1805  response regulator receiver protein  55.56 
 
 		 122 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.422276 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1472  response regulator receiver protein  54.7 
 
 		 122 aa  130  7.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.413604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1509  response regulator receiver protein  52.63 
 
 		 137 aa  124  6e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0237  response regulator receiver protein  50.86 
 
 		 124 aa  116  1.9999999999999998e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000555979 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2219  response regulator  45.76 
 
 		 123 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1901  response regulator receiver protein  43.59 
 
 		 125 aa  114  1.0000000000000001e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1632  response regulator receiver  45.69 
 
 		 123 aa  110  8.000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0669  response regulator receiver protein  42.24 
 
 		 123 aa  109  3e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3778  response regulator receiver domain-containing protein  43.8 
 
 		 124 aa  107  1e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2649  response regulator receiver protein  40.52 
 
 		 122 aa  105  3e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.857048  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4150  response regulator receiver protein  43.1 
 
 		 125 aa  105  4e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.583085 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4918  two component transcriptional regulator  44.44 
 
 		 234 aa  102  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.134814 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1911  two component transcriptional regulator  43.09 
 
 		 229 aa  102  3e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.258551 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0758  response regulator receiver protein  41.23 
 
 		 132 aa  102  4e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0540632 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1893  two component transcriptional regulator  43.59 
 
 		 235 aa  102  4e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203788 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0743  response regulator receiver protein  41.23 
 
 		 132 aa  101  5e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1786  response regulator receiver protein  49.07 
 
 		 120 aa  102  5e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00311899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4210  response regulator receiver protein  50 
 
 		 123 aa  102  5e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00926762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1501  response regulator receiver protein  41.32 
 
 		 132 aa  102  5e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.153095  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2892  two component transcriptional regulator  42.86 
 
 		 227 aa  100  8e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0239565 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4555  response regulator receiver protein  49.07 
 
 		 123 aa  100  8e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5261  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.59 
 
 		 237 aa  101  8e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.909356  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2308  response regulator receiver protein  41.59 
 
 		 123 aa  100  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1991  two component transcriptional regulator  42.74 
 
 		 235 aa  100  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2387  two component transcriptional regulator  43.97 
 
 		 229 aa  100  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00115026  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0882  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.24 
 
 		 230 aa  98.6  4e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.148935 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0640  two component transcriptional regulator  42.74 
 
 		 233 aa  98.6  4e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.772339  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0202  two component transcriptional regulator  44.35 
 
 		 233 aa  98.6  5e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.382528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1873  response regulator receiver  43.86 
 
 		 326 aa  98.2  6e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.402703 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0893  winged helix family two component transcriptional regulator  43.59 
 
 		 233 aa  97.8  7e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3143  response regulator receiver protein  39.47 
 
 		 124 aa  97.4  9e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0781  two component transcriptional regulator  43.59 
 
 		 233 aa  97.8  9e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.174075 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0567  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.69 
 
 		 225 aa  97.8  9e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.463355  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2903  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.66 
 
 		 234 aa  97.1  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0558  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.83 
 
 		 237 aa  97.1  1e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0834  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  40.62 
 
 		 265 aa  97.4  1e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0108417 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0059  response regulator receiver domain-containing protein  38.98 
 
 		 125 aa  96.7  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.157498  normal  0.212271 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0573  response regulator receiver protein  41.18 
 
 		 129 aa  96.3  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.087024  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2226  response regulator receiver protein  41.18 
 
 		 129 aa  96.3  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.561592  normal  0.814785 
 
 
-
 
NC_004310  BR2143  phosphate regulon transcriptional regulatory protein Phob  42.37 
 
 		 228 aa  95.9  3e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2401  phosphate regulon transcriptional regulatory protein phoB  39.83 
 
 		 229 aa  95.9  3e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2058  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  42.37 
 
 		 228 aa  95.5  3e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.275433  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1866  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  42.98 
 
 		 326 aa  95.5  4e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1409  two component signal transduction response regulator  39.82 
 
 		 123 aa  95.5  4e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000120114  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0603  two component transcriptional regulator  40.87 
 
 		 233 aa  95.5  4e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0519325  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1597  two component transcriptional regulator  43.65 
 
 		 237 aa  95.5  4e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2811  DNA-binding response regulator  39.67 
 
 		 228 aa  95.1  5e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0504  response regulator receiver protein  41.18 
 
 		 129 aa  94.7  6e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0548558  normal  0.11151 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0511  phosphate regulon transcriptional regulatory protein phoB  41.88 
 
 		 234 aa  94.7  7e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.473137 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2969  two component transcriptional regulator  41.46 
 
 		 229 aa  94.7  7e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000855765  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3413  two component transcriptional regulator  37.96 
 
 		 252 aa  94.4  9e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.427436 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0783  two component transcriptional regulator  39.66 
 
 		 231 aa  94.4  9e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2534  DNA-binding response regulator YycF  39.13 
 
 		 233 aa  94  1e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1147  response regulator receiver protein  43.22 
 
 		 149 aa  94  1e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.339513  normal  0.0728357 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0856  response regulator receiver domain-containing protein  35.65 
 
 		 120 aa  93.6  1e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0758877  normal  0.0586548 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0399  two component transcriptional regulator  40 
 
 		 272 aa  93.6  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.802217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0609  DNA-binding response regulator  37.93 
 
 		 231 aa  94  1e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000282114  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0485  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  41.38 
 
 		 227 aa  94  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.537934  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0183  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  39.83 
 
 		 227 aa  94  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.635675 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1434  DNA-binding response regulator PhoB  42.28 
 
 		 243 aa  94  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0018  two component transcriptional regulator  39.13 
 
 		 233 aa  94  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.70243  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1151  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.28 
 
 		 243 aa  94  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0173  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  39.83 
 
 		 227 aa  94.4  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.505642  normal  0.985195 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0018  response regulator receiver  39.13 
 
 		 233 aa  94  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2427  response regulator receiver protein  39.26 
 
 		 159 aa  94  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.468058 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5615  DNA-binding response regulator YycF  37.6 
 
 		 235 aa  92.8  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5650  DNA-binding response regulator YycF  37.6 
 
 		 235 aa  92.8  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00563499  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5319  DNA-binding response regulator YycF  37.6 
 
 		 235 aa  92.8  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.169223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5147  response regulator  37.6 
 
 		 235 aa  92.8  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00168683  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5163  response regulator  37.6 
 
 		 235 aa  92.8  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00196509  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2472  response regulator receiver protein  43.8 
 
 		 216 aa  93.6  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5715  DNA-binding response regulator YycF  37.6 
 
 		 235 aa  92.8  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.656882  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5572  DNA-binding response regulator YycF  37.6 
 
 		 235 aa  92.8  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.81316e-29 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4050  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.99 
 
 		 227 aa  93.2  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00552008  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2497  DNA-binding response regulator  39.67 
 
 		 228 aa  93.2  2e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0253  DNA-binding response regulator PhoB  38.79 
 
 		 229 aa  93.2  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3394  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.46 
 
 		 230 aa  93.2  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.103692  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6145  two component transcriptional regulator  44.07 
 
 		 228 aa  93.2  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.788201 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2749  two component transcriptional regulator  41.03 
 
 		 241 aa  93.2  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000593879  unclonable  0.00000330773 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5346  DNA-binding response regulator YycF  37.6 
 
 		 235 aa  92.4  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000234523  hitchhiker  0.00000000000323141 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5259  two component transcriptional regulator  37.6 
 
 		 235 aa  92.8  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000559572  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5589  DNA-binding response regulator YycF  37.6 
 
 		 235 aa  92.8  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0124  two component transcriptional regulator  41.38 
 
 		 227 aa  92.8  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.352403 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4006  two component transcriptional regulator  37.6 
 
 		 235 aa  92.4  3e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010356  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7423  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  42.24 
 
 		 234 aa  92  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2457  response regulator homolog PhoB (phosphate regulon transcriptional regulatory protein)  39.66 
 
 		 230 aa  92  4e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2693  two component transcriptional regulator  39.67 
 
 		 226 aa  92  4e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.575064 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3303  two component transcriptional regulator  39.84 
 
 		 229 aa  92  4e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000702519  hitchhiker  0.00000106408 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01026  response regulator  38.79 
 
 		 229 aa  92.4  4e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0896  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.38 
 
 		 226 aa  92.4  4e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.232326  hitchhiker  0.00518822 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08590  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  37.31 
 
 		 239 aa  92  4e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.857083 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8879  response regulator receiver protein  42.62 
 
 		 235 aa  92  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004385  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  38.79 
 
 		 229 aa  92  5e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1701  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.67 
 
 		 236 aa  92  5e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0623  DNA-binding response regulator  37.93 
 
 		 231 aa  91.7  5e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000212568  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1955  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.61 
 
 		 236 aa  91.7  6e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.295041  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3276  winged helix family two component transcriptional regulator  41.46 
 
 		 234 aa  91.7  6e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.208422  normal  0.192837 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>