More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_0171 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_1805  response regulator receiver protein  100 
 
 		 122 aa  241  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.422276 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0171  response regulator receiver protein  100 
 
 		 122 aa  241  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1472  response regulator receiver protein  91.8 
 
 		 122 aa  227  3e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.413604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1406  response regulator receiver protein  60.5 
 
 		 121 aa  141  4e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0894387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1509  response regulator receiver protein  56.3 
 
 		 137 aa  138  3e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2695  response regulator receiver domain-containing protein  55.56 
 
 		 186 aa  132  1.9999999999999998e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00269866  normal  0.78823 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0603  two component transcriptional regulator  45.08 
 
 		 233 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0519325  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1786  response regulator receiver protein  50.82 
 
 		 120 aa  110  8.000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00311899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4210  response regulator receiver protein  44.74 
 
 		 123 aa  108  3e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00926762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2922  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.08 
 
 		 230 aa  107  7.000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.221617  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0216  two component transcriptional regulator  38.52 
 
 		 230 aa  105  2e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.305183 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1501  response regulator receiver protein  39.67 
 
 		 132 aa  105  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.153095  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2472  response regulator receiver protein  42.37 
 
 		 216 aa  104  3e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5113  response regulator receiver protein  40.83 
 
 		 121 aa  104  4e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0202  two component transcriptional regulator  43.44 
 
 		 233 aa  104  5e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.382528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1632  response regulator receiver  40.83 
 
 		 123 aa  103  5e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4555  response regulator receiver protein  44.92 
 
 		 123 aa  104  5e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1419  two component transcriptional regulator  40.83 
 
 		 231 aa  102  1e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0720218  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3000  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 124 aa  102  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0301  two component LuxR family transcriptional regulator  38.52 
 
 		 231 aa  102  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.54347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0227  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  43.44 
 
 		 236 aa  102  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2649  response regulator receiver protein  39.17 
 
 		 122 aa  102  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.857048  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2845  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.18 
 
 		 234 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0558  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.38 
 
 		 237 aa  102  2e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2632  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.22 
 
 		 229 aa  102  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0567  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.8 
 
 		 225 aa  102  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.463355  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0615  two component transcriptional regulator  43.44 
 
 		 228 aa  101  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0841359  normal  0.719107 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0130  two component transcriptional regulator  46.67 
 
 		 229 aa  101  3e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.848842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0237  response regulator receiver protein  41.94 
 
 		 124 aa  101  4e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000555979 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0399  two component transcriptional regulator  38.52 
 
 		 272 aa  101  4e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.802217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4150  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 125 aa  101  4e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.583085 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0609  DNA-binding response regulator  35.54 
 
 		 231 aa  101  4e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000282114  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1865  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.68 
 
 		 226 aa  101  4e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1955  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.5 
 
 		 236 aa  100  5e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.295041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4627  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.33 
 
 		 226 aa  100  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5261  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.98 
 
 		 237 aa  100  5e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.909356  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1911  two component transcriptional regulator  41.18 
 
 		 229 aa  100  5e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.258551 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0644  two component transcriptional regulator, winged helix family  40 
 
 		 236 aa  100  6e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3767  response regulator receiver protein  40.34 
 
 		 124 aa  100  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0858272 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0640  two component transcriptional regulator  40.16 
 
 		 233 aa  100  8e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.772339  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4918  two component transcriptional regulator  40.98 
 
 		 234 aa  100  9e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.134814 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3411  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.62 
 
 		 224 aa  100  9e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.591115  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1102  DNA-binding response regulator  38.98 
 
 		 225 aa  99.4  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5185  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  40.5 
 
 		 234 aa  99.4  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.809056 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4718  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  40.5 
 
 		 239 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.220817 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4952  response regulator receiver protein  39.5 
 
 		 121 aa  99.4  1e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.699568  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0623  DNA-binding response regulator  35.54 
 
 		 231 aa  99.8  1e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000212568  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4323  two component LuxR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 215 aa  99.8  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.115662  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1991  two component transcriptional regulator  39.34 
 
 		 235 aa  99.8  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2709  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.16 
 
 		 236 aa  98.6  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0011921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1100  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.5 
 
 		 236 aa  99  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000182155 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0768  two component signal transduction response regulator  43.09 
 
 		 236 aa  98.6  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000566504  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2987  LuxR family two component transcriptional regulator  38.52 
 
 		 231 aa  99  2e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3155  two component transcriptional regulator  40.16 
 
 		 228 aa  98.6  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2427  response regulator receiver protein  38.02 
 
 		 159 aa  98.2  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.468058 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1659  two component transcriptional regulator  44.92 
 
 		 245 aa  98.6  3e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0588  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.83 
 
 		 226 aa  98.6  3e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.944339  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2316  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  43.22 
 
 		 230 aa  98.2  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1288  two component transcriptional regulator  38.33 
 
 		 228 aa  97.8  4e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3248  response regulator receiver protein  35 
 
 		 121 aa  97.8  4e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.500247 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0508  response regulator receiver domain-containing protein  36.44 
 
 		 121 aa  97.4  5e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.481314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2401  phosphate regulon transcriptional regulatory protein phoB  36.89 
 
 		 229 aa  97.4  5e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0893  winged helix family two component transcriptional regulator  40.98 
 
 		 233 aa  97.4  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2231  two component transcriptional regulator  38.52 
 
 		 234 aa  97.4  6e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0781  two component transcriptional regulator  40.98 
 
 		 233 aa  97.4  6e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.174075 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1011  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.98 
 
 		 231 aa  97.4  6e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0882  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.82 
 
 		 230 aa  97.4  6e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.148935 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0721  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.17 
 
 		 233 aa  97.1  7e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.811558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0059  response regulator receiver domain-containing protein  35.83 
 
 		 125 aa  97.1  7e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.157498  normal  0.212271 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1944  two component transcriptional regulator  39.83 
 
 		 238 aa  97.1  8e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1394  two component transcriptional regulator  37.29 
 
 		 236 aa  97.1  8e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000024965  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1893  two component transcriptional regulator  36.59 
 
 		 235 aa  96.7  9e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203788 
 
 
-
 
NC_004310  BR2143  phosphate regulon transcriptional regulatory protein Phob  40.34 
 
 		 228 aa  96.7  1e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2815  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  40 
 
 		 457 aa  96.3  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.631579  normal  0.0857187 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3036  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.02 
 
 		 273 aa  96.7  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0154  two component transcriptional regulator  37.29 
 
 		 238 aa  96.3  1e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.644268  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0393  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.83 
 
 		 227 aa  96.3  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.202895 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3968  response regulator receiver protein  36.21 
 
 		 125 aa  96.7  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1077  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.98 
 
 		 235 aa  96.3  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0758  response regulator receiver protein  35.9 
 
 		 132 aa  96.3  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0540632 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1860  two component LuxR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 235 aa  96.7  1e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1873  two component transcriptional regulator  41.46 
 
 		 226 aa  96.3  1e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2955  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.19 
 
 		 231 aa  96.3  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.800941 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0743  response regulator receiver protein  35.9 
 
 		 132 aa  96.3  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5215  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.84 
 
 		 217 aa  96.3  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3637  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.53 
 
 		 246 aa  96.3  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0951  response regulator receiver protein  37.61 
 
 		 239 aa  96.3  1e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000111905  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1005  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.47 
 
 		 227 aa  96.7  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000255449  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4050  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.45 
 
 		 227 aa  95.9  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00552008  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0504  response regulator receiver protein  39.32 
 
 		 129 aa  95.9  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0548558  normal  0.11151 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0804  two component transcriptional regulator  40.83 
 
 		 236 aa  95.9  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.324741  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3747  response regulator receiver protein  35.59 
 
 		 121 aa  95.5  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1572  two component transcriptional regulator  39.83 
 
 		 225 aa  95.9  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000784208  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3778  response regulator receiver domain-containing protein  38.33 
 
 		 124 aa  95.5  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3219  two component transcriptional regulator  42.15 
 
 		 241 aa  95.5  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.699117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0483  two component transcriptional regulator  36.89 
 
 		 229 aa  95.5  2e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.342081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2106  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.44 
 
 		 238 aa  95.5  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.6 
 
 		 234 aa  95.9  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.178035  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1997  two component transcriptional regulator  37.7 
 
 		 234 aa  95.1  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000742772  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1748  response regulator receiver  41.67 
 
 		 123 aa  95.5  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.122601  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>