More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2427 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_2427  response regulator receiver protein  100 
 
 		 159 aa  318  3e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.468058 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5113  response regulator receiver protein  74.58 
 
 		 121 aa  180  8.000000000000001e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3778  response regulator receiver domain-containing protein  61.54 
 
 		 124 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0237  response regulator receiver protein  62.39 
 
 		 124 aa  155  2e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000555979 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4150  response regulator receiver protein  59.83 
 
 		 125 aa  149  1e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.583085 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1632  response regulator receiver  63.25 
 
 		 123 aa  147  7e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2649  response regulator receiver protein  59.83 
 
 		 122 aa  146  9e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.857048  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0669  response regulator receiver protein  50 
 
 		 123 aa  133  9e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2044  response regulator receiver protein  48.28 
 
 		 123 aa  128  3e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0300859  normal  0.405857 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1501  response regulator receiver protein  46.34 
 
 		 132 aa  127  9.000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.153095  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2054  response regulator receiver protein  46.67 
 
 		 140 aa  126  2.0000000000000002e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0880044 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1901  response regulator receiver protein  48.31 
 
 		 125 aa  124  5e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2029  response regulator receiver protein  50.85 
 
 		 124 aa  124  7e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.371136 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4431  response regulator receiver domain-containing protein  47.5 
 
 		 125 aa  120  5e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2662  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.67 
 
 		 231 aa  114  3.9999999999999997e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1011  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.45 
 
 		 231 aa  114  6.9999999999999995e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2534  DNA-binding response regulator YycF  45.71 
 
 		 233 aa  113  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0415  two component transcriptional regulator  48.8 
 
 		 231 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.777838 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4009  two component transcriptional regulator  47.15 
 
 		 230 aa  112  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00751412  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4125  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.15 
 
 		 230 aa  110  7.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.125271  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4151  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.15 
 
 		 230 aa  110  8.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2333  two component transcriptional regulator  47.9 
 
 		 232 aa  110  9e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5589  DNA-binding response regulator YycF  44 
 
 		 235 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1714  response regulator receiver protein  45.45 
 
 		 126 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5259  two component transcriptional regulator  44 
 
 		 235 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000559572  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4006  two component transcriptional regulator  44 
 
 		 235 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010356  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0018  response regulator receiver  48 
 
 		 233 aa  110  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0018  two component transcriptional regulator  48 
 
 		 233 aa  110  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.70243  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1739  response regulator receiver protein  45.45 
 
 		 126 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5615  DNA-binding response regulator YycF  44 
 
 		 235 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5319  DNA-binding response regulator YycF  44 
 
 		 235 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.169223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5147  response regulator  44 
 
 		 235 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00168683  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5163  response regulator  44 
 
 		 235 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00196509  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0653  two-component response regulator PhoB  41.22 
 
 		 230 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.131558  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5715  DNA-binding response regulator YycF  44 
 
 		 235 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.656882  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5572  DNA-binding response regulator YycF  44 
 
 		 235 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.81316e-29 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5346  DNA-binding response regulator YycF  43.2 
 
 		 235 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000234523  hitchhiker  0.00000000000323141 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3394  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.9 
 
 		 230 aa  108  2.0000000000000002e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.103692  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5650  DNA-binding response regulator YycF  44 
 
 		 235 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00563499  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1135  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.86 
 
 		 227 aa  108  3e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0200  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.41 
 
 		 242 aa  108  4.0000000000000004e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0955644  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0609  DNA-binding response regulator  42.98 
 
 		 231 aa  107  5e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000282114  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1155  two component transcriptional regulator  44.54 
 
 		 231 aa  107  1e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000430064  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0567  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.55 
 
 		 225 aa  106  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.463355  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03750  PhoP-like protein  40.74 
 
 		 226 aa  106  1e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.181369  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1893  two component transcriptional regulator  40.15 
 
 		 235 aa  106  1e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203788 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2522  response regulator receiver  35.21 
 
 		 229 aa  106  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.661278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1865  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.76 
 
 		 226 aa  106  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0150  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  43.8 
 
 		 1177 aa  106  1e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0961  response regulator receiver protein  41.13 
 
 		 229 aa  105  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1077  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.92 
 
 		 235 aa  105  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2709  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.46 
 
 		 236 aa  105  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0011921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0251  response regulator receiver protein  34.43 
 
 		 126 aa  105  2e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.102048 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0951  response regulator receiver protein  41.22 
 
 		 239 aa  105  2e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000111905  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1276  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.88 
 
 		 242 aa  105  2e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.114994 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0623  DNA-binding response regulator  42.28 
 
 		 231 aa  105  3e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000212568  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2892  two component transcriptional regulator  41.32 
 
 		 227 aa  105  3e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0239565 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0499  winged helix family two component transcriptional regulator  41.84 
 
 		 229 aa  104  4e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1805  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  42.86 
 
 		 310 aa  105  4e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0638722  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0707  two component transcriptional regulator  41.27 
 
 		 232 aa  105  4e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5515  response regulator receiver protein  42.42 
 
 		 134 aa  104  5e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1750  two component transcriptional regulator  42.86 
 
 		 234 aa  104  6e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0105  DNA-binding response regulator  43.55 
 
 		 237 aa  104  6e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1784  alkaline phosphatase synthesis transcriptional regulatory protein  42.86 
 
 		 234 aa  104  6e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.561076  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2910  response regulator receiver  41.13 
 
 		 230 aa  103  7e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1955  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.89 
 
 		 236 aa  103  7e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.295041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0216  two component transcriptional regulator  42.86 
 
 		 230 aa  103  9e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.305183 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0588  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.98 
 
 		 226 aa  103  9e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.944339  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2464  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.42 
 
 		 229 aa  103  9e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1461  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.7 
 
 		 225 aa  103  9e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.616357  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0997  response regulator receiver  43.33 
 
 		 228 aa  103  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1673  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.54 
 
 		 233 aa  103  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2485  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.28 
 
 		 243 aa  103  1e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1950  DNA-binding response regulator  43.65 
 
 		 235 aa  103  1e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.100456  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1491  two component transcriptional regulator  38.89 
 
 		 236 aa  102  1e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00391258 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0766  two component transcriptional regulator  42.86 
 
 		 231 aa  103  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.585906  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1911  two component transcriptional regulator  40.94 
 
 		 229 aa  103  1e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.258551 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0399  two component transcriptional regulator  40.68 
 
 		 272 aa  103  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.802217  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2675  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.58 
 
 		 234 aa  102  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.661044  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2387  two component transcriptional regulator  42.28 
 
 		 229 aa  102  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00115026  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0471  two component transcriptional regulator  44.12 
 
 		 226 aa  102  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.734397 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4663  two component transcriptional regulator  45.38 
 
 		 232 aa  102  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4322  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.13 
 
 		 231 aa  102  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0937  two component transcriptional regulator  44.54 
 
 		 227 aa  102  2e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.834094  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1058  DNA-binding response regulator  43.8 
 
 		 227 aa  101  3e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000187393  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0940  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.72 
 
 		 237 aa  102  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.324642  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0080  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.52 
 
 		 230 aa  102  3e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3538  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.71 
 
 		 237 aa  102  3e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0603  two component transcriptional regulator  39.1 
 
 		 233 aa  102  3e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0519325  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1892  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.33 
 
 		 228 aa  101  4e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000392  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8215  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.13 
 
 		 226 aa  101  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6145  two component transcriptional regulator  40 
 
 		 228 aa  101  4e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.788201 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1256  alkaline phosphatase synthesis transcriptional regulatory protein PhoP  39.53 
 
 		 236 aa  101  5e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.577358  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0019  two component transcriptional regulator  40.91 
 
 		 235 aa  100  5e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_926  two-component system, OmpR family, response regulator  44.54 
 
 		 227 aa  101  5e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00200634  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4602  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.72 
 
 		 226 aa  101  5e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6310  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.43 
 
 		 261 aa  100  7e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.534044  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03700  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  40 
 
 		 226 aa  100  7e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.132847 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1802  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.88 
 
 		 232 aa  100  7e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.150286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0329  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.67 
 
 		 231 aa  100  8e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>