More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1501 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1501  response regulator receiver protein  100 
 
 		 132 aa  266  1e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.153095  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4150  response regulator receiver protein  54.62 
 
 		 125 aa  142  1e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.583085 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3778  response regulator receiver domain-containing protein  53.28 
 
 		 124 aa  138  3e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1632  response regulator receiver  52.07 
 
 		 123 aa  136  7e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2649  response regulator receiver protein  52.14 
 
 		 122 aa  136  1e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.857048  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0669  response regulator receiver protein  54.7 
 
 		 123 aa  133  9.999999999999999e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5113  response regulator receiver protein  47.9 
 
 		 121 aa  126  1.0000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2044  response regulator receiver protein  50 
 
 		 123 aa  125  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0300859  normal  0.405857 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0237  response regulator receiver protein  47.9 
 
 		 124 aa  126  1.0000000000000001e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000555979 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2054  response regulator receiver protein  51.72 
 
 		 140 aa  125  2.0000000000000002e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0880044 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2427  response regulator receiver protein  47.06 
 
 		 159 aa  125  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.468058 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1901  response regulator receiver protein  50.42 
 
 		 125 aa  124  4.0000000000000003e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0766  two component transcriptional regulator  44 
 
 		 228 aa  117  7e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0291358  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0202  two component transcriptional regulator  49.58 
 
 		 233 aa  117  7e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.382528  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1271  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.59 
 
 		 225 aa  116  7.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2143  phosphate regulon transcriptional regulatory protein Phob  44 
 
 		 228 aa  116  9.999999999999999e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1276  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.9 
 
 		 242 aa  116  9.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.114994 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2983  two component transcriptional regulator  46.03 
 
 		 228 aa  116  9.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0951  response regulator receiver protein  46.67 
 
 		 239 aa  116  9.999999999999999e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000111905  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2892  two component transcriptional regulator  48.76 
 
 		 227 aa  116  9.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0239565 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2029  response regulator receiver protein  47.9 
 
 		 124 aa  115  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.371136 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1991  two component transcriptional regulator  45.53 
 
 		 235 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3413  two component transcriptional regulator  47.54 
 
 		 252 aa  115  1.9999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.427436 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0567  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.22 
 
 		 225 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.463355  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0399  two component transcriptional regulator  42.5 
 
 		 272 aa  115  1.9999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.802217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5261  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.28 
 
 		 237 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.909356  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1102  DNA-binding response regulator  49.58 
 
 		 225 aa  114  3e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0511  phosphate regulon transcriptional regulatory protein phoB  45.53 
 
 		 234 aa  114  3e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.473137 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2058  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  44.35 
 
 		 228 aa  115  3e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.275433  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2952  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.76 
 
 		 225 aa  115  3e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4718  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  46.4 
 
 		 239 aa  114  3e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.220817 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0834  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  46.28 
 
 		 265 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0108417 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0640  two component transcriptional regulator  44.26 
 
 		 233 aa  114  3.9999999999999997e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.772339  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5185  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  46.72 
 
 		 234 aa  114  5e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.809056 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1911  two component transcriptional regulator  46.03 
 
 		 229 aa  114  5e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.258551 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7423  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  46.83 
 
 		 234 aa  114  6e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03750  PhoP-like protein  46.83 
 
 		 226 aa  113  6.9999999999999995e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.181369  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4918  two component transcriptional regulator  44.72 
 
 		 234 aa  113  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.134814 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2662  two component transcriptional regulator, winged helix family  45 
 
 		 231 aa  113  6.9999999999999995e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6685  two component transcriptional regulator  47.62 
 
 		 234 aa  113  7.999999999999999e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.599421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1572  two component transcriptional regulator  46.22 
 
 		 225 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000784208  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0588  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.97 
 
 		 226 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.944339  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5257  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.03 
 
 		 234 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.025536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0573  response regulator receiver protein  46.28 
 
 		 129 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.087024  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0781  two component transcriptional regulator  45.83 
 
 		 233 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.174075 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0893  winged helix family two component transcriptional regulator  45.83 
 
 		 233 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3143  response regulator receiver protein  45.9 
 
 		 124 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1394  two component transcriptional regulator  42.62 
 
 		 236 aa  112  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000024965  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1865  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.67 
 
 		 226 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2226  response regulator receiver protein  46.28 
 
 		 129 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.561592  normal  0.814785 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0485  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  42.98 
 
 		 227 aa  111  3e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.537934  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0483  two component transcriptional regulator  44.92 
 
 		 229 aa  111  3e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.342081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4546  two component transcriptional regulator  45.45 
 
 		 230 aa  111  3e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.281853 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2219  response regulator  47.01 
 
 		 123 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3155  two component transcriptional regulator  47.62 
 
 		 228 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2942  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.67 
 
 		 234 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1549  response regulator receiver protein  46.15 
 
 		 241 aa  110  5e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0273908  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0997  response regulator receiver  45.9 
 
 		 228 aa  110  5e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3116  two component transcriptional regulator  43.8 
 
 		 229 aa  110  8.000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.202822  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1802  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.97 
 
 		 232 aa  110  8.000000000000001e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.150286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1342  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.67 
 
 		 234 aa  110  9e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0144629  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2566  two component transcriptional regulator, winged helix family  50 
 
 		 229 aa  110  9e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000356007  hitchhiker  0.00345607 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6208  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.76 
 
 		 226 aa  110  9e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0743  response regulator receiver protein  49.15 
 
 		 132 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0603  two component transcriptional regulator  45.38 
 
 		 233 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0519325  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0882  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.46 
 
 		 230 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.148935 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0609  DNA-binding response regulator  42.28 
 
 		 231 aa  109  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000282114  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6002  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.31 
 
 		 243 aa  109  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.472724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2951  two component transcriptional regulator  45.16 
 
 		 236 aa  108  2.0000000000000002e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0758  response regulator receiver protein  49.57 
 
 		 132 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0540632 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03700  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  47.06 
 
 		 226 aa  108  2.0000000000000002e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.132847 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0653  two-component response regulator PhoB  44 
 
 		 230 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.131558  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10499  two component system sensor transduction protein regX3  45.97 
 
 		 227 aa  109  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  2.46064e-66  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2799  two component transcriptional regulator  47.5 
 
 		 236 aa  108  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000368356  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4929  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.6 
 
 		 226 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2106  two component transcriptional regulator, winged helix family  40 
 
 		 238 aa  109  2.0000000000000002e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0504  response regulator receiver protein  46.61 
 
 		 129 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0548558  normal  0.11151 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1402  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.34 
 
 		 241 aa  108  3e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.154165 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0216  two component transcriptional regulator  44.92 
 
 		 230 aa  108  3e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.305183 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2294  two component transcriptional regulator  44 
 
 		 228 aa  108  3e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.305192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0661  two component transcriptional regulator  44.8 
 
 		 228 aa  108  3e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0623  DNA-binding response regulator  42.28 
 
 		 231 aa  108  3e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000212568  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0674  two component transcriptional regulator  44.8 
 
 		 228 aa  108  3e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.850641 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0654  two component transcriptional regulator  44.8 
 
 		 228 aa  108  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.682961 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1472  response regulator receiver protein  40.5 
 
 		 122 aa  107  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.413604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6145  two component transcriptional regulator  45.6 
 
 		 228 aa  107  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.788201 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1197  response regulator receiver  46.4 
 
 		 230 aa  107  5e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0615  two component transcriptional regulator  44.09 
 
 		 228 aa  107  5e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0841359  normal  0.719107 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0471  two component transcriptional regulator  44.8 
 
 		 226 aa  107  5e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.734397 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7562  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.76 
 
 		 273 aa  107  5e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.320599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1077  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.2 
 
 		 235 aa  107  6e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2768  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  43.9 
 
 		 229 aa  107  6e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0176064  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0082  two component transcriptional regulator  44.35 
 
 		 228 aa  107  6e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0124  two component transcriptional regulator  41.32 
 
 		 227 aa  107  7.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.352403 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02690  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  45.53 
 
 		 229 aa  107  7.000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2387  two component transcriptional regulator  45.38 
 
 		 229 aa  107  7.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00115026  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1522  two component transcriptional regulator  52.03 
 
 		 227 aa  107  7.000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0831  two component transcriptional regulator  44.35 
 
 		 228 aa  107  8.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.310785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0695  response regulator receiver  40.16 
 
 		 170 aa  106  9.000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.412637  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1538  phosphate regulon transcriptional regulatory protein  43.33 
 
 		 228 aa  106  9.000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.280381 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>