More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1402 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_1402  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 241 aa  484  1e-136  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.154165 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2988  two component transcriptional regulator, winged helix family  66.39 
 
 		 256 aa  313  1.9999999999999998e-84  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0673  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.85 
 
 		 235 aa  217  1e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.996485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3446  response regulator receiver  44.74 
 
 		 234 aa  209  2e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.664648  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3569  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.93 
 
 		 235 aa  202  3e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1291  two component transcriptional regulator  46.93 
 
 		 240 aa  199  3e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000572556  hitchhiker  0.0000375019 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2942  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.59 
 
 		 234 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1342  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.59 
 
 		 234 aa  196  3e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0144629  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0507  two component transcriptional regulator  44.3 
 
 		 236 aa  194  9e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1879  DNA-binding response regulator  46.05 
 
 		 238 aa  194  1e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000557668  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0622  two component transcriptional regulator  41.7 
 
 		 240 aa  189  2.9999999999999997e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1334  two component transcriptional regulator  44.74 
 
 		 243 aa  187  1e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.592557  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1100  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.85 
 
 		 236 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000182155 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1848  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.91 
 
 		 236 aa  183  3e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0065624  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0768  two component signal transduction response regulator  44.68 
 
 		 236 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000566504  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3061  two component transcriptional regulator  41.85 
 
 		 229 aa  181  6e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.296421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0997  two component transcriptional regulator  44.69 
 
 		 230 aa  177  1e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.679101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4665  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.15 
 
 		 235 aa  176  4e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.880727  normal  0.209776 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0411  two component transcriptional regulator  42.17 
 
 		 230 aa  175  5e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4159  two component transcriptional regulator  43.29 
 
 		 230 aa  174  8e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.667277  normal  0.0359145 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3818  two component transcriptional regulator  44.25 
 
 		 230 aa  174  8e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.386967  normal  0.165932 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4388  DNA-binding response regulator  38.16 
 
 		 227 aa  170  1e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3821  response regulator receiver  39.15 
 
 		 264 aa  170  2e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.169085  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2910  response regulator receiver  40.35 
 
 		 230 aa  169  5e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0135  DNA-binding response regulator  39.56 
 
 		 230 aa  168  9e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0511  phosphate regulon transcriptional regulatory protein phoB  43.22 
 
 		 234 aa  167  1e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.473137 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0440  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.61 
 
 		 230 aa  167  1e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6145  two component transcriptional regulator  40.27 
 
 		 228 aa  166  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.788201 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1012  two component transcriptional regulator  42.31 
 
 		 257 aa  166  2e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.658807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0439  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.61 
 
 		 230 aa  167  2e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2193  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.16 
 
 		 237 aa  167  2e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0620475  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8215  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.41 
 
 		 226 aa  166  2.9999999999999998e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4054  two component transcriptional regulator  38.57 
 
 		 226 aa  166  4e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.271916 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0804  two component transcriptional regulator  41.41 
 
 		 236 aa  166  4e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.324741  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3566  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.16 
 
 		 228 aa  165  5e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.720677 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1441  two component transcriptional regulator  43.5 
 
 		 247 aa  165  5e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.167327  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1174  two component transcriptional regulator  39.22 
 
 		 239 aa  164  9e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0707  winged helix family two component transcriptional regulator  45.05 
 
 		 222 aa  164  9e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1136  two component transcriptional regulator  39.22 
 
 		 239 aa  164  9e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000652217  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1333  response regulator receiver protein  45.05 
 
 		 222 aa  164  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.40527  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5286  two component transcriptional regulator  41.56 
 
 		 240 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.498861 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03750  PhoP-like protein  40.62 
 
 		 226 aa  164  1.0000000000000001e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.181369  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0987  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.95 
 
 		 233 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.195539  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4918  two component transcriptional regulator  42.08 
 
 		 234 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.134814 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0834  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  44.54 
 
 		 265 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0108417 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0700  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.15 
 
 		 226 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.768939  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4657  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.33 
 
 		 240 aa  162  3e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0893  winged helix family two component transcriptional regulator  43.67 
 
 		 233 aa  162  3e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0640  two component transcriptional regulator  43.23 
 
 		 233 aa  162  3e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.772339  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4687  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.82 
 
 		 230 aa  163  3e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000280381  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3369  two component transcriptional regulator  41.13 
 
 		 250 aa  162  4.0000000000000004e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.881494  normal  0.845013 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0781  two component transcriptional regulator  43.67 
 
 		 233 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.174075 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5261  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.1 
 
 		 237 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.909356  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1991  two component transcriptional regulator  43.23 
 
 		 235 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6397  response regulator receiver protein  45.45 
 
 		 237 aa  162  5.0000000000000005e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.680662  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1341  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.33 
 
 		 226 aa  162  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5311  two component transcriptional regulator  41.77 
 
 		 246 aa  162  5.0000000000000005e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.554395  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4122  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.24 
 
 		 223 aa  161  7e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4322  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.71 
 
 		 231 aa  161  8.000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3352  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.62 
 
 		 225 aa  161  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2765  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.62 
 
 		 225 aa  161  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.497538  normal  0.0218205 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2903  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.23 
 
 		 234 aa  160  1e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  40.09 
 
 		 229 aa  161  1e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2106  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.36 
 
 		 238 aa  160  2e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1871  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.24 
 
 		 226 aa  160  2e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.105791  normal  0.266081 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0378  two component transcriptional regulator  36.44 
 
 		 245 aa  160  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2741  winged helix family two component transcriptional regulator  40.87 
 
 		 250 aa  160  2e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0957275  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0499  winged helix family two component transcriptional regulator  41.07 
 
 		 229 aa  160  2e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2845  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.26 
 
 		 234 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1838  two component transcriptional regulator  37.5 
 
 		 239 aa  160  2e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000194698  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0916  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.62 
 
 		 234 aa  160  2e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0276045  hitchhiker  9.727110000000001e-18 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1394  two component transcriptional regulator  37.93 
 
 		 236 aa  160  2e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000024965  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1304  DNA-binding response regulator  39.56 
 
 		 235 aa  159  3e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.18531  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0603  two component transcriptional regulator  39.5 
 
 		 233 aa  159  3e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0519325  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1414  two component transcriptional regulator  39.11 
 
 		 235 aa  159  3e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3703  two component transcriptional regulator  38.26 
 
 		 232 aa  159  3e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.230236  normal  0.0884672 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2763  DNA-binding response regulator  39.56 
 
 		 235 aa  159  3e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0137809  hitchhiker  0.000236663 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0019  two component transcriptional regulator  41.05 
 
 		 235 aa  159  3e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2742  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.2 
 
 		 230 aa  159  4e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.142828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4916  response regulator receiver protein  41.33 
 
 		 233 aa  159  5e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1546  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.75 
 
 		 237 aa  158  8e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000115937  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0287  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.39 
 
 		 229 aa  158  8e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00220806  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2983  two component transcriptional regulator  41.33 
 
 		 228 aa  158  9e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3302  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.09 
 
 		 231 aa  157  1e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000343135 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0470  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.48 
 
 		 239 aa  157  1e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0260801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1980  osmolarity response regulator  39.57 
 
 		 243 aa  157  1e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.431202  normal  0.459947 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2549  response regulator receiver  41.26 
 
 		 222 aa  157  1e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5089  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.84 
 
 		 242 aa  157  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.160869  normal  0.250223 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0835  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.44 
 
 		 222 aa  157  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000540746 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0378  two component transcriptional regulator  41.38 
 
 		 234 aa  157  1e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_143  DNA-binding response regulator, two-component system, OmpR family  37.33 
 
 		 256 aa  157  1e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2027  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.42 
 
 		 240 aa  156  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.51435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4347  two component transcriptional regulator  40.89 
 
 		 236 aa  157  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4718  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  42.6 
 
 		 239 aa  157  2e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.220817 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0208  two component transcriptional regulator  39.42 
 
 		 240 aa  156  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4929  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.29 
 
 		 226 aa  157  2e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0188  two component transcriptional regulator  41.52 
 
 		 245 aa  157  2e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00347389  normal  0.0545477 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0202  two component transcriptional regulator  42.86 
 
 		 233 aa  156  2e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.382528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5185  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  42.6 
 
 		 234 aa  157  2e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.809056 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0489  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.83 
 
 		 234 aa  156  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.210896  normal  0.371413 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>