More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1522 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1522  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 227 aa  434  1e-121  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1066  two component transcriptional regulator, winged helix family  66.36 
 
 		 222 aa  278  5e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0031  two component transcriptional regulator, winged helix family  65.16 
 
 		 234 aa  271  6e-72  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0123  two component transcriptional regulator  52.42 
 
 		 241 aa  223  3e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2735  two component transcriptional regulator  52.42 
 
 		 228 aa  219  3e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.223671 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0738  two component transcriptional regulator, winged helix family  58.04 
 
 		 223 aa  217  1e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00000283527  decreased coverage  0.00121253 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2612  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.97 
 
 		 228 aa  216  2e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0412974  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4321  two component transcriptional regulator  52.19 
 
 		 248 aa  215  4e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.173505 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3972  two component transcriptional regulator  48.67 
 
 		 242 aa  207  2e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3225  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.66 
 
 		 231 aa  203  2e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.202731  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3133  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.54 
 
 		 231 aa  202  2e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04836  two-component system regulatory protein  51.11 
 
 		 229 aa  202  4e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4353  two component transcriptional regulator  49.56 
 
 		 245 aa  201  9e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05646  two-component response regulator transcription regulator protein  46.88 
 
 		 219 aa  198  7e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3084  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  50.89 
 
 		 229 aa  197  7.999999999999999e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.692731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6822  two component transcriptional regulator  46.72 
 
 		 229 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.22547 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2228  two component transcriptional regulator  46.46 
 
 		 222 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00319429  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1792  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.7 
 
 		 249 aa  196  2.0000000000000003e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.783202  normal  0.482984 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4473  two component transcriptional regulator  48.67 
 
 		 230 aa  196  3e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3634  two component transcriptional regulator  48.67 
 
 		 230 aa  196  3e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.966844 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3893  two component transcriptional regulator  48.67 
 
 		 230 aa  196  3e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.742854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5049  two component transcriptional regulator  48.68 
 
 		 259 aa  195  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.839238  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5811  two component transcriptional regulator  48.68 
 
 		 245 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.244111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4368  two component transcriptional regulator  48.68 
 
 		 245 aa  195  6e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3292  two component transcriptional regulator  45.37 
 
 		 225 aa  195  6e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.580789  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2774  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.96 
 
 		 245 aa  194  9e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1014  two component transcriptional regulator  45.33 
 
 		 244 aa  193  1e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4321  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.77 
 
 		 219 aa  192  3e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0131168 
 
 
-
 
NC_003296  RS05454  two component response regulator transcription regulator protein  47.62 
 
 		 256 aa  192  3e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.169333 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2868  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  46.4 
 
 		 227 aa  192  3e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0808147  normal  0.133304 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4211  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.77 
 
 		 219 aa  192  3e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1681  response regulator receiver protein  42.73 
 
 		 227 aa  192  3e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0956507  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0360  two component signal transduction response regulator  44.93 
 
 		 224 aa  192  4e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4359  two component transcriptional regulator  47.14 
 
 		 229 aa  192  5e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1497  two component transcriptional regulator  44.49 
 
 		 263 aa  191  6e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3050  two component transcriptional regulator  48.03 
 
 		 245 aa  190  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.545982  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2692  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.66 
 
 		 229 aa  190  2e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1461  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.43 
 
 		 225 aa  188  5e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.616357  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1504  two component transcriptional regulator  45.3 
 
 		 231 aa  188  5e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263867  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0988  response regulator BaeR  42.53 
 
 		 227 aa  188  5e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000405458  normal  0.303622 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.26 
 
 		 235 aa  188  5.999999999999999e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0646165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3737  two component transcriptional regulator  47.81 
 
 		 231 aa  187  1e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273603 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0393  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.02 
 
 		 227 aa  187  1e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.202895 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3118  DNA-binding response regulator  45.13 
 
 		 227 aa  186  2e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2476  two component transcriptional regulator  48.2 
 
 		 241 aa  186  2e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000027247 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2526  two component transcriptional regulator  47.81 
 
 		 262 aa  186  3e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.262723  normal  0.926116 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03764  two-component system regulatory protein  47.06 
 
 		 247 aa  186  3e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2929  two component transcriptional regulator  47.83 
 
 		 250 aa  185  4e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.449606  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3557  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  44.84 
 
 		 239 aa  184  1.0000000000000001e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0258  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.67 
 
 		 236 aa  183  2.0000000000000003e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.606292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11690  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  42.67 
 
 		 236 aa  182  2.0000000000000003e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.52451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1802  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.39 
 
 		 232 aa  182  4.0000000000000006e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.150286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2485  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.12 
 
 		 243 aa  182  4.0000000000000006e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0968  two component transcriptional regulator  45.37 
 
 		 227 aa  182  4.0000000000000006e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  unclonable  0.00000000899876  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00330  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  43.11 
 
 		 240 aa  182  4.0000000000000006e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00972196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3929  two component transcriptional regulator  46.05 
 
 		 247 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0978  two component transcriptional regulator  47.77 
 
 		 321 aa  182  5.0000000000000004e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.323902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1493  two component transcriptional regulator  46.29 
 
 		 232 aa  181  6e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12584  normal  0.340507 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09580  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  46.12 
 
 		 244 aa  181  1e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.132168 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1307  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  42.98 
 
 		 242 aa  180  1e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2118  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.93 
 
 		 238 aa  181  1e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.717558  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1897  two component transcriptional regulator  45.78 
 
 		 227 aa  180  2e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.151466  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2796  DNA-binding response regulator  37.83 
 
 		 231 aa  180  2e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.512352  hitchhiker  0.00000533196 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1562  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  44.44 
 
 		 240 aa  179  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.279171  normal  0.454228 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1028  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.64 
 
 		 237 aa  179  2.9999999999999997e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2707  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  44.74 
 
 		 243 aa  179  2.9999999999999997e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.33731  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1954  two component transcriptional regulator  50.88 
 
 		 253 aa  179  2.9999999999999997e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.897911  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1367  two component transcriptional regulator, winged helix family  44 
 
 		 230 aa  179  2.9999999999999997e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000177207  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2526  DNA-binding response regulator  37.83 
 
 		 231 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2872  two component transcriptional regulator  44.39 
 
 		 226 aa  179  2.9999999999999997e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.702853  hitchhiker  0.00802276 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2972  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  42.98 
 
 		 242 aa  179  4e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0969  two component transcriptional regulator  40.89 
 
 		 226 aa  179  4e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.165699  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2385  DNA-binding response regulator  37.93 
 
 		 231 aa  178  4.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.534853  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2341  DNA-binding response regulator  37.93 
 
 		 231 aa  178  4.999999999999999e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000166477  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2302  DNA-binding response regulator  37.83 
 
 		 231 aa  178  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2561  DNA-binding response regulator  37.93 
 
 		 231 aa  178  4.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.630654  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2574  DNA-binding response regulator  37.93 
 
 		 231 aa  178  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000040017 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14310  Response regulator  47.3 
 
 		 226 aa  178  4.999999999999999e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3019  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  44 
 
 		 240 aa  178  4.999999999999999e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0767733 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2566  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.87 
 
 		 229 aa  178  5.999999999999999e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000356007  hitchhiker  0.00345607 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2564  DNA-binding response regulator  37.83 
 
 		 231 aa  178  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0589521  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2689  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  44.54 
 
 		 240 aa  178  5.999999999999999e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3061  two component transcriptional regulator  46.46 
 
 		 227 aa  178  7e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.799336  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0489  two component transcriptional regulator  46.72 
 
 		 228 aa  178  7e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2617  DNA-binding response regulator  37.93 
 
 		 231 aa  178  7e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.993672  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1271  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.21 
 
 		 225 aa  177  8e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2368  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  44 
 
 		 240 aa  177  8e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.531777  normal  0.413146 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2477  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  44 
 
 		 240 aa  177  8e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2261  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  44 
 
 		 240 aa  177  8e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.806239  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2361  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  44 
 
 		 240 aa  177  8e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4259  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.78 
 
 		 230 aa  177  9e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.602522  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1327  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  41.59 
 
 		 239 aa  177  9e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1210  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  41.59 
 
 		 239 aa  177  9e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000498147  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1784  alkaline phosphatase synthesis transcriptional regulatory protein  42.42 
 
 		 234 aa  177  1e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.561076  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1485  response regulator receiver  44 
 
 		 235 aa  177  1e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.236897  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3098  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  41.59 
 
 		 239 aa  177  1e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0001052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2317  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  44 
 
 		 240 aa  177  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.539006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1750  two component transcriptional regulator  42.42 
 
 		 234 aa  177  1e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2782  two component transcriptional regulator  45.5 
 
 		 231 aa  177  1e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.92379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2981  two component transcriptional regulator  43.23 
 
 		 229 aa  177  1e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000201285  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>