More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_4359 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010086  Bmul_4359  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 229 aa  456  1e-127  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6822  two component transcriptional regulator  79.48 
 
 		 229 aa  373  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.22547 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3634  two component transcriptional regulator  70.61 
 
 		 230 aa  316  2e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.966844 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4473  two component transcriptional regulator  70.61 
 
 		 230 aa  316  2e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3893  two component transcriptional regulator  70.61 
 
 		 230 aa  316  2e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.742854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2612  two component transcriptional regulator, winged helix family  59.21 
 
 		 228 aa  276  2e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0412974  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2735  two component transcriptional regulator  60 
 
 		 228 aa  270  1e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.223671 
 
 
-
 
NC_003296  RS05454  two component response regulator transcription regulator protein  56.44 
 
 		 256 aa  250  1e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.169333 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2118  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.95 
 
 		 238 aa  248  7e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.717558  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2774  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.39 
 
 		 245 aa  245  4e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1014  two component transcriptional regulator  52.47 
 
 		 244 aa  243  1.9999999999999999e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4368  two component transcriptional regulator  53.78 
 
 		 245 aa  242  3e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2929  two component transcriptional regulator  54.55 
 
 		 250 aa  243  3e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.449606  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5049  two component transcriptional regulator  53.78 
 
 		 259 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.839238  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5811  two component transcriptional regulator  53.78 
 
 		 245 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.244111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3050  two component transcriptional regulator  54.67 
 
 		 245 aa  240  1e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.545982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2526  two component transcriptional regulator  54.87 
 
 		 262 aa  240  1e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.262723  normal  0.926116 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4353  two component transcriptional regulator  53.33 
 
 		 245 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1954  two component transcriptional regulator  56.64 
 
 		 253 aa  234  1.0000000000000001e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.897911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6779  two component transcriptional regulator  53.51 
 
 		 229 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.652587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5742  two component transcriptional regulator  53.12 
 
 		 342 aa  231  6e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0760421  hitchhiker  0.00137021 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3972  two component transcriptional regulator  51.77 
 
 		 242 aa  231  8.000000000000001e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1792  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.29 
 
 		 249 aa  228  6e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.783202  normal  0.482984 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0123  two component transcriptional regulator  50.44 
 
 		 241 aa  218  6e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1066  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.22 
 
 		 222 aa  217  1e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0031  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.78 
 
 		 234 aa  213  9.999999999999999e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1497  two component transcriptional regulator  45.81 
 
 		 263 aa  209  3e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4321  two component transcriptional regulator  47.83 
 
 		 248 aa  202  3e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.173505 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04836  two-component system regulatory protein  45.09 
 
 		 229 aa  193  2e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1522  two component transcriptional regulator  47.14 
 
 		 227 aa  192  5e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2692  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.75 
 
 		 229 aa  187  1e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3225  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.75 
 
 		 231 aa  184  9e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.202731  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3084  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  43.75 
 
 		 229 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.692731  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1058  DNA-binding response regulator  42.79 
 
 		 227 aa  172  2.9999999999999996e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000187393  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1028  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.29 
 
 		 237 aa  172  2.9999999999999996e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_926  two-component system, OmpR family, response regulator  42.79 
 
 		 227 aa  170  2e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00200634  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0937  two component transcriptional regulator  42.54 
 
 		 227 aa  168  5e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.834094  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1681  response regulator receiver protein  39.3 
 
 		 227 aa  167  9e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0956507  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3133  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.07 
 
 		 231 aa  167  1e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  43.23 
 
 		 229 aa  164  1.0000000000000001e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2868  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  45.13 
 
 		 227 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0808147  normal  0.133304 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2286  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.44 
 
 		 231 aa  163  2.0000000000000002e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000188753  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3302  two component transcriptional regulator  40.35 
 
 		 230 aa  163  2.0000000000000002e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.288231  normal  0.346827 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3429  two component transcriptional regulator  39.04 
 
 		 233 aa  161  7e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0608192  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4477  response regulator receiver  45.95 
 
 		 228 aa  161  8.000000000000001e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0220713 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1897  two component transcriptional regulator  40.27 
 
 		 227 aa  161  1e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.151466  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3305  DNA-binding response regulator BaeR  40 
 
 		 232 aa  159  2e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.304306  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0766  two component transcriptional regulator  38.6 
 
 		 231 aa  160  2e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.585906  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1155  two component transcriptional regulator  39.13 
 
 		 231 aa  160  2e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000430064  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3737  two component transcriptional regulator  43.17 
 
 		 231 aa  159  3e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273603 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1658  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.43 
 
 		 230 aa  159  3e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.515101  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1493  two component transcriptional regulator  44.44 
 
 		 232 aa  159  4e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12584  normal  0.340507 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0988  response regulator BaeR  39.91 
 
 		 227 aa  158  7e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000405458  normal  0.303622 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3335  two component transcriptional regulator  40.77 
 
 		 230 aa  157  1e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.428008 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2476  two component transcriptional regulator  44 
 
 		 241 aa  157  1e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000027247 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2273  two component transcriptional regulator  53.38 
 
 		 154 aa  157  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.59177 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1104  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.98 
 
 		 233 aa  156  2e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1527  two component transcriptional regulator  38.77 
 
 		 230 aa  157  2e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.255733  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1288  two component transcriptional regulator  36.61 
 
 		 228 aa  156  2e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1696  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.84 
 
 		 224 aa  155  4e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1847  two component transcriptional regulator  38.53 
 
 		 234 aa  155  4e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000121968  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04130  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  42.11 
 
 		 236 aa  155  5.0000000000000005e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.118973  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2401  phosphate regulon transcriptional regulatory protein phoB  41.05 
 
 		 229 aa  155  5.0000000000000005e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0969  two component transcriptional regulator  40.81 
 
 		 226 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.165699  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1903  two component transcriptional regulator  40.17 
 
 		 230 aa  155  5.0000000000000005e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0393  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.53 
 
 		 227 aa  154  1e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.202895 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4321  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.96 
 
 		 219 aa  154  1e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0131168 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4211  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.96 
 
 		 219 aa  154  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3557  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  42.41 
 
 		 239 aa  153  2e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0882  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.48 
 
 		 230 aa  153  2e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.148935 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1504  two component transcriptional regulator  40.79 
 
 		 231 aa  154  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263867  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5196  DNA-binding response regulator CreB  42.15 
 
 		 226 aa  153  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247569 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2522  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.04 
 
 		 226 aa  153  2e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2281  two component transcriptional regulator  39.3 
 
 		 229 aa  153  2e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.331932  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3409  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.28 
 
 		 236 aa  153  2e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1408  two component transcriptional regulator  36.09 
 
 		 232 aa  153  2e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2441  two component transcriptional regulator  40.87 
 
 		 233 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.325552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4871  DNA-binding response regulator CreB  42.86 
 
 		 226 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.608103  normal  0.305164 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1456  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.89 
 
 		 223 aa  152  4e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000183373  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1962  DNA-binding response regulator  36.52 
 
 		 225 aa  152  5e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.597164  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1104  response regulator receiver protein  39.66 
 
 		 222 aa  152  5e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0360  DNA-binding response regulator CreB  42.15 
 
 		 226 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.48199  normal  0.18469 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0357  DNA-binding response regulator CreB  43.56 
 
 		 226 aa  151  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.501858  normal  0.680539 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3394  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.17 
 
 		 230 aa  152  5.9999999999999996e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.103692  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0353  two component transcriptional regulator  41.53 
 
 		 230 aa  151  5.9999999999999996e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.683455 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2844  two component transcriptional regulator  40.99 
 
 		 248 aa  151  7e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2811  DNA-binding response regulator  37.5 
 
 		 228 aa  151  7e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3366  DNA-binding response regulator  36.52 
 
 		 225 aa  151  8e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.166078  hitchhiker  0.00000000000000126215 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2015  two component transcriptional regulator  40.35 
 
 		 233 aa  151  8e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.582968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2933  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.56 
 
 		 233 aa  151  8e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0164541  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4990  two component transcriptional regulator  44.14 
 
 		 228 aa  151  8.999999999999999e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.866601  hitchhiker  0.000134834 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1367  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.09 
 
 		 230 aa  151  8.999999999999999e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000177207  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0558  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.67 
 
 		 237 aa  151  8.999999999999999e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05646  two-component response regulator transcription regulator protein  40.18 
 
 		 219 aa  150  1e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2162  phosphate regulon transcriptional regulatory protein phoB  41.15 
 
 		 235 aa  150  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308703  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1623  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  39.91 
 
 		 233 aa  150  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1271  two component transcriptional regulator  40.09 
 
 		 233 aa  151  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.624894  normal  0.128476 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2180  two component transcriptional regulator  40.87 
 
 		 235 aa  150  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0753297 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1490  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  39.91 
 
 		 233 aa  150  1e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.72233  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1520  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  39.91 
 
 		 233 aa  150  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>