More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B3050 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B3050  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 245 aa  489  1e-137  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.545982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5049  two component transcriptional regulator  91.43 
 
 		 259 aa  447  1e-125  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.839238  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5811  two component transcriptional regulator  92.15 
 
 		 245 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.244111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4368  two component transcriptional regulator  92.56 
 
 		 245 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4353  two component transcriptional regulator  88.43 
 
 		 245 aa  429  1e-119  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05454  two component response regulator transcription regulator protein  81.97 
 
 		 256 aa  413  1e-114  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.169333 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2774  two component transcriptional regulator, winged helix family  75.76 
 
 		 245 aa  338  4e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2526  two component transcriptional regulator  75.86 
 
 		 262 aa  338  5.9999999999999996e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.262723  normal  0.926116 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1014  two component transcriptional regulator  65.53 
 
 		 244 aa  324  6e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5742  two component transcriptional regulator  68.7 
 
 		 342 aa  316  2e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0760421  hitchhiker  0.00137021 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2929  two component transcriptional regulator  64.75 
 
 		 250 aa  311  5.999999999999999e-84  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.449606  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3972  two component transcriptional regulator  67.09 
 
 		 242 aa  311  6.999999999999999e-84  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2118  two component transcriptional regulator, winged helix family  67.11 
 
 		 238 aa  305  3e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.717558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1792  two component transcriptional regulator, winged helix family  64.17 
 
 		 249 aa  297  1e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.783202  normal  0.482984 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2735  two component transcriptional regulator  65.07 
 
 		 228 aa  293  2e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.223671 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2612  two component transcriptional regulator, winged helix family  64.44 
 
 		 228 aa  285  5e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0412974  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1954  two component transcriptional regulator  66.81 
 
 		 253 aa  279  3e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.897911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1497  two component transcriptional regulator  53.78 
 
 		 263 aa  260  1e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6822  two component transcriptional regulator  56.39 
 
 		 229 aa  252  3e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.22547 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3634  two component transcriptional regulator  54.63 
 
 		 230 aa  248  7e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.966844 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4473  two component transcriptional regulator  54.63 
 
 		 230 aa  248  7e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3893  two component transcriptional regulator  54.63 
 
 		 230 aa  248  7e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.742854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0123  two component transcriptional regulator  56.56 
 
 		 241 aa  247  1e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4359  two component transcriptional regulator  54.67 
 
 		 229 aa  240  2e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0031  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.71 
 
 		 234 aa  234  1.0000000000000001e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1066  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.64 
 
 		 222 aa  231  7.000000000000001e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4321  two component transcriptional regulator  54.01 
 
 		 248 aa  226  3e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.173505 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2692  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.16 
 
 		 229 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3084  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  48 
 
 		 229 aa  199  3e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.692731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04836  two-component system regulatory protein  49.78 
 
 		 229 aa  196  3e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3225  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.67 
 
 		 231 aa  194  9e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.202731  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3133  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.11 
 
 		 231 aa  193  3e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1522  two component transcriptional regulator  48.03 
 
 		 227 aa  190  1e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6779  two component transcriptional regulator  44.05 
 
 		 229 aa  186  3e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.652587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3429  two component transcriptional regulator  43.67 
 
 		 233 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0608192  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1058  DNA-binding response regulator  44 
 
 		 227 aa  171  1e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000187393  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0937  two component transcriptional regulator  43.56 
 
 		 227 aa  169  4e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.834094  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2286  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.98 
 
 		 231 aa  169  5e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000188753  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1028  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.85 
 
 		 237 aa  168  7e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1681  response regulator receiver protein  40.79 
 
 		 227 aa  167  1e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0956507  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1897  two component transcriptional regulator  43.61 
 
 		 227 aa  166  2e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.151466  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2273  two component transcriptional regulator  56.95 
 
 		 154 aa  167  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.59177 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0738  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.22 
 
 		 223 aa  166  2.9999999999999998e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00000283527  decreased coverage  0.00121253 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_926  two-component system, OmpR family, response regulator  43.56 
 
 		 227 aa  166  4e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00200634  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3739  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.53 
 
 		 230 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000466515  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2566  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.93 
 
 		 229 aa  163  2.0000000000000002e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000356007  hitchhiker  0.00345607 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2333  two component transcriptional regulator  40.43 
 
 		 232 aa  163  3e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0393  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.91 
 
 		 227 aa  162  5.0000000000000005e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.202895 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2845  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.24 
 
 		 234 aa  162  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2387  two component transcriptional regulator  41.38 
 
 		 229 aa  162  5.0000000000000005e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00115026  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3061  two component transcriptional regulator  41.56 
 
 		 227 aa  158  8e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.799336  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6330  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.22 
 
 		 234 aa  157  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.000626879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3737  two component transcriptional regulator  43.91 
 
 		 231 aa  157  1e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273603 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2892  two component transcriptional regulator  41.38 
 
 		 227 aa  157  1e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0239565 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2302  DNA-binding response regulator  40.87 
 
 		 231 aa  156  3e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0969  two component transcriptional regulator  40.27 
 
 		 226 aa  156  3e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.165699  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4585  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.33 
 
 		 234 aa  156  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.209184  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2564  DNA-binding response regulator  40.87 
 
 		 231 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0589521  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1485  response regulator receiver  42.67 
 
 		 235 aa  155  6e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.236897  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0644  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.72 
 
 		 236 aa  155  7e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2385  DNA-binding response regulator  40.87 
 
 		 231 aa  155  8e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.534853  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2341  DNA-binding response regulator  40.87 
 
 		 231 aa  155  8e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000166477  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0805  two component transcriptional regulator  43.1 
 
 		 229 aa  154  8e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2574  DNA-binding response regulator  40.87 
 
 		 231 aa  155  8e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000040017 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2561  DNA-binding response regulator  40.87 
 
 		 231 aa  155  8e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.630654  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.06 
 
 		 235 aa  155  8e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0646165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3782  response regulator receiver  42.49 
 
 		 297 aa  154  9e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2617  DNA-binding response regulator  40.87 
 
 		 231 aa  154  1e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.993672  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1527  two component transcriptional regulator  40.52 
 
 		 230 aa  154  1e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.255733  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2782  two component transcriptional regulator  40.79 
 
 		 231 aa  154  1e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.92379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0988  response regulator BaeR  37.17 
 
 		 227 aa  154  1e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000405458  normal  0.303622 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1673  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.97 
 
 		 233 aa  154  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2358  two component transcriptional regulator  41.15 
 
 		 231 aa  153  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0136772  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2796  DNA-binding response regulator  40.43 
 
 		 231 aa  153  2e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.512352  hitchhiker  0.00000533196 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0258  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.04 
 
 		 236 aa  154  2e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.606292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1367  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.17 
 
 		 230 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000177207  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3118  DNA-binding response regulator  42.48 
 
 		 227 aa  152  2.9999999999999998e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0132  response regulator receiver protein  40.97 
 
 		 231 aa  153  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01481  two-component response regulator  41 
 
 		 248 aa  153  2.9999999999999998e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04130  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  42.31 
 
 		 236 aa  152  4e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.118973  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1104  two component transcriptional regulator, winged helix family  40 
 
 		 233 aa  152  5e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3302  two component transcriptional regulator  36.56 
 
 		 230 aa  152  5e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.288231  normal  0.346827 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  40.09 
 
 		 229 aa  152  5e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3098  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  38.91 
 
 		 239 aa  152  5e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0001052  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3305  DNA-binding response regulator BaeR  38.7 
 
 		 232 aa  152  5.9999999999999996e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.304306  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2526  DNA-binding response regulator  39.74 
 
 		 231 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1155  two component transcriptional regulator  35.96 
 
 		 231 aa  151  8e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000430064  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4657  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.83 
 
 		 240 aa  150  1e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1176  two component transcriptional regulator  40.79 
 
 		 229 aa  151  1e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.149936 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0960  two component transcriptional regulator  42.11 
 
 		 236 aa  150  1e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0214647 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1504  two component transcriptional regulator  40.35 
 
 		 231 aa  151  1e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263867  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6310  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.86 
 
 		 261 aa  150  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.534044  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2001  DNA-binding response regulator  41.56 
 
 		 225 aa  150  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3028  DNA-binding response regulator  41.56 
 
 		 225 aa  150  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0360  two component signal transduction response regulator  42.29 
 
 		 224 aa  150  2e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1658  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.04 
 
 		 230 aa  150  2e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.515101  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3261  DNA-binding response regulator  41.56 
 
 		 225 aa  150  2e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3292  two component transcriptional regulator  41.15 
 
 		 225 aa  150  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.580789  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1181  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.16 
 
 		 234 aa  150  2e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00335068 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1288  two component transcriptional regulator  37.89 
 
 		 228 aa  150  2e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128008  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>