More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C6779 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C6779  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 229 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.652587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3634  two component transcriptional regulator  59.11 
 
 		 230 aa  257  9e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.966844 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4473  two component transcriptional regulator  59.11 
 
 		 230 aa  257  9e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3893  two component transcriptional regulator  59.11 
 
 		 230 aa  257  9e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.742854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6822  two component transcriptional regulator  55.75 
 
 		 229 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.22547 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4359  two component transcriptional regulator  53.51 
 
 		 229 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2612  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.12 
 
 		 228 aa  212  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0412974  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2735  two component transcriptional regulator  48.89 
 
 		 228 aa  212  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.223671 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2774  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.93 
 
 		 245 aa  204  7e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4368  two component transcriptional regulator  43.61 
 
 		 245 aa  187  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5049  two component transcriptional regulator  43.61 
 
 		 259 aa  187  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.839238  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5811  two component transcriptional regulator  43.61 
 
 		 245 aa  187  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.244111  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05454  two component response regulator transcription regulator protein  43.61 
 
 		 256 aa  186  2e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.169333 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3050  two component transcriptional regulator  44.05 
 
 		 245 aa  186  3e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.545982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1954  two component transcriptional regulator  46.55 
 
 		 253 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.897911  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2118  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.67 
 
 		 238 aa  184  1.0000000000000001e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.717558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2526  two component transcriptional regulator  43.42 
 
 		 262 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.262723  normal  0.926116 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2929  two component transcriptional regulator  42.73 
 
 		 250 aa  179  2e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.449606  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4353  two component transcriptional regulator  42.29 
 
 		 245 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1014  two component transcriptional regulator  42.15 
 
 		 244 aa  177  9e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1066  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.75 
 
 		 222 aa  176  3e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3972  two component transcriptional regulator  42.22 
 
 		 242 aa  175  5e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0123  two component transcriptional regulator  42.04 
 
 		 241 aa  171  1e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0031  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.11 
 
 		 234 aa  169  2e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1497  two component transcriptional regulator  39.47 
 
 		 263 aa  170  2e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5742  two component transcriptional regulator  42.22 
 
 		 342 aa  168  7e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0760421  hitchhiker  0.00137021 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1792  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.97 
 
 		 249 aa  159  3e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.783202  normal  0.482984 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1522  two component transcriptional regulator  40.79 
 
 		 227 aa  159  4e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3225  two component transcriptional regulator, winged helix family  40 
 
 		 231 aa  155  5.0000000000000005e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.202731  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04836  two-component system regulatory protein  40.27 
 
 		 229 aa  154  8e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4321  two component transcriptional regulator  36.8 
 
 		 248 aa  152  5.9999999999999996e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.173505 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2273  two component transcriptional regulator  50.99 
 
 		 154 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.59177 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3084  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  38.39 
 
 		 229 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.692731  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3133  two component transcriptional regulator, winged helix family  40 
 
 		 231 aa  145  4.0000000000000006e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2692  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.39 
 
 		 229 aa  142  6e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3302  two component transcriptional regulator  34.21 
 
 		 230 aa  133  1.9999999999999998e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.288231  normal  0.346827 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0949  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.04 
 
 		 252 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0393  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.8 
 
 		 227 aa  130  1.0000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.202895 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1897  two component transcriptional regulator  36.48 
 
 		 227 aa  130  1.0000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.151466  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1058  DNA-binding response regulator  36.36 
 
 		 227 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000187393  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00347  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with PhoR (or CreC)  34.07 
 
 		 229 aa  129  3e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3210  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  34.07 
 
 		 229 aa  129  3e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.146413  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0429  transcriptional regulator PhoB  34.07 
 
 		 229 aa  129  3e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.283039  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00351  hypothetical protein  34.07 
 
 		 229 aa  129  3e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0467  transcriptional regulator PhoB  34.07 
 
 		 229 aa  129  3e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0318  transcriptional regulator PhoB  34.07 
 
 		 229 aa  129  3e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0427  transcriptional regulator PhoB  34.07 
 
 		 229 aa  129  3e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3234  transcriptional regulator PhoB  34.07 
 
 		 229 aa  129  3e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.456974  unclonable  0.00000000819474 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0475  transcriptional regulator PhoB  34.07 
 
 		 229 aa  129  3e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3969  two component transcriptional regulator  36.8 
 
 		 243 aa  128  6e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.162736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2401  phosphate regulon transcriptional regulatory protein phoB  33.91 
 
 		 229 aa  128  7.000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0937  two component transcriptional regulator  35.06 
 
 		 227 aa  128  7.000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.834094  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4585  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.35 
 
 		 234 aa  128  8.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.209184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1028  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.05 
 
 		 237 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0867  transcriptional regulator PhoB  33.63 
 
 		 229 aa  127  1.0000000000000001e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.437737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0435  transcriptional regulator PhoB  32.44 
 
 		 229 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.464381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0496  transcriptional regulator PhoB  32.44 
 
 		 229 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0441  transcriptional regulator PhoB  32.44 
 
 		 229 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.244741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0454  transcriptional regulator PhoB  32.44 
 
 		 229 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0435  transcriptional regulator PhoB  32.44 
 
 		 229 aa  125  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2497  DNA-binding response regulator  33.48 
 
 		 228 aa  125  5e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2286  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.11 
 
 		 231 aa  125  6e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000188753  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3335  two component transcriptional regulator  34.65 
 
 		 230 aa  125  6e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.428008 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0117  two component transcriptional regulator  34.06 
 
 		 229 aa  125  6e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000111014  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2811  DNA-binding response regulator  33.48 
 
 		 228 aa  125  7e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3577  two component transcriptional regulator  36.8 
 
 		 232 aa  124  8.000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.70324 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2266  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  35.68 
 
 		 230 aa  124  1e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5345  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.28 
 
 		 230 aa  123  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.264155 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1728  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.2 
 
 		 233 aa  123  2e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4408  two component transcriptional regulator  34.93 
 
 		 229 aa  124  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0897949 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1903  two component transcriptional regulator  34.21 
 
 		 230 aa  123  3e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1493  two component transcriptional regulator  37.17 
 
 		 232 aa  122  4e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12584  normal  0.340507 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0940  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.05 
 
 		 237 aa  122  6e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.324642  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23040  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  35.47 
 
 		 229 aa  122  6e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.318653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0785  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.48 
 
 		 235 aa  122  6e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_926  two-component system, OmpR family, response regulator  34.05 
 
 		 227 aa  122  7e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00200634  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3993  DNA-binding response regulator  31.39 
 
 		 223 aa  121  8e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.910988 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1151  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.63 
 
 		 243 aa  121  8e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3292  two component transcriptional regulator  35.22 
 
 		 225 aa  121  8e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.580789  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1434  DNA-binding response regulator PhoB  34.63 
 
 		 243 aa  121  8e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5320  winged helix family two component transcriptional regulator  35.11 
 
 		 242 aa  121  9e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.023746 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5477  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  35.11 
 
 		 229 aa  121  9e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5367  two component transcriptional regulator  35.11 
 
 		 229 aa  121  9e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.400776 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5228  two component transcriptional regulator  35.11 
 
 		 229 aa  121  9e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.661336  normal  0.450139 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0738  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.84 
 
 		 223 aa  120  9.999999999999999e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00000283527  decreased coverage  0.00121253 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1413  DNA-binding response regulator  30.94 
 
 		 223 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5032  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  35.11 
 
 		 229 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.330128 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1962  DNA-binding response regulator  30.04 
 
 		 225 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.597164  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0154  two component transcriptional regulator  35.11 
 
 		 229 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.596099 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3737  two component transcriptional regulator  36.86 
 
 		 231 aa  120  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273603 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1681  response regulator receiver protein  30.4 
 
 		 227 aa  120  9.999999999999999e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0956507  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.66 
 
 		 234 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.178035  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1453  DNA-binding response regulator  30.94 
 
 		 223 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1193  response regulator  30.49 
 
 		 223 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2868  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  38.22 
 
 		 227 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0808147  normal  0.133304 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02492  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  31.47 
 
 		 229 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.506678  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1312  DNA-binding response regulator  30.49 
 
 		 223 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1389  DNA-binding response regulator  30.49 
 
 		 223 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2768  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  32.75 
 
 		 229 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0176064  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0351  DNA-binding response regulator  33.19 
 
 		 230 aa  120  1.9999999999999998e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>