More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2612 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_2612  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 228 aa  458  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0412974  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2735  two component transcriptional regulator  72.69 
 
 		 228 aa  345  3e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.223671 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4353  two component transcriptional regulator  66.22 
 
 		 245 aa  292  2e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5049  two component transcriptional regulator  65.33 
 
 		 259 aa  292  3e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.839238  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4368  two component transcriptional regulator  65.33 
 
 		 245 aa  292  4e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5811  two component transcriptional regulator  65.33 
 
 		 245 aa  291  4e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.244111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3634  two component transcriptional regulator  62.95 
 
 		 230 aa  291  5e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.966844 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4473  two component transcriptional regulator  62.95 
 
 		 230 aa  291  5e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3893  two component transcriptional regulator  62.95 
 
 		 230 aa  291  5e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.742854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6822  two component transcriptional regulator  62.22 
 
 		 229 aa  289  2e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.22547 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2774  two component transcriptional regulator, winged helix family  64.44 
 
 		 245 aa  290  2e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1954  two component transcriptional regulator  68.58 
 
 		 253 aa  289  3e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.897911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3050  two component transcriptional regulator  64.44 
 
 		 245 aa  285  4e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.545982  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05454  two component response regulator transcription regulator protein  63.11 
 
 		 256 aa  282  3.0000000000000004e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.169333 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2526  two component transcriptional regulator  62.01 
 
 		 262 aa  282  3.0000000000000004e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.262723  normal  0.926116 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4359  two component transcriptional regulator  59.21 
 
 		 229 aa  276  2e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1792  two component transcriptional regulator, winged helix family  62.11 
 
 		 249 aa  275  5e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.783202  normal  0.482984 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2929  two component transcriptional regulator  61.4 
 
 		 250 aa  271  6e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.449606  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2118  two component transcriptional regulator, winged helix family  60 
 
 		 238 aa  266  2e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.717558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1014  two component transcriptional regulator  59.19 
 
 		 244 aa  263  1e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3972  two component transcriptional regulator  59.38 
 
 		 242 aa  263  2e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5742  two component transcriptional regulator  58.85 
 
 		 342 aa  258  4e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0760421  hitchhiker  0.00137021 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0123  two component transcriptional regulator  56.39 
 
 		 241 aa  243  1.9999999999999999e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1066  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.95 
 
 		 222 aa  241  9e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0031  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.16 
 
 		 234 aa  236  2e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1497  two component transcriptional regulator  52.19 
 
 		 263 aa  234  6e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4321  two component transcriptional regulator  54.39 
 
 		 248 aa  228  5e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.173505 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1522  two component transcriptional regulator  51.97 
 
 		 227 aa  216  2e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2692  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.78 
 
 		 229 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3084  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  49.78 
 
 		 229 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.692731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6779  two component transcriptional regulator  49.12 
 
 		 229 aa  212  2.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.652587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04836  two-component system regulatory protein  50.67 
 
 		 229 aa  211  7e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3133  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.53 
 
 		 231 aa  199  3.9999999999999996e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3225  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.98 
 
 		 231 aa  198  7e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.202731  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2273  two component transcriptional regulator  65.33 
 
 		 154 aa  192  4e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.59177 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_926  two-component system, OmpR family, response regulator  44.05 
 
 		 227 aa  187  1e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00200634  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0937  two component transcriptional regulator  44.49 
 
 		 227 aa  187  1e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.834094  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1058  DNA-binding response regulator  43.61 
 
 		 227 aa  186  2e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000187393  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1028  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.54 
 
 		 237 aa  175  5e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3737  two component transcriptional regulator  44.83 
 
 		 231 aa  174  9.999999999999999e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273603 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0393  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.58 
 
 		 227 aa  174  9.999999999999999e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.202895 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1681  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 227 aa  172  2.9999999999999996e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0956507  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1897  two component transcriptional regulator  44.1 
 
 		 227 aa  172  3.9999999999999995e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.151466  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0738  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.83 
 
 		 223 aa  169  2e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00000283527  decreased coverage  0.00121253 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2566  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.1 
 
 		 229 aa  166  4e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000356007  hitchhiker  0.00345607 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2564  DNA-binding response regulator  40.17 
 
 		 231 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0589521  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2385  DNA-binding response regulator  40.17 
 
 		 231 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.534853  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2341  DNA-binding response regulator  40.17 
 
 		 231 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000166477  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2302  DNA-binding response regulator  40.17 
 
 		 231 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2796  DNA-binding response regulator  39.06 
 
 		 231 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.512352  hitchhiker  0.00000533196 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2561  DNA-binding response regulator  40.17 
 
 		 231 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.630654  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2526  DNA-binding response regulator  39.06 
 
 		 231 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2574  DNA-binding response regulator  40.17 
 
 		 231 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000040017 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2617  DNA-binding response regulator  40.17 
 
 		 231 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.993672  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3061  two component transcriptional regulator  42.54 
 
 		 227 aa  164  1.0000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.799336  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1485  response regulator receiver  41.67 
 
 		 235 aa  163  2.0000000000000002e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.236897  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2868  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  42.86 
 
 		 227 aa  162  3e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0808147  normal  0.133304 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0644  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.23 
 
 		 236 aa  162  4.0000000000000004e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1504  two component transcriptional regulator  43.29 
 
 		 231 aa  162  4.0000000000000004e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263867  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2286  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.15 
 
 		 231 aa  161  1e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000188753  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2476  two component transcriptional regulator  45.18 
 
 		 241 aa  160  2e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000027247 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  40.79 
 
 		 229 aa  160  2e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2892  two component transcriptional regulator  43.36 
 
 		 227 aa  160  2e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0239565 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2981  two component transcriptional regulator  41.59 
 
 		 229 aa  159  3e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000201285  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3429  two component transcriptional regulator  41.67 
 
 		 233 aa  159  3e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0608192  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1815  two component transcriptional regulator  38.89 
 
 		 232 aa  159  4e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.101184  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2915  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.78 
 
 		 225 aa  159  4e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.892207  normal  0.300351 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0988  response regulator BaeR  39.21 
 
 		 227 aa  159  4e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000405458  normal  0.303622 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1892  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.29 
 
 		 228 aa  159  4e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000392  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2401  phosphate regulon transcriptional regulatory protein phoB  40.52 
 
 		 229 aa  159  5e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0360  two component signal transduction response regulator  40.97 
 
 		 224 aa  158  6e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2709  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.38 
 
 		 236 aa  158  9e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0011921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1155  two component transcriptional regulator  36.48 
 
 		 231 aa  157  9e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000430064  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3302  two component transcriptional regulator  37.72 
 
 		 230 aa  157  2e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.288231  normal  0.346827 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0093  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.69 
 
 		 232 aa  156  2e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0258  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.59 
 
 		 236 aa  156  3e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.606292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3739  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.38 
 
 		 230 aa  155  5.0000000000000005e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000466515  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11690  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  42.04 
 
 		 236 aa  155  6e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.52451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1276  two component transcriptional regulator  40.69 
 
 		 233 aa  155  6e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1194  two component transcriptional regulator  40.69 
 
 		 233 aa  155  6e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.159741  normal  0.484581 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0824  two component transcriptional regulator  40.69 
 
 		 233 aa  155  6e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3292  two component transcriptional regulator  40 
 
 		 225 aa  155  6e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.580789  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1182  two component transcriptional regulator  40.69 
 
 		 233 aa  155  6e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.547738  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1305  two component transcriptional regulator  40.69 
 
 		 233 aa  155  6e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.920206  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4419  two component transcriptional regulator  38.66 
 
 		 239 aa  155  7e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1714  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.84 
 
 		 234 aa  154  8e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.233786  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4720  DNA-binding response regulator PhoP  38.66 
 
 		 239 aa  154  1e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4211  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.48 
 
 		 219 aa  154  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3969  two component transcriptional regulator  42.31 
 
 		 243 aa  154  1e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.162736  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4321  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.48 
 
 		 219 aa  154  1e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0131168 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1527  two component transcriptional regulator  38.33 
 
 		 230 aa  154  1e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.255733  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1408  two component transcriptional regulator  34.93 
 
 		 232 aa  154  1e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3118  DNA-binding response regulator  42.06 
 
 		 227 aa  153  2e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4484  DNA-binding response regulator PhoP  38.66 
 
 		 239 aa  154  2e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4319  alkaline phosphatase synthesis response regulator  38.66 
 
 		 239 aa  154  2e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4714  DNA-binding response regulator PhoP  38.66 
 
 		 239 aa  154  2e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4699  DNA-binding response regulator PhoP  38.66 
 
 		 239 aa  153  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4833  DNA-binding response regulator PhoP  38.66 
 
 		 239 aa  154  2e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0982965  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4704  DNA-binding response regulator PhoP  38.66 
 
 		 239 aa  154  2e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000673192 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0539  DNA-binding response regulator PhoP  38.66 
 
 		 239 aa  153  2e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000130788 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>