More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_2526 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_2526  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 262 aa  525  1e-148  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.262723  normal  0.926116 
 
 
-
 
NC_003296  RS05454  two component response regulator transcription regulator protein  75.41 
 
 		 256 aa  349  3e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.169333 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4353  two component transcriptional regulator  75.54 
 
 		 245 aa  348  4e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4368  two component transcriptional regulator  76.92 
 
 		 245 aa  346  2e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5049  two component transcriptional regulator  76.92 
 
 		 259 aa  346  2e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.839238  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5811  two component transcriptional regulator  76.92 
 
 		 245 aa  346  2e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.244111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3050  two component transcriptional regulator  75.86 
 
 		 245 aa  338  7e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.545982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3972  two component transcriptional regulator  73.71 
 
 		 242 aa  336  1.9999999999999998e-91  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2774  two component transcriptional regulator, winged helix family  74.24 
 
 		 245 aa  327  1.0000000000000001e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5742  two component transcriptional regulator  71.3 
 
 		 342 aa  320  1.9999999999999998e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0760421  hitchhiker  0.00137021 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2929  two component transcriptional regulator  67.35 
 
 		 250 aa  313  9.999999999999999e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.449606  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1014  two component transcriptional regulator  66.67 
 
 		 244 aa  309  2.9999999999999997e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2118  two component transcriptional regulator, winged helix family  66.96 
 
 		 238 aa  298  5e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.717558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2612  two component transcriptional regulator, winged helix family  62.01 
 
 		 228 aa  282  4.0000000000000003e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0412974  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1792  two component transcriptional regulator, winged helix family  61.9 
 
 		 249 aa  278  8e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.783202  normal  0.482984 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2735  two component transcriptional regulator  61.74 
 
 		 228 aa  273  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.223671 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1954  two component transcriptional regulator  63.64 
 
 		 253 aa  262  3e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.897911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1497  two component transcriptional regulator  55.6 
 
 		 263 aa  262  4e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6822  two component transcriptional regulator  56.09 
 
 		 229 aa  251  1e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.22547 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0123  two component transcriptional regulator  56.78 
 
 		 241 aa  248  7e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3634  two component transcriptional regulator  55.46 
 
 		 230 aa  246  2e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.966844 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4473  two component transcriptional regulator  55.46 
 
 		 230 aa  246  2e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3893  two component transcriptional regulator  55.46 
 
 		 230 aa  246  2e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.742854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4359  two component transcriptional regulator  54.87 
 
 		 229 aa  240  2e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1066  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.64 
 
 		 222 aa  233  2.0000000000000002e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4321  two component transcriptional regulator  55.27 
 
 		 248 aa  227  1e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.173505 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0031  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.41 
 
 		 234 aa  223  2e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04836  two-component system regulatory protein  52.21 
 
 		 229 aa  210  2e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2692  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.56 
 
 		 229 aa  206  4e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3133  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.44 
 
 		 231 aa  204  1e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3084  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  50 
 
 		 229 aa  202  3e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.692731  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3225  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.56 
 
 		 231 aa  199  3e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.202731  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1522  two component transcriptional regulator  47.81 
 
 		 227 aa  186  4e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6779  two component transcriptional regulator  43.42 
 
 		 229 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.652587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0937  two component transcriptional regulator  45.58 
 
 		 227 aa  183  3e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.834094  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1058  DNA-binding response regulator  46.02 
 
 		 227 aa  181  1e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000187393  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_926  two-component system, OmpR family, response regulator  46.02 
 
 		 227 aa  178  1e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00200634  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1681  response regulator receiver protein  42.13 
 
 		 227 aa  175  8e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0956507  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1028  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.52 
 
 		 237 aa  171  7.999999999999999e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1504  two component transcriptional regulator  43.23 
 
 		 231 aa  169  4e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263867  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3429  two component transcriptional regulator  40.77 
 
 		 233 aa  169  5e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0608192  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3737  two component transcriptional regulator  44.16 
 
 		 231 aa  168  7e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273603 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1897  two component transcriptional regulator  44.35 
 
 		 227 aa  166  2.9999999999999998e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.151466  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2845  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.49 
 
 		 234 aa  166  4e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0268  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.09 
 
 		 227 aa  165  6.9999999999999995e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.509377 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  42.17 
 
 		 229 aa  164  9e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3739  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.91 
 
 		 230 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000466515  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3292  two component transcriptional regulator  40.26 
 
 		 225 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.580789  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0905  two component transcriptional regulator  42.8 
 
 		 238 aa  163  3e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0393  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.16 
 
 		 227 aa  163  3e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.202895 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2566  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.72 
 
 		 229 aa  162  5.0000000000000005e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000356007  hitchhiker  0.00345607 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2286  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.3 
 
 		 231 aa  161  9e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000188753  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2625  two component transcriptional regulator  39.22 
 
 		 232 aa  160  1e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000561273 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0738  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.68 
 
 		 223 aa  160  1e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00000283527  decreased coverage  0.00121253 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2358  two component transcriptional regulator  41.67 
 
 		 231 aa  160  1e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0136772  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1527  two component transcriptional regulator  39.91 
 
 		 230 aa  160  1e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.255733  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3782  response regulator receiver  42.37 
 
 		 297 aa  161  1e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.16 
 
 		 235 aa  160  1e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0646165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3620  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.92 
 
 		 239 aa  160  2e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0253056  normal  0.477246 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3061  two component transcriptional regulator  42.17 
 
 		 227 aa  160  3e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.799336  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2180  two component transcriptional regulator  43.1 
 
 		 235 aa  159  3e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0753297 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0960  two component transcriptional regulator  42.37 
 
 		 236 aa  160  3e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0214647 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3302  two component transcriptional regulator  37.55 
 
 		 230 aa  159  4e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.288231  normal  0.346827 
 
 
-
 
NC_003296  RS05646  two-component response regulator transcription regulator protein  41.99 
 
 		 219 aa  159  6e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0132  response regulator receiver protein  43.42 
 
 		 231 aa  159  6e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3969  two component transcriptional regulator  42.49 
 
 		 243 aa  158  9e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.162736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1194  two component transcriptional regulator  41.2 
 
 		 233 aa  157  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.159741  normal  0.484581 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3904  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.67 
 
 		 230 aa  157  1e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.144495  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0093  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.61 
 
 		 232 aa  157  1e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0824  two component transcriptional regulator  41.2 
 
 		 233 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1276  two component transcriptional regulator  41.2 
 
 		 233 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1182  two component transcriptional regulator  41.2 
 
 		 233 aa  157  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.547738  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1305  two component transcriptional regulator  41.2 
 
 		 233 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.920206  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3485  two component transcriptional regulator  41.95 
 
 		 236 aa  157  1e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2273  two component transcriptional regulator  54.61 
 
 		 154 aa  157  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.59177 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2564  DNA-binding response regulator  40.17 
 
 		 231 aa  157  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0589521  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2853  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.6 
 
 		 233 aa  157  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2866  two component transcriptional regulator, winged helix family  40 
 
 		 231 aa  157  2e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1271  two component transcriptional regulator  40.6 
 
 		 233 aa  157  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.624894  normal  0.128476 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0080  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.32 
 
 		 230 aa  157  2e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2844  two component transcriptional regulator  43.67 
 
 		 248 aa  157  2e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1181  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.74 
 
 		 234 aa  157  2e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00335068 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2302  DNA-binding response regulator  40.17 
 
 		 231 aa  156  3e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2796  DNA-binding response regulator  39.74 
 
 		 231 aa  156  3e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.512352  hitchhiker  0.00000533196 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4448  two component transcriptional regulator  40.77 
 
 		 233 aa  156  3e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0805  two component transcriptional regulator  41.2 
 
 		 229 aa  156  3e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2526  DNA-binding response regulator  39.74 
 
 		 231 aa  156  4e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0785  DNA-binding response regulator PhoB  40.77 
 
 		 233 aa  156  4e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1623  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  40.77 
 
 		 233 aa  156  4e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0969  two component transcriptional regulator  40.53 
 
 		 226 aa  156  4e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.165699  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2768  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  40.77 
 
 		 233 aa  156  4e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.368066  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0579  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  40.77 
 
 		 233 aa  156  4e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0503015  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1296  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  40.77 
 
 		 233 aa  156  4e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0572  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  40.77 
 
 		 233 aa  156  4e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1490  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  40.77 
 
 		 233 aa  156  4e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.72233  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1520  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  40.77 
 
 		 233 aa  156  4e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0887  two component transcriptional regulator  40.6 
 
 		 233 aa  156  4e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.686184  normal  0.0397846 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2385  DNA-binding response regulator  40.17 
 
 		 231 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.534853  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2574  DNA-binding response regulator  40.17 
 
 		 231 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000040017 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2561  DNA-binding response regulator  40.17 
 
 		 231 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.630654  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>