More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1792 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_1792  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 249 aa  494  1e-139  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.783202  normal  0.482984 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5049  two component transcriptional regulator  64.05 
 
 		 259 aa  304  8.000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.839238  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4368  two component transcriptional regulator  64.05 
 
 		 245 aa  304  9.000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4353  two component transcriptional regulator  66.67 
 
 		 245 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5811  two component transcriptional regulator  64.05 
 
 		 245 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.244111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3050  two component transcriptional regulator  64.17 
 
 		 245 aa  297  1e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.545982  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2118  two component transcriptional regulator, winged helix family  61.16 
 
 		 238 aa  289  2e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.717558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1014  two component transcriptional regulator  61.5 
 
 		 244 aa  286  2e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2774  two component transcriptional regulator, winged helix family  66.52 
 
 		 245 aa  286  2e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05454  two component response regulator transcription regulator protein  59.66 
 
 		 256 aa  283  2.0000000000000002e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.169333 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2526  two component transcriptional regulator  61.9 
 
 		 262 aa  278  7e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.262723  normal  0.926116 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3972  two component transcriptional regulator  61.47 
 
 		 242 aa  278  7e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2612  two component transcriptional regulator, winged helix family  62.11 
 
 		 228 aa  275  6e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0412974  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2929  two component transcriptional regulator  62.77 
 
 		 250 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.449606  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2735  two component transcriptional regulator  60.09 
 
 		 228 aa  271  7e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.223671 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5742  two component transcriptional regulator  58.95 
 
 		 342 aa  265  5e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0760421  hitchhiker  0.00137021 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0123  two component transcriptional regulator  60.43 
 
 		 241 aa  256  2e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1954  two component transcriptional regulator  60.96 
 
 		 253 aa  249  3e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.897911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4473  two component transcriptional regulator  53.51 
 
 		 230 aa  242  3e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3893  two component transcriptional regulator  53.51 
 
 		 230 aa  242  3e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.742854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3634  two component transcriptional regulator  53.51 
 
 		 230 aa  242  3e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.966844 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1497  two component transcriptional regulator  52.84 
 
 		 263 aa  241  1e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6822  two component transcriptional regulator  51.11 
 
 		 229 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.22547 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4321  two component transcriptional regulator  53.62 
 
 		 248 aa  229  3e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.173505 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0031  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.22 
 
 		 234 aa  228  5e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4359  two component transcriptional regulator  51.29 
 
 		 229 aa  228  7e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1066  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.39 
 
 		 222 aa  225  4e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3225  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.22 
 
 		 231 aa  208  5e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.202731  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04836  two-component system regulatory protein  52 
 
 		 229 aa  206  2e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3084  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  49.78 
 
 		 229 aa  204  8e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.692731  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2692  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.56 
 
 		 229 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3133  two component transcriptional regulator, winged helix family  48 
 
 		 231 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1522  two component transcriptional regulator  48.7 
 
 		 227 aa  196  3e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1897  two component transcriptional regulator  43.42 
 
 		 227 aa  178  7e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.151466  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0937  two component transcriptional regulator  41.92 
 
 		 227 aa  172  5e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.834094  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0644  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.59 
 
 		 236 aa  171  9e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1681  response regulator receiver protein  40.34 
 
 		 227 aa  171  1e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0956507  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0738  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.03 
 
 		 223 aa  169  3e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00000283527  decreased coverage  0.00121253 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_926  two-component system, OmpR family, response regulator  41.85 
 
 		 227 aa  169  3e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00200634  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3737  two component transcriptional regulator  44.74 
 
 		 231 aa  167  2e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273603 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1028  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.13 
 
 		 237 aa  166  2e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1504  two component transcriptional regulator  44.98 
 
 		 231 aa  167  2e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263867  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1367  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.17 
 
 		 230 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000177207  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2566  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.61 
 
 		 229 aa  166  4e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000356007  hitchhiker  0.00345607 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.02 
 
 		 235 aa  166  5e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0646165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.29 
 
 		 234 aa  165  5e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.178035  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1058  DNA-binding response regulator  39.83 
 
 		 227 aa  165  6.9999999999999995e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000187393  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1102  DNA-binding response regulator  43.91 
 
 		 225 aa  165  8e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2782  two component transcriptional regulator  41.3 
 
 		 231 aa  165  8e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.92379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2625  two component transcriptional regulator  39.39 
 
 		 232 aa  164  1.0000000000000001e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000561273 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2513  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.98 
 
 		 225 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1846  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.67 
 
 		 226 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0268  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.09 
 
 		 227 aa  162  5.0000000000000005e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.509377 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1155  two component transcriptional regulator  36.73 
 
 		 231 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000430064  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0393  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.48 
 
 		 227 aa  162  6e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.202895 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0581  winged helix family two component transcriptional regulator  42.11 
 
 		 242 aa  162  6e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.296955  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0721  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.13 
 
 		 233 aa  162  7e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.811558  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2476  two component transcriptional regulator  45.18 
 
 		 241 aa  161  8.000000000000001e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000027247 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3302  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.79 
 
 		 231 aa  161  8.000000000000001e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000343135 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3739  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.78 
 
 		 230 aa  161  1e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000466515  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1349  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.86 
 
 		 237 aa  160  1e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.421984 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0256  DNA-binding response regulator  38.3 
 
 		 233 aa  161  1e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0805  two component transcriptional regulator  41.3 
 
 		 229 aa  161  1e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0245  response regulator  38.3 
 
 		 233 aa  161  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2387  two component transcriptional regulator  41.05 
 
 		 229 aa  160  1e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00115026  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0271  DNA-binding response regulator  38.3 
 
 		 233 aa  161  1e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.439326  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2273  two component transcriptional regulator  59.48 
 
 		 154 aa  161  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.59177 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2333  two component transcriptional regulator  40.43 
 
 		 232 aa  160  1e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0322  DNA-binding response regulator  38.3 
 
 		 233 aa  160  1e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000418869  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0242  response regulator  38.3 
 
 		 233 aa  160  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1878  two component transcriptional regulator  41.67 
 
 		 242 aa  160  2e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.559477 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2693  two component transcriptional regulator  42.61 
 
 		 226 aa  160  2e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.575064 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1115  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.54 
 
 		 243 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0950226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0296  DNA-binding response regulator  38.3 
 
 		 233 aa  160  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0303  DNA-binding response regulator  38.3 
 
 		 233 aa  160  3e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0610099  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0294  DNA-binding response regulator  37.87 
 
 		 233 aa  159  4e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1714  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.23 
 
 		 234 aa  159  4e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.233786  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1288  two component transcriptional regulator  36.73 
 
 		 228 aa  159  4e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6779  two component transcriptional regulator  40.97 
 
 		 229 aa  159  4e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.652587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2844  two component transcriptional regulator  46.29 
 
 		 248 aa  159  4e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3061  two component transcriptional regulator  41.38 
 
 		 227 aa  159  4e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.799336  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1453  two component transcriptional regulator  41.23 
 
 		 244 aa  159  5e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.952418  normal  0.0249242 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0766  two component transcriptional regulator  35.22 
 
 		 231 aa  159  5e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.585906  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1011  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.48 
 
 		 231 aa  158  6e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5021  DNA-binding response regulator  38.3 
 
 		 233 aa  158  6e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0330449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3429  two component transcriptional regulator  37.39 
 
 		 233 aa  159  6e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0608192  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  41.67 
 
 		 229 aa  158  7e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4207  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.67 
 
 		 247 aa  158  7e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1413  DNA-binding response regulator  37.33 
 
 		 223 aa  158  8e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1453  DNA-binding response regulator  37.33 
 
 		 223 aa  158  8e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3292  two component transcriptional regulator  38.46 
 
 		 225 aa  158  9e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.580789  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00330  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  42.37 
 
 		 240 aa  157  1e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00972196  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3118  DNA-binding response regulator  42.17 
 
 		 227 aa  157  1e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0916  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.84 
 
 		 234 aa  157  1e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0276045  hitchhiker  9.727110000000001e-18 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1485  response regulator receiver  41.56 
 
 		 235 aa  157  1e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.236897  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5010  DNA-binding response regulator  39.57 
 
 		 232 aa  157  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0258  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.36 
 
 		 236 aa  157  2e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.606292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4991  DNA-binding response regulator  39.57 
 
 		 232 aa  157  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0558  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.51 
 
 		 237 aa  157  2e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1351  DNA-binding response regulator  36.89 
 
 		 223 aa  157  2e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>