More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_1014 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_1014  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 244 aa  496  1e-139  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05454  two component response regulator transcription regulator protein  68.94 
 
 		 256 aa  334  7e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.169333 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3050  two component transcriptional regulator  65.53 
 
 		 245 aa  324  6e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.545982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4353  two component transcriptional regulator  64.26 
 
 		 245 aa  322  5e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4368  two component transcriptional regulator  65.94 
 
 		 245 aa  321  6e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5049  two component transcriptional regulator  65.94 
 
 		 259 aa  321  6e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.839238  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5811  two component transcriptional regulator  65.94 
 
 		 245 aa  321  7e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.244111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3972  two component transcriptional regulator  63.4 
 
 		 242 aa  312  1.9999999999999998e-84  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2774  two component transcriptional regulator, winged helix family  67.53 
 
 		 245 aa  311  7.999999999999999e-84  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2526  two component transcriptional regulator  66.67 
 
 		 262 aa  309  2.9999999999999997e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.262723  normal  0.926116 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2929  two component transcriptional regulator  62.3 
 
 		 250 aa  299  3e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.449606  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5742  two component transcriptional regulator  64.57 
 
 		 342 aa  290  1e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0760421  hitchhiker  0.00137021 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1792  two component transcriptional regulator, winged helix family  61.5 
 
 		 249 aa  286  2e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.783202  normal  0.482984 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2118  two component transcriptional regulator, winged helix family  59.29 
 
 		 238 aa  280  2e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.717558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2735  two component transcriptional regulator  61.5 
 
 		 228 aa  278  8e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.223671 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2612  two component transcriptional regulator, winged helix family  59.19 
 
 		 228 aa  263  2e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0412974  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1497  two component transcriptional regulator  54.82 
 
 		 263 aa  258  5.0000000000000005e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0123  two component transcriptional regulator  53.39 
 
 		 241 aa  253  1.0000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1954  two component transcriptional regulator  58.01 
 
 		 253 aa  253  3e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.897911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3634  two component transcriptional regulator  53.3 
 
 		 230 aa  246  3e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.966844 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4473  two component transcriptional regulator  53.3 
 
 		 230 aa  246  3e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3893  two component transcriptional regulator  53.3 
 
 		 230 aa  246  3e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.742854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6822  two component transcriptional regulator  52.91 
 
 		 229 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.22547 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4359  two component transcriptional regulator  52.47 
 
 		 229 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0031  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.85 
 
 		 234 aa  231  9e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1066  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.57 
 
 		 222 aa  228  6e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4321  two component transcriptional regulator  49.14 
 
 		 248 aa  224  7e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.173505 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04836  two-component system regulatory protein  49.56 
 
 		 229 aa  213  1.9999999999999998e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3225  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.66 
 
 		 231 aa  212  3.9999999999999995e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.202731  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3084  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  45.98 
 
 		 229 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.692731  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2692  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.13 
 
 		 229 aa  195  7e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1522  two component transcriptional regulator  45.33 
 
 		 227 aa  193  2e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3133  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.98 
 
 		 231 aa  192  5e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6779  two component transcriptional regulator  42.15 
 
 		 229 aa  177  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.652587  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1058  DNA-binding response regulator  44.54 
 
 		 227 aa  177  2e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000187393  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0969  two component transcriptional regulator  42.36 
 
 		 226 aa  172  5.999999999999999e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.165699  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0805  two component transcriptional regulator  42.42 
 
 		 229 aa  171  6.999999999999999e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3739  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.21 
 
 		 230 aa  171  7.999999999999999e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000466515  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0937  two component transcriptional regulator  43.17 
 
 		 227 aa  169  3e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.834094  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3737  two component transcriptional regulator  42.98 
 
 		 231 aa  169  3e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273603 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1681  response regulator receiver protein  41.63 
 
 		 227 aa  169  3e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0956507  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1504  two component transcriptional regulator  44.05 
 
 		 231 aa  169  4e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263867  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1897  two component transcriptional regulator  43.67 
 
 		 227 aa  168  8e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.151466  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0258  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.81 
 
 		 236 aa  167  1e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.606292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1349  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.06 
 
 		 237 aa  167  1e-40  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.421984 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1367  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.02 
 
 		 230 aa  167  2e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000177207  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0393  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.1 
 
 		 227 aa  166  2e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.202895 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  41.13 
 
 		 229 aa  167  2e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2273  two component transcriptional regulator  53.33 
 
 		 154 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.59177 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2333  two component transcriptional regulator  41.88 
 
 		 232 aa  166  2.9999999999999998e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2286  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.67 
 
 		 231 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000188753  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1658  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.74 
 
 		 230 aa  165  6.9999999999999995e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.515101  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_926  two-component system, OmpR family, response regulator  42.36 
 
 		 227 aa  164  8e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00200634  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1176  two component transcriptional regulator  40.09 
 
 		 229 aa  164  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.149936 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11690  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  40.42 
 
 		 236 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.52451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2590  two component transcriptional regulator  39.22 
 
 		 230 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3302  two component transcriptional regulator  37.61 
 
 		 230 aa  163  2.0000000000000002e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.288231  normal  0.346827 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00330  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  40.16 
 
 		 240 aa  163  2.0000000000000002e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00972196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3429  two component transcriptional regulator  38.86 
 
 		 233 aa  163  3e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0608192  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1104  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.17 
 
 		 233 aa  162  4.0000000000000004e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1892  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.13 
 
 		 228 aa  162  4.0000000000000004e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000392  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0905  two component transcriptional regulator  41.7 
 
 		 238 aa  162  4.0000000000000004e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3691  two component transcriptional regulator  39.22 
 
 		 230 aa  162  6e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1102  DNA-binding response regulator  43.48 
 
 		 225 aa  161  7e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0738  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.56 
 
 		 223 aa  161  7e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00000283527  decreased coverage  0.00121253 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1028  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.54 
 
 		 237 aa  161  1e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2693  two component transcriptional regulator  43.04 
 
 		 226 aa  161  1e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.575064 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03750  PhoP-like protein  39.83 
 
 		 226 aa  160  2e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.181369  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5511  two component transcriptional regulator  40.87 
 
 		 236 aa  160  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.567595 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1155  two component transcriptional regulator  37.83 
 
 		 231 aa  159  3e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000430064  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1288  two component transcriptional regulator  37.83 
 
 		 228 aa  159  3e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4602  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.41 
 
 		 226 aa  159  3e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0700  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.61 
 
 		 226 aa  159  5e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.768939  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3335  two component transcriptional regulator  37 
 
 		 230 aa  158  7e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.428008 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0724  two component transcriptional regulator  40.61 
 
 		 226 aa  158  8e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2892  two component transcriptional regulator  39.13 
 
 		 227 aa  158  8e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0239565 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3118  DNA-binding response regulator  41.41 
 
 		 227 aa  158  9e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1714  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.25 
 
 		 234 aa  157  1e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.233786  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4259  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.05 
 
 		 230 aa  157  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.602522  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2306  two component transcriptional regulator  41.51 
 
 		 225 aa  157  1e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2513  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.98 
 
 		 225 aa  157  1e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0850  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.05 
 
 		 226 aa  157  2e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0766  two component transcriptional regulator  37.39 
 
 		 231 aa  157  2e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.585906  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0541  two component transcriptional regulator  39.83 
 
 		 230 aa  156  2e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1924  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.77 
 
 		 225 aa  156  3e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2868  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  38.72 
 
 		 227 aa  156  3e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0808147  normal  0.133304 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2910  response regulator receiver  39.83 
 
 		 230 aa  156  3e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2981  two component transcriptional regulator  39.57 
 
 		 229 aa  156  3e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000201285  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2228  two component transcriptional regulator  39.47 
 
 		 222 aa  156  3e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00319429  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1572  two component transcriptional regulator  43.48 
 
 		 225 aa  156  3e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000784208  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0467  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.51 
 
 		 230 aa  155  4e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6145  two component transcriptional regulator  39.39 
 
 		 228 aa  155  4e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.788201 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0644  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.57 
 
 		 236 aa  155  4e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2522  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.39 
 
 		 226 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3061  two component transcriptional regulator  40.17 
 
 		 227 aa  155  5.0000000000000005e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.799336  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2796  DNA-binding response regulator  39.57 
 
 		 231 aa  155  6e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.512352  hitchhiker  0.00000533196 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3969  two component transcriptional regulator  42.17 
 
 		 243 aa  155  6e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.162736  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1456  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.5 
 
 		 223 aa  155  7e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000183373  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1181  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.5 
 
 		 234 aa  155  7e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00335068 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2526  DNA-binding response regulator  39.57 
 
 		 231 aa  155  7e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>