More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_2273 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_2273  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 154 aa  302  1.0000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.59177 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2612  two component transcriptional regulator, winged helix family  65.33 
 
 		 228 aa  192  1e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0412974  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2735  two component transcriptional regulator  60.81 
 
 		 228 aa  184  3e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.223671 
 
 
-
 
NC_003296  RS05454  two component response regulator transcription regulator protein  57.42 
 
 		 256 aa  177  4e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.169333 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0123  two component transcriptional regulator  57.42 
 
 		 241 aa  174  5e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2929  two component transcriptional regulator  61.18 
 
 		 250 aa  169  1e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.449606  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3050  two component transcriptional regulator  56.95 
 
 		 245 aa  167  6e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.545982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1014  two component transcriptional regulator  53.33 
 
 		 244 aa  166  1e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2774  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.95 
 
 		 245 aa  165  2e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6822  two component transcriptional regulator  52.67 
 
 		 229 aa  164  5e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.22547 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5049  two component transcriptional regulator  56.95 
 
 		 259 aa  163  8e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.839238  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4368  two component transcriptional regulator  56.95 
 
 		 245 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5811  two component transcriptional regulator  56.95 
 
 		 245 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.244111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0031  two component transcriptional regulator, winged helix family  57.72 
 
 		 234 aa  161  2.0000000000000002e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1792  two component transcriptional regulator, winged helix family  59.48 
 
 		 249 aa  161  4.0000000000000004e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.783202  normal  0.482984 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4353  two component transcriptional regulator  56.95 
 
 		 245 aa  160  6e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4473  two component transcriptional regulator  55.41 
 
 		 230 aa  159  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3893  two component transcriptional regulator  55.41 
 
 		 230 aa  159  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.742854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3634  two component transcriptional regulator  55.41 
 
 		 230 aa  159  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.966844 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1954  two component transcriptional regulator  60.53 
 
 		 253 aa  158  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.897911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2526  two component transcriptional regulator  54.61 
 
 		 262 aa  157  4e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.262723  normal  0.926116 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4359  two component transcriptional regulator  53.38 
 
 		 229 aa  157  5e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04836  two-component system regulatory protein  55.63 
 
 		 229 aa  157  6e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1066  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.38 
 
 		 222 aa  154  5.0000000000000005e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2118  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.64 
 
 		 238 aa  154  5.0000000000000005e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.717558  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3225  two component transcriptional regulator, winged helix family  56 
 
 		 231 aa  153  7e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.202731  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3972  two component transcriptional regulator  52 
 
 		 242 aa  152  2e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1497  two component transcriptional regulator  51.66 
 
 		 263 aa  149  1e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3084  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  54.67 
 
 		 229 aa  148  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.692731  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3133  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.67 
 
 		 231 aa  149  2e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6779  two component transcriptional regulator  50.99 
 
 		 229 aa  146  9e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.652587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4321  two component transcriptional regulator  53.25 
 
 		 248 aa  145  1.0000000000000001e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.173505 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1522  two component transcriptional regulator  54.61 
 
 		 227 aa  145  2.0000000000000003e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2692  two component transcriptional regulator, winged helix family  52 
 
 		 229 aa  144  3e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5742  two component transcriptional regulator  54.97 
 
 		 342 aa  142  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0760421  hitchhiker  0.00137021 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1504  two component transcriptional regulator  48.37 
 
 		 231 aa  131  3e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263867  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3737  two component transcriptional regulator  48.68 
 
 		 231 aa  122  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273603 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2476  two component transcriptional regulator  49.04 
 
 		 241 aa  122  2e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000027247 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0393  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.98 
 
 		 227 aa  121  3e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.202895 
 
 
-
 
NC_003296  RS05646  two-component response regulator transcription regulator protein  46.41 
 
 		 219 aa  120  5e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2015  two component transcriptional regulator  43.62 
 
 		 233 aa  120  7e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.582968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2689  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  45.75 
 
 		 240 aa  120  8e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4321  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.1 
 
 		 219 aa  119  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0131168 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4211  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.1 
 
 		 219 aa  119  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3118  DNA-binding response regulator  43.05 
 
 		 227 aa  118  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0572  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  42.95 
 
 		 233 aa  118  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0579  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  42.95 
 
 		 233 aa  118  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0503015  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0785  DNA-binding response regulator PhoB  42.95 
 
 		 233 aa  118  3e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1520  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  42.95 
 
 		 233 aa  118  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1490  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  42.95 
 
 		 233 aa  118  3e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.72233  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1623  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  42.95 
 
 		 233 aa  118  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2768  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  42.95 
 
 		 233 aa  118  3e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.368066  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1296  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  42.95 
 
 		 233 aa  118  3e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1053  two component transcriptional regulator  42.28 
 
 		 229 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3302  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  40.27 
 
 		 229 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1008  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  40.27 
 
 		 229 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3106  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  40.27 
 
 		 229 aa  117  6e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2768  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  42.28 
 
 		 229 aa  117  6e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0176064  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2915  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  40.27 
 
 		 229 aa  117  7e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2162  phosphate regulon transcriptional regulatory protein phoB  42.95 
 
 		 235 aa  117  7.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308703  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01984  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with BaeS  43.59 
 
 		 240 aa  116  9e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1577  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.59 
 
 		 240 aa  116  9e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0981  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  43.59 
 
 		 240 aa  116  9e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.443633  normal  0.661259 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01976  hypothetical protein  43.59 
 
 		 240 aa  116  9e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0887  two component transcriptional regulator  42.95 
 
 		 233 aa  116  9e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.686184  normal  0.0397846 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2221  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  43.59 
 
 		 240 aa  116  9e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3019  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  43.59 
 
 		 240 aa  116  9e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0767733 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1403  two component transcriptional regulator  41.61 
 
 		 229 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00109837  normal  0.0219543 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1378  two component transcriptional regulator  41.61 
 
 		 229 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000291119  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2981  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  41.61 
 
 		 229 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000220801  hitchhiker  0.00121997 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1364  two component transcriptional regulator  41.61 
 
 		 229 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000657343  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0441  transcriptional regulator PhoB  40.27 
 
 		 229 aa  116  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.244741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1296  two component transcriptional regulator  41.61 
 
 		 229 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000460678  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4400  two component transcriptional regulator  41.72 
 
 		 236 aa  116  9.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.998417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2371  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  43.59 
 
 		 240 aa  116  9.999999999999999e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2401  phosphate regulon transcriptional regulatory protein phoB  41.61 
 
 		 229 aa  116  9.999999999999999e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2853  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.95 
 
 		 233 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1276  two component transcriptional regulator  42.95 
 
 		 233 aa  115  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2266  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  41.72 
 
 		 230 aa  116  9.999999999999999e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1271  two component transcriptional regulator  42.95 
 
 		 233 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.624894  normal  0.128476 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1194  two component transcriptional regulator  42.95 
 
 		 233 aa  115  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.159741  normal  0.484581 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0824  two component transcriptional regulator  42.95 
 
 		 233 aa  115  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1154  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  43.59 
 
 		 240 aa  116  9.999999999999999e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.233901  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1182  two component transcriptional regulator  42.95 
 
 		 233 aa  115  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.547738  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1305  two component transcriptional regulator  42.95 
 
 		 233 aa  115  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.920206  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2228  two component transcriptional regulator  44.37 
 
 		 222 aa  116  9.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00319429  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1074  response regulator receiver protein  42.28 
 
 		 229 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000246777  normal  0.491091 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0867  transcriptional regulator PhoB  40.27 
 
 		 229 aa  116  9.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.437737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0454  transcriptional regulator PhoB  40.27 
 
 		 229 aa  115  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1349  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.03 
 
 		 237 aa  115  1.9999999999999998e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.421984 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1558  phosphate regulon response regulator PhoB  41.61 
 
 		 239 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2868  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  44.74 
 
 		 227 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0808147  normal  0.133304 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0360  two component signal transduction response regulator  43.14 
 
 		 224 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4448  two component transcriptional regulator  42.95 
 
 		 233 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1028  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.23 
 
 		 237 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0435  transcriptional regulator PhoB  40.27 
 
 		 229 aa  115  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.464381  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2709  two component transcriptional regulator  41.61 
 
 		 229 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000407229  decreased coverage  0.000000263688 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2777  two component transcriptional regulator  41.61 
 
 		 229 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000628627  decreased coverage  0.000208697 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0496  transcriptional regulator PhoB  40.27 
 
 		 229 aa  115  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2879  two component transcriptional regulator  41.61 
 
 		 229 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000143261  hitchhiker  0.00000615281 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>