More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2735 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_2735  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 228 aa  456  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.223671 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2612  two component transcriptional regulator, winged helix family  72.69 
 
 		 228 aa  345  3e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0412974  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1954  two component transcriptional regulator  69.87 
 
 		 253 aa  303  1.0000000000000001e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.897911  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05454  two component response regulator transcription regulator protein  65.37 
 
 		 256 aa  296  1e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.169333 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2774  two component transcriptional regulator, winged helix family  64.78 
 
 		 245 aa  296  2e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3634  two component transcriptional regulator  62.56 
 
 		 230 aa  293  2e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.966844 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3050  two component transcriptional regulator  65.07 
 
 		 245 aa  293  2e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.545982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4473  two component transcriptional regulator  62.56 
 
 		 230 aa  293  2e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5049  two component transcriptional regulator  64.19 
 
 		 259 aa  293  2e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.839238  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4368  two component transcriptional regulator  64.19 
 
 		 245 aa  293  2e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3893  two component transcriptional regulator  62.56 
 
 		 230 aa  293  2e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.742854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5811  two component transcriptional regulator  64.19 
 
 		 245 aa  293  2e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.244111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4353  two component transcriptional regulator  64.63 
 
 		 245 aa  291  5e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6822  two component transcriptional regulator  61.67 
 
 		 229 aa  286  2e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.22547 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1014  two component transcriptional regulator  61.5 
 
 		 244 aa  278  7e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2929  two component transcriptional regulator  62.61 
 
 		 250 aa  276  2e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.449606  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2526  two component transcriptional regulator  61.74 
 
 		 262 aa  273  1.0000000000000001e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.262723  normal  0.926116 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1792  two component transcriptional regulator, winged helix family  60.09 
 
 		 249 aa  271  6e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.783202  normal  0.482984 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4359  two component transcriptional regulator  60 
 
 		 229 aa  270  1e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3972  two component transcriptional regulator  61.06 
 
 		 242 aa  264  7e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5742  two component transcriptional regulator  59.91 
 
 		 342 aa  264  1e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0760421  hitchhiker  0.00137021 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2118  two component transcriptional regulator, winged helix family  57.33 
 
 		 238 aa  257  1e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.717558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0031  two component transcriptional regulator, winged helix family  58.93 
 
 		 234 aa  243  9.999999999999999e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1066  two component transcriptional regulator, winged helix family  57.4 
 
 		 222 aa  243  1.9999999999999999e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1497  two component transcriptional regulator  51.97 
 
 		 263 aa  237  1e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0123  two component transcriptional regulator  56 
 
 		 241 aa  234  6e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1522  two component transcriptional regulator  52.42 
 
 		 227 aa  219  3e-56  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4321  two component transcriptional regulator  52.63 
 
 		 248 aa  218  5e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.173505 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04836  two-component system regulatory protein  52.91 
 
 		 229 aa  215  5e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6779  two component transcriptional regulator  48.89 
 
 		 229 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.652587  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3225  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.22 
 
 		 231 aa  211  9e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.202731  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3084  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  49.33 
 
 		 229 aa  204  6e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.692731  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3133  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.43 
 
 		 231 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2692  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.74 
 
 		 229 aa  194  8.000000000000001e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2273  two component transcriptional regulator  60.81 
 
 		 154 aa  184  8e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.59177 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1028  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.35 
 
 		 237 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_926  two-component system, OmpR family, response regulator  44.05 
 
 		 227 aa  179  2.9999999999999997e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00200634  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1058  DNA-binding response regulator  41.41 
 
 		 227 aa  178  7e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000187393  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0393  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.52 
 
 		 227 aa  177  1e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.202895 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0937  two component transcriptional regulator  43.61 
 
 		 227 aa  176  3e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.834094  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1897  two component transcriptional regulator  43.91 
 
 		 227 aa  173  1.9999999999999998e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.151466  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0738  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.46 
 
 		 223 aa  171  6.999999999999999e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00000283527  decreased coverage  0.00121253 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2286  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.11 
 
 		 231 aa  171  6.999999999999999e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000188753  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3737  two component transcriptional regulator  45.96 
 
 		 231 aa  168  8e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273603 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1504  two component transcriptional regulator  44.02 
 
 		 231 aa  167  1e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263867  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1681  response regulator receiver protein  39.3 
 
 		 227 aa  167  1e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0956507  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0093  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.61 
 
 		 232 aa  166  2.9999999999999998e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2566  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.25 
 
 		 229 aa  164  9e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000356007  hitchhiker  0.00345607 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3429  two component transcriptional regulator  41.67 
 
 		 233 aa  163  2.0000000000000002e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0608192  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3061  two component transcriptional regulator  42.36 
 
 		 227 aa  163  2.0000000000000002e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.799336  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2981  two component transcriptional regulator  40.89 
 
 		 229 aa  162  3e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000201285  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2145  DNA-binding response regulator  41.99 
 
 		 232 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2782  two component transcriptional regulator  42.11 
 
 		 231 aa  162  5.0000000000000005e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.92379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1714  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.26 
 
 		 234 aa  160  2e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.233786  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3739  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.86 
 
 		 230 aa  159  2e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000466515  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2892  two component transcriptional regulator  41.05 
 
 		 227 aa  160  2e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0239565 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2522  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.04 
 
 		 226 aa  159  3e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  39.56 
 
 		 229 aa  159  3e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1155  two component transcriptional regulator  37.5 
 
 		 231 aa  159  3e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000430064  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0258  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.59 
 
 		 236 aa  159  4e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.606292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3691  two component transcriptional regulator  41.13 
 
 		 230 aa  159  4e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2083  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.18 
 
 		 237 aa  158  5e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.873655  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0644  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.09 
 
 		 236 aa  158  6e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2709  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.17 
 
 		 236 aa  158  6e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0011921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1367  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.79 
 
 		 230 aa  158  8e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000177207  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1696  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.56 
 
 		 224 aa  157  1e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1215  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.77 
 
 		 237 aa  157  1e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2845  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.09 
 
 		 234 aa  157  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3577  two component transcriptional regulator  43.48 
 
 		 232 aa  157  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.70324 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0960  two component transcriptional regulator  42.29 
 
 		 236 aa  157  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0214647 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0132  response regulator receiver protein  40.79 
 
 		 231 aa  156  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2922  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.35 
 
 		 230 aa  156  2e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.221617  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00330  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  42.48 
 
 		 240 aa  156  2e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00972196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3302  two component transcriptional regulator  38.43 
 
 		 230 aa  155  4e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.288231  normal  0.346827 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2983  two component transcriptional regulator  40.81 
 
 		 228 aa  155  4e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3485  two component transcriptional regulator  41.85 
 
 		 236 aa  155  5.0000000000000005e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1456  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.95 
 
 		 223 aa  155  5.0000000000000005e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000183373  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3302  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.48 
 
 		 231 aa  155  5.0000000000000005e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000343135 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2625  two component transcriptional regulator  39.83 
 
 		 232 aa  155  5.0000000000000005e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000561273 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1181  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.16 
 
 		 234 aa  155  6e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00335068 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0558  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.48 
 
 		 237 aa  154  8e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11690  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  41.15 
 
 		 236 aa  154  8e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.52451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2333  two component transcriptional regulator  37.99 
 
 		 232 aa  154  9e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.81 
 
 		 235 aa  154  9e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0646165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1658  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.57 
 
 		 230 aa  154  9e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.515101  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0360  two component signal transduction response regulator  41.3 
 
 		 224 aa  154  9e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2401  phosphate regulon transcriptional regulatory protein phoB  39.22 
 
 		 229 aa  154  1e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0353  two component transcriptional regulator  39.91 
 
 		 230 aa  154  1e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.683455 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1349  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.23 
 
 		 237 aa  154  1e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.421984 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3335  two component transcriptional regulator  39.13 
 
 		 230 aa  153  2e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.428008 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1288  two component transcriptional regulator  38.22 
 
 		 228 aa  153  2e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0766  two component transcriptional regulator  36.21 
 
 		 231 aa  153  2e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.585906  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1176  two component transcriptional regulator  39.3 
 
 		 229 aa  152  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.149936 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2915  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.67 
 
 		 225 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.892207  normal  0.300351 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0783  two component transcriptional regulator  39.39 
 
 		 231 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2228  two component transcriptional regulator  39.21 
 
 		 222 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00319429  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0805  two component transcriptional regulator  39.39 
 
 		 229 aa  151  7e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0916  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.43 
 
 		 234 aa  151  7e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0276045  hitchhiker  9.727110000000001e-18 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0312  response regulator receiver  41.23 
 
 		 233 aa  151  7e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0102436  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3782  response regulator receiver  39.48 
 
 		 297 aa  151  7e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>