More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_5811 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008061  Bcen_5049  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 259 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.839238  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5811  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 245 aa  490  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.244111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4368  two component transcriptional regulator  99.59 
 
 		 245 aa  488  1e-137  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4353  two component transcriptional regulator  91.02 
 
 		 245 aa  450  1e-125  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3050  two component transcriptional regulator  92.15 
 
 		 245 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.545982  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05454  two component response regulator transcription regulator protein  80.41 
 
 		 256 aa  402  1e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.169333 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2774  two component transcriptional regulator, winged helix family  77.29 
 
 		 245 aa  346  2e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2526  two component transcriptional regulator  76.92 
 
 		 262 aa  346  2e-94  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.262723  normal  0.926116 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5742  two component transcriptional regulator  67.22 
 
 		 342 aa  322  5e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0760421  hitchhiker  0.00137021 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1014  two component transcriptional regulator  65.94 
 
 		 244 aa  321  7e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2929  two component transcriptional regulator  68.83 
 
 		 250 aa  315  3e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.449606  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3972  two component transcriptional regulator  68.26 
 
 		 242 aa  310  1e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2118  two component transcriptional regulator, winged helix family  68 
 
 		 238 aa  309  2.9999999999999997e-83  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.717558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1792  two component transcriptional regulator, winged helix family  64.05 
 
 		 249 aa  304  1.0000000000000001e-81  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.783202  normal  0.482984 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2735  two component transcriptional regulator  64.19 
 
 		 228 aa  293  2e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.223671 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2612  two component transcriptional regulator, winged helix family  65.33 
 
 		 228 aa  291  5e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0412974  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1954  two component transcriptional regulator  65.5 
 
 		 253 aa  274  8e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.897911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1497  two component transcriptional regulator  55.51 
 
 		 263 aa  256  2e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6822  two component transcriptional regulator  55.46 
 
 		 229 aa  255  4e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.22547 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3634  two component transcriptional regulator  54.39 
 
 		 230 aa  249  2e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.966844 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4473  two component transcriptional regulator  54.39 
 
 		 230 aa  249  2e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3893  two component transcriptional regulator  54.39 
 
 		 230 aa  249  2e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.742854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0123  two component transcriptional regulator  55.88 
 
 		 241 aa  245  4e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4359  two component transcriptional regulator  53.78 
 
 		 229 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1066  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.64 
 
 		 222 aa  233  1.0000000000000001e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4321  two component transcriptional regulator  53.53 
 
 		 248 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.173505 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0031  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.2 
 
 		 234 aa  233  3e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3084  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  48.44 
 
 		 229 aa  201  7e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.692731  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3133  two component transcriptional regulator, winged helix family  48 
 
 		 231 aa  199  5e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2692  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.98 
 
 		 229 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04836  two-component system regulatory protein  49.33 
 
 		 229 aa  196  3e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3225  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.11 
 
 		 231 aa  196  4.0000000000000005e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.202731  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1522  two component transcriptional regulator  48.68 
 
 		 227 aa  195  6e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6779  two component transcriptional regulator  43.61 
 
 		 229 aa  187  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.652587  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1028  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.72 
 
 		 237 aa  172  5.999999999999999e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0937  two component transcriptional regulator  44.44 
 
 		 227 aa  171  7.999999999999999e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.834094  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1058  DNA-binding response regulator  44.89 
 
 		 227 aa  171  1e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000187393  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1897  two component transcriptional regulator  44.05 
 
 		 227 aa  168  6e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.151466  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3429  two component transcriptional regulator  42.79 
 
 		 233 aa  166  2.9999999999999998e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0608192  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1681  response regulator receiver protein  40.34 
 
 		 227 aa  166  2.9999999999999998e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0956507  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0738  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.33 
 
 		 223 aa  166  2.9999999999999998e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00000283527  decreased coverage  0.00121253 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2566  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.26 
 
 		 229 aa  165  5.9999999999999996e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000356007  hitchhiker  0.00345607 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3739  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.97 
 
 		 230 aa  164  8e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000466515  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2286  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.54 
 
 		 231 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000188753  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2387  two component transcriptional regulator  42.24 
 
 		 229 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00115026  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2273  two component transcriptional regulator  56.95 
 
 		 154 aa  163  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.59177 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3737  two component transcriptional regulator  43.67 
 
 		 231 aa  162  4.0000000000000004e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273603 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_926  two-component system, OmpR family, response regulator  43.56 
 
 		 227 aa  162  4.0000000000000004e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00200634  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2333  two component transcriptional regulator  40.43 
 
 		 232 aa  162  5.0000000000000005e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2845  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.38 
 
 		 234 aa  160  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0644  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.02 
 
 		 236 aa  159  3e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0393  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.17 
 
 		 227 aa  159  3e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.202895 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2892  two component transcriptional regulator  41.99 
 
 		 227 aa  159  4e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0239565 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3061  two component transcriptional regulator  41.23 
 
 		 227 aa  157  1e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.799336  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.16 
 
 		 235 aa  157  1e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0646165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1504  two component transcriptional regulator  41.67 
 
 		 231 aa  157  1e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263867  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2782  two component transcriptional regulator  40.79 
 
 		 231 aa  156  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.92379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3782  response regulator receiver  41.43 
 
 		 297 aa  156  3e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2625  two component transcriptional regulator  39.83 
 
 		 232 aa  155  4e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000561273 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1673  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.43 
 
 		 233 aa  155  6e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0988  response regulator BaeR  37.17 
 
 		 227 aa  155  6e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000405458  normal  0.303622 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1485  response regulator receiver  41.81 
 
 		 235 aa  155  7e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.236897  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0882  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.23 
 
 		 230 aa  155  7e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.148935 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0805  two component transcriptional regulator  43.1 
 
 		 229 aa  154  1e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0969  two component transcriptional regulator  40.27 
 
 		 226 aa  154  1e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.165699  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2302  DNA-binding response regulator  40.43 
 
 		 231 aa  154  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2522  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.2 
 
 		 226 aa  154  2e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1527  two component transcriptional regulator  39.32 
 
 		 230 aa  153  2e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.255733  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2564  DNA-binding response regulator  40.43 
 
 		 231 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0589521  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4657  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.08 
 
 		 240 aa  152  2.9999999999999998e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1367  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.74 
 
 		 230 aa  152  2.9999999999999998e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000177207  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0960  two component transcriptional regulator  43.42 
 
 		 236 aa  153  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0214647 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1155  two component transcriptional regulator  36.52 
 
 		 231 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000430064  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0258  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.04 
 
 		 236 aa  152  2.9999999999999998e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.606292  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2385  DNA-binding response regulator  40.43 
 
 		 231 aa  152  4e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.534853  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2341  DNA-binding response regulator  40.43 
 
 		 231 aa  152  4e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000166477  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2561  DNA-binding response regulator  40.43 
 
 		 231 aa  152  4e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.630654  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2574  DNA-binding response regulator  40.43 
 
 		 231 aa  152  4e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000040017 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1658  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.47 
 
 		 230 aa  152  5e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.515101  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2526  DNA-binding response regulator  40 
 
 		 231 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2617  DNA-binding response regulator  40.43 
 
 		 231 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.993672  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2796  DNA-binding response regulator  39.74 
 
 		 231 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.512352  hitchhiker  0.00000533196 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1104  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.57 
 
 		 233 aa  151  8.999999999999999e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0132  response regulator receiver protein  40.53 
 
 		 231 aa  151  8.999999999999999e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1102  DNA-binding response regulator  42.86 
 
 		 225 aa  150  1e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2083  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.68 
 
 		 237 aa  151  1e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.873655  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2937  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.32 
 
 		 243 aa  151  1e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0093  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.17 
 
 		 232 aa  150  2e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6330  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.33 
 
 		 234 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.000626879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3302  two component transcriptional regulator  35.24 
 
 		 230 aa  150  2e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.288231  normal  0.346827 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3305  DNA-binding response regulator BaeR  37.83 
 
 		 232 aa  149  3e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.304306  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1652  DNA-binding response regulator CreB  40.68 
 
 		 232 aa  149  3e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2983  two component transcriptional regulator  40.26 
 
 		 228 aa  150  3e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1176  two component transcriptional regulator  39.91 
 
 		 229 aa  149  3e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.149936 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1288  two component transcriptional regulator  37.89 
 
 		 228 aa  149  3e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3118  DNA-binding response regulator  41.85 
 
 		 227 aa  149  4e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3261  DNA-binding response regulator  41.56 
 
 		 225 aa  149  4e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  40 
 
 		 229 aa  149  4e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0630  two component transcriptional regulator  37.72 
 
 		 232 aa  149  4e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3485  two component transcriptional regulator  42.98 
 
 		 236 aa  149  4e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>