More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2929 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2929  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 250 aa  489  1e-137  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.449606  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05454  two component response regulator transcription regulator protein  67.19 
 
 		 256 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.169333 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5049  two component transcriptional regulator  68.83 
 
 		 259 aa  316  2e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.839238  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5811  two component transcriptional regulator  68.83 
 
 		 245 aa  315  3e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.244111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4368  two component transcriptional regulator  65.98 
 
 		 245 aa  316  3e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2526  two component transcriptional regulator  67.35 
 
 		 262 aa  313  9.999999999999999e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.262723  normal  0.926116 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2774  two component transcriptional regulator, winged helix family  68.83 
 
 		 245 aa  312  3.9999999999999997e-84  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3050  two component transcriptional regulator  64.75 
 
 		 245 aa  311  5.999999999999999e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.545982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4353  two component transcriptional regulator  67.39 
 
 		 245 aa  310  1e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3972  two component transcriptional regulator  67.69 
 
 		 242 aa  301  7.000000000000001e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1014  two component transcriptional regulator  62.3 
 
 		 244 aa  299  3e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5742  two component transcriptional regulator  65.35 
 
 		 342 aa  286  2e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0760421  hitchhiker  0.00137021 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2118  two component transcriptional regulator, winged helix family  64.16 
 
 		 238 aa  282  4.0000000000000003e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.717558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2735  two component transcriptional regulator  62.61 
 
 		 228 aa  276  3e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.223671 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1792  two component transcriptional regulator, winged helix family  62.77 
 
 		 249 aa  273  2.0000000000000002e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.783202  normal  0.482984 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2612  two component transcriptional regulator, winged helix family  61.4 
 
 		 228 aa  271  7e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0412974  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1954  two component transcriptional regulator  66.81 
 
 		 253 aa  266  2.9999999999999995e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.897911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1497  two component transcriptional regulator  55.84 
 
 		 263 aa  254  7e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3634  two component transcriptional regulator  56.96 
 
 		 230 aa  248  7e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.966844 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4473  two component transcriptional regulator  56.96 
 
 		 230 aa  248  7e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3893  two component transcriptional regulator  56.96 
 
 		 230 aa  248  7e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.742854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6822  two component transcriptional regulator  55.26 
 
 		 229 aa  244  6.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.22547 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0123  two component transcriptional regulator  57.69 
 
 		 241 aa  243  1.9999999999999999e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4359  two component transcriptional regulator  54.55 
 
 		 229 aa  243  3e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4321  two component transcriptional regulator  52.72 
 
 		 248 aa  224  8e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.173505 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0031  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.52 
 
 		 234 aa  223  2e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1066  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.19 
 
 		 222 aa  221  8e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3133  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.22 
 
 		 231 aa  219  3e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3084  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  52 
 
 		 229 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.692731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04836  two-component system regulatory protein  52.86 
 
 		 229 aa  212  3.9999999999999995e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3225  two component transcriptional regulator, winged helix family  52 
 
 		 231 aa  211  7.999999999999999e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.202731  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2692  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.89 
 
 		 229 aa  209  4e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1522  two component transcriptional regulator  47.83 
 
 		 227 aa  185  5e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1897  two component transcriptional regulator  46.26 
 
 		 227 aa  182  5.0000000000000004e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.151466  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6779  two component transcriptional regulator  42.73 
 
 		 229 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.652587  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00330  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  46.98 
 
 		 240 aa  177  1e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00972196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0937  two component transcriptional regulator  44.74 
 
 		 227 aa  177  2e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.834094  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0393  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.35 
 
 		 227 aa  176  2e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.202895 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0258  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.26 
 
 		 236 aa  176  3e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.606292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11690  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  46.55 
 
 		 236 aa  174  9e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.52451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_926  two-component system, OmpR family, response regulator  45.58 
 
 		 227 aa  172  3.9999999999999995e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00200634  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3739  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.98 
 
 		 230 aa  171  1e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000466515  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1058  DNA-binding response regulator  43.81 
 
 		 227 aa  170  2e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000187393  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1681  response regulator receiver protein  42.17 
 
 		 227 aa  170  2e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0956507  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3737  two component transcriptional regulator  46.96 
 
 		 231 aa  170  3e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273603 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0805  two component transcriptional regulator  45.89 
 
 		 229 aa  169  3e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04710  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.76 
 
 		 237 aa  169  4e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2273  two component transcriptional regulator  61.18 
 
 		 154 aa  169  5e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.59177 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1349  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.83 
 
 		 237 aa  168  7e-41  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.421984 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2286  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.23 
 
 		 231 aa  167  1e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000188753  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1055  DNA-binding response regulator SrrA  41.81 
 
 		 241 aa  167  2e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1176  two component transcriptional regulator  43.67 
 
 		 229 aa  166  2e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.149936 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0738  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.12 
 
 		 223 aa  165  6.9999999999999995e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00000283527  decreased coverage  0.00121253 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3302  two component transcriptional regulator  39.74 
 
 		 230 aa  165  8e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.288231  normal  0.346827 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2892  two component transcriptional regulator  44.21 
 
 		 227 aa  164  9e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0239565 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3061  two component transcriptional regulator  42.92 
 
 		 227 aa  164  1.0000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.799336  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  43.78 
 
 		 229 aa  164  1.0000000000000001e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1181  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.36 
 
 		 234 aa  163  2.0000000000000002e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00335068 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0949  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.49 
 
 		 252 aa  163  2.0000000000000002e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1367  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.78 
 
 		 230 aa  163  3e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000177207  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3429  two component transcriptional regulator  41.56 
 
 		 233 aa  162  4.0000000000000004e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0608192  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1714  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.83 
 
 		 234 aa  162  4.0000000000000004e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.233786  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4585  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.23 
 
 		 234 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.209184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0916  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.7 
 
 		 234 aa  162  6e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0276045  hitchhiker  9.727110000000001e-18 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2845  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.38 
 
 		 234 aa  161  7e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1504  two component transcriptional regulator  45.41 
 
 		 231 aa  161  7e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263867  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0467  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.29 
 
 		 230 aa  161  8.000000000000001e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2333  two component transcriptional regulator  40.08 
 
 		 232 aa  161  9e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2566  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.13 
 
 		 229 aa  161  1e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000356007  hitchhiker  0.00345607 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3782  response regulator receiver  42.58 
 
 		 297 aa  160  1e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2709  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.26 
 
 		 236 aa  160  1e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0011921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3485  two component transcriptional regulator  45.65 
 
 		 236 aa  160  2e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0132  response regulator receiver protein  44.64 
 
 		 231 aa  160  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1580  response regulator receiver  40.09 
 
 		 241 aa  160  2e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1549  two component transcriptional regulator  40.09 
 
 		 241 aa  160  2e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1456  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.05 
 
 		 223 aa  159  3e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000183373  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0960  two component transcriptional regulator  45.53 
 
 		 236 aa  159  3e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0214647 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0093  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.87 
 
 		 232 aa  159  4e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1155  two component transcriptional regulator  39.06 
 
 		 231 aa  159  4e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000430064  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6330  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.05 
 
 		 234 aa  159  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.000626879  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0268  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.23 
 
 		 227 aa  159  4e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.509377 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0882  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.54 
 
 		 230 aa  159  5e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.148935 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23040  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  42.36 
 
 		 229 aa  158  7e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.318653  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3118  DNA-binding response regulator  42.98 
 
 		 227 aa  158  9e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1028  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.88 
 
 		 237 aa  157  1e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2387  two component transcriptional regulator  41.92 
 
 		 229 aa  157  1e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00115026  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2782  two component transcriptional regulator  43.48 
 
 		 231 aa  157  1e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.92379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.96 
 
 		 235 aa  157  1e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0646165  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1485  response regulator receiver  41.92 
 
 		 235 aa  157  1e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.236897  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1673  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.91 
 
 		 233 aa  157  2e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0264  two component transcriptional regulator  38.66 
 
 		 238 aa  156  3e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.392693  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3394  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.45 
 
 		 230 aa  156  3e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.103692  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1911  two component transcriptional regulator  45.41 
 
 		 229 aa  156  3e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.258551 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1220  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.56 
 
 		 233 aa  155  4e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00991602 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2983  two component transcriptional regulator  42.86 
 
 		 228 aa  155  4e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1104  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.11 
 
 		 233 aa  155  5.0000000000000005e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1944  two component transcriptional regulator  40.51 
 
 		 238 aa  155  5.0000000000000005e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0766  two component transcriptional regulator  38.2 
 
 		 231 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.585906  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5511  two component transcriptional regulator  38.26 
 
 		 236 aa  155  6e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.567595 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2145  DNA-binding response regulator  41.1 
 
 		 232 aa  155  6e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>