More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4585 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011368  Rleg2_4585  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 234 aa  464  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.209184  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6330  two component transcriptional regulator, winged helix family  88.89 
 
 		 234 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.000626879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3302  two component transcriptional regulator  61.84 
 
 		 230 aa  277  8e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.288231  normal  0.346827 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3335  two component transcriptional regulator  52.63 
 
 		 230 aa  238  5.999999999999999e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.428008 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4324  two component transcriptional regulator  55.67 
 
 		 207 aa  224  9e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.823634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3969  two component transcriptional regulator  50 
 
 		 243 aa  219  3e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.162736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0268  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.12 
 
 		 227 aa  212  4.9999999999999996e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.509377 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1028  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.74 
 
 		 237 aa  195  4.0000000000000005e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4871  DNA-binding response regulator CreB  45.22 
 
 		 226 aa  194  7e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.608103  normal  0.305164 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0360  DNA-binding response regulator CreB  45.45 
 
 		 226 aa  192  3e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.48199  normal  0.18469 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2981  two component transcriptional regulator  43.61 
 
 		 229 aa  191  6e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000201285  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2656  two component transcriptional regulator  41.41 
 
 		 226 aa  190  2e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.311089  normal  0.831438 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1527  two component transcriptional regulator  42.86 
 
 		 230 aa  187  9e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.255733  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2866  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.41 
 
 		 231 aa  187  1e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1077  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.58 
 
 		 235 aa  187  1e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0568  DNA-binding response regulator CreB  42.17 
 
 		 229 aa  185  4e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0391692  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4120  DNA-binding response regulator CreB  43.23 
 
 		 226 aa  186  4e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1903  two component transcriptional regulator  41.85 
 
 		 230 aa  185  6e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0357  DNA-binding response regulator CreB  44.21 
 
 		 226 aa  185  7e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.501858  normal  0.680539 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  44 
 
 		 229 aa  184  7e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3739  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.17 
 
 		 230 aa  184  8e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000466515  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2741  two component transcriptional regulator  41.67 
 
 		 231 aa  184  9e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.299643 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1681  two-component transcriptional regulator  41.99 
 
 		 233 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5196  DNA-binding response regulator CreB  44.84 
 
 		 226 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247569 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2724  response regulator receiver domain-containing protein  37.66 
 
 		 230 aa  183  2.0000000000000003e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.480114  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06060  DNA-binding response regulator CreB  41.53 
 
 		 229 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00519358 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0314  two component transcriptional regulator  41.99 
 
 		 233 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.765921 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00330  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  43.3 
 
 		 240 aa  182  3e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00972196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0258  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.3 
 
 		 236 aa  182  3e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.606292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0361  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.79 
 
 		 233 aa  182  3e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.324623  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02230  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  43.3 
 
 		 229 aa  182  4.0000000000000006e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1066  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.48 
 
 		 222 aa  182  4.0000000000000006e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11690  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  43.3 
 
 		 236 aa  182  4.0000000000000006e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.52451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0031  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.78 
 
 		 234 aa  182  4.0000000000000006e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5423  two component transcriptional regulator  41.85 
 
 		 239 aa  182  4.0000000000000006e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0402  two component transcriptional regulator  40.85 
 
 		 235 aa  182  5.0000000000000004e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.344138  normal  0.0526207 
 
 
-
 
NC_002936  DET1058  DNA-binding response regulator  44.05 
 
 		 227 aa  181  9.000000000000001e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000187393  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1453  DNA-binding response regulator  40.36 
 
 		 223 aa  180  2e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1413  DNA-binding response regulator  40.36 
 
 		 223 aa  180  2e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7367  two component transcriptional regulator  42.79 
 
 		 233 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_926  two-component system, OmpR family, response regulator  43.61 
 
 		 227 aa  179  2.9999999999999997e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00200634  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2496  response regulator receiver  42.36 
 
 		 225 aa  179  4e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.491467  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0463  two component transcriptional regulator  42.79 
 
 		 233 aa  179  4e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.966783  normal  0.711351 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0367  winged helix family two component transcriptional regulator  42.79 
 
 		 233 aa  179  4e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0127671 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2121  two component transcriptional regulator  42.73 
 
 		 231 aa  179  4.999999999999999e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0255  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.67 
 
 		 231 aa  178  5.999999999999999e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.02112 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0443  two component transcriptional regulator  42.36 
 
 		 233 aa  178  5.999999999999999e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1155  two component transcriptional regulator  42.11 
 
 		 231 aa  178  5.999999999999999e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000430064  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0348  transcriptional regulatory protein  42.36 
 
 		 233 aa  178  7e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.618403  normal  0.242627 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03750  PhoP-like protein  40.89 
 
 		 226 aa  178  7e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.181369  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02200  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  43.95 
 
 		 231 aa  178  8e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3571  two component transcriptional regulator  41.41 
 
 		 233 aa  178  8e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3394  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.89 
 
 		 230 aa  177  9e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.103692  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1456  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.36 
 
 		 223 aa  177  9e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000183373  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5905  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.36 
 
 		 237 aa  177  9e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1351  DNA-binding response regulator  40.36 
 
 		 223 aa  177  1e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1897  two component transcriptional regulator  44.59 
 
 		 227 aa  177  1e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.151466  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0969  two component transcriptional regulator  38.57 
 
 		 226 aa  177  1e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.165699  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2907  two component transcriptional regulator  43.04 
 
 		 250 aa  177  1e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0597  two component transcriptional regulator  42.36 
 
 		 233 aa  177  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1332  transcriptional regulatory protein BvrR  40.53 
 
 		 240 aa  177  1e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1213  DNA-binding response regulator  40.81 
 
 		 223 aa  177  2e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.203275  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2845  two component transcriptional regulator  41.05 
 
 		 232 aa  176  2e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.868207 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1191  response regulator  39.91 
 
 		 223 aa  176  2e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2477  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  40.09 
 
 		 240 aa  176  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2361  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  40.09 
 
 		 240 aa  176  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1312  DNA-binding response regulator  40.81 
 
 		 223 aa  177  2e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2368  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  40.09 
 
 		 240 aa  176  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.531777  normal  0.413146 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0937  two component transcriptional regulator  43.17 
 
 		 227 aa  176  2e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.834094  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.93 
 
 		 234 aa  176  2e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.178035  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2261  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  40.09 
 
 		 240 aa  176  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.806239  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3993  DNA-binding response regulator  40.36 
 
 		 223 aa  176  3e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.910988 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1240  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.36 
 
 		 227 aa  176  3e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.729355  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1558  phosphate regulon response regulator PhoB  39.48 
 
 		 239 aa  176  3e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1193  response regulator  39.91 
 
 		 223 aa  176  3e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1389  DNA-binding response regulator  39.91 
 
 		 223 aa  176  3e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2317  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  40.09 
 
 		 240 aa  176  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.539006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0435  transcriptional regulator PhoB  40.69 
 
 		 229 aa  176  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.464381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0454  transcriptional regulator PhoB  40.69 
 
 		 229 aa  176  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0496  transcriptional regulator PhoB  40.69 
 
 		 229 aa  176  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2333  two component transcriptional regulator  39.22 
 
 		 232 aa  176  3e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1884  two component transcriptional regulator  39.22 
 
 		 233 aa  176  4e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0441  transcriptional regulator PhoB  40.69 
 
 		 229 aa  175  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.244741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1288  two component transcriptional regulator  39.01 
 
 		 228 aa  175  4e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1403  two component transcriptional regulator  39.39 
 
 		 229 aa  175  5e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00109837  normal  0.0219543 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2981  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  39.39 
 
 		 229 aa  175  5e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000220801  hitchhiker  0.00121997 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2922  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.99 
 
 		 230 aa  175  5e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.221617  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2709  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.23 
 
 		 236 aa  175  5e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0011921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1378  two component transcriptional regulator  39.39 
 
 		 229 aa  175  5e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000291119  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3089  two component transcriptional regulator  41.38 
 
 		 236 aa  175  5e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.63756 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1364  two component transcriptional regulator  39.39 
 
 		 229 aa  175  5e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000657343  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0609  DNA-binding response regulator  41.48 
 
 		 231 aa  175  6e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000282114  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0766  two component transcriptional regulator  41.23 
 
 		 231 aa  175  6e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.585906  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1975  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.56 
 
 		 236 aa  174  7e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.206633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3176  DNA-binding response regulator CreB  39.21 
 
 		 226 aa  174  7e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0818547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2709  two component transcriptional regulator  39.39 
 
 		 229 aa  174  7e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000407229  decreased coverage  0.000000263688 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2777  two component transcriptional regulator  39.39 
 
 		 229 aa  174  7e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000628627  decreased coverage  0.000208697 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2879  two component transcriptional regulator  39.39 
 
 		 229 aa  174  7e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000143261  hitchhiker  0.00000615281 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2689  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  39.91 
 
 		 240 aa  175  7e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0867  transcriptional regulator PhoB  40.26 
 
 		 229 aa  174  8e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.437737  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>