More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2845 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_2845  two component transcriptional regulator  100 
 
 
232 aa  470  1e-132  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.868207 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0361  two component transcriptional regulator, winged helix family  90.56 
 
 
233 aa  421  1e-117  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.324623  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0463  two component transcriptional regulator  90.99 
 
 
233 aa  421  1e-117  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.966783  normal  0.711351 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0597  two component transcriptional regulator  90.99 
 
 
233 aa  421  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0367  winged helix family two component transcriptional regulator  90.99 
 
 
233 aa  421  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0127671 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0348  transcriptional regulatory protein  90.13 
 
 
233 aa  416  9.999999999999999e-116  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.618403  normal  0.242627 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0443  two component transcriptional regulator  90.13 
 
 
233 aa  416  9.999999999999999e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7367  two component transcriptional regulator  89.7 
 
 
233 aa  414  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0255  two component transcriptional regulator, winged helix family  86.21 
 
 
231 aa  410  1e-114  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.02112 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2741  two component transcriptional regulator  85.78 
 
 
231 aa  408  1e-113  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.299643 
 
 
-
 
NC_004310  BR2090  DNA-binding response regulator BvrR, putative  86.09 
 
 
239 aa  406  1.0000000000000001e-112  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0306093  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3089  two component transcriptional regulator  86.81 
 
 
236 aa  404  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.63756 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2010  putative DNA-binding response regulator BvrR  86.09 
 
 
239 aa  406  1.0000000000000001e-112  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.112651  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0828  two component transcriptional regulator  85.65 
 
 
239 aa  404  1.0000000000000001e-112  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0815733  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1179  two component transcriptional regulator, winged helix family  86.08 
 
 
237 aa  401  1e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.566879  normal  0.163877 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1238  response regulator receiver  86.08 
 
 
237 aa  401  1e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1400  two component transcriptional regulator, winged helix family  86.08 
 
 
237 aa  401  1e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0577794  normal  0.435154 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5433  two component transcriptional regulator, winged helix family  85.65 
 
 
238 aa  397  9.999999999999999e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.177781  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0225  two component transcriptional regulator  85.65 
 
 
238 aa  397  9.999999999999999e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0106464 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3571  two component transcriptional regulator  81.9 
 
 
233 aa  392  1e-108  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0044  two component response regulator  80.67 
 
 
240 aa  386  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4296  two component transcriptional regulator, winged helix family  78.93 
 
 
250 aa  380  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3969  two component transcriptional regulator, winged helix family  78.93 
 
 
244 aa  378  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.966692  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3252  two component transcriptional regulator  79.83 
 
 
240 aa  371  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0111  two component transcriptional regulator  80.17 
 
 
233 aa  372  1e-102  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.953605 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1332  transcriptional regulatory protein BvrR  76.52 
 
 
240 aa  365  1e-100  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1681  two-component transcriptional regulator  69.83 
 
 
233 aa  344  8e-94  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2441  two component transcriptional regulator  70.76 
 
 
233 aa  342  2e-93  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.325552  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0314  two component transcriptional regulator  69.83 
 
 
233 aa  342  2.9999999999999997e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.765921 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0212  two component transcriptional regulator  70.26 
 
 
233 aa  341  5e-93  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0074  two component transcriptional regulator  71.91 
 
 
236 aa  339  2e-92  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0536  two component transcriptional regulator  69.83 
 
 
233 aa  337  9.999999999999999e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3422  two component transcriptional regulator  69.13 
 
 
241 aa  330  2e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0402  two component transcriptional regulator  68.38 
 
 
235 aa  321  6e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.344138  normal  0.0526207 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1975  two component transcriptional regulator, winged helix family  66.09 
 
 
236 aa  318  6e-86  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.206633  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1884  two component transcriptional regulator  65.38 
 
 
233 aa  315  5e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4630  two component transcriptional regulator  65.11 
 
 
235 aa  314  6e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0961185  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2047  two component transcriptional regulator  65.95 
 
 
236 aa  310  2e-83  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.50343  normal  0.117999 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2907  two component transcriptional regulator  65.67 
 
 
250 aa  303  1.0000000000000001e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0268  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.37 
 
 
227 aa  202  5e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.509377 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3335  two component transcriptional regulator  42.73 
 
 
230 aa  193  2e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.428008 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1791  two component transcriptional regulator  43.35 
 
 
230 aa  190  2e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000231936  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3302  two component transcriptional regulator  40.35 
 
 
230 aa  189  5e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.288231  normal  0.346827 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4259  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.78 
 
 
230 aa  187  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.602522  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  41.38 
 
 
229 aa  186  2e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3969  two component transcriptional regulator  46.72 
 
 
243 aa  186  3e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.162736  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5905  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.54 
 
 
237 aa  185  5e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03557  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.34 
 
 
229 aa  185  6e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000983286  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3685  two component transcriptional regulator  42.42 
 
 
233 aa  183  2.0000000000000003e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.934173  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1077  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.28 
 
 
235 aa  181  1e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1016  response regulator receiver domain-containing protein  41.45 
 
 
230 aa  178  8e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1504  two component transcriptional regulator  44.26 
 
 
231 aa  177  8e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263867  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4324  two component transcriptional regulator  45.45 
 
 
207 aa  177  1e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.823634  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4585  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.05 
 
 
234 aa  176  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.209184  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2202  two component transcriptional regulator  41.2 
 
 
230 aa  177  2e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0636153  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2279  two component transcriptional regulator  41.2 
 
 
230 aa  177  2e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00696203  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2412  two component transcriptional regulator  41.2 
 
 
230 aa  176  2e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000515704  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2872  two component transcriptional regulator  41.13 
 
 
226 aa  176  3e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.702853  hitchhiker  0.00802276 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3920  two component transcriptional regulator  42.24 
 
 
237 aa  176  3e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1623  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  40.77 
 
 
229 aa  176  3e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.314496  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1738  two component transcriptional regulator  41.2 
 
 
230 aa  176  3e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.485524  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2910  response regulator receiver  41.56 
 
 
230 aa  175  5e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6330  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.92 
 
 
234 aa  175  5e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.000626879  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2983  two component transcriptional regulator  41.67 
 
 
228 aa  174  7e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1875  two component transcriptional regulator  41.2 
 
 
230 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00450797  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3982  DNA-binding response regulator  40.43 
 
 
238 aa  174  9.999999999999999e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.319576  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2494  two component transcriptional regulator  40.87 
 
 
232 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00298377  normal  0.523068 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1827  two component transcriptional regulator  41.2 
 
 
230 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0283431  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2450  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.2 
 
 
230 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000016563  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2122  two component transcriptional regulator  40.6 
 
 
231 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00660884  normal  0.0855219 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1102  DNA-binding response regulator  42.13 
 
 
225 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2570  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.43 
 
 
239 aa  173  1.9999999999999998e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2193  DNA-binding response regulator  40.77 
 
 
230 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0969  two component transcriptional regulator  40.17 
 
 
226 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.165699  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3145  two component transcriptional regulator  42.11 
 
 
231 aa  172  2.9999999999999996e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00258001  hitchhiker  0.000377263 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3929  two component transcriptional regulator  39.74 
 
 
247 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03750  PhoP-like protein  39.39 
 
 
226 aa  172  3.9999999999999995e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.181369  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0700  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.26 
 
 
226 aa  172  5e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.768939  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1572  two component transcriptional regulator  40.43 
 
 
225 aa  171  9e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000784208  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01984  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with BaeS  39.13 
 
 
240 aa  171  1e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1577  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.13 
 
 
240 aa  171  1e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3118  DNA-binding response regulator  41.92 
 
 
227 aa  170  1e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0981  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  39.13 
 
 
240 aa  171  1e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.443633  normal  0.661259 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1154  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  39.13 
 
 
240 aa  170  1e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.233901  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2972  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  40 
 
 
242 aa  170  1e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2221  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  39.13 
 
 
240 aa  171  1e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3019  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  39.13 
 
 
240 aa  171  1e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0767733 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2371  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  39.13 
 
 
240 aa  170  1e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01976  hypothetical protein  39.13 
 
 
240 aa  171  1e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1493  two component transcriptional regulator  42.61 
 
 
232 aa  171  1e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12584  normal  0.340507 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1897  two component transcriptional regulator  40.17 
 
 
227 aa  170  2e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.151466  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0783  two component transcriptional regulator  43.36 
 
 
231 aa  170  2e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1573  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  39.74 
 
 
234 aa  170  2e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0961  response regulator receiver protein  40.43 
 
 
229 aa  169  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0019  two component transcriptional regulator  40.44 
 
 
235 aa  169  3e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2518  two component transcriptional regulator  39.06 
 
 
230 aa  169  3e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0122186  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2005  response regulator receiver protein  41.63 
 
 
231 aa  169  3e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.243352  normal  0.209106 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4321  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.21 
 
 
219 aa  169  4e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0131168 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4211  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.21 
 
 
219 aa  169  4e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3557  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  40.35 
 
 
239 aa  169  5e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>