More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7367 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_7367  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 233 aa  473  1e-133  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0443  two component transcriptional regulator  96.57 
 
 		 233 aa  457  9.999999999999999e-129  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0348  transcriptional regulatory protein  96.14 
 
 		 233 aa  455  1e-127  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.618403  normal  0.242627 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0463  two component transcriptional regulator  96.14 
 
 		 233 aa  453  1e-127  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.966783  normal  0.711351 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0597  two component transcriptional regulator  95.71 
 
 		 233 aa  453  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0367  winged helix family two component transcriptional regulator  96.14 
 
 		 233 aa  453  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0127671 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0361  two component transcriptional regulator, winged helix family  96.12 
 
 		 233 aa  451  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.324623  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2845  two component transcriptional regulator  89.7 
 
 		 232 aa  414  9.999999999999999e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.868207 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0255  two component transcriptional regulator, winged helix family  86.64 
 
 		 231 aa  409  1e-113  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.02112 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3089  two component transcriptional regulator  85.59 
 
 		 236 aa  404  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.63756 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2741  two component transcriptional regulator  86.27 
 
 		 231 aa  406  1.0000000000000001e-112  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.299643 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1400  two component transcriptional regulator, winged helix family  86.44 
 
 		 237 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0577794  normal  0.435154 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1179  two component transcriptional regulator, winged helix family  86.44 
 
 		 237 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.566879  normal  0.163877 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1238  response regulator receiver  86.44 
 
 		 237 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2090  DNA-binding response regulator BvrR, putative  83.55 
 
 		 239 aa  391  1e-108  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0306093  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2010  putative DNA-binding response regulator BvrR  83.55 
 
 		 239 aa  391  1e-108  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.112651  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0828  two component transcriptional regulator  83.91 
 
 		 239 aa  390  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0815733  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0225  two component transcriptional regulator  84.81 
 
 		 238 aa  391  1e-108  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0106464 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5433  two component transcriptional regulator, winged helix family  84.81 
 
 		 238 aa  391  1e-108  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.177781  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3571  two component transcriptional regulator  80.69 
 
 		 233 aa  385  1e-106  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0044  two component response regulator  79.5 
 
 		 240 aa  381  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4296  two component transcriptional regulator, winged helix family  78.51 
 
 		 250 aa  375  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3969  two component transcriptional regulator, winged helix family  77.78 
 
 		 244 aa  372  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.966692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3252  two component transcriptional regulator  79.08 
 
 		 240 aa  367  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0111  two component transcriptional regulator  78.11 
 
 		 233 aa  358  6e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.953605 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1332  transcriptional regulatory protein BvrR  74.78 
 
 		 240 aa  348  3e-95  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0074  two component transcriptional regulator  70.34 
 
 		 236 aa  329  2e-89  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2441  two component transcriptional regulator  66.81 
 
 		 233 aa  328  5.0000000000000004e-89  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.325552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1681  two-component transcriptional regulator  66.81 
 
 		 233 aa  327  7e-89  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0536  two component transcriptional regulator  68.53 
 
 		 233 aa  327  1.0000000000000001e-88  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0314  two component transcriptional regulator  66.81 
 
 		 233 aa  326  2.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.765921 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0212  two component transcriptional regulator  67.67 
 
 		 233 aa  325  3e-88  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3422  two component transcriptional regulator  67.83 
 
 		 241 aa  322  3e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4630  two component transcriptional regulator  65.11 
 
 		 235 aa  321  5e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0961185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0402  two component transcriptional regulator  67.66 
 
 		 235 aa  313  9.999999999999999e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.344138  normal  0.0526207 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1975  two component transcriptional regulator, winged helix family  63.79 
 
 		 236 aa  305  5.0000000000000004e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.206633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2907  two component transcriptional regulator  64.17 
 
 		 250 aa  301  4.0000000000000003e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1884  two component transcriptional regulator  62.82 
 
 		 233 aa  300  2e-80  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2047  two component transcriptional regulator  64.38 
 
 		 236 aa  298  5e-80  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.50343  normal  0.117999 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3335  two component transcriptional regulator  44.93 
 
 		 230 aa  196  3e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.428008 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5905  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.78 
 
 		 237 aa  191  1e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3302  two component transcriptional regulator  41.67 
 
 		 230 aa  190  2e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.288231  normal  0.346827 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0268  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.72 
 
 		 227 aa  188  5.999999999999999e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.509377 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03557  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.57 
 
 		 229 aa  185  4e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000983286  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3969  two component transcriptional regulator  45.61 
 
 		 243 aa  181  7e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.162736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1077  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.1 
 
 		 235 aa  181  7e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6330  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.1 
 
 		 234 aa  181  8.000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.000626879  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3982  DNA-binding response regulator  43.59 
 
 		 238 aa  180  1e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.319576  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3685  two component transcriptional regulator  43.29 
 
 		 233 aa  181  1e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.934173  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1791  two component transcriptional regulator  43.78 
 
 		 230 aa  181  1e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000231936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  40.95 
 
 		 229 aa  179  2e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4259  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.13 
 
 		 230 aa  180  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.602522  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1102  DNA-binding response regulator  42.13 
 
 		 225 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2494  two component transcriptional regulator  43.04 
 
 		 232 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00298377  normal  0.523068 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4585  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.79 
 
 		 234 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.209184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1623  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  42.49 
 
 		 229 aa  178  5.999999999999999e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.314496  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2122  two component transcriptional regulator  42.74 
 
 		 231 aa  177  9e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00660884  normal  0.0855219 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2412  two component transcriptional regulator  42.55 
 
 		 230 aa  177  9e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000515704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2202  two component transcriptional regulator  43.35 
 
 		 230 aa  177  1e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0636153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2279  two component transcriptional regulator  43.35 
 
 		 230 aa  177  1e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00696203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1738  two component transcriptional regulator  43.35 
 
 		 230 aa  177  2e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.485524  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1572  two component transcriptional regulator  40 
 
 		 225 aa  175  5e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000784208  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3920  two component transcriptional regulator  42.24 
 
 		 237 aa  174  7e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3118  DNA-binding response regulator  43.23 
 
 		 227 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1875  two component transcriptional regulator  41.7 
 
 		 230 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00450797  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2450  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.7 
 
 		 230 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000016563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1827  two component transcriptional regulator  41.7 
 
 		 230 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0283431  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4324  two component transcriptional regulator  45.5 
 
 		 207 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.823634  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2193  DNA-binding response regulator  42.92 
 
 		 230 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2983  two component transcriptional regulator  41.23 
 
 		 228 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2005  response regulator receiver protein  42.49 
 
 		 231 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.243352  normal  0.209106 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1504  two component transcriptional regulator  41.99 
 
 		 231 aa  171  5.999999999999999e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263867  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2910  response regulator receiver  41.13 
 
 		 230 aa  169  2e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2693  two component transcriptional regulator  40 
 
 		 226 aa  170  2e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.575064 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1367  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.86 
 
 		 230 aa  170  2e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000177207  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5196  DNA-binding response regulator CreB  40.34 
 
 		 226 aa  169  3e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247569 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0805  two component transcriptional regulator  40.79 
 
 		 229 aa  169  5e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2872  two component transcriptional regulator  39.48 
 
 		 226 aa  168  6e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.702853  hitchhiker  0.00802276 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2518  two component transcriptional regulator  40.77 
 
 		 230 aa  168  7e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0122186  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2476  two component transcriptional regulator  42.61 
 
 		 241 aa  167  9e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000027247 
 
 
-
 
NC_003296  RS05646  two-component response regulator transcription regulator protein  39.65 
 
 		 219 aa  167  1e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1016  response regulator receiver domain-containing protein  41.28 
 
 		 230 aa  167  1e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0783  two component transcriptional regulator  42.04 
 
 		 231 aa  167  1e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1271  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.41 
 
 		 225 aa  167  1e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2952  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.83 
 
 		 225 aa  167  1e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0630  two component transcriptional regulator  40 
 
 		 232 aa  167  1e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01984  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with BaeS  40 
 
 		 240 aa  166  2e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1577  two component transcriptional regulator, winged helix family  40 
 
 		 240 aa  166  2e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1154  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  40 
 
 		 240 aa  166  2e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.233901  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2371  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  40 
 
 		 240 aa  166  2e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3557  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  39.74 
 
 		 239 aa  166  2e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0969  two component transcriptional regulator  40.17 
 
 		 226 aa  167  2e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.165699  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01976  hypothetical protein  40 
 
 		 240 aa  166  2e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0981  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  40 
 
 		 240 aa  166  2e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.443633  normal  0.661259 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3019  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  40 
 
 		 240 aa  167  2e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0767733 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2221  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  40 
 
 		 240 aa  166  2e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3305  DNA-binding response regulator BaeR  36.52 
 
 		 232 aa  166  2.9999999999999998e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.304306  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2922  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.36 
 
 		 230 aa  166  2.9999999999999998e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.221617  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1573  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  38.86 
 
 		 234 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1554  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.09 
 
 		 229 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709514 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>