More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4630 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_4630  two component transcriptional regulator  100 
 
 
235 aa  475  1e-133  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0961185  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0074  two component transcriptional regulator  69.2 
 
 
236 aa  326  2.0000000000000001e-88  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7367  two component transcriptional regulator  65.11 
 
 
233 aa  321  5e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3571  two component transcriptional regulator  65.96 
 
 
233 aa  319  3e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0111  two component transcriptional regulator  67.23 
 
 
233 aa  318  6e-86  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.953605 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0597  two component transcriptional regulator  64.26 
 
 
233 aa  316  2e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0044  two component response regulator  64.44 
 
 
240 aa  316  2e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0348  transcriptional regulatory protein  64.26 
 
 
233 aa  315  3e-85  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.618403  normal  0.242627 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0361  two component transcriptional regulator, winged helix family  64.53 
 
 
233 aa  315  3e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.324623  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0443  two component transcriptional regulator  64.26 
 
 
233 aa  315  5e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1179  two component transcriptional regulator, winged helix family  64.14 
 
 
237 aa  315  5e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.566879  normal  0.163877 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1238  response regulator receiver  64.14 
 
 
237 aa  315  5e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1400  two component transcriptional regulator, winged helix family  64.14 
 
 
237 aa  315  5e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0577794  normal  0.435154 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2845  two component transcriptional regulator  65.11 
 
 
232 aa  314  6e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.868207 
 
 
-
 
NC_004310  BR2090  DNA-binding response regulator BvrR, putative  65.09 
 
 
239 aa  314  6e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0306093  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2010  putative DNA-binding response regulator BvrR  65.09 
 
 
239 aa  314  6e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.112651  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0828  two component transcriptional regulator  65.09 
 
 
239 aa  314  8e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0815733  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0463  two component transcriptional regulator  63.83 
 
 
233 aa  313  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.966783  normal  0.711351 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0367  winged helix family two component transcriptional regulator  63.83 
 
 
233 aa  313  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0127671 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3089  two component transcriptional regulator  64.71 
 
 
236 aa  313  9.999999999999999e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.63756 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2741  two component transcriptional regulator  64.26 
 
 
231 aa  311  4.999999999999999e-84  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.299643 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0255  two component transcriptional regulator, winged helix family  63.68 
 
 
231 aa  309  2e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.02112 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2441  two component transcriptional regulator  63.4 
 
 
233 aa  309  2e-83  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.325552  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0314  two component transcriptional regulator  62.39 
 
 
233 aa  304  7e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.765921 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0225  two component transcriptional regulator  63.45 
 
 
238 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0106464 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5433  two component transcriptional regulator, winged helix family  63.45 
 
 
238 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.177781  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0402  two component transcriptional regulator  65.53 
 
 
235 aa  302  3.0000000000000004e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.344138  normal  0.0526207 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1681  two-component transcriptional regulator  61.97 
 
 
233 aa  301  5.000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4296  two component transcriptional regulator, winged helix family  62.14 
 
 
250 aa  300  1e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1332  transcriptional regulatory protein BvrR  63.95 
 
 
240 aa  300  1e-80  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3969  two component transcriptional regulator, winged helix family  62.14 
 
 
244 aa  299  3e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.966692  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0212  two component transcriptional regulator  62.55 
 
 
233 aa  299  3e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3252  two component transcriptional regulator  62.76 
 
 
240 aa  297  1e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0536  two component transcriptional regulator  61.11 
 
 
233 aa  296  2e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1975  two component transcriptional regulator, winged helix family  60.17 
 
 
236 aa  293  2e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.206633  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1884  two component transcriptional regulator  59.91 
 
 
233 aa  291  4e-78  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2047  two component transcriptional regulator  59.49 
 
 
236 aa  288  6e-77  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.50343  normal  0.117999 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3422  two component transcriptional regulator  61.9 
 
 
241 aa  287  1e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2907  two component transcriptional regulator  57.45 
 
 
250 aa  279  2e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3302  two component transcriptional regulator  40.87 
 
 
230 aa  194  7e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.288231  normal  0.346827 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4259  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.38 
 
 
230 aa  183  2.0000000000000003e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.602522  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0268  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.06 
 
 
227 aa  183  2.0000000000000003e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.509377 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3335  two component transcriptional regulator  41.3 
 
 
230 aa  182  4.0000000000000006e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.428008 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2693  two component transcriptional regulator  43.46 
 
 
226 aa  180  1e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.575064 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1102  DNA-binding response regulator  43.04 
 
 
225 aa  180  2e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2476  two component transcriptional regulator  41.3 
 
 
241 aa  176  2e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000027247 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  40.6 
 
 
229 aa  176  3e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3118  DNA-binding response regulator  42.67 
 
 
227 aa  174  8e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1077  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.34 
 
 
235 aa  173  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2122  two component transcriptional regulator  39.15 
 
 
231 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00660884  normal  0.0855219 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1572  two component transcriptional regulator  40.51 
 
 
225 aa  172  3.9999999999999995e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000784208  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3929  two component transcriptional regulator  39.83 
 
 
247 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3394  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.74 
 
 
230 aa  172  5e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.103692  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1875  two component transcriptional regulator  37.87 
 
 
230 aa  171  7.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00450797  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2450  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.87 
 
 
230 aa  171  7.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000016563  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1827  two component transcriptional regulator  37.87 
 
 
230 aa  171  7.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0283431  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1791  two component transcriptional regulator  39.15 
 
 
230 aa  171  9e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000231936  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4585  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.47 
 
 
234 aa  171  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.209184  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3969  two component transcriptional regulator  45.18 
 
 
243 aa  171  1e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.162736  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03557  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.84 
 
 
229 aa  170  1e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000983286  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3685  two component transcriptional regulator  41.63 
 
 
233 aa  171  1e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.934173  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4211  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.47 
 
 
219 aa  169  2e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0080  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.53 
 
 
230 aa  170  2e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1865  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.17 
 
 
226 aa  169  2e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4321  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.47 
 
 
219 aa  169  2e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0131168 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3305  DNA-binding response regulator BaeR  37.18 
 
 
232 aa  169  4e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.304306  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2412  two component transcriptional regulator  37.45 
 
 
230 aa  169  4e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000515704  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1738  two component transcriptional regulator  37.97 
 
 
230 aa  169  4e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.485524  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2202  two component transcriptional regulator  37.97 
 
 
230 aa  169  5e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0636153  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2279  two component transcriptional regulator  37.97 
 
 
230 aa  169  5e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00696203  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3557  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  38.96 
 
 
239 aa  168  5e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2868  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  38.6 
 
 
227 aa  168  6e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0808147  normal  0.133304 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1623  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  37.55 
 
 
229 aa  168  6e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.314496  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2983  two component transcriptional regulator  42.67 
 
 
228 aa  167  9e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1756  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.47 
 
 
230 aa  167  1e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.769657  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2005  response regulator receiver protein  40.08 
 
 
231 aa  167  1e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.243352  normal  0.209106 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2981  two component transcriptional regulator  37.99 
 
 
229 aa  167  1e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000201285  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2193  DNA-binding response regulator  37.55 
 
 
230 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1271  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.5 
 
 
225 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4324  two component transcriptional regulator  42.16 
 
 
207 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.823634  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3019  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  41.74 
 
 
240 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0767733 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1897  two component transcriptional regulator  40.52 
 
 
227 aa  166  2.9999999999999998e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.151466  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2368  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  41.28 
 
 
240 aa  166  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.531777  normal  0.413146 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2361  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  41.28 
 
 
240 aa  166  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2261  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  41.28 
 
 
240 aa  166  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.806239  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2477  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  41.28 
 
 
240 aa  166  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2371  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  41.74 
 
 
240 aa  166  4e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1154  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  41.74 
 
 
240 aa  166  4e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.233901  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01984  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with BaeS  41.74 
 
 
240 aa  165  5e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1577  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.74 
 
 
240 aa  165  5e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01976  hypothetical protein  41.74 
 
 
240 aa  165  5e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0981  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  41.74 
 
 
240 aa  165  5e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.443633  normal  0.661259 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2221  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  41.74 
 
 
240 aa  165  5e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2317  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  41.28 
 
 
240 aa  165  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.539006  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6330  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.04 
 
 
234 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.000626879  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0916  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.99 
 
 
234 aa  165  6.9999999999999995e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0276045  hitchhiker  9.727110000000001e-18 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0951  response regulator receiver protein  40.08 
 
 
239 aa  165  6.9999999999999995e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000111905  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2892  two component transcriptional regulator  39.15 
 
 
227 aa  165  6.9999999999999995e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0239565 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1955  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.76 
 
 
236 aa  164  8e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.295041  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1840  two component transcriptional regulator  39.62 
 
 
227 aa  164  9e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>