More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3571 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_3571  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 233 aa  472  1e-132  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2090  DNA-binding response regulator BvrR, putative  88.74 
 
 		 239 aa  421  1e-117  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0306093  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0828  two component transcriptional regulator  88.74 
 
 		 239 aa  421  1e-117  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0815733  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2010  putative DNA-binding response regulator BvrR  88.74 
 
 		 239 aa  421  1e-117  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.112651  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0044  two component response regulator  84.03 
 
 		 240 aa  411  1e-114  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3252  two component transcriptional regulator  85.77 
 
 		 240 aa  400  1e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3969  two component transcriptional regulator, winged helix family  82.52 
 
 		 244 aa  397  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.966692  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4296  two component transcriptional regulator, winged helix family  82.11 
 
 		 250 aa  396  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2845  two component transcriptional regulator  81.9 
 
 		 232 aa  392  1e-108  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.868207 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0361  two component transcriptional regulator, winged helix family  81.47 
 
 		 233 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.324623  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0225  two component transcriptional regulator  81.93 
 
 		 238 aa  384  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0106464 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5433  two component transcriptional regulator, winged helix family  81.93 
 
 		 238 aa  384  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.177781  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7367  two component transcriptional regulator  80.69 
 
 		 233 aa  385  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3089  two component transcriptional regulator  81.86 
 
 		 236 aa  387  1e-106  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.63756 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0255  two component transcriptional regulator, winged helix family  81.03 
 
 		 231 aa  384  1e-106  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.02112 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0463  two component transcriptional regulator  80.6 
 
 		 233 aa  386  1e-106  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.966783  normal  0.711351 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0597  two component transcriptional regulator  81.03 
 
 		 233 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0367  winged helix family two component transcriptional regulator  80.6 
 
 		 233 aa  386  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0127671 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0348  transcriptional regulatory protein  80.6 
 
 		 233 aa  383  1e-105  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.618403  normal  0.242627 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0443  two component transcriptional regulator  80.26 
 
 		 233 aa  383  1e-105  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2741  two component transcriptional regulator  80.77 
 
 		 231 aa  383  1e-105  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.299643 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1179  two component transcriptional regulator, winged helix family  81.01 
 
 		 237 aa  380  1e-104  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.566879  normal  0.163877 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1400  two component transcriptional regulator, winged helix family  81.01 
 
 		 237 aa  380  1e-104  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0577794  normal  0.435154 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1238  response regulator receiver  81.01 
 
 		 237 aa  380  1e-104  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1332  transcriptional regulatory protein BvrR  77.49 
 
 		 240 aa  373  1e-102  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0111  two component transcriptional regulator  79.4 
 
 		 233 aa  367  1e-101  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.953605 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1681  two-component transcriptional regulator  69.83 
 
 		 233 aa  335  2.9999999999999997e-91  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0314  two component transcriptional regulator  69.83 
 
 		 233 aa  334  7e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.765921 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3422  two component transcriptional regulator  69.57 
 
 		 241 aa  333  1e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0074  two component transcriptional regulator  71.06 
 
 		 236 aa  332  4e-90  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0536  two component transcriptional regulator  69.83 
 
 		 233 aa  331  5e-90  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2441  two component transcriptional regulator  67.67 
 
 		 233 aa  331  7.000000000000001e-90  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.325552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0212  two component transcriptional regulator  68.1 
 
 		 233 aa  327  7e-89  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1884  two component transcriptional regulator  66.95 
 
 		 233 aa  319  1.9999999999999998e-86  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4630  two component transcriptional regulator  65.96 
 
 		 235 aa  319  3e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0961185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1975  two component transcriptional regulator, winged helix family  65.22 
 
 		 236 aa  313  9.999999999999999e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.206633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0402  two component transcriptional regulator  68.4 
 
 		 235 aa  313  9.999999999999999e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.344138  normal  0.0526207 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2907  two component transcriptional regulator  64.38 
 
 		 250 aa  303  2.0000000000000002e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2047  two component transcriptional regulator  63.48 
 
 		 236 aa  298  6e-80  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.50343  normal  0.117999 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0268  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.18 
 
 		 227 aa  196  3e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.509377 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1791  two component transcriptional regulator  44.64 
 
 		 230 aa  191  8e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000231936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3969  two component transcriptional regulator  47.37 
 
 		 243 aa  186  2e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.162736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3302  two component transcriptional regulator  41.05 
 
 		 230 aa  186  2e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.288231  normal  0.346827 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3685  two component transcriptional regulator  44.35 
 
 		 233 aa  186  3e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.934173  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3982  DNA-binding response regulator  43.48 
 
 		 238 aa  186  4e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.319576  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03557  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.83 
 
 		 229 aa  185  4e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000983286  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2122  two component transcriptional regulator  42.92 
 
 		 231 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00660884  normal  0.0855219 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1623  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  42.49 
 
 		 229 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.314496  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2005  response regulator receiver protein  44.21 
 
 		 231 aa  182  3e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.243352  normal  0.209106 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1016  response regulator receiver domain-containing protein  43.04 
 
 		 230 aa  182  4.0000000000000006e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6330  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.29 
 
 		 234 aa  181  7e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.000626879  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4259  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.48 
 
 		 230 aa  181  8.000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.602522  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1077  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.1 
 
 		 235 aa  181  1e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2202  two component transcriptional regulator  42.92 
 
 		 230 aa  181  1e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0636153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2279  two component transcriptional regulator  42.92 
 
 		 230 aa  181  1e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00696203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1738  two component transcriptional regulator  42.92 
 
 		 230 aa  180  2e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.485524  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2412  two component transcriptional regulator  42.92 
 
 		 230 aa  180  2e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000515704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1875  two component transcriptional regulator  42.92 
 
 		 230 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00450797  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2450  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.92 
 
 		 230 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000016563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1827  two component transcriptional regulator  42.92 
 
 		 230 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0283431  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3335  two component transcriptional regulator  40.17 
 
 		 230 aa  178  4.999999999999999e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.428008 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3920  two component transcriptional regulator  42.06 
 
 		 237 aa  178  5.999999999999999e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4585  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.41 
 
 		 234 aa  178  8e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.209184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2494  two component transcriptional regulator  42.61 
 
 		 232 aa  177  1e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00298377  normal  0.523068 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2193  DNA-binding response regulator  42.49 
 
 		 230 aa  176  2e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5905  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.87 
 
 		 237 aa  174  9.999999999999999e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  39.22 
 
 		 229 aa  172  3.9999999999999995e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1102  DNA-binding response regulator  41.53 
 
 		 225 aa  171  7.999999999999999e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1840  two component transcriptional regulator  44.29 
 
 		 227 aa  171  1e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3929  two component transcriptional regulator  39.74 
 
 		 247 aa  171  1e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02200  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  40.87 
 
 		 231 aa  169  3e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1307  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  37.93 
 
 		 242 aa  169  3e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1493  two component transcriptional regulator  41.85 
 
 		 232 aa  169  4e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12584  normal  0.340507 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4324  two component transcriptional regulator  43.63 
 
 		 207 aa  168  6e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.823634  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2972  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  38.36 
 
 		 242 aa  168  6e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2981  two component transcriptional regulator  39.65 
 
 		 229 aa  168  6e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000201285  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1897  two component transcriptional regulator  39.74 
 
 		 227 aa  168  8e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.151466  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3098  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  36.24 
 
 		 239 aa  168  8e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0001052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1210  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  36.24 
 
 		 239 aa  167  9e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000498147  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1327  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  36.24 
 
 		 239 aa  167  9e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2922  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.67 
 
 		 230 aa  167  9e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.221617  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2983  two component transcriptional regulator  42.11 
 
 		 228 aa  167  9e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2518  two component transcriptional regulator  39.06 
 
 		 230 aa  167  1e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0122186  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3557  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  37.89 
 
 		 239 aa  166  2e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1573  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  40.53 
 
 		 234 aa  166  2e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2570  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.25 
 
 		 239 aa  166  2.9999999999999998e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02230  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  39.57 
 
 		 229 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09580  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  38.43 
 
 		 244 aa  165  4e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.132168 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0969  two component transcriptional regulator  38.16 
 
 		 226 aa  165  5e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.165699  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1572  two component transcriptional regulator  38.98 
 
 		 225 aa  165  5e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000784208  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0588  two component transcriptional regulator  39.65 
 
 		 227 aa  164  6.9999999999999995e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000451147  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04274  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with CreC  38.7 
 
 		 229 aa  164  9e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3658  DNA-binding response regulator CreB  38.7 
 
 		 229 aa  164  9e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04239  hypothetical protein  38.7 
 
 		 229 aa  164  9e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0019  two component transcriptional regulator  39.56 
 
 		 235 aa  164  1.0000000000000001e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0805  two component transcriptional regulator  40.52 
 
 		 229 aa  164  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4949  DNA-binding response regulator CreB  38.7 
 
 		 229 aa  163  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4634  DNA-binding response regulator CreB  38.7 
 
 		 229 aa  162  3e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2866  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.86 
 
 		 231 aa  162  3e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5913  DNA-binding response regulator CreB  38.7 
 
 		 229 aa  162  3e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>