More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene B21_04239 on replicon NC_012892
Organism: Escherichia coli BL21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_04274  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with CreC  100 
 
 
229 aa  467  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04239  hypothetical protein  100 
 
 
229 aa  467  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3658  DNA-binding response regulator CreB  100 
 
 
229 aa  467  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3599  two component transcriptional regulator, winged helix family  98.25 
 
 
229 aa  461  1e-129  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4634  DNA-binding response regulator CreB  99.13 
 
 
229 aa  462  1e-129  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4949  DNA-binding response regulator CreB  98.69 
 
 
229 aa  462  1e-129  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4997  DNA-binding response regulator CreB  98.69 
 
 
229 aa  460  1e-129  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5913  DNA-binding response regulator CreB  98.25 
 
 
229 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4946  DNA-binding response regulator CreB  97.29 
 
 
221 aa  439  9.999999999999999e-123  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4912  DNA-binding response regulator CreB  84.72 
 
 
229 aa  388  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4839  DNA-binding response regulator CreB  85.15 
 
 
229 aa  390  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.877159  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4946  DNA-binding response regulator CreB  84.28 
 
 
229 aa  387  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A5000  DNA-binding response regulator CreB  84.28 
 
 
229 aa  387  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4998  DNA-binding response regulator CreB  84.28 
 
 
229 aa  386  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.866584 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0559  DNA-binding response regulator CreB  77.88 
 
 
229 aa  367  1e-101  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3896  DNA-binding response regulator CreB  65.93 
 
 
231 aa  268  4e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.49169  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0878  DNA-binding response regulator CreB  60.71 
 
 
232 aa  266  1e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0875  DNA-binding response regulator CreB  60.71 
 
 
232 aa  266  2e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3843  DNA-binding response regulator CreB  60.27 
 
 
232 aa  264  7e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.980313 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1652  DNA-binding response regulator CreB  56.09 
 
 
232 aa  248  6e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5485  DNA-binding response regulator CreB  53.16 
 
 
237 aa  241  6e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.631221 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3569  DNA-binding response regulator CreB  53.16 
 
 
237 aa  241  6e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0155325  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4798  DNA-binding response regulator CreB  53.16 
 
 
237 aa  241  6e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0185  DNA-binding response regulator CreB  53.54 
 
 
226 aa  241  7.999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2656  two component transcriptional regulator  52.68 
 
 
226 aa  237  1e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.311089  normal  0.831438 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0912  DNA-binding response regulator CreB  52.12 
 
 
236 aa  235  3e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.40948  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0360  DNA-binding response regulator CreB  53.18 
 
 
226 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.48199  normal  0.18469 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5196  DNA-binding response regulator CreB  52.25 
 
 
226 aa  229  2e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.247569 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0357  DNA-binding response regulator CreB  53.64 
 
 
226 aa  227  1e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.501858  normal  0.680539 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4120  DNA-binding response regulator CreB  53.18 
 
 
226 aa  226  2e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0135  two component transcriptional regulator  51.25 
 
 
251 aa  224  7e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.134918  normal  0.276067 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4871  DNA-binding response regulator CreB  51.36 
 
 
226 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.608103  normal  0.305164 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06060  DNA-binding response regulator CreB  51.33 
 
 
229 aa  220  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00519358 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0568  DNA-binding response regulator CreB  50.68 
 
 
229 aa  216  2e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0391692  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3176  DNA-binding response regulator CreB  49.78 
 
 
226 aa  211  1e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0818547  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0027  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.93 
 
 
260 aa  209  3e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0030  two component transcriptional regulator  45.93 
 
 
282 aa  206  2e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.815374  normal  0.380288 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1204  DNA-binding response regulator CreB  51.09 
 
 
242 aa  204  8e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.353505  normal  0.155073 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5423  two component transcriptional regulator  48.66 
 
 
239 aa  204  1e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0237  two component transcriptional regulator  49.34 
 
 
226 aa  202  3e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1317  two component transcriptional regulator  48.73 
 
 
240 aa  201  8e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.886781  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3904  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.67 
 
 
230 aa  189  4e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.144495  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1992  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.12 
 
 
233 aa  187  9e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.703312  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0968  two component transcriptional regulator  44.25 
 
 
227 aa  181  1e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  unclonable  0.00000000899876  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  43.5 
 
 
229 aa  179  4.999999999999999e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2228  two component transcriptional regulator  42.34 
 
 
222 aa  177  1e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00319429  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4477  response regulator receiver  45.78 
 
 
228 aa  177  1e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0220713 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2689  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  43.56 
 
 
240 aa  176  2e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2872  two component transcriptional regulator  40.18 
 
 
226 aa  176  2e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.702853  hitchhiker  0.00802276 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1527  two component transcriptional regulator  43.04 
 
 
230 aa  174  7e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.255733  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2590  two component transcriptional regulator  40.79 
 
 
230 aa  174  9e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3302  two component transcriptional regulator  39.46 
 
 
230 aa  174  9.999999999999999e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.288231  normal  0.346827 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1461  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.73 
 
 
225 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.616357  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2476  two component transcriptional regulator  43.89 
 
 
241 aa  173  1.9999999999999998e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000027247 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2972  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  44.34 
 
 
242 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0318  two component transcriptional regulator  46.9 
 
 
227 aa  173  1.9999999999999998e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3305  DNA-binding response regulator BaeR  39.65 
 
 
232 aa  173  2.9999999999999996e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.304306  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0314  two component transcriptional regulator  39.82 
 
 
233 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.765921 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3019  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  42.67 
 
 
240 aa  172  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0767733 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3118  DNA-binding response regulator  41.89 
 
 
227 aa  172  5e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4990  two component transcriptional regulator  44.2 
 
 
228 aa  172  5e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.866601  hitchhiker  0.000134834 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1201  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  44.29 
 
 
243 aa  172  5e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.106709  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2261  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  42.22 
 
 
240 aa  171  5.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.806239  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2477  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  42.22 
 
 
240 aa  171  5.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2361  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  42.22 
 
 
240 aa  171  5.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2047  two component transcriptional regulator  41.48 
 
 
236 aa  171  5.999999999999999e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.50343  normal  0.117999 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2368  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  42.22 
 
 
240 aa  171  5.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.531777  normal  0.413146 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1493  two component transcriptional regulator  44.44 
 
 
232 aa  171  5.999999999999999e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12584  normal  0.340507 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01984  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with BaeS  42.67 
 
 
240 aa  171  6.999999999999999e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1577  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.67 
 
 
240 aa  171  6.999999999999999e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2221  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  42.67 
 
 
240 aa  171  6.999999999999999e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0981  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  42.67 
 
 
240 aa  171  6.999999999999999e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.443633  normal  0.661259 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01976  hypothetical protein  42.67 
 
 
240 aa  171  6.999999999999999e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0402  two component transcriptional regulator  39.91 
 
 
235 aa  171  9e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.344138  normal  0.0526207 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2106  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.61 
 
 
238 aa  171  1e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2441  two component transcriptional regulator  39.38 
 
 
233 aa  170  1e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.325552  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1562  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  42.67 
 
 
240 aa  170  1e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.279171  normal  0.454228 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1104  response regulator receiver protein  39.73 
 
 
222 aa  171  1e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02230  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  43.24 
 
 
229 aa  170  1e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2371  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  42.22 
 
 
240 aa  169  2e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1681  two-component transcriptional regulator  39.38 
 
 
233 aa  169  2e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0360  two component signal transduction response regulator  40.36 
 
 
224 aa  170  2e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1307  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  42.99 
 
 
242 aa  170  2e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1154  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  42.22 
 
 
240 aa  169  2e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.233901  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1573  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  44.64 
 
 
234 aa  170  2e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2317  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  41.78 
 
 
240 aa  170  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.539006  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2868  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  41.63 
 
 
227 aa  169  3e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0808147  normal  0.133304 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2892  two component transcriptional regulator  40.95 
 
 
227 aa  169  4e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0239565 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0988  response regulator BaeR  39.56 
 
 
227 aa  169  4e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000405458  normal  0.303622 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0567  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.25 
 
 
225 aa  168  5e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.463355  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02200  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  43.86 
 
 
231 aa  168  5e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1884  two component transcriptional regulator  39.91 
 
 
233 aa  168  6e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0329  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.95 
 
 
231 aa  168  6e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1327  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  41.41 
 
 
239 aa  168  7e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1210  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  41.41 
 
 
239 aa  168  7e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000498147  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0268  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.47 
 
 
227 aa  168  8e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.509377 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3098  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  41.41 
 
 
239 aa  167  9e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0001052  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1058  DNA-binding response regulator  41.78 
 
 
227 aa  167  1e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000187393  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05646  two-component response regulator transcription regulator protein  38.91 
 
 
219 aa  167  1e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0536  two component transcriptional regulator  38.94 
 
 
233 aa  167  1e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>