More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_4431 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_4431  response regulator receiver domain-containing protein  100 
 
 		 125 aa  253  9e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1739  response regulator receiver protein  64.52 
 
 		 126 aa  168  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1714  response regulator receiver protein  64.52 
 
 		 126 aa  168  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3778  response regulator receiver domain-containing protein  51.22 
 
 		 124 aa  127  6e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2975  response regulator receiver protein  50 
 
 		 124 aa  123  7e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0989438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3017  response regulator receiver protein  50 
 
 		 124 aa  123  7e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.203071 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2427  response regulator receiver protein  47.11 
 
 		 159 aa  120  8e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.468058 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5113  response regulator receiver protein  47.15 
 
 		 121 aa  120  9e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1632  response regulator receiver  50 
 
 		 123 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0669  response regulator receiver protein  45.97 
 
 		 123 aa  118  1.9999999999999998e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1750  two component transcriptional regulator  48.78 
 
 		 234 aa  117  4.9999999999999996e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1784  alkaline phosphatase synthesis transcriptional regulatory protein  48.78 
 
 		 234 aa  117  4.9999999999999996e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.561076  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1901  response regulator receiver protein  46.77 
 
 		 125 aa  117  6e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2649  response regulator receiver protein  47.15 
 
 		 122 aa  116  9.999999999999999e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.857048  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0237  response regulator receiver protein  44.72 
 
 		 124 aa  115  1.9999999999999998e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000555979 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1256  alkaline phosphatase synthesis transcriptional regulatory protein PhoP  49.59 
 
 		 236 aa  114  3.9999999999999997e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.577358  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4150  response regulator receiver protein  43.2 
 
 		 125 aa  114  6e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.583085 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2675  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.78 
 
 		 234 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.661044  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0785  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.97 
 
 		 235 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2044  response regulator receiver protein  45.22 
 
 		 123 aa  108  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0300859  normal  0.405857 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0695  response regulator receiver  44.63 
 
 		 170 aa  108  3e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.412637  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4720  DNA-binding response regulator PhoP  47.15 
 
 		 239 aa  107  6e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4699  DNA-binding response regulator PhoP  47.15 
 
 		 239 aa  107  6e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4484  DNA-binding response regulator PhoP  47.15 
 
 		 239 aa  107  6e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4319  alkaline phosphatase synthesis response regulator  47.15 
 
 		 239 aa  107  6e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4330  alkaline phosphatase synthesis response regulator  47.15 
 
 		 239 aa  107  6e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4833  DNA-binding response regulator PhoP  47.15 
 
 		 239 aa  107  6e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0982965  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4704  DNA-binding response regulator PhoP  47.15 
 
 		 239 aa  107  6e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000673192 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4714  DNA-binding response regulator PhoP  47.15 
 
 		 239 aa  107  6e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2662  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.65 
 
 		 231 aa  107  6e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0539  DNA-binding response regulator PhoP  47.15 
 
 		 239 aa  107  6e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000130788 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4419  two component transcriptional regulator  47.15 
 
 		 239 aa  107  7.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3274  two component transcriptional regulator  46.34 
 
 		 238 aa  106  1e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1605  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.47 
 
 		 216 aa  105  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3248  response regulator receiver protein  41.32 
 
 		 121 aa  105  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.500247 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1580  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.47 
 
 		 216 aa  105  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1288  two component transcriptional regulator  41.67 
 
 		 228 aa  105  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1155  two component transcriptional regulator  45.53 
 
 		 231 aa  104  4e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000430064  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4009  two component transcriptional regulator  45 
 
 		 230 aa  103  5e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00751412  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4151  two component transcriptional regulator, winged helix family  45 
 
 		 230 aa  103  5e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4125  two component transcriptional regulator, winged helix family  45 
 
 		 230 aa  103  6e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.125271  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0951  response regulator receiver protein  45.22 
 
 		 239 aa  103  9e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000111905  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0766  two component transcriptional regulator  44.72 
 
 		 231 aa  102  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.585906  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1077  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.35 
 
 		 235 aa  102  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1997  two component transcriptional regulator  41.46 
 
 		 234 aa  102  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000742772  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1285  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.12 
 
 		 234 aa  102  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.477652  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2566  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.32 
 
 		 229 aa  102  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000356007  hitchhiker  0.00345607 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1911  two component transcriptional regulator  42.15 
 
 		 229 aa  102  1e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.258551 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2522  response regulator receiver  40.5 
 
 		 229 aa  102  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.661278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2029  response regulator receiver protein  41.94 
 
 		 124 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.371136 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0415  two component transcriptional regulator  46.9 
 
 		 231 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.777838 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1501  response regulator receiver protein  43.44 
 
 		 132 aa  102  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.153095  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2226  response regulator receiver protein  40.98 
 
 		 129 aa  101  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.561592  normal  0.814785 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0573  response regulator receiver protein  40.98 
 
 		 129 aa  101  3e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.087024  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  45.83 
 
 		 229 aa  101  3e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4323  two component LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 215 aa  101  3e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.115662  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1456  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.33 
 
 		 223 aa  101  4e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000183373  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2887  LuxR family two component transcriptional regulator  38.6 
 
 		 225 aa  101  4e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.526109  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5259  two component transcriptional regulator  45.76 
 
 		 235 aa  100  6e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000559572  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0508  response regulator receiver domain-containing protein  43.7 
 
 		 121 aa  100  6e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.481314  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5589  DNA-binding response regulator YycF  45.76 
 
 		 235 aa  100  7e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1892  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.98 
 
 		 228 aa  100  7e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000392  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0653  two-component response regulator PhoB  42.15 
 
 		 230 aa  100  7e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.131558  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5346  DNA-binding response regulator YycF  45.76 
 
 		 235 aa  100  7e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000234523  hitchhiker  0.00000000000323141 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4006  two component transcriptional regulator  45.76 
 
 		 235 aa  100  7e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010356  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5572  DNA-binding response regulator YycF  45.76 
 
 		 235 aa  100  8e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.81316e-29 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5615  DNA-binding response regulator YycF  45.76 
 
 		 235 aa  100  8e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5319  DNA-binding response regulator YycF  45.76 
 
 		 235 aa  100  8e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.169223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5147  response regulator  45.76 
 
 		 235 aa  100  8e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00168683  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5163  response regulator  45.76 
 
 		 235 aa  100  8e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00196509  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5715  DNA-binding response regulator YycF  45.76 
 
 		 235 aa  100  8e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.656882  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5650  DNA-binding response regulator YycF  45.76 
 
 		 235 aa  100  8e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00563499  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3394  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.07 
 
 		 230 aa  100  8e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.103692  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1756  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.54 
 
 		 230 aa  100  9e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.769657  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3628  two component LuxR family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 225 aa  100  9e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.717242  normal  0.142765 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1409  two component signal transduction response regulator  42.98 
 
 		 123 aa  100  9e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000120114  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2159  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.61 
 
 		 227 aa  100  9e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00177162  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0581  winged helix family two component transcriptional regulator  44.63 
 
 		 242 aa  99.8  1e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.296955  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2709  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.65 
 
 		 236 aa  99.8  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0011921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0783  two component transcriptional regulator  45.53 
 
 		 231 aa  99.8  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1115  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.45 
 
 		 243 aa  99.8  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0950226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0954  two component transcriptional regulator  44.63 
 
 		 243 aa  99.8  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0817018 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0483  two component transcriptional regulator  40.65 
 
 		 229 aa  99.4  1e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.342081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1865  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.15 
 
 		 226 aa  99.8  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0170  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.33 
 
 		 232 aa  99.8  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1011  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.47 
 
 		 231 aa  99.8  1e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1878  two component transcriptional regulator  44.63 
 
 		 242 aa  99.4  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.559477 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1453  two component transcriptional regulator  45.45 
 
 		 244 aa  99.4  2e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.952418  normal  0.0249242 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1805  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  41.32 
 
 		 310 aa  99  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0638722  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2782  two component transcriptional regulator  41.53 
 
 		 231 aa  99  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.92379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4207  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.8 
 
 		 247 aa  98.6  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1102  DNA-binding response regulator  40.5 
 
 		 225 aa  98.2  4e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0200  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.98 
 
 		 242 aa  97.8  4e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0955644  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0707  two component transcriptional regulator  41.74 
 
 		 232 aa  98.2  4e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3661  response regulator receiver protein  37.82 
 
 		 120 aa  97.8  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.442071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0216  two component transcriptional regulator  40.65 
 
 		 230 aa  97.8  5e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.305183 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0603  two component transcriptional regulator  40.65 
 
 		 233 aa  97.4  5e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0519325  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1673  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.41 
 
 		 233 aa  97.4  5e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5511  two component transcriptional regulator  46.28 
 
 		 236 aa  97.4  6e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.567595 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01531  two-component response regulator  46.9 
 
 		 248 aa  97.4  6e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>