More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_3661 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_3661  response regulator receiver protein  100 
 
 		 120 aa  248  2e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.442071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3968  response regulator receiver protein  59.66 
 
 		 125 aa  159  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4952  response regulator receiver protein  60.5 
 
 		 121 aa  156  8e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.699568  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0508  response regulator receiver domain-containing protein  58.82 
 
 		 121 aa  152  1e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.481314  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3000  response regulator receiver protein  55.46 
 
 		 124 aa  147  6e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3248  response regulator receiver protein  52.94 
 
 		 121 aa  145  2.0000000000000003e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.500247 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3747  response regulator receiver protein  52.94 
 
 		 121 aa  144  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0722  response regulator receiver protein  48.74 
 
 		 121 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0751  response regulator receiver protein  48.74 
 
 		 121 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1234  response regulator receiver protein  47.9 
 
 		 122 aa  130  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1264  response regulator receiver protein  47.9 
 
 		 122 aa  130  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0578681  hitchhiker  0.00155192 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3990  response regulator receiver protein  49.09 
 
 		 146 aa  123  8.000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.27172  normal  0.4632 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2551  response regulator receiver domain-containing protein  46.61 
 
 		 121 aa  123  1e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1062  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 120 aa  119  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58489  hitchhiker  0.0000344775 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1221  response regulator receiver domain-containing protein  46.3 
 
 		 125 aa  119  1.9999999999999998e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2789  response regulator receiver protein  45.38 
 
 		 121 aa  117  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2795  response regulator receiver protein  44.07 
 
 		 121 aa  116  9e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3337  response regulator receiver protein  43.7 
 
 		 121 aa  116  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2780  response regulator receiver protein  43.7 
 
 		 121 aa  116  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.76051 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1874  response regulator receiver protein  44.54 
 
 		 320 aa  114  3e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.420153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4743  response regulator receiver protein  48.33 
 
 		 125 aa  112  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00329385 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0856  response regulator receiver domain-containing protein  41.53 
 
 		 120 aa  111  3e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0758877  normal  0.0586548 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02637  regulatory protein PilH family  48.21 
 
 		 128 aa  111  4.0000000000000004e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1789  response regulator receiver protein  44.64 
 
 		 128 aa  110  5e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1724  response regulator receiver protein  44.64 
 
 		 128 aa  110  5e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.999633  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3018  response regulator receiver protein  47.75 
 
 		 123 aa  110  7.000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.454082 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1423  response regulator receiver protein  39.5 
 
 		 119 aa  110  9e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.24081  normal  0.185499 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0059  response regulator receiver domain-containing protein  39.66 
 
 		 125 aa  109  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.157498  normal  0.212271 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0613  response regulator receiver protein  46.09 
 
 		 122 aa  108  3e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.242329  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0561  response regulator receiver protein  46.09 
 
 		 122 aa  108  3e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.718467 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2900  response regulator receiver protein  43.33 
 
 		 121 aa  107  4.0000000000000004e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.197839  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3577  response regulator receiver protein  43.33 
 
 		 121 aa  107  4.0000000000000004e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.400966  normal  0.141746 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0902  response regulator receiver protein  42.37 
 
 		 121 aa  107  4.0000000000000004e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844306 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3020  response regulator receiver protein  42.37 
 
 		 121 aa  107  5e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.447611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2158  response regulator receiver protein  40.34 
 
 		 120 aa  107  6e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2472  response regulator receiver protein  41.03 
 
 		 216 aa  107  7.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4663  two component transcriptional regulator  42.86 
 
 		 232 aa  107  8.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0960  two component transcriptional regulator  44.54 
 
 		 236 aa  106  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0214647 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3485  two component transcriptional regulator  43.7 
 
 		 236 aa  105  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1573  response regulator receiver protein  44.44 
 
 		 121 aa  105  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.146471 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0845  response regulator receiver protein  39.83 
 
 		 125 aa  105  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.455865  normal  0.167506 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4991  response regulator receiver protein  45.38 
 
 		 121 aa  105  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.353726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3898  response regulator receiver  38.98 
 
 		 121 aa  105  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2401  phosphate regulon transcriptional regulatory protein phoB  42.02 
 
 		 229 aa  105  2e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0473  response regulator receiver protein  44.54 
 
 		 121 aa  105  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.950452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1740  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.54 
 
 		 225 aa  105  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000204942  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4865  response regulator receiver protein  45.38 
 
 		 121 aa  105  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.321258  normal  0.0275279 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5041  response regulator receiver protein  45.38 
 
 		 121 aa  105  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3189  twitching motility protein  40.52 
 
 		 121 aa  105  3e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.612166  normal  0.249154 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3689  response regulator receiver protein  40 
 
 		 121 aa  105  3e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.443278  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3353  response regulator receiver protein  44.44 
 
 		 121 aa  105  3e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.392561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3767  response regulator receiver protein  40.17 
 
 		 130 aa  105  3e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.401563  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0142  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.02 
 
 		 221 aa  104  4e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.709604 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1243  response regulator receiver domain-containing protein  42.61 
 
 		 121 aa  104  4e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.253807 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0356  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 121 aa  104  5e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0780111  normal  0.957515 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1137  response regulator receiver domain-containing protein  42.61 
 
 		 121 aa  103  6e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.635456 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3633  response regulator receiver domain-containing protein  41.53 
 
 		 120 aa  103  9e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.480345  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4625  response regulator receiver protein  40.87 
 
 		 121 aa  103  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.635313  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1805  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  37.07 
 
 		 310 aa  103  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0638722  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3970  response regulator receiver protein  38.79 
 
 		 121 aa  102  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0244969 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0669  putative twitching motility two-component response regulator transcription regulator protein  43.22 
 
 		 122 aa  102  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0508  twitching motility protein PilG  41.03 
 
 		 135 aa  102  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1790  response regulator  42.74 
 
 		 254 aa  102  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0306127  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3302  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.74 
 
 		 231 aa  102  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000343135 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0707  two component transcriptional regulator  36.97 
 
 		 232 aa  102  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0670  response regulator receiver domain-containing protein  40.68 
 
 		 122 aa  102  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00691443  normal  0.823575 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3767  response regulator receiver protein  40.34 
 
 		 124 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0858272 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05320  twitching motility protein PilG  41.03 
 
 		 135 aa  102  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1772  response regulator  42.74 
 
 		 254 aa  101  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1372  response regulator receiver domain-containing protein  45.3 
 
 		 121 aa  101  3e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0313107  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0403  response regulator receiver protein  41.03 
 
 		 135 aa  101  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1955  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.66 
 
 		 236 aa  101  3e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.295041  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2041  DNA-binding response regulator  43.1 
 
 		 225 aa  101  4e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0972255  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1897  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.83 
 
 		 229 aa  101  4e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1422  response regulator receiver protein  40 
 
 		 119 aa  101  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.153955  normal  0.123704 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1991  DNA-binding response regulator  42.74 
 
 		 254 aa  101  4e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.9362699999999994e-45 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1897  two component transcriptional regulator  40.68 
 
 		 227 aa  101  4e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.151466  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01871  two-component response regulator  43.22 
 
 		 242 aa  100  5e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.528311  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2062  DNA-binding response regulator  43.1 
 
 		 225 aa  100  5e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000169038  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  36.97 
 
 		 229 aa  100  6e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2100  response regulator receiver domain-containing protein  36.97 
 
 		 120 aa  100  6e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3776  response regulator receiver domain-containing protein  35.59 
 
 		 120 aa  100  7e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.143561 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1461  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.24 
 
 		 225 aa  100  7e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.616357  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2622  response regulator receiver  39.83 
 
 		 123 aa  100  9e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3302  two component transcriptional regulator  39.83 
 
 		 230 aa  100  9e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.288231  normal  0.346827 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2507  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  40.34 
 
 		 488 aa  99.8  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.182398 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1892  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.68 
 
 		 228 aa  99.4  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000392  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0997  two component transcriptional regulator  35.29 
 
 		 230 aa  99.8  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.679101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0131  response regulator receiver  41.23 
 
 		 132 aa  99.8  1e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4373  two component transcriptional regulator  35.9 
 
 		 243 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1050  two component transcriptional regulator  36.75 
 
 		 260 aa  99.4  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.36572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1077  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.5 
 
 		 235 aa  99.8  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0566  response regulator receiver domain-containing protein  38.66 
 
 		 120 aa  99.8  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1100  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.66 
 
 		 236 aa  99.4  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000182155 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5034  type IV pilus response regulator PilG  41.53 
 
 		 136 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0488  response regulator receiver  41.53 
 
 		 136 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1824  two component transcriptional regulator  42.24 
 
 		 225 aa  99  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.529032  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0044  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.13 
 
 		 224 aa  99  2e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1011  two component transcriptional regulator  36.75 
 
 		 241 aa  98.6  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.675078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0268  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.83 
 
 		 227 aa  99.4  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.509377 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>