More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_2100 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_2100  response regulator receiver domain-containing protein  100 
 
 
120 aa  250  4.0000000000000004e-66  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1817  putative two-component response regulator  90.83 
 
 
120 aa  227  4e-59  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2158  response regulator receiver protein  68.91 
 
 
120 aa  184  3e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0404  response regulator receiver protein  56.3 
 
 
121 aa  155  2e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5307  response regulator receiver domain-containing protein  53.78 
 
 
121 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0137607  normal  0.215998 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0509  twitching motility protein PilH  55.46 
 
 
121 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05330  twitching motility protein PilH  55.46 
 
 
121 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5033  type IV pilus response regulator PilH  54.62 
 
 
121 aa  150  4e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3633  response regulator receiver domain-containing protein  56.78 
 
 
120 aa  150  7e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.480345  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0489  response regulator receiver  53.78 
 
 
121 aa  148  3e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.646514  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5041  response regulator receiver protein  50.42 
 
 
121 aa  144  3e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4991  response regulator receiver protein  50.42 
 
 
121 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.353726  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4865  response regulator receiver protein  50.42 
 
 
121 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.321258  normal  0.0275279 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3018  response regulator receiver protein  51.26 
 
 
123 aa  144  4.0000000000000006e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.454082 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0356  response regulator receiver protein  52.1 
 
 
121 aa  143  7.0000000000000006e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0780111  normal  0.957515 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3768  response regulator receiver protein  52.1 
 
 
120 aa  140  4e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48045  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2399  response regulator receiver protein  49.58 
 
 
121 aa  140  7e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.732485 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1724  response regulator receiver protein  46.22 
 
 
128 aa  140  8e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.999633  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1789  response regulator receiver protein  46.22 
 
 
128 aa  140  8e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2903  response regulator receiver protein  49.58 
 
 
120 aa  139  9e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.629195  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0130  response regulator receiver  59.13 
 
 
121 aa  138  3e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0473  response regulator receiver protein  47.06 
 
 
121 aa  136  1e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.950452  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3689  response regulator receiver protein  55.75 
 
 
121 aa  134  3.0000000000000003e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.443278  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0515  response regulator receiver protein  48.74 
 
 
120 aa  133  9e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.163432  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2551  response regulator receiver domain-containing protein  51.69 
 
 
121 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02637  regulatory protein PilH family  46.22 
 
 
128 aa  132  1.9999999999999998e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1573  response regulator receiver protein  57.41 
 
 
121 aa  129  1.0000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.146471 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3898  response regulator receiver  54.46 
 
 
121 aa  127  6e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1062  response regulator receiver protein  44.54 
 
 
120 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58489  hitchhiker  0.0000344775 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3970  response regulator receiver protein  49.56 
 
 
121 aa  125  2.0000000000000002e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0244969 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01603  PilH  45.38 
 
 
120 aa  125  3e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.376187  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2900  response regulator receiver protein  55.56 
 
 
121 aa  124  4.0000000000000003e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.197839  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3020  response regulator receiver protein  55.56 
 
 
121 aa  124  4.0000000000000003e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.447611  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3577  response regulator receiver protein  55.56 
 
 
121 aa  124  4.0000000000000003e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.400966  normal  0.141746 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3189  twitching motility protein  50.44 
 
 
121 aa  123  9e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.612166  normal  0.249154 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1137  response regulator receiver domain-containing protein  50.43 
 
 
121 aa  122  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.635456 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0902  response regulator receiver protein  53.7 
 
 
121 aa  121  3e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.844306 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3353  response regulator receiver protein  50.43 
 
 
121 aa  121  3e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.392561  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3088  response regulator receiver protein  46.22 
 
 
120 aa  120  5e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.224006 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4625  response regulator receiver protein  50.89 
 
 
121 aa  120  6e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.635313  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0522  response regulator receiver domain-containing protein  43.97 
 
 
120 aa  116  9.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0561  response regulator receiver protein  47.86 
 
 
122 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.718467 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0613  response regulator receiver protein  47.86 
 
 
122 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.242329  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1243  response regulator receiver domain-containing protein  42.61 
 
 
121 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.253807 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1234  response regulator receiver protein  42.02 
 
 
122 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0670  response regulator receiver domain-containing protein  46.09 
 
 
122 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00691443  normal  0.823575 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1264  response regulator receiver protein  42.02 
 
 
122 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0578681  hitchhiker  0.00155192 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2622  response regulator receiver  46.96 
 
 
123 aa  110  5e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1372  response regulator receiver domain-containing protein  46.09 
 
 
121 aa  110  5e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0313107  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0669  putative twitching motility two-component response regulator transcription regulator protein  45.22 
 
 
122 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0059  response regulator receiver domain-containing protein  38.79 
 
 
125 aa  104  5e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.157498  normal  0.212271 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2795  response regulator receiver protein  41.53 
 
 
121 aa  103  7e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3968  response regulator receiver protein  37.5 
 
 
125 aa  103  8e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0856  response regulator receiver domain-containing protein  38.98 
 
 
120 aa  101  3e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0758877  normal  0.0586548 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3337  response regulator receiver protein  38.33 
 
 
121 aa  100  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2780  response regulator receiver protein  38.33 
 
 
121 aa  100  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.76051 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3661  response regulator receiver protein  36.97 
 
 
120 aa  100  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.442071  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0508  response regulator receiver domain-containing protein  34.45 
 
 
121 aa  100  8e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.481314  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3747  response regulator receiver protein  34.45 
 
 
121 aa  99.4  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1221  response regulator receiver domain-containing protein  42.06 
 
 
125 aa  99  2e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4952  response regulator receiver protein  33.61 
 
 
121 aa  97.4  6e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.699568  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0599  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  38.46 
 
 
313 aa  97.1  7e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.464892  normal  0.548622 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0650  response regulator receiver protein  40.52 
 
 
123 aa  96.7  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.438565  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0631  response regulator receiver protein  39.66 
 
 
123 aa  96.3  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0512  response regulator PleD  38.79 
 
 
456 aa  96.3  1e-19  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3862  histidine kinase  40.65 
 
 
1384 aa  96.7  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1836  two component AraC family transcriptional regulator  44.64 
 
 
1341 aa  96.3  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3248  response regulator receiver protein  35.29 
 
 
121 aa  96.3  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.500247 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0640  response regulator receiver protein  39.66 
 
 
123 aa  96.3  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1423  response regulator receiver protein  35.29 
 
 
119 aa  96.3  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.24081  normal  0.185499 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0751  response regulator receiver protein  35.29 
 
 
121 aa  95.9  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0722  response regulator receiver protein  35.29 
 
 
121 aa  95.9  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0424  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  38.26 
 
 
469 aa  95.5  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.97349 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1805  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  37.93 
 
 
310 aa  94.7  3e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0638722  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1842  response regulator receiver protein  37.82 
 
 
122 aa  95.1  3e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.808404  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0304  response regulator PleD  38.79 
 
 
458 aa  94.7  4e-19  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0864091  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0221  response regulator PleD  38.26 
 
 
460 aa  94  6e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3000  response regulator receiver protein  32.77 
 
 
124 aa  94  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0606  response regulator receiver domain-containing protein  38.79 
 
 
123 aa  94  6e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2709  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.75 
 
 
236 aa  93.6  8e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0011921  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5316  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  37.5 
 
 
354 aa  93.2  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.100222 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1277  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  37.93 
 
 
454 aa  92.8  1e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.410696  normal  0.0388481 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2789  response regulator receiver protein  35 
 
 
121 aa  92  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0773  response regulator PleD  37.93 
 
 
458 aa  92.4  2e-18  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4238  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.78 
 
 
356 aa  92  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3412  adenylate/guanylate cyclase  38.6 
 
 
1207 aa  92.4  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.210507 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2820  response regulator  40.52 
 
 
462 aa  92  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.229785  normal  0.330149 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4605  response regulator receiver protein  35 
 
 
120 aa  91.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.509614 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1497  response regulator PleD  40 
 
 
454 aa  91.7  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.122959 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2543  response regulator receiver protein  40.83 
 
 
121 aa  91.7  3e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3872  histidine kinase  39.84 
 
 
1373 aa  90.9  5e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0459124  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0912  response regulator receiver protein  37.82 
 
 
118 aa  90.9  6e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.616011 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2051  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.93 
 
 
247 aa  90.9  6e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.520505  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0671  two component LuxR family transcriptional regulator  43.27 
 
 
333 aa  90.9  6e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0205263  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0567  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.21 
 
 
225 aa  90.5  7e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.463355  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0251  response regulator receiver protein  36.13 
 
 
126 aa  90.5  8e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.102048 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0536  histidine kinase  34.19 
 
 
1324 aa  89.4  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0692259  normal  0.421547 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2507  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  34.91 
 
 
488 aa  90.1  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.182398 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1911  two component transcriptional regulator  34.19 
 
 
229 aa  90.1  1e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.258551 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0717  response regulator receiver protein  38.05 
 
 
115 aa  89.7  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>