More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0356 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_0356  response regulator receiver protein  100 
 
 
121 aa  244  4e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0780111  normal  0.957515 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0509  twitching motility protein PilH  57.02 
 
 
121 aa  159  9e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05330  twitching motility protein PilH  57.02 
 
 
121 aa  159  9e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0404  response regulator receiver protein  57.02 
 
 
121 aa  159  1e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5033  type IV pilus response regulator PilH  54.55 
 
 
121 aa  155  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5041  response regulator receiver protein  57.02 
 
 
121 aa  155  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2399  response regulator receiver protein  56.2 
 
 
121 aa  154  3e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.732485 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0489  response regulator receiver  53.72 
 
 
121 aa  152  1e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.646514  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4991  response regulator receiver protein  55.37 
 
 
121 aa  152  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.353726  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2903  response regulator receiver protein  54.17 
 
 
120 aa  151  2e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.629195  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4865  response regulator receiver protein  55.37 
 
 
121 aa  152  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.321258  normal  0.0275279 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5307  response regulator receiver domain-containing protein  53.72 
 
 
121 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0137607  normal  0.215998 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3768  response regulator receiver protein  53.33 
 
 
120 aa  149  1e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48045  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0473  response regulator receiver protein  54.55 
 
 
121 aa  149  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.950452  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3689  response regulator receiver protein  56.9 
 
 
121 aa  147  6e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.443278  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3633  response regulator receiver domain-containing protein  53.39 
 
 
120 aa  146  7e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.480345  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2100  response regulator receiver domain-containing protein  52.1 
 
 
120 aa  143  7.0000000000000006e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0130  response regulator receiver  53.33 
 
 
121 aa  143  1e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0515  response regulator receiver protein  52.5 
 
 
120 aa  142  2e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.163432  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3018  response regulator receiver protein  55.37 
 
 
123 aa  141  3e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.454082 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02637  regulatory protein PilH family  55 
 
 
128 aa  139  1.9999999999999998e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3898  response regulator receiver  51.69 
 
 
121 aa  137  3.9999999999999997e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2158  response regulator receiver protein  51.67 
 
 
120 aa  137  4.999999999999999e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1817  putative two-component response regulator  49.58 
 
 
120 aa  135  2e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1724  response regulator receiver protein  53.98 
 
 
128 aa  134  4e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.999633  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1789  response regulator receiver protein  53.98 
 
 
128 aa  134  4e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3189  twitching motility protein  50 
 
 
121 aa  132  9.999999999999999e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.612166  normal  0.249154 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3970  response regulator receiver protein  50.43 
 
 
121 aa  131  3e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0244969 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01603  PilH  52.1 
 
 
120 aa  130  5e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.376187  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1243  response regulator receiver domain-containing protein  53.1 
 
 
121 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.253807 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0522  response regulator receiver domain-containing protein  46.09 
 
 
120 aa  126  1.0000000000000001e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2551  response regulator receiver domain-containing protein  46.61 
 
 
121 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3088  response regulator receiver protein  49.17 
 
 
120 aa  124  4.0000000000000003e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.224006 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1573  response regulator receiver protein  50 
 
 
121 aa  122  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.146471 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1062  response regulator receiver protein  41.18 
 
 
120 aa  121  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58489  hitchhiker  0.0000344775 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4625  response regulator receiver protein  48.28 
 
 
121 aa  121  4e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.635313  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1234  response regulator receiver protein  47.5 
 
 
122 aa  120  4e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1264  response regulator receiver protein  47.5 
 
 
122 aa  120  4e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0578681  hitchhiker  0.00155192 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1137  response regulator receiver domain-containing protein  47.41 
 
 
121 aa  120  8e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.635456 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1372  response regulator receiver domain-containing protein  47.41 
 
 
121 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0313107  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0613  response regulator receiver protein  48.67 
 
 
122 aa  119  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.242329  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0670  response regulator receiver domain-containing protein  47.46 
 
 
122 aa  119  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00691443  normal  0.823575 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0561  response regulator receiver protein  48.67 
 
 
122 aa  119  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.718467 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3577  response regulator receiver protein  47.41 
 
 
121 aa  118  1.9999999999999998e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.400966  normal  0.141746 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2900  response regulator receiver protein  47.41 
 
 
121 aa  118  1.9999999999999998e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.197839  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2622  response regulator receiver  49.14 
 
 
123 aa  118  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3020  response regulator receiver protein  47.41 
 
 
121 aa  117  3.9999999999999996e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.447611  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0902  response regulator receiver protein  46.55 
 
 
121 aa  117  6e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.844306 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3353  response regulator receiver protein  46.55 
 
 
121 aa  117  6e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.392561  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0669  putative twitching motility two-component response regulator transcription regulator protein  46.09 
 
 
122 aa  115  3e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0856  response regulator receiver domain-containing protein  38.98 
 
 
120 aa  114  6e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0758877  normal  0.0586548 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0640  response regulator receiver protein  46.61 
 
 
123 aa  113  8.999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0631  response regulator receiver protein  46.61 
 
 
123 aa  113  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0606  response regulator receiver domain-containing protein  46.61 
 
 
123 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0059  response regulator receiver domain-containing protein  38.66 
 
 
125 aa  111  4.0000000000000004e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.157498  normal  0.212271 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4952  response regulator receiver protein  42.98 
 
 
121 aa  110  6e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.699568  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4743  response regulator receiver protein  47.93 
 
 
125 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00329385 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0751  response regulator receiver protein  42.02 
 
 
121 aa  108  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0722  response regulator receiver protein  42.02 
 
 
121 aa  108  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0508  response regulator receiver domain-containing protein  41.32 
 
 
121 aa  107  6e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.481314  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3248  response regulator receiver protein  41.18 
 
 
121 aa  107  7.000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.500247 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2562  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  40.71 
 
 
437 aa  106  9.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0790  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.24 
 
 
566 aa  105  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.391268  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2709  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.69 
 
 
236 aa  105  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0011921  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1221  response regulator receiver domain-containing protein  46.73 
 
 
125 aa  105  3e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3747  response regulator receiver protein  39.67 
 
 
121 aa  105  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0178  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  42.24 
 
 
322 aa  104  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.895619 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4229  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  41.23 
 
 
383 aa  104  5e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.599633  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3661  response regulator receiver protein  42.86 
 
 
120 aa  104  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.442071  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2795  response regulator receiver protein  37.29 
 
 
121 aa  104  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0809  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  41.38 
 
 
367 aa  103  5e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3000  response regulator receiver protein  40.34 
 
 
124 aa  103  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2507  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  38.33 
 
 
488 aa  103  7e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.182398 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2960  response regulator receiver  39.83 
 
 
190 aa  103  9e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0852903  normal  0.915615 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0650  response regulator receiver protein  44.07 
 
 
123 aa  103  9e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.438565  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2343  two component transcriptional regulator  45.69 
 
 
243 aa  102  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00929975  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5066  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  41.38 
 
 
338 aa  103  1e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1955  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.7 
 
 
236 aa  102  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.295041  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1842  response regulator receiver protein  42.15 
 
 
122 aa  102  2e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.808404  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2815  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  39.83 
 
 
457 aa  102  3e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.631579  normal  0.0857187 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2570  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  43.59 
 
 
381 aa  101  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6559  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.64 
 
 
541 aa  101  4e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.59439 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1373  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  39.66 
 
 
365 aa  100  5e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0195  two component transcriptional regulator  43.97 
 
 
243 aa  100  5e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00716616 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4344  two component transcriptional regulator  43.1 
 
 
239 aa  100  8e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.325933  normal  0.345767 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0761  two component transcriptional regulator  41.88 
 
 
229 aa  99.8  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1805  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  40.17 
 
 
310 aa  99.4  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0638722  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2892  two component transcriptional regulator  39.83 
 
 
227 aa  99.8  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0239565 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2333  two component transcriptional regulator  41.53 
 
 
232 aa  99  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0367  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.17 
 
 
503 aa  99  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0540164 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4445  two component transcriptional regulator  41.88 
 
 
229 aa  99  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.14031 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2789  response regulator receiver protein  40.34 
 
 
121 aa  98.2  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1887  adenylate/guanylate cyclase  41.03 
 
 
403 aa  98.2  3e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.522729 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0707  two component transcriptional regulator  41.18 
 
 
232 aa  98.2  3e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1102  DNA-binding response regulator  42.86 
 
 
225 aa  97.8  4e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4136  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  38.14 
 
 
440 aa  98.2  4e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000660181  hitchhiker  0.00876613 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1477  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  39.82 
 
 
317 aa  97.8  4e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2623  response regulator receiver  42.86 
 
 
160 aa  97.8  5e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0567  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.24 
 
 
225 aa  97.4  5e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.463355  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1100  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.18 
 
 
236 aa  97.4  5e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000182155 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>