More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_0515 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_0515  response regulator receiver protein  100 
 
 		 120 aa  246  9e-65  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.163432  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0404  response regulator receiver protein  65.55 
 
 		 121 aa  172  9.999999999999999e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2399  response regulator receiver protein  61.67 
 
 		 121 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.732485 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5307  response regulator receiver domain-containing protein  63.87 
 
 		 121 aa  169  1e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0137607  normal  0.215998 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0489  response regulator receiver  62.18 
 
 		 121 aa  166  8e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.646514  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5033  type IV pilus response regulator PilH  62.18 
 
 		 121 aa  166  1e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0509  twitching motility protein PilH  63.03 
 
 		 121 aa  165  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05330  twitching motility protein PilH  63.03 
 
 		 121 aa  165  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3633  response regulator receiver domain-containing protein  61.86 
 
 		 120 aa  164  2.9999999999999998e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.480345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2903  response regulator receiver protein  65.18 
 
 		 120 aa  164  5e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.629195  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5041  response regulator receiver protein  60.83 
 
 		 121 aa  162  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4991  response regulator receiver protein  60 
 
 		 121 aa  161  3e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.353726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4865  response regulator receiver protein  60 
 
 		 121 aa  161  3e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.321258  normal  0.0275279 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0473  response regulator receiver protein  59.66 
 
 		 121 aa  157  4e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.950452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3768  response regulator receiver protein  57.14 
 
 		 120 aa  152  1e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48045  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2551  response regulator receiver domain-containing protein  58.93 
 
 		 121 aa  147  7e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0356  response regulator receiver protein  52.5 
 
 		 121 aa  142  2e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0780111  normal  0.957515 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0130  response regulator receiver  51.67 
 
 		 121 aa  140  5e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02637  regulatory protein PilH family  50 
 
 		 128 aa  140  7e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3689  response regulator receiver protein  57.27 
 
 		 121 aa  138  3e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.443278  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3898  response regulator receiver  55.45 
 
 		 121 aa  137  7e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4625  response regulator receiver protein  51.35 
 
 		 121 aa  136  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.635313  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3088  response regulator receiver protein  55.75 
 
 		 120 aa  135  2e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.224006 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01603  PilH  54.87 
 
 		 120 aa  135  2e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.376187  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3018  response regulator receiver protein  51.26 
 
 		 123 aa  134  3.0000000000000003e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.454082 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3970  response regulator receiver protein  50 
 
 		 121 aa  134  4e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0244969 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2100  response regulator receiver domain-containing protein  48.74 
 
 		 120 aa  133  9e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1724  response regulator receiver protein  45 
 
 		 128 aa  131  1.9999999999999998e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.999633  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1789  response regulator receiver protein  45 
 
 		 128 aa  131  1.9999999999999998e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1372  response regulator receiver domain-containing protein  47.71 
 
 		 121 aa  128  2.0000000000000002e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0313107  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3189  twitching motility protein  47.79 
 
 		 121 aa  127  6e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.612166  normal  0.249154 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1817  putative two-component response regulator  47.06 
 
 		 120 aa  127  7.000000000000001e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0669  putative twitching motility two-component response regulator transcription regulator protein  52.73 
 
 		 122 aa  125  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3577  response regulator receiver protein  47.71 
 
 		 121 aa  126  1.0000000000000001e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.400966  normal  0.141746 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2900  response regulator receiver protein  47.71 
 
 		 121 aa  126  1.0000000000000001e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.197839  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1243  response regulator receiver domain-containing protein  45.69 
 
 		 121 aa  125  1.0000000000000001e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.253807 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1137  response regulator receiver domain-containing protein  48.65 
 
 		 121 aa  126  1.0000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.635456 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1573  response regulator receiver protein  47.71 
 
 		 121 aa  126  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.146471 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3353  response regulator receiver protein  46.85 
 
 		 121 aa  125  2.0000000000000002e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.392561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3020  response regulator receiver protein  47.71 
 
 		 121 aa  125  2.0000000000000002e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.447611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0902  response regulator receiver protein  46.79 
 
 		 121 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844306 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2158  response regulator receiver protein  44.54 
 
 		 120 aa  125  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0670  response regulator receiver domain-containing protein  44.17 
 
 		 122 aa  122  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00691443  normal  0.823575 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0561  response regulator receiver protein  49.54 
 
 		 122 aa  120  7e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.718467 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0613  response regulator receiver protein  49.54 
 
 		 122 aa  120  7e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.242329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2622  response regulator receiver  47.71 
 
 		 123 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0856  response regulator receiver domain-containing protein  40.68 
 
 		 120 aa  114  3e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0758877  normal  0.0586548 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3000  response regulator receiver protein  35 
 
 		 124 aa  106  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1062  response regulator receiver protein  35.29 
 
 		 120 aa  105  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58489  hitchhiker  0.0000344775 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3248  response regulator receiver protein  34.17 
 
 		 121 aa  103  6e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.500247 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0059  response regulator receiver domain-containing protein  35.29 
 
 		 125 aa  103  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.157498  normal  0.212271 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1221  response regulator receiver domain-containing protein  42.99 
 
 		 125 aa  102  1e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4743  response regulator receiver protein  37.19 
 
 		 125 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00329385 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2149  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  40.91 
 
 		 407 aa  101  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.142048 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0751  response regulator receiver protein  31.67 
 
 		 121 aa  100  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0722  response regulator receiver protein  31.67 
 
 		 121 aa  100  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0522  response regulator receiver domain-containing protein  42.31 
 
 		 120 aa  100  5e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3747  response regulator receiver protein  35 
 
 		 121 aa  99.8  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0221  response regulator PleD  41.82 
 
 		 460 aa  99  2e-20  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0967  diguanylate cyclase  40.54 
 
 		 457 aa  99  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.555277  normal  0.0207283 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0931  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  40.54 
 
 		 457 aa  99  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.436852  normal  0.104843 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2780  response regulator receiver protein  39.29 
 
 		 121 aa  98.6  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.76051 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0907  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  40.54 
 
 		 457 aa  98.6  3e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.401363  normal  0.40647 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3337  response regulator receiver protein  39.29 
 
 		 121 aa  98.6  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2662  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.02 
 
 		 231 aa  97.8  5e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2815  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  38.39 
 
 		 457 aa  96.7  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.631579  normal  0.0857187 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4605  response regulator receiver protein  34.17 
 
 		 120 aa  95.5  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.509614 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0508  response regulator receiver domain-containing protein  31.67 
 
 		 121 aa  95.5  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.481314  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0424  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  37.5 
 
 		 469 aa  95.5  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.97349 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1423  response regulator receiver protein  38.26 
 
 		 119 aa  95.5  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.24081  normal  0.185499 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1497  response regulator PleD  40.18 
 
 		 454 aa  95.5  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.122959 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3776  response regulator receiver domain-containing protein  38.74 
 
 		 120 aa  95.1  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.143561 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1277  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  36.44 
 
 		 454 aa  95.1  3e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.410696  normal  0.0388481 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2795  response regulator receiver protein  35 
 
 		 121 aa  94.7  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0500  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  37.07 
 
 		 373 aa  94.7  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2507  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  35.83 
 
 		 488 aa  94.4  5e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.182398 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1526  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.39 
 
 		 975 aa  94.4  5e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2960  response regulator receiver  34.75 
 
 		 190 aa  94  6e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0852903  normal  0.915615 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0912  response regulator receiver protein  39.5 
 
 		 118 aa  94  6e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.616011 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0603  two component transcriptional regulator  31.09 
 
 		 233 aa  94  7e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0519325  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2343  two component transcriptional regulator  39.32 
 
 		 243 aa  93.6  8e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00929975  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1264  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 122 aa  93.6  9e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0578681  hitchhiker  0.00155192 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2061  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  39.09 
 
 		 318 aa  93.6  9e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365539  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1234  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 122 aa  93.6  9e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3968  response regulator receiver protein  33.61 
 
 		 125 aa  92.8  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0599  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  37.5 
 
 		 313 aa  93.2  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.464892  normal  0.548622 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0512  response regulator PleD  42.73 
 
 		 456 aa  92.8  1e-18  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4952  response regulator receiver protein  30.83 
 
 		 121 aa  92.8  1e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.699568  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0979  response regulator receiver protein  35.9 
 
 		 336 aa  92  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3625  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  36.97 
 
 		 322 aa  92  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1228  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  38.83 
 
 		 349 aa  92.4  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3790  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  41.51 
 
 		 300 aa  92  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4530  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  39.42 
 
 		 386 aa  91.7  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6679  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  37.5 
 
 		 457 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01756  Response regulator CheB (receptor modification enzyme, protein-glutamate methylesterase)  39.62 
 
 		 337 aa  91.7  3e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.844049  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3557  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  36.97 
 
 		 322 aa  91.7  3e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.457648  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1236  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  39.42 
 
 		 386 aa  91.7  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.493129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2051  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.75 
 
 		 247 aa  91.3  4e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.520505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0606  response regulator receiver domain-containing protein  35.04 
 
 		 123 aa  91.3  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2709  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.19 
 
 		 236 aa  91.3  4e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0011921  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>