More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1221 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1221  response regulator receiver domain-containing protein  100 
 
 		 125 aa  255  1e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3248  response regulator receiver protein  52.1 
 
 		 121 aa  140  6e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.500247 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3000  response regulator receiver protein  47.06 
 
 		 124 aa  130  5e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0508  response regulator receiver domain-containing protein  47.9 
 
 		 121 aa  130  5e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.481314  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4952  response regulator receiver protein  47.06 
 
 		 121 aa  129  1.0000000000000001e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.699568  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0722  response regulator receiver protein  47.06 
 
 		 121 aa  126  9.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0751  response regulator receiver protein  47.06 
 
 		 121 aa  126  9.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3661  response regulator receiver protein  46.22 
 
 		 120 aa  125  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.442071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3747  response regulator receiver protein  45.38 
 
 		 121 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1234  response regulator receiver protein  49.18 
 
 		 122 aa  121  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1264  response regulator receiver protein  49.18 
 
 		 122 aa  121  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0578681  hitchhiker  0.00155192 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1423  response regulator receiver protein  46.15 
 
 		 119 aa  121  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.24081  normal  0.185499 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3968  response regulator receiver protein  40.8 
 
 		 125 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3970  response regulator receiver protein  45.45 
 
 		 121 aa  115  3e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0244969 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1422  response regulator receiver protein  44.54 
 
 		 119 aa  114  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.153955  normal  0.123704 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3898  response regulator receiver  48.18 
 
 		 121 aa  114  3.9999999999999997e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2551  response regulator receiver domain-containing protein  46.43 
 
 		 121 aa  114  3.9999999999999997e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3189  twitching motility protein  42.86 
 
 		 121 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.612166  normal  0.249154 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0951  response regulator receiver protein  45.08 
 
 		 239 aa  113  7.999999999999999e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000111905  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4605  response regulator receiver protein  47.32 
 
 		 120 aa  112  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.509614 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0130  response regulator receiver  49.11 
 
 		 121 aa  112  1.0000000000000001e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2789  response regulator receiver protein  46.55 
 
 		 121 aa  112  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3990  response regulator receiver protein  45.54 
 
 		 146 aa  113  1.0000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.27172  normal  0.4632 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1062  response regulator receiver protein  41.18 
 
 		 120 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58489  hitchhiker  0.0000344775 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3577  response regulator receiver protein  43.12 
 
 		 121 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.400966  normal  0.141746 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2900  response regulator receiver protein  43.12 
 
 		 121 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.197839  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3020  response regulator receiver protein  43.12 
 
 		 121 aa  111  3e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.447611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0902  response regulator receiver protein  43.12 
 
 		 121 aa  111  3e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844306 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2399  response regulator receiver protein  41.32 
 
 		 121 aa  110  8.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.732485 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0856  response regulator receiver domain-containing protein  41.38 
 
 		 120 aa  109  1.0000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0758877  normal  0.0586548 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0509  twitching motility protein PilH  47.32 
 
 		 121 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0356  response regulator receiver protein  46.55 
 
 		 121 aa  109  1.0000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0780111  normal  0.957515 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05330  twitching motility protein PilH  47.32 
 
 		 121 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1573  response regulator receiver protein  44.04 
 
 		 121 aa  109  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.146471 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4743  response regulator receiver protein  45 
 
 		 125 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00329385 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0473  response regulator receiver protein  42.98 
 
 		 121 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.950452  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02637  regulatory protein PilH family  45.13 
 
 		 128 aa  108  3e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2795  response regulator receiver protein  41.38 
 
 		 121 aa  108  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3633  response regulator receiver domain-containing protein  45.54 
 
 		 120 aa  108  3e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.480345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3689  response regulator receiver protein  43.86 
 
 		 121 aa  108  3e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.443278  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0404  response regulator receiver protein  47.32 
 
 		 121 aa  107  5e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1372  response regulator receiver domain-containing protein  41.23 
 
 		 121 aa  107  6e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0313107  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0912  response regulator receiver protein  46.22 
 
 		 118 aa  105  1e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.616011 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1724  response regulator receiver protein  42.48 
 
 		 128 aa  105  2e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.999633  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1789  response regulator receiver protein  42.48 
 
 		 128 aa  105  2e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5307  response regulator receiver domain-containing protein  45.54 
 
 		 121 aa  105  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0137607  normal  0.215998 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3018  response regulator receiver protein  44.64 
 
 		 123 aa  105  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.454082 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0059  response regulator receiver domain-containing protein  40.52 
 
 		 125 aa  104  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.157498  normal  0.212271 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0515  response regulator receiver protein  41.96 
 
 		 120 aa  105  3e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.163432  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2780  response regulator receiver protein  41.03 
 
 		 121 aa  104  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.76051 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3337  response regulator receiver protein  41.03 
 
 		 121 aa  104  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5033  type IV pilus response regulator PilH  44.64 
 
 		 121 aa  104  4e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5041  response regulator receiver protein  42.15 
 
 		 121 aa  104  4e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2158  response regulator receiver protein  41.74 
 
 		 120 aa  104  5e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0489  response regulator receiver  44.64 
 
 		 121 aa  103  6e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.646514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3768  response regulator receiver protein  40.18 
 
 		 120 aa  103  7e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48045  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4991  response regulator receiver protein  41.32 
 
 		 121 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.353726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4865  response regulator receiver protein  41.32 
 
 		 121 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.321258  normal  0.0275279 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1137  response regulator receiver domain-containing protein  39.29 
 
 		 121 aa  102  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.635456 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3353  response regulator receiver protein  40.37 
 
 		 121 aa  102  1e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.392561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2100  response regulator receiver domain-containing protein  39.32 
 
 		 120 aa  102  2e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1077  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.98 
 
 		 235 aa  102  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4625  response regulator receiver protein  40.37 
 
 		 121 aa  101  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.635313  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1955  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.18 
 
 		 236 aa  100  7e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.295041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0132  response regulator receiver protein  41.94 
 
 		 231 aa  100  8e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1842  response regulator receiver protein  42.74 
 
 		 122 aa  100  8e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.808404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2061  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  44.74 
 
 		 318 aa  100  9e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365539  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0609  DNA-binding response regulator  41.59 
 
 		 231 aa  100  9e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000282114  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1243  response regulator receiver domain-containing protein  42.98 
 
 		 121 aa  99.4  1e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.253807 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1580  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.17 
 
 		 216 aa  99.4  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1605  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.17 
 
 		 216 aa  99.4  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0623  DNA-binding response regulator  41.59 
 
 		 231 aa  99.4  1e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000212568  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.4 
 
 		 234 aa  98.6  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.178035  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1805  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  38.79 
 
 		 310 aa  98.6  3e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0638722  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4431  response regulator receiver domain-containing protein  40.71 
 
 		 125 aa  98.6  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4050  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.64 
 
 		 227 aa  98.2  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00552008  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2844  two component transcriptional regulator  37.82 
 
 		 248 aa  97.8  4e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0031  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.24 
 
 		 234 aa  97.4  5e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1817  putative two-component response regulator  40.18 
 
 		 120 aa  97.1  8e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0606  response regulator receiver domain-containing protein  41.88 
 
 		 123 aa  96.7  9e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0783  two component transcriptional regulator  43.64 
 
 		 231 aa  96.7  9e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1419  two component transcriptional regulator  41.18 
 
 		 231 aa  96.7  1e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0720218  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3069  two component transcriptional regulator  40 
 
 		 230 aa  96.3  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000467461  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2622  response regulator receiver  40.91 
 
 		 123 aa  96.7  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2625  two component transcriptional regulator  36.07 
 
 		 232 aa  96.7  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000561273 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0707  two component transcriptional regulator  42.02 
 
 		 232 aa  96.3  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0882  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.52 
 
 		 230 aa  96.7  1e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.148935 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0669  putative twitching motility two-component response regulator transcription regulator protein  40.18 
 
 		 122 aa  95.9  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3088  response regulator receiver protein  39.32 
 
 		 120 aa  95.5  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.224006 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1911  two component transcriptional regulator  39.47 
 
 		 229 aa  95.9  2e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.258551 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4225  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.28 
 
 		 1322 aa  95.5  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0640  response regulator receiver protein  41.03 
 
 		 123 aa  95.9  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2746  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.17 
 
 		 1096 aa  95.5  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.455726  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2903  response regulator receiver protein  38.39 
 
 		 120 aa  95.5  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.629195  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2918  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.02 
 
 		 232 aa  95.5  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0631  response regulator receiver protein  41.03 
 
 		 123 aa  95.5  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2358  two component transcriptional regulator  45.61 
 
 		 231 aa  95.9  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0136772  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01603  PilH  37.61 
 
 		 120 aa  95.9  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.376187  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0216  two component transcriptional regulator  41.44 
 
 		 230 aa  94.7  3e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.305183 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1997  two component transcriptional regulator  39.47 
 
 		 234 aa  94.7  3e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000742772  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>