More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2746 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2746  multi-sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 		 1096 aa  2211    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.455726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002587  chitin catabolic cascade sensor histidine kinase ChiS  32.83 
 
 		 1111 aa  555  1e-156  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2575  chitin degradation sensor protein  32.4 
 
 		 1127 aa  553  1e-156  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03422  hypothetical protein  32.5 
 
 		 1128 aa  545  1e-153  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0150  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  33.15 
 
 		 1177 aa  536  1e-151  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2729  adenylate/guanylate cyclase  36.26 
 
 		 1119 aa  315  3.9999999999999997e-84  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0163544 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3412  adenylate/guanylate cyclase  37.31 
 
 		 1207 aa  303  2e-80  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.210507 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0662  adenylate/guanylate cyclase  36.2 
 
 		 1130 aa  301  5e-80  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0661  adenylate/guanylate cyclase  35.77 
 
 		 1133 aa  296  2e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0667  response regulator receiver domain-containing protein  38.27 
 
 		 1526 aa  257  7e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0280955  hitchhiker  0.000000898802 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0135  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.59 
 
 		 858 aa  239  2e-61  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.711395  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0411  signal transduction histidine kinase, LytS  36.25 
 
 		 1018 aa  236  2.0000000000000002e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000411039  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1816  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  32.1 
 
 		 977 aa  224  4.9999999999999996e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.218789  normal  0.39116 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1567  signal transduction histidine kinase, LytS  35.65 
 
 		 1016 aa  223  9.999999999999999e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0336431  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6237  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.7 
 
 		 721 aa  213  2e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.703753 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4701  multi-sensor hybrid histidine kinase  32 
 
 		 1274 aa  212  4e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0613664  normal  0.609464 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3600  histidine kinase  33.97 
 
 		 548 aa  211  4e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.94225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3663  putative sensor/response regulator hybrid  31.25 
 
 		 651 aa  210  9e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.800386  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.48 
 
 		 1352 aa  210  1e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1976  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.57 
 
 		 1383 aa  209  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.624185 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4211  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  30.97 
 
 		 633 aa  209  3e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.79688  normal  0.233659 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1117  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 770 aa  207  7e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0800  histidine kinase  34.12 
 
 		 882 aa  207  1e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.127646  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3009  histidine kinase  31.19 
 
 		 603 aa  206  2e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.176735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1390  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.28 
 
 		 1977 aa  206  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4086  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  33.4 
 
 		 631 aa  206  3e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5184  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.2 
 
 		 939 aa  206  3e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.584953  normal  0.0776559 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4276  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.42 
 
 		 1847 aa  205  3e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2208  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.26 
 
 		 823 aa  206  3e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.73393 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4529  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.02 
 
 		 989 aa  205  4e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3552  Cache sensor hybrid histidine kinase  33.1 
 
 		 970 aa  204  6e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1235  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.34 
 
 		 989 aa  204  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.172784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0238  multi-component transcriptional regulator  32.94 
 
 		 1629 aa  203  1.9999999999999998e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2646  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.17 
 
 		 1163 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.898724 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2687  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.76 
 
 		 1013 aa  203  1.9999999999999998e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.70216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4122  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.25 
 
 		 1853 aa  201  3.9999999999999996e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4253  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.48 
 
 		 1843 aa  202  3.9999999999999996e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43670  putative sensor/response regulator hybrid  30.49 
 
 		 651 aa  201  5e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0493  signal transduction histidine kinase, LytS  34.37 
 
 		 1022 aa  201  5e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000359244  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2929  histidine kinase  34.42 
 
 		 606 aa  201  7e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3786  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.49 
 
 		 606 aa  200  1.0000000000000001e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3818  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.98 
 
 		 1426 aa  199  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3744  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.88 
 
 		 643 aa  199  3e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1705  histidine kinase  29.43 
 
 		 910 aa  199  3e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0116  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.19 
 
 		 1711 aa  198  5.000000000000001e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.257821  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4352  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.34 
 
 		 1287 aa  197  9e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.06083 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4037  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  32.6 
 
 		 659 aa  197  1e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2206  histidine kinase  34.35 
 
 		 556 aa  197  1e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0776  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.67 
 
 		 1559 aa  197  1e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1497  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.26 
 
 		 880 aa  196  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2468  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.42 
 
 		 631 aa  196  2e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.633599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1695  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.63 
 
 		 643 aa  195  4e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.695799 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3479  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.41 
 
 		 1078 aa  195  4e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6560  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.14 
 
 		 720 aa  195  5e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.441976  normal  0.646619 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0204  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.84 
 
 		 687 aa  195  5e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.478023 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0664  ATP-binding region, ATPase-like protein  28.39 
 
 		 853 aa  194  8e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5091  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.27 
 
 		 1479 aa  194  9e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.493325  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0562  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.01 
 
 		 743 aa  194  9e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.1893  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2202  histidine kinase  29.74 
 
 		 613 aa  194  1e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.143763  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3699  histidine kinase  29.25 
 
 		 998 aa  193  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1037  sensor histidine kinase/response regulator  31.88 
 
 		 896 aa  193  2e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0565  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.49 
 
 		 947 aa  193  2e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0743  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.28 
 
 		 869 aa  192  2e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2948  histidine kinase  30.75 
 
 		 800 aa  192  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.549542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1053  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.78 
 
 		 1458 aa  192  2.9999999999999997e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2684  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.56 
 
 		 645 aa  192  4e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0551  PAS  33.25 
 
 		 1026 aa  192  4e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.425664 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1574  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.09 
 
 		 841 aa  192  4e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4266  sensor histidine kinase/response regulator  31.79 
 
 		 896 aa  192  4e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000252034 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0219  histidine kinase  36.34 
 
 		 1166 aa  192  4e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.803779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0186  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.58 
 
 		 657 aa  191  5e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00908915 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0286  GAF sensor hybrid histidine kinase  29.14 
 
 		 1406 aa  191  5e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3271  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.73 
 
 		 1691 aa  191  7e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2142  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.34 
 
 		 1149 aa  191  8e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.694825  hitchhiker  0.00121197 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0578  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.12 
 
 		 667 aa  191  9e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000984  signal transduction histidine kinase  29.8 
 
 		 631 aa  191  9e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0566  MCP methyltransferase, CheR-type with PAS/PAC sensor  34.77 
 
 		 1193 aa  190  1e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2628  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.93 
 
 		 902 aa  190  1e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2194  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  31.01 
 
 		 858 aa  190  1e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.857252  normal  0.467192 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0307  response regulator, histidine kinase  29.16 
 
 		 755 aa  190  2e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0148  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.54 
 
 		 1048 aa  189  2e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.872071 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1968  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.61 
 
 		 846 aa  189  2e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2508  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.36 
 
 		 784 aa  190  2e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.033945 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0186  histidine kinase  29.53 
 
 		 810 aa  189  2e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0420  PAS  30.89 
 
 		 787 aa  189  3e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0516903 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3688  aerobic respiration control sensor protein ArcB  31.47 
 
 		 778 aa  189  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.739542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0564  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.5 
 
 		 627 aa  189  3e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.211254  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1072  sensor histidine kinase/response regulator  31.19 
 
 		 896 aa  189  3e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.88167e-43 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3868  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.77 
 
 		 1127 aa  189  3e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4423  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.33 
 
 		 1361 aa  189  3e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.498632 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3519  aerobic respiration control sensor protein ArcB  31.47 
 
 		 778 aa  188  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4814  histidine kinase  33.41 
 
 		 919 aa  188  4e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00150972  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3590  aerobic respiration control sensor protein ArcB  31.47 
 
 		 778 aa  188  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.571349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2106  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.88 
 
 		 1155 aa  189  4e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1090  sensor histidine kinase/response regulator  31.88 
 
 		 896 aa  188  5e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.358618  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0932  sensor histidine kinase/response regulator  31.88 
 
 		 896 aa  188  5e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3329  hybrid sensor and regulator fused  28.81 
 
 		 968 aa  188  5e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2782  Hpt sensor hybrid histidine kinase  34.58 
 
 		 1091 aa  188  5e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0996  sensor histidine kinase/response regulator  31.88 
 
 		 896 aa  188  5e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4173  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.85 
 
 		 643 aa  188  6e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>