More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0493 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0493  signal transduction histidine kinase, LytS  100 
 
 
1022 aa  2088    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000359244  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1567  signal transduction histidine kinase, LytS  35.88 
 
 
1016 aa  553  1e-156  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0336431  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0411  signal transduction histidine kinase, LytS  32.66 
 
 
1018 aa  486  1e-136  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000411039  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3412  adenylate/guanylate cyclase  33.69 
 
 
1207 aa  244  5e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.210507 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0150  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  37.77 
 
 
1177 aa  244  6e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0662  adenylate/guanylate cyclase  34.92 
 
 
1130 aa  242  2.9999999999999997e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0661  adenylate/guanylate cyclase  36.1 
 
 
1133 aa  241  5e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2575  chitin degradation sensor protein  36.21 
 
 
1127 aa  239  2e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0667  response regulator receiver domain-containing protein  34.54 
 
 
1526 aa  235  3e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0280955  hitchhiker  0.000000898802 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002587  chitin catabolic cascade sensor histidine kinase ChiS  34.86 
 
 
1111 aa  232  2e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03422  hypothetical protein  35.21 
 
 
1128 aa  223  9.999999999999999e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2729  adenylate/guanylate cyclase  34.83 
 
 
1119 aa  216  9.999999999999999e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0163544 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1227  ATP-binding region ATPase domain protein  26 
 
 
787 aa  209  2e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.570195  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2746  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.37 
 
 
1096 aa  202  3e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.455726  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1545  histidine kinase  25.53 
 
 
708 aa  198  4.0000000000000005e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00108525  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2452  signal transduction histidine kinase, LytS  42.03 
 
 
408 aa  172  2e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00298598  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2468  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.49 
 
 
631 aa  172  3e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.633599  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0806  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.97 
 
 
902 aa  171  8e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0077  histidine kinase  30.63 
 
 
661 aa  167  1.0000000000000001e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.131853 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6560  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  28.38 
 
 
720 aa  165  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.441976  normal  0.646619 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0551  PAS  31.9 
 
 
1026 aa  161  5e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.425664 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1703  histidine kinase  32.61 
 
 
1346 aa  161  6e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1526  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.42 
 
 
975 aa  161  6e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6237  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  29.14 
 
 
721 aa  161  6e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.703753 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0186  histidine kinase  30.46 
 
 
810 aa  160  8e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1549  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.23 
 
 
1199 aa  159  2e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2954  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.67 
 
 
1127 aa  159  3e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3745  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  28.07 
 
 
1010 aa  159  3e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.412805  hitchhiker  0.00597184 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4814  histidine kinase  26.3 
 
 
919 aa  158  5.0000000000000005e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00150972  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2784  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.51 
 
 
1222 aa  158  5.0000000000000005e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0520121 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6561  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.06 
 
 
863 aa  157  1e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2218  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.63 
 
 
1070 aa  157  1e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0765203 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1770  histidine kinase  30.77 
 
 
742 aa  156  2e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3783  histidine kinase  30.48 
 
 
544 aa  156  2e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.401083  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3119  Signal transduction histidine kinase-like  26.88 
 
 
861 aa  156  2e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3496  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.36 
 
 
643 aa  155  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3479  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.95 
 
 
1078 aa  155  5e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0204  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  29.8 
 
 
687 aa  155  5e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.478023 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1968  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.82 
 
 
846 aa  155  5e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2212  sensor histidine kinase/response regulator  31.01 
 
 
641 aa  154  7e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.378364  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0819  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.61 
 
 
844 aa  154  8.999999999999999e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0848  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.61 
 
 
844 aa  154  8.999999999999999e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2663  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.06 
 
 
979 aa  154  8.999999999999999e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.366427 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3528  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.24 
 
 
690 aa  153  1e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.148332  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4541  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.95 
 
 
896 aa  154  1e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1622  PAS  30.91 
 
 
802 aa  153  1e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.2135  normal  0.458803 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4211  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  29.95 
 
 
633 aa  154  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.79688  normal  0.233659 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0831  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.76 
 
 
957 aa  154  1e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1484  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.92 
 
 
1002 aa  153  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3714  PAS  31.45 
 
 
1028 aa  153  2e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.101634 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0987  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.99 
 
 
846 aa  153  2e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.594505  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1511  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.92 
 
 
1002 aa  153  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1695  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.49 
 
 
643 aa  152  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.695799 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3744  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.49 
 
 
643 aa  152  4e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4086  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  30.32 
 
 
631 aa  151  5e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1268  Hpt sensor hybrid histidine kinase  26.12 
 
 
781 aa  151  5e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3329  hybrid sensor and regulator fused  30.12 
 
 
968 aa  151  6e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1825  Hpt sensor hybrid histidine kinase  29.05 
 
 
932 aa  151  6e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2114  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.71 
 
 
674 aa  151  8e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1976  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.96 
 
 
1383 aa  150  9e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.624185 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4427  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.82 
 
 
772 aa  150  9e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2096  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.13 
 
 
1140 aa  150  9e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.166751  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0585  ATP-binding region ATPase domain protein  31 
 
 
528 aa  150  9e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.215545  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0811  Hpt sensor hybrid histidine kinase  29.29 
 
 
724 aa  150  1.0000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3279  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.26 
 
 
1433 aa  150  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.681112  normal  0.627666 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2487  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  30.58 
 
 
1535 aa  150  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.162467  normal  0.455724 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1029  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.92 
 
 
1820 aa  150  1.0000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.165868 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6296  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.84 
 
 
673 aa  150  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.312585  normal  0.564635 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0852  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  29.29 
 
 
859 aa  150  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.237693 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1409  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.82 
 
 
778 aa  150  1.0000000000000001e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2453  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.52 
 
 
969 aa  150  1.0000000000000001e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.19952  normal  0.304956 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4200  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.16 
 
 
678 aa  149  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.679083  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4310  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.16 
 
 
631 aa  150  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.917762  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4539  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  24.66 
 
 
1152 aa  149  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.329946  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.82 
 
 
1363 aa  150  2.0000000000000003e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4305  signal transduction histidine kinase, LytS  40.48 
 
 
654 aa  150  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.119677  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0776  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.67 
 
 
1559 aa  149  2.0000000000000003e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2149  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.53 
 
 
680 aa  149  2.0000000000000003e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4759  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  28.99 
 
 
593 aa  149  2.0000000000000003e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0993289 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0903  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.03 
 
 
977 aa  150  2.0000000000000003e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.393558  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4529  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.07 
 
 
989 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2628  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.72 
 
 
902 aa  149  3e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5087  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.93 
 
 
1058 aa  149  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6547  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.92 
 
 
865 aa  148  4.0000000000000006e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.325935 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1582  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.16 
 
 
788 aa  148  4.0000000000000006e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4844  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.72 
 
 
507 aa  148  4.0000000000000006e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0550144  normal  0.563731 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2208  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.64 
 
 
823 aa  149  4.0000000000000006e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.73393 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4725  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  27.75 
 
 
614 aa  149  4.0000000000000006e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.269083  normal  0.0435637 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3382  ATPase domain-containing protein  29.21 
 
 
1071 aa  148  5e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.525319  normal  0.740946 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3847  Hpt sensor hybrid histidine kinase  29.58 
 
 
921 aa  148  5e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2021  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  29.87 
 
 
645 aa  148  6e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.798842  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0213  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.49 
 
 
974 aa  147  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0934932  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2831  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.03 
 
 
1407 aa  147  7.0000000000000006e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.160519  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5067  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.01 
 
 
1002 aa  147  7.0000000000000006e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0381  sensory box histidine kinase/response regulator  29.55 
 
 
497 aa  147  7.0000000000000006e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1221  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.07 
 
 
1044 aa  147  8.000000000000001e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.227424  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0258  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.9 
 
 
1040 aa  147  8.000000000000001e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.119641 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0469  aerobic respiration control sensor protein ArcB  29.67 
 
 
778 aa  147  9e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.55831  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0533  aerobic respiration control sensor protein ArcB  29.67 
 
 
778 aa  147  9e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0807351  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2838  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.49 
 
 
860 aa  147  1e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>