More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_0489 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_0489  response regulator receiver  100 
 
 		 121 aa  246  6e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.646514  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5033  type IV pilus response regulator PilH  97.52 
 
 		 121 aa  241  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5307  response regulator receiver domain-containing protein  91.74 
 
 		 121 aa  228  1e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0137607  normal  0.215998 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0404  response regulator receiver protein  89.26 
 
 		 121 aa  228  2e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0509  twitching motility protein PilH  89.26 
 
 		 121 aa  226  7e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05330  twitching motility protein PilH  89.26 
 
 		 121 aa  226  7e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4991  response regulator receiver protein  76.03 
 
 		 121 aa  199  8e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.353726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4865  response regulator receiver protein  76.03 
 
 		 121 aa  199  8e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.321258  normal  0.0275279 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0473  response regulator receiver protein  73.55 
 
 		 121 aa  197  6e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.950452  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5041  response regulator receiver protein  74.38 
 
 		 121 aa  196  7.999999999999999e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3768  response regulator receiver protein  70 
 
 		 120 aa  183  6e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48045  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3633  response regulator receiver domain-containing protein  66.95 
 
 		 120 aa  171  2.9999999999999996e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.480345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0515  response regulator receiver protein  62.18 
 
 		 120 aa  166  8e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.163432  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2399  response regulator receiver protein  63.03 
 
 		 121 aa  164  2.9999999999999998e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.732485 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2903  response regulator receiver protein  59.17 
 
 		 120 aa  156  7e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.629195  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0356  response regulator receiver protein  53.72 
 
 		 121 aa  152  1e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0780111  normal  0.957515 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3018  response regulator receiver protein  58.68 
 
 		 123 aa  151  2.9999999999999998e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.454082 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02637  regulatory protein PilH family  57.14 
 
 		 128 aa  148  2e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2100  response regulator receiver domain-containing protein  53.78 
 
 		 120 aa  148  3e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1817  putative two-component response regulator  52.94 
 
 		 120 aa  143  7.0000000000000006e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2158  response regulator receiver protein  51.67 
 
 		 120 aa  143  9e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1724  response regulator receiver protein  51.67 
 
 		 128 aa  142  1e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.999633  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1789  response regulator receiver protein  51.67 
 
 		 128 aa  142  1e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3970  response regulator receiver protein  55.65 
 
 		 121 aa  142  2e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0244969 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2551  response regulator receiver domain-containing protein  55.08 
 
 		 121 aa  140  5e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0130  response regulator receiver  53.78 
 
 		 121 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3689  response regulator receiver protein  52.59 
 
 		 121 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.443278  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3189  twitching motility protein  54.7 
 
 		 121 aa  138  1.9999999999999998e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.612166  normal  0.249154 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3898  response regulator receiver  54.78 
 
 		 121 aa  137  6e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1137  response regulator receiver domain-containing protein  53.45 
 
 		 121 aa  135  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.635456 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1573  response regulator receiver protein  52.59 
 
 		 121 aa  135  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.146471 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2900  response regulator receiver protein  50.85 
 
 		 121 aa  133  9e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.197839  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3577  response regulator receiver protein  50.85 
 
 		 121 aa  133  9e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.400966  normal  0.141746 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3020  response regulator receiver protein  50.85 
 
 		 121 aa  132  9.999999999999999e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.447611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3088  response regulator receiver protein  49.17 
 
 		 120 aa  132  1.9999999999999998e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.224006 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4625  response regulator receiver protein  50 
 
 		 121 aa  132  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.635313  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3353  response regulator receiver protein  51.72 
 
 		 121 aa  131  1.9999999999999998e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.392561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0902  response regulator receiver protein  50 
 
 		 121 aa  131  3e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844306 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1372  response regulator receiver domain-containing protein  50 
 
 		 121 aa  128  2.0000000000000002e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0313107  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1243  response regulator receiver domain-containing protein  50.43 
 
 		 121 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.253807 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01603  PilH  46.22 
 
 		 120 aa  125  2.0000000000000002e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.376187  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0522  response regulator receiver domain-containing protein  42.61 
 
 		 120 aa  120  9e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2622  response regulator receiver  49.14 
 
 		 123 aa  117  4.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0670  response regulator receiver domain-containing protein  47.46 
 
 		 122 aa  117  7.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00691443  normal  0.823575 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0059  response regulator receiver domain-containing protein  38.66 
 
 		 125 aa  114  5e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.157498  normal  0.212271 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0669  putative twitching motility two-component response regulator transcription regulator protein  49.57 
 
 		 122 aa  113  7.999999999999999e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0561  response regulator receiver protein  48.67 
 
 		 122 aa  113  7.999999999999999e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.718467 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0613  response regulator receiver protein  48.67 
 
 		 122 aa  113  7.999999999999999e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.242329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1062  response regulator receiver protein  36.97 
 
 		 120 aa  110  6e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58489  hitchhiker  0.0000344775 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0856  response regulator receiver domain-containing protein  38.14 
 
 		 120 aa  106  1e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0758877  normal  0.0586548 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2780  response regulator receiver protein  42.02 
 
 		 121 aa  105  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.76051 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3337  response regulator receiver protein  42.02 
 
 		 121 aa  105  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0722  response regulator receiver protein  36.97 
 
 		 121 aa  104  5e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0751  response regulator receiver protein  36.97 
 
 		 121 aa  104  5e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1221  response regulator receiver domain-containing protein  45.79 
 
 		 125 aa  102  1e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1234  response regulator receiver protein  38.66 
 
 		 122 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1264  response regulator receiver protein  38.66 
 
 		 122 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0578681  hitchhiker  0.00155192 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0508  response regulator receiver domain-containing protein  38.02 
 
 		 121 aa  101  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.481314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1348  response regulator PleD  43.59 
 
 		 457 aa  101  3e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0717  response regulator receiver protein  41.82 
 
 		 115 aa  101  3e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2815  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  38.98 
 
 		 457 aa  101  3e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.631579  normal  0.0857187 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3968  response regulator receiver protein  36.97 
 
 		 125 aa  101  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4743  response regulator receiver protein  39.17 
 
 		 125 aa  100  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00329385 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3747  response regulator receiver protein  35.54 
 
 		 121 aa  100  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3000  response regulator receiver protein  36.13 
 
 		 124 aa  100  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2467  response regulator receiver modulated serine phosphatase  41.88 
 
 		 385 aa  99.8  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0424  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  41.03 
 
 		 469 aa  99.8  1e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.97349 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4229  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  42.37 
 
 		 383 aa  99.4  1e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.599633  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1277  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  39.83 
 
 		 454 aa  99.8  1e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.410696  normal  0.0388481 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1955  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.5 
 
 		 236 aa  99  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.295041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3248  response regulator receiver protein  36.13 
 
 		 121 aa  99  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.500247 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6548  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  41.44 
 
 		 397 aa  99  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.543575 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1887  adenylate/guanylate cyclase  42.74 
 
 		 403 aa  98.2  3e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.522729 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1228  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  44.23 
 
 		 349 aa  98.2  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0606  response regulator receiver domain-containing protein  41.03 
 
 		 123 aa  98.6  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0650  response regulator receiver protein  40.17 
 
 		 123 aa  98.2  3e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.438565  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5066  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  42.5 
 
 		 338 aa  98.6  3e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1750  response regulator PleD  39.83 
 
 		 457 aa  98.2  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.263569  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0610  response regulator PleD  41.88 
 
 		 461 aa  97.8  4e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.961713  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0599  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  37.93 
 
 		 313 aa  97.8  4e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.464892  normal  0.548622 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0575  response regulator PleD  41.88 
 
 		 456 aa  97.8  5e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2795  response regulator receiver protein  35.59 
 
 		 121 aa  97.4  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4952  response regulator receiver protein  37.19 
 
 		 121 aa  97.4  6e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.699568  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2709  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.66 
 
 		 236 aa  97.1  7e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0011921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1874  response regulator receiver protein  38.33 
 
 		 320 aa  97.1  7e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.420153  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1456  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.74 
 
 		 223 aa  97.1  7e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000183373  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2960  response regulator receiver  36.75 
 
 		 190 aa  96.3  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0852903  normal  0.915615 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0640  response regulator receiver protein  39.32 
 
 		 123 aa  96.3  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1498  two component transcriptional regulator  41.18 
 
 		 247 aa  96.3  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.220919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2789  response regulator receiver protein  40.34 
 
 		 121 aa  96.3  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0631  response regulator receiver protein  40.17 
 
 		 123 aa  96.7  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03700  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  40.34 
 
 		 226 aa  96.3  1e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.132847 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1423  response regulator receiver protein  37.82 
 
 		 119 aa  96.7  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.24081  normal  0.185499 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5113  response regulator receiver protein  38.98 
 
 		 121 aa  96.3  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0926  response regulator PleD  41.53 
 
 		 455 aa  96.7  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.773886 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0912  response regulator receiver protein  41.18 
 
 		 118 aa  95.9  1e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.616011 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3637  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.34 
 
 		 246 aa  95.9  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3776  response regulator receiver domain-containing protein  35.65 
 
 		 120 aa  95.5  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.143561 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0773  response regulator PleD  36.44 
 
 		 458 aa  95.9  2e-19  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0393  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.5 
 
 		 227 aa  95.9  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.202895 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>