More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_5034 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_5034  type IV pilus response regulator PilG  100 
 
 		 136 aa  280  6.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0488  response regulator receiver  100 
 
 		 136 aa  280  6.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5308  response regulator receiver domain-containing protein  92.37 
 
 		 134 aa  249  1e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0630269  normal  0.22086 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0403  response regulator receiver protein  87.97 
 
 		 135 aa  244  2e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05320  twitching motility protein PilG  87.12 
 
 		 135 aa  239  7.999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0508  twitching motility protein PilG  89.84 
 
 		 135 aa  239  1e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03180  type IV pili response regulator, PilG  84.96 
 
 		 135 aa  236  5.999999999999999e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.392248  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4992  response regulator receiver protein  78.36 
 
 		 133 aa  220  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.162705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4866  response regulator receiver protein  78.36 
 
 		 133 aa  220  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.638507  normal  0.0288736 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5042  response regulator receiver protein  76.87 
 
 		 133 aa  216  6e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3767  response regulator receiver protein  78.95 
 
 		 130 aa  216  6e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.401563  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0472  response regulator receiver protein  77.61 
 
 		 133 aa  215  1e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.418097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3634  response regulator receiver domain-containing protein  83.2 
 
 		 131 aa  214  4e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.185946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1017  response regulator receiver protein  79.67 
 
 		 138 aa  212  1.9999999999999998e-54  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.88924  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0893  response regulator receiver protein  79.67 
 
 		 138 aa  212  1.9999999999999998e-54  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.605635  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3089  response regulator receiver protein  80 
 
 		 133 aa  209  7.999999999999999e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.22915 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01602  type IV pilus response regulator PilG  83.48 
 
 		 117 aa  206  7e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.388184  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2101  response regulator receiver domain-containing protein  79.03 
 
 		 125 aa  206  1e-52  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0355  response regulator receiver protein  75.81 
 
 		 161 aa  205  2e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.384709  normal  0.97064 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1818  two component reponse regulator  78.23 
 
 		 125 aa  204  3e-52  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2904  response regulator receiver protein  78.33 
 
 		 137 aa  201  2e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0131  response regulator receiver  75.83 
 
 		 132 aa  196  9e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2159  response regulator receiver protein  71.77 
 
 		 129 aa  196  1.0000000000000001e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2552  response regulator receiver domain-containing protein  70.34 
 
 		 130 aa  185  2e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3688  response regulator receiver protein  71.43 
 
 		 133 aa  185  2e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478813  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2400  response regulator receiver protein  68.07 
 
 		 135 aa  185  2e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.726464 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1242  response regulator receiver protein  66.41 
 
 		 138 aa  182  1.0000000000000001e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.390656 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3899  response regulator receiver  70.94 
 
 		 136 aa  181  3e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3971  response regulator receiver protein  66.67 
 
 		 145 aa  174  2e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0152715 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3190  twitching motility, CheY-like protein  65 
 
 		 141 aa  171  2.9999999999999996e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.510228  normal  0.242476 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4626  response regulator receiver protein  62.3 
 
 		 132 aa  167  4e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.664548  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1371  response regulator receiver domain-containing protein  60.66 
 
 		 132 aa  166  1e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.019268  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0901  response regulator receiver protein  60.33 
 
 		 136 aa  165  2e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.850584 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3021  response regulator receiver protein  62.18 
 
 		 144 aa  164  2.9999999999999998e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.381292  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0560  response regulator receiver protein  59.38 
 
 		 165 aa  164  4e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.595412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1136  response regulator receiver domain-containing protein  63.25 
 
 		 132 aa  164  4e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.638067 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3354  response regulator receiver protein  61.34 
 
 		 147 aa  164  5e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.878811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1572  response regulator receiver protein  59.84 
 
 		 132 aa  164  5e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277281 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0612  response regulator receiver protein  59.38 
 
 		 152 aa  164  5.9999999999999996e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.296044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2901  response regulator receiver protein  62.61 
 
 		 130 aa  163  9e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.191122  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3578  response regulator receiver protein  62.61 
 
 		 130 aa  162  1.0000000000000001e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.677729  normal  0.0425656 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2623  response regulator receiver  59.35 
 
 		 160 aa  162  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0669  response regulator receiver domain-containing protein  58.87 
 
 		 167 aa  158  3e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00304574  normal  0.832292 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0668  twitching motility two-component response regulator transcription regulator protein  59.32 
 
 		 179 aa  156  8e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3249  response regulator receiver protein  40 
 
 		 405 aa  110  5e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.517316 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0987  response regulator receiver protein  43.36 
 
 		 414 aa  107  6e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.332272 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3772  CheA signal transduction histidine kinase  41.38 
 
 		 2539 aa  106  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5311  two component transcriptional regulator  41.38 
 
 		 246 aa  103  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.554395  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0855  response regulator receiver domain-containing protein  38.84 
 
 		 417 aa  101  3e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00541919 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4742  response regulator receiver protein  37.27 
 
 		 382 aa  100  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.333438  hitchhiker  0.00408649 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0492  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  37.8 
 
 		 1992 aa  100  7e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05390  ChpA  38.71 
 
 		 2476 aa  100  7e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.812783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0126  CheA signal transduction histidine kinase  40.71 
 
 		 1758 aa  100  7e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0513  response regulator  38.71 
 
 		 2458 aa  100  8e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0058  response regulator receiver domain-containing protein  37.93 
 
 		 347 aa  100  9e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.259686  normal  0.253815 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5030  sensor histidine kinase/response regulator  36.97 
 
 		 1987 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1116  DNA-binding response regulator  42.74 
 
 		 235 aa  99.8  1e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.310768  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3248  response regulator receiver protein  41.23 
 
 		 121 aa  99.8  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.500247 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1740  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.48 
 
 		 225 aa  99.4  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000204942  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3661  response regulator receiver protein  41.53 
 
 		 120 aa  99.4  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.442071  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4720  DNA-binding response regulator PhoP  40.87 
 
 		 239 aa  98.2  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0539  DNA-binding response regulator PhoP  40.87 
 
 		 239 aa  97.8  4e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000130788 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4484  DNA-binding response regulator PhoP  40.87 
 
 		 239 aa  98.2  4e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4699  DNA-binding response regulator PhoP  40.87 
 
 		 239 aa  97.8  4e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4319  alkaline phosphatase synthesis response regulator  40.87 
 
 		 239 aa  98.2  4e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4330  alkaline phosphatase synthesis response regulator  40.87 
 
 		 239 aa  98.2  4e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4704  DNA-binding response regulator PhoP  40.87 
 
 		 239 aa  98.2  4e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000673192 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4833  DNA-binding response regulator PhoP  40.87 
 
 		 239 aa  98.2  4e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0982965  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4714  DNA-binding response regulator PhoP  40.87 
 
 		 239 aa  98.2  4e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0719  DNA-binding response regulator  41.88 
 
 		 236 aa  97.8  5e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0951718  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0092  response regulator receiver protein  39.83 
 
 		 120 aa  97.4  5e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0723  response regulator receiver protein  36.79 
 
 		 405 aa  97.8  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4419  two component transcriptional regulator  40.87 
 
 		 239 aa  97.4  6e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0785  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.13 
 
 		 235 aa  97.4  6e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0408  CheA signal transduction histidine kinase  38.39 
 
 		 2423 aa  97.4  6e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1005  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.21 
 
 		 227 aa  97.4  6e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000255449  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1102  response regulator receiver domain-containing protein  38.46 
 
 		 457 aa  97.1  7e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0509  response regulator receiver domain-containing protein  36 
 
 		 412 aa  97.1  8e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.75217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0752  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 405 aa  96.7  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.26894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3274  two component transcriptional regulator  40 
 
 		 238 aa  96.3  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2675  two component transcriptional regulator, winged helix family  40 
 
 		 234 aa  96.7  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.661044  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1155  two component transcriptional regulator  42.99 
 
 		 235 aa  96.7  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.503115  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4988  CheA signal transduction histidine kinase  38.14 
 
 		 1646 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.4615  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0413  response regulator receiver protein  36.21 
 
 		 347 aa  95.9  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.827991  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3286  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.93 
 
 		 228 aa  95.5  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167791  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3210  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  38.4 
 
 		 337 aa  95.5  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.32327  normal  0.712325 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0444  DNA-binding response regulator  42.74 
 
 		 233 aa  95.1  3e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3942  response regulator receiver protein  36.75 
 
 		 163 aa  94.7  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4862  CheA signal transduction histidine kinase  38.14 
 
 		 1646 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00418474 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2396  CheA signal transduction histidine kinase  34.71 
 
 		 1832 aa  94.7  3e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.412957 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1784  alkaline phosphatase synthesis transcriptional regulatory protein  37.39 
 
 		 234 aa  94.7  4e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.561076  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1901  response regulator receiver protein  35.96 
 
 		 125 aa  94.7  4e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1061  response regulator receiver protein  36.84 
 
 		 427 aa  94.7  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.609626  hitchhiker  0.0000494803 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1750  two component transcriptional regulator  37.39 
 
 		 234 aa  94.7  4e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2790  response regulator receiver protein  36.21 
 
 		 398 aa  94.4  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1632  response regulator receiver  36.75 
 
 		 123 aa  94  6e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0323  two component transcriptional regulator  34.96 
 
 		 227 aa  94  6e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1040  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.9 
 
 		 365 aa  94  7e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5038  CheA signal transduction histidine kinase  37.61 
 
 		 1647 aa  94  7e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0359  CheA signal transduction histidine kinases  36.44 
 
 		 1834 aa  94  7e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.505566  normal  0.609353 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>