More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3190 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A3190  twitching motility, CheY-like protein  100 
 
 		 141 aa  292  1e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.510228  normal  0.242476 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3971  response regulator receiver protein  82.58 
 
 		 145 aa  226  9e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0152715 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1371  response regulator receiver domain-containing protein  80.95 
 
 		 132 aa  219  9.999999999999999e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.019268  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4626  response regulator receiver protein  84.17 
 
 		 132 aa  217  5e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.664548  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1136  response regulator receiver domain-containing protein  83.05 
 
 		 132 aa  213  8e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.638067 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3354  response regulator receiver protein  72.26 
 
 		 147 aa  211  2.9999999999999995e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.878811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1572  response regulator receiver protein  79.51 
 
 		 132 aa  210  4.9999999999999996e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277281 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2901  response regulator receiver protein  78.69 
 
 		 130 aa  208  2e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.191122  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3578  response regulator receiver protein  78.69 
 
 		 130 aa  207  3e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.677729  normal  0.0425656 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0901  response regulator receiver protein  77.69 
 
 		 136 aa  207  4e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.850584 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3021  response regulator receiver protein  79.66 
 
 		 144 aa  204  3e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.381292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3899  response regulator receiver  78.95 
 
 		 136 aa  197  3e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3688  response regulator receiver protein  75.63 
 
 		 133 aa  195  2.0000000000000003e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478813  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2552  response regulator receiver domain-containing protein  72.27 
 
 		 130 aa  194  4.0000000000000005e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2623  response regulator receiver  64.44 
 
 		 160 aa  192  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1242  response regulator receiver protein  70.83 
 
 		 138 aa  187  2.9999999999999997e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.390656 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0612  response regulator receiver protein  68.33 
 
 		 152 aa  179  1e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.296044  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0560  response regulator receiver protein  68.33 
 
 		 165 aa  179  1e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.595412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2101  response regulator receiver domain-containing protein  66.67 
 
 		 125 aa  177  4.999999999999999e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3089  response regulator receiver protein  63.91 
 
 		 133 aa  176  1e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.22915 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3634  response regulator receiver domain-containing protein  65.08 
 
 		 131 aa  176  1e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.185946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1818  two component reponse regulator  65.83 
 
 		 125 aa  175  2e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0669  response regulator receiver domain-containing protein  64.35 
 
 		 167 aa  173  7e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00304574  normal  0.832292 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2159  response regulator receiver protein  64.46 
 
 		 129 aa  173  9e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3767  response regulator receiver protein  65.55 
 
 		 130 aa  172  9.999999999999999e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.401563  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5308  response regulator receiver domain-containing protein  65 
 
 		 134 aa  172  9.999999999999999e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0630269  normal  0.22086 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0355  response regulator receiver protein  64.71 
 
 		 161 aa  172  1.9999999999999998e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.384709  normal  0.97064 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5034  type IV pilus response regulator PilG  65 
 
 		 136 aa  171  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0488  response regulator receiver  65 
 
 		 136 aa  171  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0472  response regulator receiver protein  63.03 
 
 		 133 aa  169  9e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.418097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0403  response regulator receiver protein  65 
 
 		 135 aa  169  9e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2904  response regulator receiver protein  61.19 
 
 		 137 aa  169  1e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05320  twitching motility protein PilG  64.17 
 
 		 135 aa  169  2e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0508  twitching motility protein PilG  64.17 
 
 		 135 aa  169  2e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4992  response regulator receiver protein  63.03 
 
 		 133 aa  168  3e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.162705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2400  response regulator receiver protein  59.54 
 
 		 135 aa  168  3e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.726464 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4866  response regulator receiver protein  63.03 
 
 		 133 aa  168  3e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.638507  normal  0.0288736 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1017  response regulator receiver protein  66.67 
 
 		 138 aa  167  4e-41  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.88924  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0893  response regulator receiver protein  66.67 
 
 		 138 aa  167  4e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.605635  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01602  type IV pilus response regulator PilG  68.42 
 
 		 117 aa  167  5e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.388184  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5042  response regulator receiver protein  63.03 
 
 		 133 aa  167  5e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0668  twitching motility two-component response regulator transcription regulator protein  60.16 
 
 		 179 aa  166  8e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0131  response regulator receiver  62.18 
 
 		 132 aa  166  1e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03180  type IV pili response regulator, PilG  63.33 
 
 		 135 aa  162  2.0000000000000002e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.392248  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0723  response regulator receiver protein  43.59 
 
 		 405 aa  111  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0752  response regulator receiver protein  43.97 
 
 		 405 aa  110  5e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.26894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2999  response regulator receiver protein  37.31 
 
 		 421 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0987  response regulator receiver protein  39.82 
 
 		 414 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.332272 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0855  response regulator receiver domain-containing protein  37.88 
 
 		 417 aa  108  3e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00541919 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0509  response regulator receiver domain-containing protein  38.89 
 
 		 412 aa  103  6e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.75217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2396  CheA signal transduction histidine kinase  38.89 
 
 		 1832 aa  103  9e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.412957 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0058  response regulator receiver domain-containing protein  40 
 
 		 347 aa  102  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.259686  normal  0.253815 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1102  response regulator receiver domain-containing protein  38.02 
 
 		 457 aa  101  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3814  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  40.43 
 
 		 1131 aa  101  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.257486 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3249  response regulator receiver protein  40.52 
 
 		 405 aa  101  4e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.517316 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0413  response regulator receiver protein  37.19 
 
 		 347 aa  100  6e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.827991  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4742  response regulator receiver protein  40.68 
 
 		 382 aa  100  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.333438  hitchhiker  0.00408649 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2096  CheA signal transduction histidine kinases  38.94 
 
 		 2301 aa  100  9e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3553  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  42.48 
 
 		 348 aa  99  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528491 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3772  CheA signal transduction histidine kinase  35.9 
 
 		 2539 aa  98.2  3e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0476  CheA signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 1629 aa  98.2  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1813  putative hybrid two-component sensor and regulatory protein  38.94 
 
 		 2284 aa  97.1  8e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.409027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0790  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.32 
 
 		 566 aa  96.7  9e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.391268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1271  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  40.35 
 
 		 350 aa  95.9  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2492  response regulator receiver  39.47 
 
 		 352 aa  96.3  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.570528  normal  0.0101485 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05390  ChpA  34.51 
 
 		 2476 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.812783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0126  CheA signal transduction histidine kinase  36.28 
 
 		 1758 aa  96.3  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0513  response regulator  34.51 
 
 		 2458 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4988  CheA signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 		 1646 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.4615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4862  CheA signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 		 1646 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00418474 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0408  CheA signal transduction histidine kinase  35.09 
 
 		 2423 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3248  response regulator receiver protein  38.14 
 
 		 121 aa  95.9  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.500247 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2795  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 121 aa  94.7  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3747  response regulator receiver protein  38.98 
 
 		 121 aa  94.7  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1901  response regulator receiver protein  35.65 
 
 		 125 aa  94.7  4e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5311  two component transcriptional regulator  43.24 
 
 		 246 aa  94.4  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.554395  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1632  response regulator receiver  35 
 
 		 123 aa  94.4  5e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1011  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.89 
 
 		 231 aa  94.4  5e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1375  CheA signal transduction histidine kinases  37.82 
 
 		 1888 aa  94.4  5e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3000  response regulator receiver protein  38.14 
 
 		 124 aa  94  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5038  CheA signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 		 1647 aa  94  6e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3942  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 163 aa  94  6e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2149  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  37.39 
 
 		 407 aa  94  7e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.142048 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3138  response regulator receiver protein  36.13 
 
 		 455 aa  93.6  9e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0492  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  33.88 
 
 		 1992 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4622  CheA signal transduction histidine kinase  37.39 
 
 		 2022 aa  92.8  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.45 
 
 		 234 aa  93.2  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.178035  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1955  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.46 
 
 		 236 aa  93.2  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.295041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0323  two component transcriptional regulator  37.17 
 
 		 227 aa  92.8  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3143  response regulator receiver protein  35.09 
 
 		 124 aa  93.2  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2318  chemotaxis protein CheY  40 
 
 		 121 aa  92.8  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5030  sensor histidine kinase/response regulator  33.06 
 
 		 1987 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0508  response regulator receiver domain-containing protein  38.46 
 
 		 121 aa  92.4  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.481314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3776  response regulator receiver domain-containing protein  38.46 
 
 		 120 aa  92.4  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.143561 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0130  response regulator receiver  35.71 
 
 		 121 aa  92.4  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1037  response regulator receiver protein  37.07 
 
 		 247 aa  92  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1061  response regulator receiver protein  38.05 
 
 		 427 aa  92.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.609626  hitchhiker  0.0000494803 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2416  two component transcriptional regulator  41.28 
 
 		 255 aa  92.4  2e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0279623 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2674  DNA-binding response regulator  40.98 
 
 		 232 aa  92.4  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00069138  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4006  two component transcriptional regulator  37.29 
 
 		 235 aa  91.7  3e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010356  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>